普通细菌孔道蛋白家族
普通细菌孔道蛋白是一类存在于革兰氏阴性菌外膜上的蛋白质。这类蛋白充当了对亲水性物质的分子过滤器[1]，在外膜上起着“分子筛”的作用。这些蛋白生成的装满水的通道可让亲水性物质进入周质空间中。部分孔道蛋白生成的扩散通路可允许大小小于排阻极限的溶质通过，而另一些则在孔道内有特异性的结合位点，只能允许一种溶质通过。孔道蛋白是细菌外膜上的一种主要蛋白质，噬菌体和细菌素常常会通过它们与细菌结合。
| 革兰氏阴性菌孔道蛋白 | |||||||||||
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| 鉴定 | |||||||||||
| 标志 | Porin_1 | ||||||||||
| Pfam | PF00267（旧版） | ||||||||||
| Pfam宗系 | CL0193（旧版） | ||||||||||
| InterPro | IPR001702 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00498 | ||||||||||
| SCOP | 1mpf / SUPFAM | ||||||||||
| TCDB | 1.B.1 | ||||||||||
| OPM家族 | 31 | ||||||||||
| OPM蛋白 | 1pho | ||||||||||
| CDD | cd01345 | ||||||||||
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细菌孔道蛋白常常会结合成三聚体。而它们的β链则是这些蛋白质的跨膜核心[2]。有证据表明[3]一些孔道蛋白与净化有关。这些蛋白质有：
- Enterobacteria PhoE, OmpC, OmpF, NmpC.
- Bacteriophage PA-2 LC.
- Neisseria PI.A, PI.B
亚家族
参考
- ^ Benz R, Bauer K. Permeation of hydrophilic molecules through the outer membrane of gram-negative bacteria. Review on bacterial porins. Eur. J. Biochem. 1988, 176 (1): 1–19. PMID 2901351. doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14245.x.
- ^ Jap BK, Walian PJ. Biophysics of the structure and function of porins. Q. Rev. Biophys. 1990, 23 (4): 367–403. PMID 2178269. doi:10.1017/S003358350000559X.
- ^ Pattus F, Jeanteur D, Lakey JH. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. Mol. Microbiol. 1991, 5 (9): 2153–2164. PMID 1662760. doi:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02145.x.