普通細菌孔道蛋白家族

普通細菌孔道蛋白一類英語Protein family存在於革蘭氏陰性菌外膜上的蛋白質。這類蛋白充當了對親水性物質的分子過濾器[1],在外膜上起著「分子篩」的作用。這些蛋白生成的裝滿水的通道可讓親水性物質進入週質空間中。部分孔道蛋白生成的擴散通路可允許大小小於排阻極限的溶質通過,而另一些則在孔道內有特異性的結合位點,只能允許一種溶質通過。孔道蛋白是細菌外膜上的一種主要蛋白質,噬菌體細菌素英語Bacteriocin常常會通過它們與細菌結合。

革蘭氏陰性菌孔道蛋白
鑑定
標誌Porin_1
PfamPF00267舊版
Pfam宗系CL0193舊版
InterPro英語InterProIPR001702
PROSITE英語PROSITEPDOC00498
SCOP英語Structural Classification of Proteins1mpf / SUPFAM
TCDB英語TCDB1.B.1
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database家族31
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database蛋白1pho
CDD英語Conserved Domain Databasecd01345

細菌孔道蛋白常常會結合成三聚體英語Protein trimer。而它們的β鏈則是這些蛋白質的跨膜核心[2]。有證據表明[3]一些孔道蛋白與淨化有關。這些蛋白質有:

亞家族

參考

  1. ^ Benz R, Bauer K. Permeation of hydrophilic molecules through the outer membrane of gram-negative bacteria. Review on bacterial porins. Eur. J. Biochem. 1988, 176 (1): 1–19. PMID 2901351. doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14245.x. 
  2. ^ Jap BK, Walian PJ. Biophysics of the structure and function of porins. Q. Rev. Biophys. 1990, 23 (4): 367–403. PMID 2178269. doi:10.1017/S003358350000559X. 
  3. ^ Pattus F, Jeanteur D, Lakey JH. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. Mol. Microbiol. 1991, 5 (9): 2153–2164. PMID 1662760. doi:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02145.x.