严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2缪变异株
严重急性呼吸道症候群冠状病毒2型-Mu变异株(英语:SARS-CoV-2 Mu variant),别名B.1.621谱系 (英语:Lineage B.1.621),是严重急性呼吸综合症冠状病毒2型(SARS-CoV-2)的一种变异株。于2021年七月在哥伦比亚被发现并在同年8月30日被WHO标示为“需留意变异株”(VOI)。[1]WHO称这个变种拥有可能使疫苗失效的突变,并表示必须深入研究以彻底了解此种变异株。[2]Mu变异株已被通报在南美洲与欧洲扩散。[3]
B.1.621谱系拥有一个子谱系,依PANGO命名规则编号为B.1.621.1, 目前已被发现散布到全世界20馀国。[4]
命名
2021年一月,此变异株首度在哥伦比亚被发现,并被命名为 B.1.621。[5]
变异
Mu变异株的基因体拥有21个突变位,包括9个胺基酸突变,棘蛋白编号分别为: T95I、Y144S、Y145N、R346K、E484K,以及逃脱变异N501Y、D614G、P681H、以及D950N。[7]病毒突变并不罕见。每一种病毒,包括SARS-CoV-2,每隔一段时间就会变化。 大部分的突变是无关紧要的,但一些突变可以增强病毒的威力或对药物、疫苗产生免疫逃避。[3] 一项在罗马一间实验室进行的研究[8]测试了辉瑞-BioNTech疫苗对Mu变异株的疗效,并发现: 虽然Mu变异株在棘蛋白上有许多突变,辉瑞疫苗仍能有效将其消灭。而相较于其他变种株,辉瑞疫苗虽然有效,但其诱发的抗体消灭Mu变异株的效果大大减弱。[5]
-
SARS-CoV-2 Mu变异株基因体棘蛋白部分的胺基酸变异图[9]
基因编号 | 突变之胺基酸编号 |
---|---|
ORF1a | T1055A |
T1538I | |
T3255I | |
Q3729R | |
ORF1b | P314L |
P1342S | |
棘蛋白(S) | T95I |
Y144S | |
Y145N | |
R346K | |
E484K | |
N501Y | |
D614G | |
P681H | |
D950N | |
ORF3a | Q57H |
del257/257 | |
ORF8 | T11K |
P38S | |
S67F | |
核壳蛋白(N) | T205I |
历史
2021年8月
8月30日,日本宣布确诊境内首两例Mu变异株患者,分别是一名40岁左右的女性,于8月26日自阿拉伯联合大公国入境。另一名为50多岁女性,于7月5日由英国入境。此两例皆为无症状感染者。[10]
2021年9月
9月2日:
- 中华民国中央流行疫情指挥中心宣布发现台湾第一例Mu变种株确诊个案,为一位60多岁本国籍女性,自美国入境,且已接种2剂辉瑞疫苗。她在7月5日于美国接种第一剂辉瑞疫苗,并于7月26日接种第二剂。当她于8月3日返国时,起先并未回报有任何症状,后于机场检疫时确诊COVID-19。[11][12]
- 瓜地马拉通报境内首两例女性Mu变异株患者,分别为19及25岁。两名患者皆无旅游史与疫苗接种史。病人随即被安置在位于瓜地马拉市的医院。[13]
9月3日:
- 希腊通报境内首六例Mu变异株确诊案例。其中四例为境外移入。[14]
- 香港通报境内首三例Mu变异株确诊案例。其中两例为19岁男性与22岁女性,曾入境瓜地马拉,确认在六月初时就已感染Mu变异株,另一26岁女性,自美国入境,于7月24日确诊。香港同时也新增了四例境外移入COVID-19病例,皆为由菲律宾入境之移工。[15]
- 韩国通报境内首三例Mu变异株确诊案例。疾病管理厅宣布确诊3例由墨西哥、美国及哥伦比亚入境之境外移入病例。[16]
9月4日:
统计数据
国家 | 病例数 | |||
---|---|---|---|---|
来自GISAID[18] | 来自outbreak.info[7] | 来自其他来源 | ||
美国 | 2,400 | 2,216 | ||
哥伦比亚 | 965 | 877 | ||
西班牙 | 512 | 512 | ||
墨西哥 | 367 | 357 | ||
厄瓜多尔 | 170 | 170 | ||
阿鲁巴 | 84 | 84 | ||
义大利 | 82 | 77 | ||
智利 | 84 | 73 | ||
荷兰 | 75 | 72 | 44[19] | |
英国 | 61 | 55 | 53[20] | |
波多黎各 | – | 51 | ||
奥地利 | 49 | 49 | ||
哥斯达黎加 | 49 | 49 | ||
瑞士 | 48 | 48 | ||
加拿大 | 114 | 69 | ||
多米尼加 | 46 | 46 | ||
比利时 | 36 | 36 | ||
葡萄牙 | 24 | 24 | ||
英属维尔京群岛 | 21 | 21 | ||
库拉索 | 20 | 20 | ||
德国 | 14 | 14 | ||
秘鲁 | 14 | 14 | ||
法国 | 21 | 16 | ||
巴西 | 11 | 11 | ||
荷兰加勒比区 | 8 | 8 | ||
丹麦 | 7 | 7 | ||
波兰 | 6 | 6 | ||
委内瑞拉 | 5 | 5 | ||
爱尔兰 | 4 | 4 | 4[17] | |
芬兰 | 3 | 3 | ||
荷属圣马丁 | 3 | 3 | ||
斯洛伐克 | 3 | 3 | ||
瑞典 | 4 | 4 | ||
开曼群岛 | 2 | 2 | ||
香港 | 2 | 2 | 3[15] | |
日本 | 2 | 2 | 2[10] | |
土耳其 | 2 | 2 | ||
巴巴多斯 | 1 | 1 | ||
直布罗陀 | 1 | 1 | ||
以色列 | 1 | 1 | ||
列支敦斯登 | 1 | 1 | ||
卢森堡 | 2 | 2 | ||
马尔他 | 1 | 1 | ||
罗马尼亚 | 1 | 1 | ||
韩国 | 1 | 1 | 3[16] | |
特克斯和凯科斯群岛 | 1 | 1 | ||
希腊 | – | – | 6[14] | |
危地马拉 | – | – | 2[13] | |
台湾 | – | – | 1[11] | |
共计: | 5,328 | 5,022 | 118 |
参见
参考文献
- ^ 1.0 1.1 Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int. World Health Organization. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-06-18) (英语).
- ^ WHO monitoring new coronavirus variant named 'Mu'. france24.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-09-01) (英语).
- ^ 3.0 3.1 Why Has WHO Designated 'Mu' A Variant Of Concern? Find Out All About It. ndtv.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-09-01) (英语).
- ^ Lineage B.1.621.1. cov-lineages.org. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-08-31) (英语).
- ^ 5.0 5.1 Mu COVID variant: All you need to know about the new UK coronavirus strain. BBC Science Focus Magazine. [2021-09-01]. (原始内容存档于2021-09-01) (英语).
- ^ Variants: distribution of cases data. gov.uk. Government Digital Service. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-06-07).
- ^ 7.0 7.1 7.2 Mu Lineage Report. outbreak.info. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-09-01).
- ^ Messali, S., Bertelli, A., Campisi, G., Zani, A., Ciccozzi, M., Caruso, A. and Caccuri, F.(2021). A cluster of the new SARS-CoV-2 B.1.621 lineage in Italy and sensitivity of the viral isolate to the BNT162b2 vaccine.. Journal of Medical Virology. [2020-09-04].
- ^ SARS-CoV-2 variants - Stanford Coronavirus Antiviral & Resistance Database. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-06-30).
- ^ 10.0 10.1 Japan confirms first cases of mu variant of COVID-19. thebharatexpressnews.com. September 2, 2021 [September 2, 2021]. (原始内容存档于September 2, 2021).
- ^ 11.0 11.1 Taiwan reports its 1st imported case of Mu COVID variant. Taiwan News. September 3, 2021 [September 3, 2021]. (原始内容存档于2021-11-27).
- ^ 疾管署. 新增19例COVID-19確定病例,分別為16例本土及3例境外移入. 2021-08-03 [2021-09-04].
- ^ 13.0 13.1 The “MU” variant is already in Guatemala. Is it immune to vaccines?. bullfrag.com. [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-11-27) (英语).
- ^ 14.0 14.1 Κορονοϊός - Μετάλλαξη Mu: Έξι κρούσματα στην Ελλάδα - Πού εντοπίστηκαν. ethnos.gr. [September 3, 2021]. (原始内容存档于2021-09-03) (希腊语).
- ^ 15.0 15.1 Coronavirus: three cases of new Mu variant found in Hong Kong arrivals, authorities reveal. South China Morning Post. [September 3, 2021]. (原始内容存档于2021-11-27) (英语).
- ^ 16.0 16.1 3 Mu variant cases detected in South Korea. malaysianow.com. September 3, 2021 [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-09-04) (英语).
- ^ 17.0 17.1 Neville, Steve. Four Covid cases associated with Mu variant identified in Ireland. Irish Examiner. 4 September 2021 [5 September 2021]. (原始内容存档于2021-11-27).
- ^ Tracking of Variants. gisaid.org. [September 5, 2021]. (原始内容存档于2021-06-23).
- ^ Variants of the coronavirus SARS-CoV-2. rivm.nl. [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-07-09).
- ^ Variants: distribution of case data, 3 September 2021. gov.uk. Government Digital Service. [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-09-03).