基因密度

基因密度(英語:genomic density)單位長度DNA基因的數量,單位通常為百萬鹼基對的基因數量(gene/Mb)。其中人類的基因密度為每百萬鹼基對大約有11至15個基因,而秀麗隱杆線蟲的基因密度則高達每百萬鹼基對200個基因。[1]由於細菌沒有內含子密碼子較少,因此細菌的基因密度遠超人類。[2]

部分生物的基因密度列表

原生動物

物種 基因數量 基因組鹼基對總長度(百萬鹼基對) 基因密度
田鼠巴貝蟲 3,685[3] 6.4[4] 575.8
貝氏貝諾孢子蟲 8,546[5] 58.8[6] 145.3
小隱孢子蟲 3,887[7] 9.1[8] 427.1
藍氏賈第鞭毛蟲 5,388[9] 11.5[10] 468.5
杜氏利什曼原蟲 8,123[11] 32.4[12] 250.7
惡性瘧原蟲 5,683[13] 23.5[14] 241.8
致病疫霉 19,344[15] 203.2[16] 95.2
四膜蟲 26,996[17] 130.4[18] 207
水泰勒原蟲 4,141[19] 8.3[20] 498.9
弓形蟲 8,925[21] 64.5[22] 138.4
克氏錐蟲 25,183[23] 32.5[24] 774.9

參考文獻

  1. ^ Science Reference: Gene. Science Daily. [2013-10-15]. (原始內容存檔於2015-03-28). 
  2. ^ Sands, Jeff. Genomes of Bacteria. Lehigh University. [2013-10-15]. (原始內容存檔於2021-01-26). 
  3. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Babesia_microti/latest_assembly_versions/GCF_000691945.2_ASM69194v2. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. 
  4. ^ Babesia microti (ID 11700) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  5. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Besnoitia_besnoiti/latest_assembly_versions/GCF_002563875.1_Bbes1.0. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  6. ^ Besnoitia besnoiti (ID 62526) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  7. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Cryptosporidium_parvum/latest_assembly_versions/GCF_000165345.1_ASM16534v1. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  8. ^ Cryptosporidium parvum (ID 29) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  9. ^ Giardia intestinalis (ID 26) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  10. ^ Giardia intestinalis (ID 26) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-30]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  11. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Leishmania_donovani/latest_assembly_versions/GCF_000227135.1_ASM22713v2. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
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  15. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Phytophthora_infestans/latest_assembly_versions/GCF_000142945.1_ASM14294v1. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
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  20. ^ Theileria parva (ID 38) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  21. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Toxoplasma_gondii/latest_assembly_versions/GCF_000006565.2_TGA4. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  22. ^ Toxoplasma gondii (ID 30) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-31]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  23. ^ Index of /genomes/refseq/protozoa/Trypanosoma_cruzi/latest_assembly_versions/GCF_000209065.1_ASM20906v1. ftp.ncbi.nih.gov. [2020-12-30]. (原始內容存檔於2022-07-31). 
  24. ^ Trypanosoma cruzi (ID 25) - Genome - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-12-30]. (原始內容存檔於2022-07-31).