非蛋白氨基酸

非蛋白氨基酸是生物化学上指在蛋白质内找不到（例如：肉碱、GABA和L-DOPA），或没有被标准遗传密码编码的其他氨基酸。

蛋白氨基酸（左下方圆形）其实在所有氨基酸中只占少数，余下的都可以算是非蛋白氨基酸。

尽管在合成蛋白质时只会用到21种氨基酸（真核细胞只会用20种），事实上目前已经知道还有另外超过300种的天然氨基酸，而相信穷尽所有组合，这数目可以数以千计。 在所有的非蛋白氨基酸当中，有部分较为值得注意，因为下列各种原因：

• 是生物合成的中间体；
• 于翻译后修饰作用加进蛋白质内；
• 有其生理学角色（例如：可以成为细菌的细胞壁的肽聚糖、神经递质及毒素）
• 是天然及人工合成的药用化合物
• 存在于陨石或生命起源实验（例如：米勒-尤里实验）中所发现的​）

通过否定来定义

赖氨酸（Lysine）

在技术上，任何具有胺（-NH₂）和羧酸（-COOH）官能团的有机化合物都是氨基酸。 蛋白氨基酸是该组的一小部分，具有带有一个氨基，一个羧基，一个侧链和一个α-氢左旋构象的中心碳原子（α-或2-），甘氨酸除外， 非氨基和脯氨酸，其氨基是仲胺，因此由于传统原因通常被称为亚氨基酸，尽管不是亚氨基。

遗传密码编码20种标准氨基酸，用于在翻译过程中掺入蛋白质中。 然而，有两种额外的蛋白质氨基酸：硒代半胱氨酸和吡咯赖氨酸。 这些非标准氨基酸不具有专用密码子，但是当存在特测序列时，加入代替终止密码子，硒代半胱氨酸的UGA密码子和SECIS元件，吡咯赖氨酸的UAG PYLIS下游序列。 所有其他氨基酸被称为“非蛋白原性”。

• 
  硒代半胱氨酸。 该氨基酸在其β-碳上含有硒醇基团
• 
  吡咯赖氨酸。 该氨基酸通过与赖氨酸的羧基吡咯啉环的ε-氨基连接而形成

有各种氨基酸组：

• 20种标准氨基酸
• 22种蛋白质氨基酸
• 超过80个氨基酸是由高浓度非生物创建
• 大约900个是由自然途径产生的
• 超过118种被工程化氨基酸被置于蛋白质中

参见

• 标准蛋白氨基酸列表