姬蛙甲型勒托病毒一型

姬蛙甲型勒托病毒一型
病毒分类
（未分级）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
亚科：	勒托病毒亚科 Letovirinae
属：	甲型勒托病毒属 Alphaletovirus
种：	姬蛙甲型勒托病毒一型 Microhyla alphaletovirus 1

姬蛙甲型勒托病毒一型（学名：Microhyla alphaletovirus 1，MLeV）是勒托病毒亚科（Letovirinae）及甲型勒托病毒属（Alphaletovirus）的唯一一种病毒，属于冠状病毒科^[1]，为一种在小雨蛙（Microhyla fissipes）身上发现的病毒。此病毒为所有其他冠状病毒（冠状病毒亚科）的姊妹群^[2]。

词源

MLeV病毒的属名（alphaletovirus）与亚科名（Letovirinae）来自希腊神话中的女神勒托，勒托曾把搅动池塘底泥、阻止她饮用池水的农民变成青蛙，因此发表者取其与青蛙的联系命名这种感染蛙类的病毒^[2]。

基因组

MLeV病毒于2018年由美国国家生物技术资讯中心（NCBI）公开的转录组霰弹枪序列组装（英语：transcriptome shotgun assembly） (transcriptome shotgun assembly) 与表现序列标签（英语：expressed sequence tag）数据库中经BLAST比对发现，为感染小雨蛙的病毒。测得的序列约长22300nt，不过其5端编码5′ UTR与复制酶前三个蛋白（nsp1、nsp2与nsp3）约1500–4000nt的序列佚失^[2]。

MLeV病毒的基因组与冠状病毒相似，5端具有编码复制酶的开放阅读框ORF1a与ORF1b，且中间亦有冠状病毒基因组中典型、造成-1核糖体移码的序列。ORF1b的下游还有六个开放阅读框，包括与刺突蛋白（S）、外膜蛋白（E）、膜蛋白（M）与衣壳蛋白（N）四种冠状病毒结构蛋白相似的蛋白，另外在S与E之间另有两个开放阅读框ORF2b与ORF3编码辅助蛋白，S与M的起始密码子皆和上游基因的终止密码子重叠，显示此病毒基因组中基因的排列相当紧密。有五个开放阅读框带有冠状病毒典型的转录调控序列（transcription regulatory sequence）^[2]。

分类

最初发表MLeV病毒的论文中，序列分析的结果显示MLeV病毒为所有其他冠状病毒（冠状病毒亚科）的姊妹群^[2]^[3]。2018年10月，国际病毒分类委员会（ICTV）认定MLeV病毒属于冠状病毒科下的一个新亚科勒托病毒亚科Letovirinae^[4]。

2019年，有研究人员在加拿大温哥华岛沿岸钩吻鲑属的鲑鱼中发现了网巢病毒目的一新型病毒，并将其命名为太平洋鲑鱼网巢病毒（Pacific salmon nidovirus、PsNV）。此病毒多感染鲑鱼的鳃，序列分析显示此病毒与MLeV病毒的关系接近，互为姊妹群，而两者组成的演化支为冠状病毒亚科的姊妹群^[5]。

参考文献

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^ Shi, Mang; Lin, Xian-Dan; Chen, Xiao; Tian, Jun-Hua; Chen, Liang-Jun; Li, Kun; Wang, Wen; Eden, John-Sebastian; Shen, Jin-Jin; Liu, Li; Holmes, Edward C.; Zhang, Yong-Zhen. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature. 2018, 556 (7700): 197–202. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/s41586-018-0012-7.
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[5] Gideon J Mordecai, Kristina M Miller, Emiliano Di Cicco, Angela D Schulze, Karia H Kaukinen, Tobi J Ming, Shaorong Li, Amy Tabata, Amy Teffer, David A Patterson, Hugh W Ferguson, Curtis A Suttle. Endangered wild salmon infected by newly discovered viruses (PDF). eLIFE. 2019, 8: e47615 [2020-03-31]. doi:10.7554/eLife.47615.001. （原始内容存档 (PDF)于2021-02-10）.

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