歐洲生物資訊研究所

歐洲生物資訊研究所(EMBL-EBI,全稱EMBL - European Bioinformatics Institute),是一個政府間國際組織的學術機構,致力於以資訊學手段解答生命科學問題。該所建立於1994年,位於英國劍橋南部的維康信託基因園,是歐洲分子生物學實驗室(EMBL,全稱European Molecular Biology Laboratory)的一部分。

歐洲生物資訊研究所 (EBI)
簡稱EMBL-EBI
成立時間1992[1]
創始人Michael Ashburner[*]
總部劍橋 編輯維基數據
地址
坐標52.079889, 0.186356
Director
Ewan Birney
Director
Rolf Apweiler
上級組織
歐洲分子生物學實驗室
員工數570[2]
網站www.ebi.ac.uk
歐洲生物資訊研究所

歐洲生物資訊研究所為科學界提供免費生物資訊資源、促進基礎研究、提供培訓和傳播行業尖端技術。歐洲生物資訊研究所管理和維護着多個大型生物資訊公共數據庫, 跨基因組學,蛋白質組學,化學資訊學,轉錄組學,系統生物學等,同時創建了多種工具供讓研究人員分析和分享資訊。歐洲生物資訊研究所提供最優質的研究環境、無數跨學科的合作機會以及遍及世界各地的培訓課程。

主要任務

  1. 為科學界建立和維護生物學數據庫, 提供免費的數據和生物資訊服務, 支持生物學數據的存儲和挖掘,促進科技進步;
  2. 通過生物資訊學的基礎研究繼續推動生物學發展;
  3. 為各個層次的科學工作者提供生物資訊學培訓;
  4. 支持幫助邊緣尖端科技成果向工業界的轉化;
  5. 協調歐洲生物數據的提供。

主要服務

歐洲生物資訊研究所擁有超過20年生物資訊學研究和服務經驗,是全球收集和傳播生物數據、提供免費生物資訊服務的歐洲節點。該所管理維護着世界最全面的分子生物數據庫,其中很多是生物學家熟悉的數據庫,例如核酸序列數據庫(ENA),基因組基因表達數據UniProt蛋白質數據庫,InterPro(蛋白質家族/域/蛋白指紋等)和PDBe(大分子結構)。ENA由原EMBL-Bank核酸序列數據庫基礎上發展起來,是歐洲最重要的核酸序列資源,與美國NCBIGenBank和日本的日本DNA數據庫(DDBJ)組成國際核酸序列數據庫合作聯盟(INSDC)。這三大數據庫各自收錄了世界上所報道的所有序列數據的一部分,並且每天實時更新交換各自的序列資訊。

歐洲生物資訊研究新的數據資源包括蛋白質相互作用(IntAct),反應途徑(Reactome)、小分子(ChEBI)等等,能幫助研究人員了解構建一個有機體的分子部分,以及這些部件如何結合起來建立系統。其它還包含文獻數據庫、專利數據資源、BioModels DatabaseGene Ontology等等。每個數據庫的細節有所不同,但都堅持相同的服務原則。

歐洲生物資訊研究所向全球提供免費的生物資訊服務,發展和維護着多種用於瀏覽、檢索、分析處理生物數據的工具服務。數據獲取工具SRS(序列檢索系統)為用戶提供了快速、便捷和友好的界面以搜索超過200個局域和公眾數據庫中大量不同種類的生命科學類數據。序列數據搜索包括FASTA、 NCBI BLAST和WU-BLAST序列同源性和相似性對比工具。其它還包括蛋白功能分析,序列多重排比,進化樹分析,大分子結構分析與多維顯示等。

研究興趣

歐洲生物資訊研究所為生物資訊學提供了一個優質而獨特的研究環境。該所研究興趣廣泛,研究與服務相輔相成。作為一個EMBL不可分割的一部分, 歐洲生物資訊研究所是EMBL的活躍研究成員。研究小組旨在通過研究開發新方法來解釋闡述生物數據,了解其生物學的意義。服務隊伍在維護和加強現有數據資源的同時研究開發新的服務內容。

參閱

參考文獻

  1. ^ http://www.ebi.ac.uk/about/background頁面存檔備份,存於互聯網檔案館) Background
  2. ^ Jobs at EMBL-EBI. [20 June 2016]. (原始內容存檔於2016-11-11). 

外部連結