東南大學交通學院隸屬於2009年設立的東南大學土建交通學部[1]。
2000年4月,原東南大學、南京鐵道醫學院、南京交通高等專科學校合併,南京地質學校併入,組建了新的東南大學。[2]相關院系組建了東南大學交通學院。
交通學院目前設置了交通工程、道路橋樑與渡河工程、交通運輸、測繪工程、港口航道與海岸工程、地理信息系統、城市地下空間工程七個本科專業。