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19世紀50年代患小兒麻痹症的孩子們接受治療

病毒社會史講述了病毒及其感染對人類歷史的影響。大約在 12000 年前的新石器時代，人類的行為出現轉變。農業的發展使得人口變得更加密集，因此，由病毒引起的流行病爆發了。密集的人口使得病毒迅速傳播並成為地方性流行病。 與此同時，與牲畜和植物相關的病毒也在增加。因為人類越來越依賴農業和畜牧業，馬鈴薯病毒和牛瘟等造成了災難性的後果。

天花和麻疹是最早感染人類的病毒之一。這些病毒從感染其他動物的病毒進化而來，數千年前首次出現在歐洲和北非的人類身上。這些病毒後來在西班牙征服美洲時期被歐洲人帶到了新大陸，但當地人民對病毒並沒有天然的抵抗力，成千上萬的人在流行病期間死亡。 自 1580 年以來，就有傳染性流感大範圍爆發的記錄，並且在隨後的幾個世紀中爆發頻率越來越高。 1918-19 年的大流行病在不到一年的時間內造成四五千萬人死亡，是歷史上最具毀滅性的大流行病之一。

路易·巴斯德和愛德華·詹納是通過研發疫苗來預防病毒感染的先驅。19世紀30年代電子顯微鏡發明後，人們了解了病毒的性質，病毒學也得以迅猛發展。20世紀，人們發現以前和現在的許多疾病都是由病毒引起的。19世紀50年代疫苗研發後，小兒麻痹症才得以控制。 愛滋病毒是幾個世紀以來出現的最具致病性的新病毒之一。雖然是那些由病毒引起的疾病讓科學家們對病毒產生了興趣，但大多數病毒還是有益的。病毒能夠通過在物種間水平轉移基因（將遺傳物質傳遞給其他細胞而非其子代）來推動進化，在生態系統中發揮重要作用，對生命也是至關重要的。

史前時期

在過去五萬至十萬年來，人類數量不斷增加，並分散在世界各地，新的傳染病出現了，包括由病毒引起的疾病。[1]早年間，人類生活在狹小、孤立的區域中，大多數流行病並不存在。[2][3]天花是歷史上最致命和最具毀滅性的傳染病，大約11000 年前首次出現在印度的農業社區。[4]這種只感染人類的病毒可能源於齧齒動物的痘病毒。[5]人類很可能是接觸到了這些齧齒動物，其中一些人感染了其攜帶的病毒。當病毒越過了這種所謂的「物種屏障」時，影響可能會很嚴重，[6]而人類卻幾乎沒有與之對應的免疫系統。當時的人們生活在小團體中，感染病毒的人或死亡，或對其產生免疫力。這種後天形成的免疫系統只能通過母乳中的抗體和母親血液流經的胎盤傳給未出生的嬰兒這兩種方式，暫時傳給後代，因此，每一代都可能發生傳染病的零星爆發。大約公元前9000 年，許多人陸續在尼羅河肥沃的沖積平原上定居，由於人口變得足夠密集，易感人群高度集中，病毒得以持續存在。[7]流行性腮腺炎、風疹和小兒麻痹症以及其他需人群密集所致的病毒性疾病，也是在這個時候首次出現的。[8]

新石器時代始於約公元前9500 年的中東，這個時期，人們開始從事農業。 [9]這場農業革命發展了單一耕作的方式，為多種植物病毒的快速傳播提供了機會。[10] 南方豆花葉病毒的分化和傳播可追溯到這一時期。 [11]影響馬鈴薯以及其他水果蔬菜的馬鈴薯病毒的傳播始於大約 6600年前。 [10]

約10000 多年前，居住在地中海盆地周圍的人類開始馴養野生動物，圈養了豬、牛、山羊、綿羊、馬、駱駝、貓和狗。 [12]這些動物隨身攜帶病毒。 [13]病毒可能會從動物傳播給人類，但這種人畜共患感染很少見，動物病毒在人與人之間的傳播更為罕見，但流感是例外。大多數病毒都具有物種特異性，不會對人類構成威脅。 [14]由動物病毒性疾病引起的罕見流行病不會持續很長時間，因為病毒沒有完全適應人類[15]並且，人口太少無法維持感染鏈。 [16]

其他更古老的病毒威脅更小。 8000 萬多年前，人類的祖先首次感染了疱疹病毒。 [17]人類因此對這些病毒產生了耐受性，並且大多數人已至少感染過其中一種病毒。 [18]這些較輕微的病毒感染的記錄很少，但早期人類很可能像今天的人類一樣遭受由病毒引起的感冒、流感和腹瀉。歷史記載的則是近年來由進化後病毒引起的流行病和瘟疫。  [17]

古代

 
人們認為埃及石碑描繪了埃及第十八王朝（公元前 1580-1350年）一個患有小兒麻痹症的人。

據病毒感染記載，人們認為有一塊埃及石碑描繪了一位來自埃及第十八王朝（公元前 1580-1350 年）的埃及牧師，他因感染小兒麻痹病毒出現足下垂畸形。 [19]西普塔（埃及第十九王朝的統治者）的木乃伊有患小兒麻痹症的跡象，而埋葬在 3000 多年前的拉美西斯五世和其他埃及木乃伊有患天花的跡象。 [20] [21]公元前430年，天花病毒流行於雅典，四分之一的雅典軍隊和城內許多平民死於感染此病毒。 [22]公元 165 年至 180 年的安東尼瘟疫，可能是天花大流行，致使羅馬帝國大約 500 萬人死亡，其中包括現在的英國、歐洲、中東和北非。 [23]羅馬士兵因被派往鎮壓現在伊拉克的起義，掠奪了底格里斯河上的塞琉西亞市，受到此病毒感染，這是大流行的開端。羅馬士兵之後將這種疾病帶回了羅馬和歐洲，導致那裏每天有多達 5,000 人感染死亡。疫情最嚴重時波及印度和中國。 [24]

麻疹是一種古老的疾病，但直到 10 世紀，波斯醫生穆罕默德·伊本·扎卡里亞·拉齊（ 865–925 年）才首次發現它。 [25] 拉齊使用阿拉伯語名稱hasbah (íب٩) 來命名麻疹。麻疹還有許多其他名稱，包括來自拉丁語 rubeus（「紅色」）的 rubeola 和 morbilli（「小瘟疫」）。 [26]麻疹病毒、犬瘟熱病毒和牛瘟病毒之間的密切相似性引起了人們的猜測，即麻疹最初是從家養的狗或牛傳染給人類的。 [27]到 12 世紀，麻疹病毒似乎已經完全不同於當時廣泛傳播的牛瘟病毒。 [28]

感染一次麻疹即可獲得終生免疫力。因此，病毒需要很高的人口密度才能成為流行病，而這在新石器時代可能沒有形成。 [25]該病毒在中東出現後，於公元前 2500 年傳播到印度。 [29]當時麻疹在兒童中很常見，因此人們沒把麻疹當作一種疾病。在埃及象形文字中，麻疹被視為人類發展的正常階段。 [30]日本孝謙天皇 （718-770 年）寫的一首詩中有關於感染病毒的植物的最早描述，她在詩中描述了一種夏天葉子變黃的植物。這種植物後來被鑑定為紫莖澤蘭，易感染番茄黃曲葉病毒。 [31]

中世紀

 
中世紀的木刻畫，描繪的是患狂犬病的狗

歐洲人口的快速增長和城鎮人口的日益集中導致了許多傳染病，其中最臭名昭著的可能是黑死病 ——一種細菌感染 。 [32]除了天花和流感，現在有記錄的由病毒引起的感染爆發很少見。狂犬病是一種已發現了4000多年的疾病， [33]流行於歐洲，直到 1886 年路易·巴斯德研製出疫苗才得以抑制該病。 [34]中世紀歐洲人的平均預期壽命為35歲 ; 60% 的兒童在 16 歲之前死亡，其中許多人在六歲前死亡。醫生——為數不多的醫生——既依賴他們有限的醫學知識，也依賴占星術。治療感染的方法包括一種由刺蝟脂肪烤過的貓製成的藥膏。 [35]導致兒童死亡的眾多疾病包括麻疹、流感和天花。 [36]由於十字軍東征和穆斯林征服促進了天花的傳播，天花在五至七世紀傳入歐洲大陸後，在歐洲盛行。 [37] [38]

麻疹在歐洲、北非和中東人口稠密的國家流行。 [39]英格蘭在13世紀首次提及了當時被稱為「mezils」的這種病毒 ，可能存在於526年至1087年之間的49場瘟疫之一。 [29]牛瘟是由一種與麻疹病毒密切相關的病毒引起的，是自羅馬時代以來已知的一種牛疾病。 [40]這種疾病起源於亞洲，於公元 370 年由入侵的匈奴人首次傳入歐洲。 後來，1222 年、1233 年和 1238 年，成吉思汗及其軍隊率領蒙古人入侵，在歐洲引發了流行病。隨後，英國從歐洲大陸進口牛，病毒傳播到了英國。 [41]當時牛瘟是一種毀滅性的疾病，死亡率高達 80-90%。牲畜的大量死亡進一步導致了饑荒。 [41]

近代早期到近代晚期

1485 年 8 月 22 日，亨利都鐸在博斯沃思戰役中獲勝後不久，他的軍隊突然因「英國汗熱病」倒下，當代觀察家將其描述為一種新疾病。 [42]不同的是，這種疾病主要影響富人，可能起源於亨利七世在法國為軍隊徵募士兵。 [43] 1508 年炎熱的夏天，倫敦經歷了一場流行病。感染者在一天之內死亡，整個城市處處都有人死亡。除了運送屍體的手推車外，街道上空無一人，亨利國王宣佈除醫生和藥劑師外，禁止他人進入倫敦。 [44]這種疾病在1529年7月傳到了歐洲的漢堡，在最初的幾周內就有一到兩千人死亡。 [45]在接下來的幾個月里，普魯士、瑞士和北歐因病毒受到重創。 [46]最近一次爆發是在 1556 年的英國。 [47]這種導致數萬人死亡的疾病可能是流感[48]或類似的病毒感染， [49]但當時醫學還不是一門科學，記錄並不可靠。 [50]隨着醫學成為一門科學，對疾病的描述不那麼模糊了。 [51]當時醫學對減輕感染者的痛苦收效甚微，政府還採取了其他控制疾病傳播的措施。其中包括實施貿易和旅行限制，感染家庭與社區隔離，熏蒸建築物，宰殺牲畜等。 [52]

關於流感感染的記載可追溯至 15 世紀末和 16 世紀初， [53]但幾乎可以肯定，感染發生的時間早於此。 [54] 1173 年，可能是歐洲首次出現流行病，而在 1493 年，伊斯帕尼奧拉島的印第安人經歷了一場現在被認為是豬流感的流行病爆發。有證據表明感染源是哥倫布船上的豬。 [55]在 1557 年至 1559 年英格蘭爆發流感期間，5% 的人口（約 15萬人）死於感染。死亡率幾乎是 1918-19 年流感的五倍。 [47]第一次有可靠記錄的大流行始於1580年7月，席捲了歐洲、非洲和亞洲。 [56]死亡率很高 – 羅馬死亡人數達8000人。 [57]接下來的三場流行病都發生在 18  世紀，1781-82 年間，這可能是歷史上最具災難性的流行病。 [58]這次流行病於1781年11月從中國開始，12月傳播至莫斯科。 [57] 1782 年 2 月，大流感襲擊了聖彼得堡，5 月傳染到了丹麥。 [59]六周內，就有75% 的英國人被感染，大流感很快蔓延到美洲。 [60]

 
十六世紀阿茲特克人患天花（上）和麻疹（下）的圖畫
 

在15至18世紀歐洲殖民者到來之前，美洲和澳大利亞一直沒有麻疹和天花。[1] 天花與麻疹和流感一起被西班牙人帶到了美洲。[1] 天花由摩爾人從非洲引入，在西班牙流行。 [61] 1519年，墨西哥的阿茲特克首都特諾奇蒂特蘭爆發天花疫情。這是由潘菲洛·德·納爾瓦埃斯的軍隊引起的，他跟隨埃爾南·科爾特斯從古巴出發，船上有一個患天花的非洲奴隸。 [61]當西班牙人在1521年夏天最終進入首都時，他們看到首都到處是天花患者的屍體。 [62]這次流行病，以及隨後在1545-1548年和1576-1581年期間發生的流行病，最終殺死了一半以上的西班牙本地人。 [63]大多數西班牙人都有免疫力；他的軍隊只有不到900人，如果沒有天花的幫助，科爾特斯就不可能打敗阿茲特克人並征服墨西哥。[64]許多美洲原住民後來因歐洲人無意中傳播的疾病而遭受重創。[1]在哥倫布1492年抵達後的150年裏，北美原住民人口因麻疹、天花和流感等疾病減少了80%。 [65] [66]這些病毒造成的損害極大地幫助了歐洲人取代和征服原住民的企圖。 [67] [68]

到18世紀，天花在歐洲流行起來。1719年至1746年間，倫敦發生了五次流行病，歐洲其他主要城市也發生了大規模爆發。到該世紀末，每年約有40萬歐洲人死於該疾病。[69]1713年，該疾病由船隻從印度攜帶到南非，並於 1789 年感染澳大利亞。 [69]在 19 世紀，天花成為澳大利亞原住民最重要的單一死因。 [70]

1546 年，吉羅拉莫·弗拉卡斯托羅 （1478-1553 年）（1478-1553）寫了一篇關於麻疹的經典描述。他認為這種疾病是由「種子」（seminaria）引起的，這些種子在人與人之間傳播。托馬斯·西德納姆（1624-1689年）記錄了 1670 年倫敦發生的一場流行病，他認為這是由於從地球上噴出的有毒氣體造成的。 [29]雖然他的理論是錯誤的，但他是一個熟練的觀察者，做了細緻的記錄。 [71]

黃熱病是一種由黃病毒引起的致命疾病。該病毒通過蚊子（埃及伊蚊）傳播給人類，並首次出現在 3,000 多年前。 [72] 1647年，第一次有記錄的黃熱病流行發生在巴巴多斯島，當時擔任該島總督的約翰·溫思羅普稱之為 "巴巴多斯瘟疫"。他通過了檢疫法來保護人民——北美有史以來第一部這樣的法律。[73]17、18和19世紀，該疾病在北美進一步流行。 [74]1779年，印度尼西亞和埃及出現了第一批已知的登革熱病例。貿易船把這種疾病帶到了美國，1780年費城發生了流行病。 [75]

新發傳染病（EID）已經對人類健康構成了越來越大的威脅。它們大多數是人畜共患的， [76]其中人口增加和畜牧業集約化以及野生動物環境的強化是其部分致病原因。 [77] [78]

 
安布羅修斯·博斯查特（1573-1620）《靜物》

在歐洲的博物館中可以找到許多描繪帶有迷人彩色條紋的鬱金香的畫作。大多數，例如約翰內斯·博斯哈特的靜物研究，都是在 17 世紀繪製的。這些花特別受歡迎，受到買得起的人的追捧。在17世紀30年代鬱金香狂熱的頂峰時期，一株鬱金香的價格可能相當於一座房子。 [79]當時人們並不知道這些條紋是由一種植物病毒引起的，這種病毒被稱為鬱金香破壞病毒，是人類不小心從茉莉花中轉移到鬱金香上的。 [80]由於病毒的削弱，這些植物變成了一種糟糕的投資。只有少數球莖開出的花朵具有其母株的迷人特徵。 [81]

在 1845 年至 1852 年的愛爾蘭大饑荒之前，導致馬鈴薯發病的最常見原因不是導致枯萎病的黴菌，而是一種病毒。這種稱為「捲曲」的疾病是由馬鈴薯卷葉病毒引起的，1770年代在英國廣泛流行，它摧毀了那裏75%的馬鈴薯作物。當時，愛爾蘭的馬鈴薯作物相對沒有受到影響。 [82]

接種疫苗的發現

 
愛德華·詹納

天花

瑪麗·沃特利·蒙塔古夫人（1689-1762 年）是一位貴族、作家和一位國會議員的妻子。1716年，她的丈夫愛德華·沃特利·蒙塔古被任命為英國駐伊斯坦布爾大使。她跟隨他到了那裏，並在抵達兩周後發現了當地通過接種人痘來預防天花的做法——將天花患者的膿液注射到皮膚中。 [7]她的弟弟死於天花，她也得過這種病。她決心讓她五歲的兒子愛德華免於遭受同樣的痛苦，於是她命令大使館的外科醫生查爾斯·梅特蘭為他接種疫苗。回到倫敦後，她要求梅特蘭當着國王醫生的面給她四歲的女兒接種疫苗。 [83]後來，蒙塔古說服威爾斯親王和王妃贊助該程序的公開演示。六名被判處死刑並在紐蓋特監獄等待處決的囚犯獲得了完全赦免，作為公開實驗的對象。他們接受了這一建議，並在1721年被接種了人痘，所有囚犯都從手術中康復。 [84]為了測試其保護作用，其中一名19歲的婦女被命令與一名10歲的天花患者同床共枕6周。她沒有感染這種疾病。 [85]

這個實驗在11個孤兒身上重複進行，他們都經受住了考驗，到1722年，甚至連喬治一世國王的孫輩都接種了疫苗。 [86]這種做法並不完全安全，有五十分之一的死亡幾率。 [87]這個過程很昂貴；一些醫生收取5到10英鎊的費用，有些醫生以50到100英鎊的費用向其他醫生出售這種方法，或者收取一半的利潤。人痘接種成為一種有利可圖的特許經營方式，但直到18世紀70年代末，它仍然超出了許多人的能力範圍。[88]當時人們對病毒或免疫系統一無所知，沒有人知道該程序如何提供保護。 [89]

 
1802年的一幅漫畫，描繪了詹納接種疫苗的情景——接受者身體上出現了牛的外貌。

愛德華·詹納（1749-1823年）是英國的一名鄉村醫生，他在小時候曾患過人痘。[90]他遭受了巨大的磨難，但卻完全沒有受到天花的影響。[91]詹納知道當地有一種說法，即感染了一種叫做牛痘的相對溫和的傳染病的乳品工人對天花有免疫力。他決定檢驗這一理論（儘管他可能不是第一個這樣做的人）。 [92] 1796年5月14日，他選擇了「一個健康的男孩，大約8歲，用於接種牛痘」。 [93]這個男孩，詹姆斯·菲普斯（James Phipps，1788-1853 年）在牛痘病毒的實驗性接種中倖存下來，只出現了輕微的發燒。 1796 年 7 月 1 日，詹納取了一些「天花物質」（可能是受感染的膿液）反覆給菲普斯的手臂接種。菲普斯活了下來，隨後被接種了20多次天花，但沒有感染於這種疾病。疫苗接種——這個詞來自拉丁文vacca，意思是「牛」——被發明了。 [94]詹納的方法很快被證明比接種人痘更安全，到1801年，已有10萬多人接種了疫苗 [95]

儘管遭到那些仍在進行接種人痘疫苗的醫生的反對，並預見到他們的收入會減少，但英國還是在1840年對窮人實行了免費的疫苗接種。由於相關死亡，接種人痘疫苗在同年被宣佈為非法。 [95]1853年的《疫苗接種法》規定，在英格蘭和威爾斯強制接種疫苗，如果他們的孩子在三個月大之前沒有接種疫苗，家長將被罰款1英鎊。這項法律沒有得到充分執行，提供疫苗接種的系統自 1840 年以來一直沒有改變，效率低下。 [96]強制疫苗接種並不受歡迎，在抗議之後，1866年成立了反疫苗接種聯盟和反強制疫苗接種聯盟。 [97] [98]在反疫苗接種運動之後，1895年格洛斯特爆發了嚴重的天花，這是該市20年來的第一次；434人死亡，包括281名兒童。 [99]儘管如此，英國政府還是向抗議者做出了讓步，1898年的《疫苗接種法》取消了罰款，並為不相信疫苗接種的父母制定了「良心反對者」條款——這是第一次使用這個詞。在接下來的一年裏，有25萬名反對者被批准，到1912年，只有不到一半的新生兒接種疫苗。 [100]到 1948 年，英國不再強制接種天花疫苗。 [101]

狂犬病

 
路易斯·巴斯德

狂犬病是由哺乳動物感染狂犬病病毒引起的一種致命的疾病。在21世紀，它是主要影響是導致狐狸和蝙蝠等野生哺乳動物感染疾病，但它是已知的最古老的病毒性疾病之一：狂犬病是一個可以追溯到公元前3000年的梵語單詞（rabhas）， [34]意思是「瘋狂」或「憤怒」， [30]而這種疾病已經有4000多年的歷史。 [33]關於狂犬病的描述可以在美索不達米亞的文本中找到， [102]而古希臘人稱其為 「lyssa」或「lytta」，意思是「瘋狂」。 [33]在公元前2300年的《埃什努納法法》中可以找到關於狂犬病的記載。 亞里士多德（公元前384-322年）寫了關於這種疾病以及它如何傳給人類的最早的無可爭議的描述之一。 公元一世紀的塞爾蘇斯首次記錄了被稱為恐水症的症狀，並認為受感染的動物和人類的唾液中含有一種粘液或毒藥——為了描述這一點，他發明了「病毒」一詞。 [33]狂犬病不會引起流行病，但由於其可怕的症狀，包括精神錯亂、恐水症和死亡，人們對這種感染非常恐懼。 [33]

在路易斯·巴斯德（1822-1895）時期的法國時代，法國每年只有幾百例狂犬病感染病例，但人們迫切希望找到治癒方法。意識到可能存在的危險，巴斯德開始在瘋狗身上尋找「微生物」。 [103]巴斯德表明，當把死於狂犬病的狗的干脊髓壓碎並注射到健康狗身上時，它們不會被感染。他他用乾燥時間越來越短的組織在同一隻狗身上重複了幾次實驗，直到注射了感染狂犬病的新鮮脊柱組織後，這隻狗仍然存活。巴斯德對這隻狗進行了狂犬病免疫，正如他後來對另外50隻狗所做的那樣。 [104]

 
一幅 1826 年的卡通畫，描繪了一隻在倫敦街頭的瘋狗

儘管巴斯德對他的方法如何運作知之甚少，但他還是在一個名叫約瑟夫·邁斯特（1876-1940）的男孩身上做了試驗，這個男孩於1885年7月6日被他母親帶到巴斯德那裏。他被一隻瘋狗咬了一口，渾身是傷。邁斯特的母親懇求巴斯德幫助她的兒子。巴斯德是一名科學家，而不是一名醫生，他很清楚如果事情出了差錯會給他帶來什麼後果。儘管如此，他還是決定幫助這個男孩，並在接下來的10天裏給他注射了毒性越來越強的狂犬病兔脊髓組織。 [105]後來巴斯德寫道：「由於這個孩子的死亡似乎不可避免，我決定在約瑟夫·邁斯特身上試一試這個在狗身上一直有效的程序......」 [106]邁斯特康復了，並於7月27日和他母親回家。同年10月，巴斯德成功地治療了第二個男孩；讓·巴蒂斯特·朱皮耶（1869-1923）是一個15歲的牧羊男孩，他在試圖保護其他孩子不被瘋狗咬傷時被嚴重咬傷。 巴斯德的治療方法一直沿用了50多年。 [107]巴斯德的治療方法沿用了 50 多年。 [108]

直到1903年，阿德爾奇·內格里（1876-1912）首次在狂犬病動物的大腦中看到微小的病變——現在稱為內格里體，人們對狂犬病的病因知之甚少。 [109]他錯誤地認為它們是原生動物寄生蟲。保羅·雷姆林格（1871-1964）很快通過過濾實驗表明，它們比原生動物小得多，甚至比細菌還要小。30年後，內格里體被證明是100-150納米長的顆粒堆積物，現在已知是彈狀病毒顆粒的大小，這就是導致狂犬病的病毒。 [33]

20世紀和21世紀

在20世紀之交，人們通過過濾器實驗證實了病毒的存在，，這些過濾器的孔隙太小，細菌無法通過；因此得名「濾過性病毒」。 [110]直到20世紀30年代，大多數科學家認為病毒是小型細菌，但在1931年發明電子顯微鏡之後，證明了兩者是完全不同的，因此並非所有科學家都相信它們不是有毒蛋白質的堆積物。 [111]當人們發現病毒含有DNA或RNA形式的遺傳物質時，情況發生了根本性的變化。[112]一旦將它們確認為獨特的生物實體，很快就會發現它們是許多植物、動物甚至細菌感染的原因。 [113]

20世紀發現了許多由病毒引起的人類疾病，其中有一種疾病已經被根除，那就是天花。事實證明，由愛滋病毒和流感病毒等引起的疾病更難控制。[114]其他疾病，如由蟲媒病毒引起的疾病，為人類帶來了新的挑戰。

[115]

人類在歷史上改變了行為，病毒也是如此。在古代，人類人口太少，不可能發生大流行病，就某些病毒而言，人口太少也不可能生存。在20世紀和21世紀，不斷增加的人口密度、農業和耕作方法的革命性變化以及高速旅行都促成了新病毒的傳播和舊病毒的重新出現。 [116] [117]像天花一樣，人類可以征服一些病毒性疾病，但新的疾病，如嚴重急性呼吸系統綜合症（SARS）仍在繼續出現。 [118]儘管疫苗仍然是對付病毒的最有力的武器，但近幾十年來，人們已經開發出抗病毒藥物，專門針對病毒在宿主體內複製的情況。 [119] 2009年的大流感表明，儘管努力遏制病毒，但新的病毒菌株繼續在世界各地迅速蔓延。[120]

人類在病毒的發現和控制方面持續取得進展。人類偏肺病毒，可能引發呼吸道感染，比如於2001年發現的肺炎。[121] 在2002年到2006年期間，針對導致宮頸癌的乳頭瘤病毒研發了一種疫苗。 [122] 1222005年發現了人類T淋巴瘤病毒3和4。 [123]2008年世衛組織重新啟動了全球根除脊髓灰質炎計劃，計劃在2015年前根除脊髓灰質炎。[124] 2010年發現最大的病毒智利巨型病毒感染了阿米巴蟲。[125]巨型病毒重新引起了人們對研究病毒在進化中所扮演的角色以及它們在生命樹中的地位的興趣。 [126]

消滅天花

主條目：AIDS
 
拉希馬 巴努是一位來自孟加拉的女生，她於1975年成為已知最後一位感染天花的病人。現已痊癒。 [127]

天花病毒是20世紀的主要死因，大約有3億人因此死亡。[128]它可能比其他任何病毒殺死的人都要多。[128]它殺死的人類可能比任何其他病毒都多。 [129] 1966年世界衛生大會（世衛組織的決策機構）達成了一項協議，開始實施加強版天花根除計劃，嘗試在十年內根除這一疾病。 [130]當時天花仍在31個國家[131]流行，包括巴西、整個印度次大陸、印度尼西亞和撒哈拉以南非洲。 [130]人們相信這一雄心勃勃的目標可以實現，因為疫苗提供了特殊的保護；病毒類型只有一種；沒有自然攜帶病毒的動物；已知感染的潛伏期，12天內很少有變化；症狀明顯，易發現感染人群。[132] [133]

在大規模接種疫苗之後，疾病的檢測和遏制是根除天花的核心。一旦發現病例，就會將其隔離，密切接觸者也會進行隔離，他們都接種了疫苗。 [134]這一計劃很快就看到了成果，到1970年，天花不再在非洲西部流行，到1872年，也不再在巴西流行。 [135]到1973年，天花只在印度次大陸、博茨瓦納和埃塞俄比亞保持流行。[131]最後，經過13年在全世界範圍內協調的病毒監測和疫苗接種運動，世界衛生組織於1979年宣佈已根除天花。 [136]儘管將痘苗病毒用作疫苗，但似乎沒有人知道痘苗病毒到底來自哪裏；它不是愛德華詹納使用的牛痘菌株，也不是天花的弱化形式。 [137]

根除運動導致了珍妮特 帕克（約1938-1978年）的死亡，以及隨後天花專家亨利 貝德森（1930-1978年）的自殺。帕克就職於伯明翰大學，她與貝德森的天花實驗室在同一棟樓里工作。她感染了貝德森團隊一直在研究的一株天花病毒。貝德森對這次事故感到羞愧自責，於是自殺了。 [138]

在美國2001年911事件之前，世界衛生組織建議銷毀保存在美國和俄羅斯實驗室中的所有已知的剩餘天花病毒庫存。 [139]出於對使用天花病毒的生物恐怖主義的擔心，以及在開發治療感染的藥物時可能需要這種病毒，這一計劃最終被終止。 [140]如果銷毀工作繼續進行，天花病毒可能是第一個因人類干預而滅絕的病毒。 [141]

麻疹

主條目：Influenza

十九世紀初，在南非，麻疹雖然致命，但是卻十分罕見，但從1950年代起，逐漸開始流行起來。在第二次布爾戰爭期間（1899-1902年），麻疹在英國集中營的囚犯中盛行，並造成數千人死亡。集中營中麻疹的死亡率比英軍傷亡人員的死亡率高十倍。 [142]

在20世紀60年代美國引入疫苗接種之前，每年有超過50萬病例，導致了約400人死亡。在發達國家，主要是3至5歲的兒童易感染，但在發展中國家，一半的兒童在2歲之前就會感染。 [143]在美國和英國，該疾病每年或每兩年定期流行，這取決於每年出生的兒童數量。[144]目前的流行菌株是在20世紀上半葉演變而來的,可能是在1908至1943年間。 [145]

 
1940年至2007年，英格蘭和威爾斯報告的麻疹病例顯示從每年400,000例下降到不到1000例。

1950年至1968年期間，倫敦每兩年就有一次流行病，但在出生率較高的利物浦，每年都有一次流行病的周期。在第二次世界大戰前的美國大蕭條期間，出生率很低，麻疹的流行是零星的。戰後，出生率上升，每兩年定期發生流行病。在出生率非常高的發展中國家，每年都有流行病發生。 [144]在人口稠密、出生率高、缺乏有效疫苗接種運動的欠發達國家，麻疹仍是一個主要問題。[146]

到 20 世紀 70 年代中期，在被稱為「讓麻疹成為記憶」的大規模疫苗接種計劃之後，美國的麻疹發病率下降了 90%。 [147]在過去的50年裏，其他國家的類似疫苗接種運動使感染水平降低了99%。 [148]易感者仍然是感染源，包括那些從疫苗接種計劃無效的國家移民過來的人，或者拒絕接種疫苗或選擇不為其子女接種疫苗的人。 [149]人類是麻疹病毒的唯一自然宿主。 [147]感染後對疾病的免疫力是終生的；疫苗接種提供的效果是長期的，但最終會減弱。 [150]

是否使用疫苗曾引起爭議。1998年，安德魯 維克菲爾德和他的同事發表了一篇欺詐性的研究論文，他聲稱麻疹疫苗與自閉症有關。這項研究被廣泛報道，並引發了對疫苗接種安全性的擔憂。 [151]維克菲爾德的研究被認定為是欺詐性的，2010年，他被從英國醫學登記冊上除名，不能再在英國行醫。 [152]在這場爭論之後，英國的麻疹疫苗接種率從1995年的92%下降到2003年的不足80%。 [153]麻疹病例從1998年的56例上升到2008年的1370例，整個歐洲也出現了類似的增長。[152] 2013年4月，英國威爾斯爆發了一場麻疹疫情，主要感染的是未接種疫苗的青少年。[153]儘管存在這種爭議，但芬蘭、瑞典和古巴已經消除了麻疹。[154]日本在1992年取消了強制性疫苗接種，在1995-1997年，該國報告了20多萬個病例。 [155]在日本，麻疹仍然是公共健康問題，目前是地方性疾病；2007年12月制定了國家根除麻疹計劃，目的是在日本消除這一疾病。[156]自20世紀60年代引入疫苗以來，醫學文獻中關於全球消除麻疹的可能性一直存在爭議。如果目前根除脊髓灰質炎的運動獲得成功，很可能會重新進行討論。[157]

脊髓灰質炎

 
1960年羅得島州脊髓灰質炎流行期間，醫院工作人員正在檢查一名戴着罐式呼吸器「鐵肺」的病人。

在20世紀中期的夏天，美國和歐洲的父母害怕每年出現的脊髓灰質炎，它通常被稱為「小兒麻痹」。[158]這種疾病在本世紀初很罕見，全世界每年只有幾千個病例，但到了20世紀50年代，僅美國每年就有6萬個病例[159]，英格蘭和威爾斯平均有2300個病例。 [160]

1916年和1917年期間，美國發生了一次重大的流行病； 27,000個病例記錄在冊，其中包括6,000個死亡，其中紐約市有9,000個病例。[161]當時沒有人知道該病毒是如何傳播的。 [162]該市的許多居民，包括科學家，認為貧窮的貧民窟移民是罪魁禍首，儘管該疾病的流行率在史泰登島等較繁榮的地區較高,這種模式也曾在費城等城市出現過。 [163]許多其他工業化國家也同時受到影響。特別是在美國爆發之前，瑞典曾發生過大規模的流行病。[164]

20世紀脊髓灰質炎在工業化國家興起的原因一直沒有得到充分的解釋。這種疾病是由病毒引起的，在人與人之間通過糞口傳播途徑傳播， [165]並且只感染人類。 [166]在衛生條件改善和日益富裕的時代，這種疾病卻成為問題，這是一個悖論。[165]儘管在20世紀初就發現了該病毒，但直到20世紀50年代，才認識到它的普遍性。現在已經知道，被感染的人中只有不到2%會發展成這種疾病，而且大多數感染是溫和的。 [167]在流行病期間，病毒實際上無處不在，這就解釋了為什麼公共衛生官員無法隔離病毒源。 [166]

在1950年代中期開發出疫苗後，許多國家開展了大規模的疫苗接種運動。 [168]在美國，在出生缺陷基金會的推動下，每年小兒麻痹症的病例數量急劇下降；最後一次爆發是在1979年。 [169]1988年，世界衛生組織與其他組織一起發起了全球消除脊髓灰質炎倡議，到1994年，美洲徹底消除該疾病，隨後太平洋地區在2000年消除完畢，歐洲在2003年結束了該疾病。[170]在2012年底，世界衛生組織只報告了223例。主要是脊髓灰質炎病毒1型感染，122例發生在尼日利亞，1例在乍得，58例在巴基斯坦，37例在阿富汗。疫苗接種團隊經常面臨危險；2013年初，7名疫苗接種者在巴基斯坦遇害，9名在尼日利亞遇害。 [171]在巴基斯坦，該運動因2013年2月26日一名提供安全保障的警察遇害而進一步受阻。[172]

愛滋病

 
圖從左至右：非洲綠猴，猴免疫缺陷病毒的來源；白頸白眉猴，HIV-2 的來源；和黑猩猩，HIV-1的來源

人類免疫缺陷病毒 (HIV，愛滋病毒) 是病毒的一種，感染後未得到治療時，會導致愛滋病（即獲得性免疫缺陷綜合症,）。 [173]大多數病毒學家認為，愛滋病毒源於 20 世紀剛果民主共和國的金沙薩， [174] [175]當時感染該病毒人數超過7000萬。截至2011年，愛滋病成為史上最具破壞性的流行病之一[176]，大約有3500萬人死於愛滋病 [177] HIV-1是20世紀末出現的最主要的病毒之一。 [178] 1981年，一篇科學文章報道了五名年輕男同性戀者的死亡，但當時並沒有人知道他們死於愛滋病。由於這種病毒幾十年來一直潛在，其全貌至今不得而知。 [179]

20世紀初，愛滋病毒在非洲跨越了黑猩猩和人類之間的物種屏障。 [180]在隨後的幾年裏，非洲發生了巨大的社會變革和動盪。隨着大量人口從鄉下遷移到城市，前所未有的人口遷徙也同時將病毒從偏遠地區帶到了人口稠密的大都市。 [181]愛滋病的潛伏期約為10年，因此上面提到的愛滋病毒始於1980年代初是有跡可循的。 [182]當時，出現了很多替罪羊和污名化的現象。 [183]非洲人民並不接受所謂的愛滋病毒「源於非洲」的理論，他們認為這一指責是錯誤的。因此世界衛生大會在1987年通過了一項決議，其中指出愛滋病毒是「一種自然產生的病毒，其地理來源未定」。 [184]

愛滋病毒的流行給世界各地帶來了前所未有的挑戰，也為全世界帶來了一系列的社會變革。 [185]人們愈發公開討論「性」話題。關於性行為和藥物使用的建議也得到了許多政府及其醫護人員的支持，這些曾一度被視為禁忌話題。 [186]關於提供抗逆轉錄病毒藥物的倫理和成本問題的爭論，凸顯了醫療衛生方面的不平等，並激起了立法改革，這一影響在一些較為貧窮的國家尤為顯著。 [187]在發展中國家，愛滋病的影響非常廣泛，醫療、國防和民事服務等核心部門都受到了嚴重的影響。 [188]人類的預期壽命大幅度下降。比如，1991年，津巴布韋人民的預期壽命是79歲，但到2001年已降至39歲。 [189]

流行性感冒

 
1918 年，美國紅十字會的成員將一名西班牙流感患者從家中移走

在流感病毒發生基因轉變後，許多人對新毒株沒有免疫力。此時，當易感個體的數量高到足以維持感染鏈時，就會發生大流行病。基因變異通常發生在不同的毒株同時感染動物的情況下，特別是鳥類和豬類。儘管脊椎動物易感的許多病毒受限於一個物種，但流感病毒是個例外。 [190] 19世紀的最後一次大流行發生在1899年，導致歐洲25萬人死亡。這種病毒起源於俄羅斯或亞洲，是第一個通過火車和輪船上的人迅速傳播的病毒。 [191]

1918年出現了一種新的病毒株，隨後的西班牙流感是歷史上最嚴重的自然災害之一。 [191]這次疫情死亡慘重，全世界約有5000萬人因此喪命。 [192]其中，美國死亡人數達55萬人，是該國第一次世界大戰期間死亡人數的十倍， [193]英國有22萬8千人死亡。 [194]印度超2000萬人死亡，西薩摩亞有22%的人口喪生。 [195]雖然每年冬天都有流感病例發生，但在20世紀只有兩次大流行。 [196]

1957年，另一種新毒株的出現引起了亞洲流感大流行。儘管這種病毒的毒性低於1918年的毒株，但全世界仍有超過100萬人死亡。下一次大流行是1968年香港流感，這種新毒株取代了1957年的毒株。 [197] 這次的疫情以老年群體感染為主，並沒有以往那麼嚴重，但在美國仍有33800人死亡。 [198]流感病毒的新毒株通常源自東亞；而中國農村，鴨、豬和人的密集程度是世界上最高的。 [199]

最近一次的大流行發生在2009年，但近三次都沒有1918年那樣高的破壞性。究竟為什麼1918年出現的流感病毒株破壞力如此強大，這一問題還有待考究。 [191]

黃熱病、登革熱和其他蟲媒病毒

 
以人血為食的埃及伊蚊

蟲媒病毒是通過吸血昆蟲傳播給人類和其他脊椎動物的病毒。這類病毒有很多種，「蟲媒病毒」是「節肢動物傳播的病毒」的一種，由於許多種病毒都是以這種方式傳播的，因此該詞現已不再用於正式分類 [200]蟲媒病毒有500多種，但在20世紀30年代，人們只知道有三種病毒會傳染人類並致病：即黃熱病病毒、登革熱病毒和白蟻熱病毒。 [201]如今已知有100多種此類病毒會使人類患病，如腦炎。 [202]

黃熱病是由黃病毒引起的最棘手的疾病。[203]美國上一次大流行發生在 1905 年。 [74]在巴拿馬運河的建設過程中，成千上萬的工人死於黃熱病。 [204]黃熱病起源於非洲，貨船從非洲來到美洲，也同時給美洲帶來了攜帶病毒的埃及伊蚊。據記載，1926年，西非的加納爆發了非洲第一次流行病。 [205]20世紀30年代，這種疾病在巴西再次出現。美國流行病學家弗雷德·索普（Fred Soper，1893-1977）發現了非人類宿主感染的叢林傳播環節的重要性，而人類感染是打破這一循環的「死胡同」。 [206]儘管黃熱病疫苗是有史以來研製的最成功的疫苗之一， [207]流行病仍在繼續。1986-1991年，西非有超20000人被感染，其中4000人死亡。 [208]

20世紀30年代，美國相繼出現了聖路易斯腦炎、東部馬腦炎和西部馬腦炎。60年代，人們發現了導致拉克羅斯腦炎的病毒， [209]之後，西尼羅河病毒於1999年席捲了紐約。 [210]截至2010年，登革熱病毒仍是最有威脅的蟲媒病毒，它的毒性越來越強，已逐漸蔓延至亞洲和美洲。 [211]

肝炎病毒

肝炎是一種自古以來就公認的肝臟疾病。 [212]其症狀包括黃疸，即皮膚、眼睛和體液發黃。 [213]導致肝炎的原因有很多，包括病毒，尤其是甲型肝炎病毒、乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒。 [214]縱觀歷史，黃疸流行病主要發生在戰爭時期的士兵身上，在中世紀常被叫做 「戰役黃疸」。之後在19-20世紀的大部分重大衝突中都可見其蹤影，比如拿破崙的軍隊。據報道，在美國內戰期間爆發了超40000例病例，造成了約150人死亡。 [215]直到20世紀中葉，人們才發現了流行性黃疸的誘發病毒。 [216]1946年，有研究發表稱，流行性黃疸（甲型肝炎）和血源性感染性黃疸（乙型肝炎）是截然不同的， [217] 1947年，首次開始使用這兩種病毒名。 [218]20世紀60年代，人們發現了第一種可能引起肝炎的病毒—— 「乙型肝炎病毒」，這是以其引起的疾病命名的。[219]之後在1974年發現了甲型肝炎病毒。 [220]乙型肝炎病毒的發現和其檢測方式的發明從根本上改變了醫療和整容手術的流程。 20世紀70年代初引入的獻血篩查大大減少了病毒的傳播。 [221]1975年之前採集的獻血血漿和因子VIII總是含有感染性的乙型肝炎病毒。 [222]20世紀60年代末，醫療專業人員經常重複使用皮下注射的針頭，再加上紋身師所使用的針頭，這兩者是常見的傳染源頭。 [223] 20世紀90年代末，歐美國家制定了針頭換新方案，以防止靜脈注射吸毒者傳染肝炎。 [224]這些措施也有助於減少愛滋病毒和丙型肝炎病毒的傳播。 [225]

非人類動物病毒

動物流行病是指除人類之外的動物中爆發的疾病或流行病。 [226]在20世紀期間，動物，特別是家畜的病毒性疾病在世界範圍內發生了大流行病。由病毒引起動物疾病有許多，包括口蹄疫、牛瘟、禽流感和豬流感、豬瘟和羊藍舌病等。從2001年英國爆發的口蹄疫看來，牲畜的病毒性疾病對農民以致整個社會都是毀滅性的災難。 [227]

1891年，牛瘟（一種牛的疾病）首先出現在東非，並迅速蔓延到整個非洲。 [228]一年後，東非95%的牛全部死亡。由於農民和游牧民族的生計完全依賴他們的牛，饑荒的泛濫給他們的生活帶來了毀滅性的災難。三分之二的馬賽人因此死亡。饑荒之後，天花的流行使情況變得更糟。 [229]20世紀初，牛瘟在亞洲和歐洲部分地區十分常見。 [230]幸運的是，通過包括疫苗接種在內的控制措施，疾病的流行率開始穩步下降。 [231]到1908年，歐洲已經擺脫了這種疾病。第二次世界大戰後疫情的確也爆發過，但很快得到了控制。然而這種疾病在亞洲的流行率卻有所上升，1957年，由於太多的水牛因此死亡，農民無法種植水稻，泰國不得不尋求援助。 [232]烏拉爾山脈以西的俄羅斯卻沒有出現這種疾病，這是因為列寧頒佈了幾項控制這種疾病的法律。但是俄羅斯東部的牛經常感染牛瘟，這種牛瘟來源於蒙古和中國，這兩地瘟發病率仍然很高。 [233]印度成功控制了這種疾病的傳播，這種疾病在整個20世紀一直在南部的泰米爾納德邦和喀拉拉邦苟延殘喘， [234]但最終在1995年前被徹底消滅。 [235]非洲在20世紀20年代和80年代遭受了兩次重大的泛獸性疾病。 [236] 1928年，索馬里爆發了一次嚴重的疫情，直到1953年仍在肆虐。20世紀80年代， 2600萬劑疫苗的使用控制了坦桑尼亞和肯雅的疫情，1997年，人們普遍接種了疫苗，從而抑制了疾病的復發。 [237]到20世紀末，大多數國家已徹底消滅了牛瘟。不過，埃塞俄比亞和蘇丹仍有少量感染病例， [238] 1994年，糧食農業組織（FAO）啟動了全球根除牛瘟方案，其目標是：到2010年在全球範圍內根除牛瘟。 [239] 2011年5月，糧農組織和世界動物衛生組織宣佈，「作為一種自由傳播的病毒性疾病，牛瘟已從世界上消滅。」 [240]

口蹄疫是一種高度傳染性的傳染病，由口蹄疫病毒屬的病毒引起，與脊髓灰質炎病毒屬於同一家族。該病毒自古以來就感染了非洲的動物，主要是有蹄類動物，這可能是在19世紀由進口牲畜帶到美洲的。 [241]口蹄疫很少致命，但牛羊群疫情的爆發所造成的經濟損失不可估量。 [242]美國上一次發生口蹄疫是1929年。但在2001年，英國各地發生了幾次大規模爆發，數千隻動物被殺死或燒死。 [243]

流感病毒的自然宿主是豬和鳥類，不過它可能早已感染了人類。 [244]該病毒可在野生和家養動物中引起輕度甚至重度動物疫病。[245]許多野生鳥類都在遷徙，這使流感在各個大洲蔓延開來。該病毒已經變異成許多毒株，並繼續進化，構成了一種無時不在的威脅。 [246]

21世紀初，由病毒引起的牲畜流行病後患無窮。藍舌病是一種由環狀病毒引起的疾病，於2007年在法國的羊群中爆發。 [247]在此之前，該疾病主要局限於美洲、非洲、南亞和澳大利亞北部，但現在它在地中海周圍又大肆泛濫。 [248]

植物病毒

主條目：植物病毒

 
粉虱( Trialeurodes vaporariorum )是木薯花葉病毒的傳播媒介。

在 20 世紀，人們發現許多「古老」的植物疾病是由病毒引起的，比如玉蜀黍條斑病和木薯花葉病。[249]與人類一樣，當植物茁壯成長時，病毒也同樣繁衍。這會造成巨大的經濟損失，甚至殃及人類。在 20 世紀 70 年代的約旦，西紅柿和葫蘆科植物（黃瓜、甜瓜和葫蘆）廣泛種植，整片田地都感染了病毒。[250] 同樣，在科特迪瓦，30種不同的病毒感染了豆類和蔬菜等作物。在肯雅，木薯花葉病毒、玉米條紋病毒和花生病毒病導致高達 70% 的作物損失。[250] 木薯是東非種植最豐富的作物，是 2 億多人的主食。它從南美洲傳入非洲，在肥力差的土壤中生長良好。木薯最重要的病害是由木薯花葉病毒引起的，它是一種雙生病毒，通過粉虱在植物間傳播。這種疾病首次有記錄的出現是在1894，在東非肆虐了整個20世紀，頻繁導致饑荒。[251]

20世紀 20 年代，由葉蟬傳播的甜菜卷頂病毒對美國西部的甜菜種植者造成了巨大的經濟損失。 1956 年，古巴和委內瑞拉 25% - 50% 的水稻作物被白葉水稻病毒毀壞。 1958年，這種病毒造成哥倫比亞許多稻田遭受損失。 1981 年病毒再次爆發，造成高達 100% 的損失。[252]20世紀 20 年代，由葉蟬傳播的甜菜卷頂病毒對美國西部的甜菜種植者造成了巨大的經濟損失。 1956 年，古巴和委內瑞拉 25% - 50% 的水稻作物被白葉水稻病毒毀壞。 1958年，這種病毒造成哥倫比亞許多稻田遭受損失。 1981 年病毒再次爆發，造成高達 100% 的損失。[253] 1948 年，在美國堪薩斯州，7% 的小麥作物被小麥條紋花葉病毒破壞，該病毒通過小麥捲曲蟎(Aceria tulipae)傳播。[254]在 1950 年代，木瓜環斑病毒，一種馬鈴薯病毒，導致夏威夷瓦胡島的單株木瓜作物遭受毀滅性損失。上個世紀，這種木瓜被引入該島，但該病害在 1940 年代之前從未在該島上出現過。[255]

當人類將新的作物引入載體和病毒，引起生態變化時，就會發生這種災難。可可原產於南美洲，19世紀末被引入西非。在1936年，腫脹的根病已經通過當地樹木的粉虱傳播到種植園。 [256]新的棲息地可能引發植物病毒疾病的爆發。1970年以前，水稻黃色斑駁病毒只在肯雅的基蘇木地區出現，但是隨着東非大片地區的灌溉和大面積的水稻種植，該病毒傳播到了整個東非。[257]人類活動將植物病毒引入本地作物。柑橘 tristeza 病毒(CTV)於1926年至1930年間從非洲傳入南美洲。與此同時，大桔蚜（Toxoptera citricidus）從亞洲傳播到南美洲，加速了病毒的傳播。到1950年，巴西聖保羅已有600多萬棵柑橘樹被病毒殺死。[257] 這種病毒和柑橘樹可能在它們原來的國家共同進化了幾個世紀。該病毒向其他地區傳播，並與柑橘新品種相互影響，導致了毀滅性的植物病害暴發。[258]由於人類傳播植物病毒所造成的問題，許多國家對任何可能含有危險植物病毒或其昆蟲載體的材料實行嚴格的進口管制。[259]

新興病毒

主條目：新興病毒

即使沒有突變，一些迄今尚不為人所知的寄生生物也總有可能離開它們習以為常的生態圈，使人類，已經成為地球顯著特徵的密集種群，暴露在某種新的、或許是毀滅性的死亡面前。麥克尼爾(1998)第293頁 新興病毒是那些最近才感染宿主物種的病毒。 [260]在人類身上，許多新出現的病毒來自其他動物。[261]由其他物種感染並傳染給人類的病毒引起的疾病被稱為人畜共患病或人畜共患病感染。[262]

非典

主條目: 嚴重急性呼吸道綜合症 和 2019新型冠狀病毒

更多信息: 嚴重急性呼吸道綜合症疫情 和 2019冠狀病毒疫情

 
疾病控制與預防中心(CDC) 製作的插圖揭示了冠狀病毒的超微結構形態；請注意裝飾外表面的尖刺，它們使病毒體看起來像一個冠狀病毒。[263]

嚴重急性呼吸系統綜合症（SARS）是由一種新型冠狀病毒引起的。[264]已知其他冠狀病毒會在人類中引起輕度感染，[265]因此這種新型病毒株的毒力和快速傳播引起了衛生專業人員的恐慌以及公眾的恐懼。[260]但並沒有引發大規模疫情，截止到2003年7月，約有8000例感染病例和800人死亡，隨後疫情結束。[266] SARS 病毒的確切來源尚不清楚，但有證據表明它來自蝙蝠。[267]

2019年11月，中國武漢出現了一種類似的冠狀病毒，並在世界各地迅速傳播。隨後，這種病毒被命名為嚴重急性呼吸系統綜合症冠狀病毒 2，在全世界傳播引起大流行。50 歲以下健康人群的病死率約為 2%，在80歲以上的人群中約為15% ，特別是那些已經存在合併症的人群。[268] [269] [270]截至2022年11月，這種病毒的病死率低於非典型肺炎，但傳染性更強。[268]因受感染者的恐懼、偏見和污名化，遏制疫情的措施受到阻礙。[271]各國在和平時期對國際旅行施加了前所未有的限制，[272]並且在全球幾個主要城市實施了宵禁。 [273]許多國家和地區實施檢疫、入境禁令或其他限制。 [274]隨着病毒在世界範圍內傳播，這些措施的有效性受到質疑。 [275]各國政府沒有為大流行的規模做好準備，全世界的病毒學家和流行病學專家對現有檢測和監測系統的效率感到自滿。[276]截至2023年3月10日，大流行已造成超過6.76億病例和6,880,000確認死亡，使其成為歷史上最致命的死亡事件之一。 [277]

西尼羅病毒

主條目: 西尼羅河病毒 西尼羅河病毒是一種黃病毒，1937年在一名發燒婦女的血液中首次發現。這種由蚊子和鳥類攜帶的病毒在20世紀50年代在北非和中東引起了感染暴發，到20世紀60年代，歐洲的馬也受到了影響。1974年，南非開普省發生了人類最大規模的疫情，有1萬人患病。 [278]1996年，在地中海盆地附近病毒開始感染了越來越多的的人類和動物(馬) 。到1999年，病毒已經傳播到紐約市。從那時起，這種病毒已經在美國各地蔓延。[278]在美國，蚊子在夏末攜帶的病毒數量最多，因此7 月中旬至 9 月初的病例數增加。當天氣變冷時，蚊子就會死亡，疾病的風險也會降低。 [279]在歐洲，已經爆發了很多次疫情。2000 年，英國啟動了一項監測計劃，監測人類、死鳥、蚊子和馬的病毒發病率。[280]能夠攜帶病毒的蚊子(庫蚊)在肯特郡北部的沼澤地繁殖。人們以前認為這種蚊子在英國並不存在，但它在攜帶西尼羅河病毒的南歐廣泛存在。[281]

立百病毒

主條目:亨尼巴病毒屬 1997年，馬來西亞農民和他們的豬爆發了呼吸道疾病。有記錄的腦炎病例超過265例，其中105例死亡。 [282]在一個人的大腦中發現了新的副粘病毒，它被命名為尼帕病毒，也是他曾經居住過的村莊名字。這種感染是由果蝠的一種病毒引起的，因為它們的棲息地被森林砍伐破壞了。蝙蝠轉移到靠近養豬場的樹上，豬從它們的糞便中感染了病毒。[283]

病毒性出血熱

 
馬爾堡病毒

絲狀病毒科的病原體是高度致命的。絲狀病毒可以導致病毒性出血熱，包括伊波拉病毒和馬爾堡病毒。2005年4月，在安哥拉爆發疫情後，這種馬爾堡病毒引起了媒體的廣泛關注。疫情從2004年10月開始，一直到2005年，共有252起病例，包括227例死亡病例。[284]

西非的伊波拉病毒疫情始於 2013 年，是自愛滋病毒出現以來最具破壞性的一次。[285]最初的疫情開始於2013年12月，發生在幾內亞南部名為Meliandou的村莊。[286]首批病例包括一個兩歲的男孩，他三歲的姐姐，他們的母親和祖母。在祖母的家人和護工出席了她的葬禮之後，這種疾病傳播到了鄰近的村莊。到2014年3月，疫情變得更加嚴重，引起了當地衛生官員的關注，他們向幾內亞衛生部報告了疫情。到年中時，這一流行病已蔓延到利比里亞和塞拉利昂。[287]截至2015年6月，世界衛生組織報告了超過2.7萬例愛滋病病例，導致了超過1.1萬人死亡。[288]

伊波拉病毒的自然來源很可能是蝙蝠。 [289] [290]馬爾堡病毒通過猴子[291]傳播給人類，拉沙熱通過大鼠 ( Mastomys natalensis ) 傳播給人類。 [292]人畜共患感染可能很嚴重，因為人類通常對感染沒有天然抵抗力，只有當病毒對新宿主適應良好時，它們的毒力才會降低。一些人畜共患傳染病情況會好轉，因為在最初爆發後，由於病毒在人與人之間的傳播效率不高，隨後感染的散佈會減少。[293]

21世紀初，全球對發展中國家災難性流行病的認識有所提高，而在過去幾十年中，這種認識相對而言並未引起國際衛生界的注意。[294]

有益病毒

彼得 · 梅達瓦爵士(1915-1987)將病毒描述為「包裹在蛋白質外殼中的壞消息」。[295]除了噬菌體之外，病毒被公認為是導致疾病和死亡的罪魁禍首。大量病毒的發現及其在許多生態系統中的壓倒性存在，促使現代病毒學家重新考慮它們在生物圈中的作用。[296]

據估計，地球上大約有1031種病毒。它們大部分是噬菌體，存在於海洋中。[297]微生物占海洋生物量的 90% 以上， [298]據估計，病毒每天殺死大約 20% 的生物量，海洋中的病毒數量是細菌和古細菌的15倍。[298]病毒是快速破壞有害藻類大量繁殖的主要因素，藻類大量繁殖往往會殺死其他海洋生物，[298]並有助於維持不同種類海洋藍綠藻的生態平衡，[299]從而為地球上的生命提供充足的氧氣。[300]

對多種抗生素具有耐藥性的細菌菌株的出現，已成為治療細菌感染的一個難題。 [301]在過去的 30 年裏，只有兩類新的抗生素被開發出來，[302]人們正在尋找對抗細菌感染的新方法。 [301]噬菌體在 1920 年代首次用於控制細菌， [303]1963年蘇聯科學家進行了一次大規模的臨床實驗。[304]直到實驗結果於1989年在西方公佈之前，這項工作在蘇聯以外的國家是不為人知的。[305]最近由抗生素耐藥細菌引起的問題不斷升級，激發了人們對使用噬菌體和噬菌體療法的新興趣。 [306]

人類基因組計劃揭示了許多病毒 DNA 序列散佈在整個人類基因組的存在。[307]這些序列約佔人類 DNA 的 8%， [308]似乎是人類祖先古代逆轉錄病毒感染的遺蹟。 [309]這些 DNA 片段已在人類 DNA 中牢固地確立了自己的地位。[307]這些 DNA 中的大部分不再起作用，但其中一些有益病毒帶來了對人類發展很重要的新基因。 [310] [311] [312]病毒已將重要基因轉移到植物中。大約 10% 的光合作用使用是由病毒從藍綠藻轉移到植物體內的基因產物。[313]



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