柯元芳(?年—?年),字楚衡,浙江嘉善縣(今浙江省嘉興市)人。明朝政治人物,崇禎進士。
天啓元年(1621年)辛酉科浙江鄉試第二十二名舉人[1],崇禎十年(1637年)丁丑科進士。任福建建寧府推官,任內寬仁明允,多有平反[2]。歷署甌寧、浦城二縣事。崇禎十七年(1644年)國破歸里。卒年六十二[3]。