在歷史上,對基督徒的迫害可以追溯到公元一世紀至今(英語:Christianity in the 21st century)。自從基督教出現以來,基督教傳教士和皈依基督教(英語:Conversion to Christianity)之人都成為受迫害的對象,他們有時甚至因信仰而殉道(英語:Christian martyr)。
在近代,部分在伊斯蘭教國家為主的基督徒的宗教自由及言論自由受到限制,部分更受到仇恨犯罪。
在晚清時期,流行着傳教士挖取眼球、腎臟煉製藥水等反教謠言。這是義和團參與者破壞教堂的原因之一。[1]
基督教在日本安土桃山時代、江戶時代也曾遭受當局迫害,直至明治維新後才解禁。