衛生福利部所屬醫院
衛生福利部所屬醫療機構，為中華民國衛生福利部所管理的醫療機構，原為臺灣省政府衛生處所屬之各地省立醫院，1999年7月1日精省後改隸行政院衛生署醫院管理委員會（今衛生福利部附屬醫療及社會福利機構管理會）。共有26家醫療機構，可分為綜合醫院及特殊療養院。
所屬醫院
綜合醫院
計有19家綜合醫院。
- 北區區域聯盟
- 中南區域聯盟
特殊療養院
計有7家特殊療養院。
- 北區區域聯盟
- 中南區域聯盟
公辦民營（BOT）模式醫院
已裁撤或改制的醫院
- 雲林醫院：2004年4月改制為「國立臺灣大學醫學院附設醫院雲林分院」
- 宜蘭醫院：2008年1月改制為「國立陽明大學附設醫院」
- 新竹醫院：2011年7月改制為「國立臺灣大學醫學院附設醫院新竹分院」
- 竹東醫院：2011年7月改制為「國立臺灣大學醫學院附設醫院竹東分院」