曲霉属
曲霉属(学名:Aspergillus)是一个由几百种多细胞霉菌菌种所组成的菌属,在许多气候条件下皆可发现它们的踪影。
曲霉属 | |
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Conidial head of Aspergillus niger | |
科学分类 | |
界: | 真菌界 Fungi |
门: | 子囊菌门 Ascomycota |
纲: | 散囊菌纲 Eurotiomycetes |
目: | 散囊菌目 Eurotiales |
科: | 曲菌科 Aspergillaceae |
属: | 曲霉属 Aspergillus P.Micheli, 1729 |
种 | |
参见 曲霉属菌种列表 |
曲霉属于1729年被皮耶尔·安东尼奥·米凯利(一位义大利神父兼生物学家)首次记录。在显微镜下,米凯利发现该菌属的形状长的与圣水勺(拉丁文:aspergillum)相似,该菌属名Aspergillus因而得名。[1]圣水勺构造是所有曲霉属皆有的一种无性生殖产孢构造,大约1/3的该属物种也具备有性生殖阶段。[2]
分类
曲霉属由数百种菌种所组成。[2]
生长及分化
曲霉属为不完全菌(尚未发现其有性态的真菌)的属。然而,其中有些种类已发现其有性态,且其有性态被归类为子囊菌门,所以,借由DNA证据,曲霉属被归类于子囊菌门中。
该属的成员皆具有能够在高渗透压环境中生长的能力,且该属的物种都非常好氧,常常能在氧气充足的环境下找到他们,并观察到他们呈现菌丝型态。正常来说,其菌体喜欢生长在碳源丰富的基质,像单糖或多糖丰富的地方。曲霉属常常为淀粉类食物(面包、米、马铃薯……)的污染源,也生长于许多植物及树种上。
除了生长于营养丰富的基质上以外,曲霉属中的许多物种皆可在营养缺乏或缺少关键养分的环境中进行寡营养生长。黑曲霉是最好的例子,往往可以在潮湿的墙壁上发现它的踪影,为造成白粉病的主要菌种。
曲霉属有时也可以在枕头中发现大量的菌株。[3]
商业上的重要性
曲霉属在医学上及商业上皆具重要性,有些种类亦可以感染人类及其他动物。有些种类为动物的感染源已被研究多年,而其他在动物体中发现的物种却被视为对疾病的特定新物种,甚至还有一些为腐生菌。曲霉属中超过60种的菌已被认为是医学相关的病原菌种。对人类,许多造成感染,如外耳炎、皮肤病变、及溃疡的菌种已被发现。
其他物种对商业上的微生物发酵非常重要。例如,相较于一般制酒法,清酒的制造过程还需要经过一步将淀粉分解为简单糖类的程序。相较于一般常用来制酒的酵母属,它可以分解结构较复杂的淀粉(酵母属仅能分解简单糖类,如葡萄糖)。因此,日本的清酒就需要将稻米经过米曲霉的处理。[4]
该属的成员也可以应用于医学上以治疗疾病。
黑曲霉最大的应用为制造柠檬酸,世界上99%的柠檬酸产量都是从它而来,每年约可生产140万吨的柠檬酸。黑曲霉也常被用来制造酵素,包括葡萄糖氧化酶、溶菌酶及乳糖酶。而在上述的例子中,它很少被培养在固态基质上,比较常被培养为生物反应中的淹没培养物,如此一来,我们便可以直接掌握参数,以达到最大生产量。这制程使分离酵素及医疗用的化学成分更为简单,因次造成更大的经济效益。
研究
小巢状曲霉(异名构巢裸胞壳)已被拿来做研究许多年了,而基多·庞蒂科夫也拿它来展示真菌的假有性生殖。最近,小巢状曲霉的基因于博劳德研究所的实验中被定序出来,为他们的创举之一。到了2008年,有七个曲霉属的物种被接续定序出来:具有工业价值的黑曲霉(两个族系)、米曲霉、土曲霉, 和病原体棒曲霉、费雪氏曲霉、黄麹霉和烟曲霉(两个族系)。[5]费雪氏曲霉几乎不会有病原的特性,但和与其相似的烟曲霉具有高度的相关性,为了更进一步的了解烟曲霉的病源特性而将他定序出来。[6]
有性生殖
在曲霉属的250个物种中,约有64%的菌种未发现其有性态。然而,当的许多物种似乎有著尚未被辨认的有性生殖阶段。[7]有性生殖在真菌中以两种不同的方式呈现,分别为异交(异丝型真菌)两个独立个体各贡献一个细胞核, 还有自体受精或自交(同丝型真菌)两个细胞核皆由同一个个体贡献。最近几年,有性循环在许多当初被认定为无性的物种中被发现。这些发现反映出近期的实验大多聚焦在和人类有关联的物种上。
烟曲霉是最常见造成人类免疫缺失疾病的物种。在2009年,烟曲霉被展现出其功能完整的异丝型有性生殖循环。[8]此有性循环需要借由独立出来的配对型来完成。
黄麹霉是广泛于作物中产生致癌的黄曲毒素主要制造者。也有机会成为人体或动物的病源,于免疫功能不足的个体造成病害。在2009年,该异丝型真菌的有性生殖阶段于适当的条件下被发现,当中出现不同的配对型结合。 [9]
Aspergillus lentulus是一种有机会造成侵入性曲霉症的人体病源,该疾病的死亡率甚高。在2003年,Aspergillus lentulus被发现有异丝型、具有功能的有性配种构造。[10]
土曲霉常被应用于工业以制造重要的有机酸和酵素,并且是制造降胆固醇药物洛伐他汀最初的重要来源。在2013年,土曲霉被发现在适当的培养条件下有能力产生不同的配对型,进行有性繁殖。[11]
这些有关曲霉属物种的发现正随著证据(从其他真核生物的研究中,有性生殖是所有真核生物最有可能的形式)的累积而持续中。[12][13][14]
小巢状曲霉是一种同丝型真菌,有能力自体繁殖,自交牵扯到与异交物种同样的配对特性的激活,也就是说自体繁殖并没有省略异交必要的途径,而是需要在单一个体中激活这些途径。[15]
在这些曲霉属物种的有性循环中,同丝型(自体繁殖)在自然界中以压到性的比例存在。[16]这个观察支持了曲霉属的物种大多得以在较少的基因多样性条件下仍然保有其性生殖的是因为其同丝型字体繁殖的关系”的说法。烟曲霉,一个广泛存在于各种气候及环境中的异丝型(异交)真菌,同时也展现出微小的基因多样性,无论地理区域或世界规模,这个例子一样可以支持在微小的基因差异下仍可维持有性态,而这次是异交。
基因体学
在2005年,《自然》期刊上同时发表的三份曲霉属的基因序列,使该属被认定为是在比较基因体的研究上最为重要的丝状真菌属。像大部分的主要基因体计画,这些成就是由一个巨大的定序中心以及个别的科学家团体合作而来的。例如,基因研究机构(TIGR)和烟曲霉研究团体合作。小巢状曲霉在此大机构中被定序出来。米曲霉在日本的先进工业科学及科技国家研究机构中被定序出来。能量部门的基因体联合机构发布了柠檬酸产酸菌株黑曲霉的基因序列库。TIGR 现在被改称为克莱格.凡特研究所, 目前在领导一项黄麹霉基因序的研究计画。[17]
曲霉属被定序的基因体大小分布大约从烟曲霉的29.3 Mb到米曲霉的37.1 Mb,然而v本来被预估有9926Mb,而米曲霉本来被预估有12,071Mb。至于产酶菌株黑曲霉的基因体大小为33.9 Mb,介于两者之间。[18]
致病菌
有些曲霉属的物种造成人体及动物疾病。最常见的病原菌是烟曲霉和黄麹霉,他们制造黄曲毒素(是毒素亦是致癌物,并可污染如坚果类的食物)。最常见造成过敏反应的物种是烟曲霉和棒曲霉。其他物种在农业病害非常重要,Aspergillus spp. 造成许多谷物的疾病(尤其玉米),还有些变种能制造霉菌毒素,其中包含黄曲毒素。还有一些会导致新生儿疾病。[19]
烟曲霉(最常见的物种)造成的感染主要是肺部的感染,并且有可能由肺吲发炎造成快速的细胞坏死,也有传播的可能性。这物种可和其他霉菌感染区别,基于它无论在环境还是宿主都是以菌丝态存在。(不像白色念珠菌为二型性,在环境为菌丝态而在宿主为酵母态)
曲霉症
曲霉症是由曲霉属造成的疾病. 与常见的鼻窦炎相关的物种为烟曲霉。[20]此症状包含发烧、咳嗽、胸腔疼痛、或呼吸困难,和其他疾病的症状类似,所以不好诊断出来。通常只有在患者的免疫系统功能低落或受到其他肺部感染的人容易染上这些菌。
- 呼吸道过敏性曲霉症:造成病人呼吸道疾病,如哮喘、囊性纤维化、及鼻窦炎
- 急性侵入性曲霉症:一个长进周遭组织的形式,通常发生于免疫功能低下的人身上,如 AIDS或化疗患者
- 传播性侵入性曲霉症:一种能扩散至全身的感染
- 曲霉球:一种可以在腔室中(如肺)形成的“真菌球”
在空气中曲霉症的传染途径也常常经由鸟类,而许多曲霉属的物种也被发现能感染昆虫。[23]
参考资料
- ^ Machida, Masayuki; Gomi, Katsuya. Aspergillus: molecular biology and genomics. Wymondham, Norfolk, UK: Caister Academic. 2010 [2022-07-30]. ISBN 978-1-904455-53-0. OCLC 317114602. (原始内容存档于2022-07-30) (英语).
- ^ 2.0 2.1 Geiser, David M. Sexual structures in Aspergillus : morphology, importance and genomics. Medical Mycology. 2009-01, 47 (s1) [2022-07-30]. ISSN 1369-3786. doi:10.1080/13693780802139859. (原始内容存档于2022-03-08) (英语).
- ^ Pillows: A Hot Bed Of Fungal Spores. ScienceDaily. [2018-12-22]. (原始内容存档于2017-10-08) (英语).
- ^ You're Probably Using The Wrong Soy Sauce. HuffPost. 2014-04-08 [2018-12-22]. (原始内容存档于2021-05-06) (英语).
- ^ Wortman, Jennifer Russo; Gilsenan, Jane Mabey; Joardar, Vinita; Deegan, Jennifer; Clutterbuck, John; Andersen, Mikael R.; Archer, David; Bencina, Mojca; Braus, Gerhard; Coutinho, Pedro. The 2008 update of the Aspergillus nidulans genome annotation: A community effort. Fungal Genetics and Biology. 2009-03, 46 (1) [2022-07-30]. PMC 2826280 . PMID 19146970. doi:10.1016/j.fgb.2008.12.003. (原始内容存档于2022-06-20) (英语).
- ^ Descriptions – Aspergillus Comparative. Broad Institute. [2009-10-15]. (原始内容存档于2009-11-22).
- ^ Dyer, Paul S; O’Gorman, Céline M. A fungal sexual revolution: Aspergillus and Penicillium show the way. Current Opinion in Microbiology. Growth and development: eukaryotes/prokaryotes. 2011-12-01, 14 (6). ISSN 1369-5274. doi:10.1016/j.mib.2011.10.001 (英语).
- ^ O’Gorman, Céline M.; Fuller, Hubert T.; Dyer, Paul S. Discovery of a sexual cycle in the opportunistic fungal pathogen Aspergillus fumigatus. Nature. 2009-01, 457 (7228) [2022-07-30]. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/nature07528. (原始内容存档于2022-07-30) (英语).
- ^ Horn, Bruce W.; Moore, Geromy G.; Carbone, Ignazio. Sexual reproduction in Aspergillus flavus. Mycologia. 2009-05-01, 101 (3). ISSN 0027-5514. PMID 19537215. doi:10.3852/09-011.
- ^ Swilaiman, Sameira S.; O'Gorman, Céline M.; Balajee, S. Arunmozhi; Dyer, Paul S. Discovery of a Sexual Cycle in Aspergillus lentulus, a Close Relative of A. fumigatus. Eukaryotic Cell. 2013-07, 12 (7). ISSN 1535-9778. PMC 3697472 . PMID 23650087. doi:10.1128/EC.00040-13 (英语).
- ^ Arabatzis, Michael; Velegraki, Aristea. Sexual reproduction in the opportunistic human pathogen Aspergillus terreus. Mycologia. 2013-01, 105 (1) [2022-07-30]. ISSN 0027-5514. doi:10.3852/11-426. (原始内容存档于2022-03-16) (英语).
- ^ Malik, Shehre-Banoo; Pightling, Arthur W.; Stefaniak, Lauren M.; Schurko, Andrew M.; Logsdon, John M. Hahn, Matthew W. , 编. An Expanded Inventory of Conserved Meiotic Genes Provides Evidence for Sex in Trichomonas vaginalis. PLoS ONE. 2008-08-06, 3 (8). ISSN 1932-6203. PMC 2488364 . PMID 18663385. doi:10.1371/journal.pone.0002879 (英语).
- ^ Bernstein, Harris; Bernstei, Carol. Evolutionary Origin and Adaptive Function of Meiosis. Bernstein, Carol (编). Meiosis. InTech. 2013-09-11 [2019-01-04]. ISBN 978-953-51-1197-9. doi:10.5772/56557. (原始内容存档于2018-07-05) (英语).
- ^ Heitman, Joseph; Sun, Sheng; James, Timothy Y. Evolution of fungal sexual reproduction. Mycologia. 2013-01, 105 (1) [2022-07-30]. ISSN 0027-5514. doi:10.3852/12-253. (原始内容存档于2022-06-21) (英语).
- ^ Paoletti, Mathieu; Seymour, Fabian A.; Alcocer, Marcos J. C.; Kaur, Navgeet; Calvo, Ana M.; Archer, David B.; Dyer, Paul S. Mating Type and the Genetic Basis of Self-Fertility in the Model Fungus Aspergillus nidulans. Current Biology. 2007-08-21, 17 (16) [2022-07-30]. ISSN 0960-9822. PMID 17669651. doi:10.1016/j.cub.2007.07.012. (原始内容存档于2013-06-05) (英语).
- ^ Dyer, Paul S.; O'Gorman, Céline M. Sexual development and cryptic sexuality in fungi: insights from Aspergillus species. FEMS Microbiology Reviews. 2012-01, 36 (1) [2022-07-30]. ISSN 1574-6976. doi:10.1111/j.1574-6976.2011.00308.x. (原始内容存档于2022-01-19) (英语).
- ^ Machida, M; Gomi, K (编). Aspergillus: Molecular Biology and Genomics. Caister Academic Press. 2010. ISBN 978-1-904455-53-0.
- ^ Bennett JW. An Overview of the Genus Aspergillus (PDF). Aspergillus: Molecular Biology and Genomics. Caister Academic Press. 2010 [2019-01-04]. ISBN 978-1-904455-53-0. (原始内容存档 (PDF)于2016-06-17).
- ^ Cloherty, John. Manual of neonatal care. Philadelphia: Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins. 2012. ISBN 978-1-60831-777-6; Access provided by the University of Pittsburgh.
- ^ Bozkurt, MK; Ozçelik, T; Saydam, L; Kutluay, L. [A case of isolated aspergillosis of the maxillary sinus]. Kulak Burun Bogaz Ihtisas Dergisi. 2008, 18 (1): 53–5. PMID 18443405 (土耳其语).
- ^ Aspergillosis. MedScape. [2014-06-29]. (原始内容存档于2014-02-23).
- ^ Wilson WR et al. Current diagnosis and treatment in Infect Dis. Lange, 2001
- ^ Thom, C; Church, M. The Aspergilli. Baltimore: The Williams & Wilkins Company. 1926.
- Du C, Lin SK, Koutinas A, Wang R, Dorado P, Webb C. A wheat biorefining strategy based on solid-state fermentation for fermentative production of succinic acid. Bioresour. Technol. Nov 2008, 99 (17): 8310–5. PMID 18434138. doi:10.1016/j.biortech.2008.03.019.
- Zirbes JM, Milla CE. Steroid-sparing effect of omalizumab for allergic bronchopulmonary aspergillosis and cystic fibrosis. Pediatr. Pulmonol. Jun 2008, 43 (6): 607–10. PMID 18433040. doi:10.1002/ppul.20804.
- Asan A. Aspergillus, Penicillium, and Related Species Reported from Turkey (PDF). Mycotaxon. February 10, 2015, 89 (1): 155–7 [2004] [2019-01-04]. (原始内容存档 (PDF)于2011-09-30).
外部链接
- FungiDB: An integrated functional genomics database for fungi and oomycetes (页面存档备份,存于互联网档案馆)
- Aspergillus Genome Resources (NIH) (页面存档备份,存于互联网档案馆)
- Aspergillus Comparative Database (页面存档备份,存于互联网档案馆) Comparative genomic resource at the Broad Institute
- Central Aspergillus Data Repository (页面存档备份,存于互联网档案馆)
- The Fungal Genetics Stock Center (页面存档备份,存于互联网档案馆)
- The Aspergillus/Aspergillosis Website (页面存档备份,存于互联网档案馆) An encyclopedia of Aspergillus for patients, doctors and scientists
- Aspergillus surveillance project at a large tertiary-care hospital. (PDF).
- The Aspergillus Genome Database (页面存档备份,存于互联网档案馆)