叶意深（？—？），字曼卿，为中国清朝官员，浙江慈溪人。
举人出身的叶意深于1889年（光绪十五年）接替李淦担任台湾府淡水县知县一职，是该县的地方父母官。1892年调署新竹知县，1895年，则转任台湾县知县，是年，因福建台湾省遭清朝割让予日本，他奉旨内渡。1898年（光绪二十四年）补江苏金匮（今无锡）知县。
