VMD(英语:Visual molecular dynamics, 可视化分子动力学)是一套分子建模与可视化软件[2],主要用来分析分子动力学模拟的实验数据。同时,软件也包含处理长度与提及相关数据的模块,能可视化与分析轨迹,添加任意图形,并能导出成其他软件能利用的格式例如POV-RayPRManVRML等。用户能运行TclPython脚本进行批量操作,也可通过Tcl/Tk与其他程序进行交互。VMD能在Unix,MacOS,Microsoft Windows等操作系统下运行[3]。对于非商业用途,VMD通过特定分发协议发布,用户注册后可免费使用和修改源码[4]

VMD
VMD 1.8.3 软件截图.
原作者威廉·汉弗莱,安德鲁·达尔克,克劳斯·舒尔顿,约翰·斯通
开发者UIUC
首次发布1995年7月4日,​29年前​(1995-07-04
当前版本1.9.2(2014年12月,​9年前​(2014-12
操作系统OS X, Unix, Windows
语言English
类型分子建模
许可协议需注册(Distribution-specific)[1]
网站www.ks.uiuc.edu/Research/vmd


外部链接

参考资料

  1. ^ VMD license. [2017-01-03]. (原始内容存档于2022-01-21). 
  2. ^ Humphrey, William; Dalke, Andrew; Schulten, Klaus. VMD: Visual molecular dynamics. Journal of Molecular Graphics. February 1996, 14 (1): 33–38. PMID 8744570. doi:10.1016/0263-7855(96)00018-5. 
  3. ^ VMD User's Guide Version 1.9.1 (PDF). Massachusetts Institute of Technology. NIH Resource for Macromolecular Modeling and Bioinformatics. [January 29, 2012]. (原始内容 (PDF)存档于2016-06-09). 
  4. ^ VMD License. Theoretical and Computational Biophysics Group. NIH Center for Macromolecular Modeling & Bioinformatics, University of Illinois at Urbana–Champaign. [4 January 2016]. (原始内容存档于2022-01-21).