中國魚類列表
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中國魚類列表是以中文魚類數據庫（cnfishbase.cn）中收錄的中國魚類為基礎整理而成。截止2023年10月，該網站收錄了中國大陸、香港、澳門以及台灣各地魚類共計4922種。[1]
本表根據中文魚類數據庫中的數據按照所屬的目分類，並補充了部分物種的中文名。
| 編號 | 學名 | 中文名 | 生境 | 發生 |
|---|---|---|---|---|
| 刺尾鯛目 Acanthuriformes | ||||
| 36 | Acanthurus dussumieri | 額帶刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 37 | Acanthurus japonicus | 日本刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 38 | Acanthurus lineatus | 縱帶刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 39 | Acanthurus mata | 暗色刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 40 | Acanthurus nigricans | 白面刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 41 | Acanthurus nigrofuscus | 褐斑刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 42 | Acanthurus olivaceus | 橙斑刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 43 | Acanthurus thompsoni | 黃尾刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 44 | Acanthurus triostegus | 橫帶刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 45 | Acanthurus xanthopterus | 黃鰭刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 198 | Antigonia capros | 高菱鯛 | 海水 | 本土 |
| 199 | Antigonia rubescens | 紅菱鯛 | 海水 | 本土 |
| 200 | Antigonia rubicunda | 緋菱鯛 | 海水 | 本土 |
| 215 | Apolemichthys trimaculatus | 三點阿波魚(三斑刺蝶魚) | 海水 | 本土 |
| 281 | Aurigequula fasciata | 條紋金鰏 | 海水 | 本土 |
| 494 | Centropyge bispinosa | 雙棘刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 495 | Centropyge heraldi | 海氏刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 496 | Centropyge tibicen | 白斑刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 497 | Centropyge venusta | 仙女刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 498 | Centropyge vrolikii | 福氏刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 520 | Chaetodon adiergastos | 項斑蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 521 | Chaetodon argentatus | 銀身蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 522 | Chaetodon auriga | 絲蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 523 | Chaetodon auripes | 叉紋蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 524 | Chaetodon bennetti | 雙絲蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 525 | Chaetodon citrinellus | 密點蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 526 | Chaetodon collare | 領蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 527 | Chaetodon ephippium | 鞭蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 528 | Chaetodon kleinii | 珠蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 529 | Chaetodon lineolatus | 細紋蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 530 | Chaetodon lunula | 新月蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 531 | Chaetodon melannotus | 黑背蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 532 | Chaetodon octofasciatus | 八帶蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 533 | Chaetodon ornatissimus | 華麗蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 534 | Chaetodon punctatofasciatus | 斑帶蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 535 | Chaetodon rafflesii | 格紋蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 536 | Chaetodon semeion | 細點蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 537 | Chaetodon speculum | 鏡斑蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 538 | Chaetodon trifascialis | 三紋蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 539 | Chaetodon ulietensis | 烏利蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 540 | Chaetodon unimaculatus | 單斑蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 541 | Chaetodon vagabundus | 斜紋蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 542 | Chaetodon wiebeli | 麗蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 543 | Chaetodon xanthurus | 黃蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 544 | Chaetodontoplus septentrionalis | 藍帶荷包魚 | 海水 | 本土 |
| 590 | Chelmon rostratus | 鑽嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 720 | Coradion altivelis | 褐帶少女魚 | 海水 | 本土 |
| 721 | Coradion chrysozonus | 少女魚 | 海水 | 本土 |
| 763 | Ctenochaetus cyanocheilus | 青唇櫛齒刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 764 | Ctenochaetus striatus | 櫛齒刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 867 | Deveximentum insidiator | 長吻仰口鰏 | 海水 | 本土 |
| 940 | Drepane longimana | 條紋雞籠鯧 | 海水 | 本土 |
| 941 | Drepane punctata | 斑點雞籠鯧 | 海水 | 本土 |
| 983 | Ephippus orbis | 白鯧 | 海水 | 本土 |
| 1022 | Equulites leuciscus | 曳絲馬鰏 | 海水 | 本土 |
| 1023 | Equulites popei | 波氏馬鰏 | 海水 | 本土 |
| 1039 | Eubleekeria jonesi | 瓊斯布氏鰏 | 海水 | 本土 |
| 1040 | Eubleekeria splendens | 黑邊布氏鰏 | 海水 | 本土 |
| 1070 | Forcipiger flavissimus | 黃鑷口魚 | 海水 | 本土 |
| 1071 | Forcipiger longirostris | 長吻鑷口魚 | 海水 | 本土 |
| 1110 | Gazza minuta | 小牙鰏 | 海水 | 本土 |
| 1112 | Genicanthus lamarck | 月蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 1113 | Genicanthus melanospilos | 黑斑月蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 1294 | Hapalogenys analis | 華髭鯛 | 海水 | 本土 |
| 1295 | Hapalogenys kishinouyei | 岸上氏髭鯛 | 海水 | 本土 |
| 1296 | Hapalogenys nigripinnis | 黑鰭髭鯛 | 海水 | 本土 |
| 1348 | Hemitaurichthys polylepis | 多鱗霞蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 1355 | Heniochus acuminatus | 馬夫魚 | 海水 | 本土 |
| 1356 | Heniochus chrysostomus | 金口馬夫魚 | 海水 | 本土 |
| 1357 | Heniochus monoceros | 單角馬夫魚 | 海水 | 本土 |
| 1358 | Heniochus singularius | 四帶馬夫魚 | 海水 | 本土 |
| 1359 | Heniochus varius | 白帶馬夫魚 | 海水 | 本土 |
| 1545 | Leiognathus berbis | 細紋鰏 | 海水 | 本土 |
| 1546 | Leiognathus brevirostris | 短吻鰏 | 海水 | 本土 |
| 1547 | Leiognathus equula | 小馬鰏 | 海水 | 本土 |
| 1548 | Leiognathus ruconius | 仰口鰏 | 海水 | 本土 |
| 1623 | Lobotes surinamensis | 松鯛 | 海水 | 本土 |
| 1663 | Luvarus imperialis | 鯕鯖 | 海水 | 本土 |
| 1808 | Naso annulatus | 突角鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1809 | Naso brachycentron | 粗棘鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1810 | Naso brevirostris | 短吻鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1811 | Naso hexacanthus | 六棘鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1812 | Naso lituratus | 頰吻鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1813 | Naso thynnoides | 擬鮪鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1814 | Naso unicornis | 單角鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1815 | Naso vlamingii | 絲尾鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 1899 | Nuchequula gerreoides | 若盾項鰏 | 海水 | 本土 |
| 2072 | Paracanthurus hepatus | 黃尾副刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 2074 | Parachaetodon ocellatus | 眼點副蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 2205 | Photopectoralis bindus | 黃斑光胸鰏 | 海水 | 本土 |
| 2234 | Platax orbicularis | 圓燕魚 | 海水 | 本土 |
| 2235 | Platax teira | 燕魚 | 海水 | 本土 |
| 2294 | Pomacanthus annularis | 環紋刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 2295 | Pomacanthus imperator | 主刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 2296 | Pomacanthus semicirculatus | 半環刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 2297 | Pomacanthus sexstriatus | 六帶刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 2330 | Prionurus scalprum | 三棘多板盾尾魚 | 海水 | 本土 |
| 2522 | Pygoplites diacanthus | 雙棘甲尻魚 | 海水 | 本土 |
| 2641 | Roa modesta | 朴蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 2738 | Scatophagus argus | 金錢魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2905 | Siganus canaliculatus | 長鰭籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2906 | Siganus corallinus | 凹吻籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2907 | Siganus fuscescens | 褐籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2908 | Siganus guttatus | 星斑籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2909 | Siganus javus | 爪哇籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2910 | Siganus puellus | 眼帶籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2911 | Siganus punctatus | 斑籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2912 | Siganus spinus | 刺籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 2913 | Siganus virgatus | 藍帶籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 3541 | Zanclus cornutus | 角鐮魚 | 海水 | 本土 |
| 3542 | Zebrasoma flavescens | 黃高鰭刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3543 | Zebrasoma scopas | 小高鰭刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3544 | Zebrasoma velifer | 橫帶高鰭刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3569 | Acanthurus bariene | 鰓斑刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3570 | Acanthurus blochii | 布氏刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3571 | Acanthurus guttatus | 斑點刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3572 | Acanthurus leucopareius | 白頰刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3573 | Acanthurus maculiceps | 斑頭刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3574 | Acanthurus nigricauda | 黑尾刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3575 | Acanthurus pyroferus | 黑鰓刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3576 | Acanthurus sohal | 紅海刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3765 | Centropyge bicolor | 二色刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 3766 | Centropyge ferrugata | 鏽紅刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 3767 | Centropyge fisheri | 條尾刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 3768 | Centropyge interrupta | 斷線刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 3769 | Centropyge nox | 黑刺尻魚 | 海水 | 本土 |
| 3777 | Chaetodon baronessa | 曲紋蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3778 | Chaetodon falcula | 紋帶蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3779 | Chaetodon guentheri | 貢氏蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3780 | Chaetodon madagaskariensis | 馬達加斯加蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3781 | Chaetodon mertensii | 默氏蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3782 | Chaetodon meyeri | 麥氏蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3783 | Chaetodon miliaris | 粟點蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3784 | Chaetodon nippon | 日本蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3785 | Chaetodon plebeius | 四棘蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3786 | Chaetodon quadrimaculatus | 四點蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3787 | Chaetodon reticulatus | 網紋蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3788 | Chaetodon selene | 彎月蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3789 | Chaetodon triangulum | 三角蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3790 | Chaetodon trifasciatus | 三帶蝴蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 3791 | Chaetodontoplus cephalareticulatus | 網紋頭荷包魚 | 海水 | 本土 |
| 3792 | Chaetodontoplus chrysocephalus | 黃頭荷包魚 | 海水 | 本土 |
| 3793 | Chaetodontoplus duboulayi | 眼帶荷包魚 | 海水 | 本土 |
| 3794 | Chaetodontoplus melanosoma | 黑身荷包魚 | 海水 | 本土 |
| 3795 | Chaetodontoplus mesoleucus | 中白荷包魚 | 海水 | 本土 |
| 3796 | Chaetodontoplus personifer | 罩面荷包魚 | 海水 | 本土 |
| 3888 | Ctenochaetus binotatus | 雙斑櫛齒刺尾魚 | 海水 | 本土 |
| 3910 | Deveximentum indicium | 印度仰口鰏 | 海水 | 本土 |
| 3911 | Deveximentum interruptum | 間斷仰口鰏 | 海水 | 本土 |
| 4010 | Equulites absconditus | 秘馬鰏 | 海水 | 本土 |
| 4011 | Equulites lineolatus | 粗紋馬鰏 | 海水 | 本土 |
| 4012 | Equulites rivulatus | 條馬鰏 | 海水 | 本土 |
| 4062 | Gazza achlamys | 寬身牙鰏 | 海水 | 本土 |
| 4063 | Genicanthus semifasciatus | 半紋月蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 4064 | Genicanthus watanabei | 渡邊月蝶魚 | 海水 | 本土 |
| 4210 | Karalla daura | 黑斑卡拉鰏 | 海水 | 本土 |
| 4330 | Naso lopezi | 洛氏鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 4331 | Naso maculatus | 斑鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 4332 | Naso minor | 小鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 4333 | Naso reticulatus | 網紋鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 4334 | Naso tergus | 大眼鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 4335 | Naso tonganus | 球吻鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 4367 | Nuchequula mannusella | 圈項鰏 | 海水 | 本土 |
| 4368 | Nuchequula nuchalis | 項斑項鰏 | 海水 | 本土 |
| 4440 | Paracentropyge multifasciata | 多帶副鋸刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 4502 | Photopectoralis aureus | 金黃光胸鰏 | 海水 | 本土 |
| 4510 | Platax batavianus | 印尼燕魚 | 海水 | 本土 |
| 4511 | Platax pinnatus | 彎鰭燕魚 | 海水 | 本土 |
| 4554 | Pomacanthus arcuatus | 弓紋刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 4555 | Pomacanthus navarchus | 馬鞍刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 4556 | Pomacanthus xanthometopon | 黃顱刺蓋魚 | 海水 | 本土 |
| 4711 | Siganus argenteus | 銀色籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 4712 | Siganus punctatissimus | 黑身籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 4713 | Siganus vulpinus | 狐籃子魚 | 海水 | 本土 |
| 4873 | Equulites elongatus | 長身馬鰏 | 海水 | 本土 |
| 4884 | Karalla dussumieri | 杜氏卡拉鰏 | 海水 | 本土 |
| 鱘形目 Acipenseriformes | ||||
| 71 | Acipenser baerii | 西伯利亞鱘 | 淡水 | 本土 |
| 72 | Acipenser dabryanus | 達氏鱘 | 淡水 | 本土 |
| 73 | Acipenser gueldenstaedtii | 俄羅斯鱘 | 淡水 | 引入種 |
| 74 | Acipenser mikadoi | 米氏鱘 | 淡水/海水 | 本土 |
| 75 | Acipenser nudiventris | 裸腹鱘 | 淡水 | 引入種 |
| 76 | Acipenser ruthenus | 小體鱘 | 淡水 | 引入種 |
| 77 | Acipenser schrenckii | 史氏鱘 | 淡水 | 本土 |
| 78 | Acipenser sinensis | 中華鱘 | 淡水/海水 | 本土 |
| 79 | Acipenser stellatus | 閃光鱘 | 淡水 | 引入種 |
| 1431 | Huso dauricus | 鰉 | 淡水 | 本土 |
| 2362 | Psephurus gladius | 白鱘 | 淡水/海水 | 特有種 |
| 發光鯛目 Acropomatiformes | ||||
| 81 | Acropoma japonicum | 日本發光鯛 | 海水 | 本土 |
| 321 | Banjos banjos | 壽魚 | 海水 | 本土 |
| 547 | Champsodon snyderi | 短鱷齒魚 | 海水 | 本土 |
| 934 | Doederleinia berycoides | 赤鯥 | 海水 | 本土 |
| 1128 | Glaucosoma buergeri | 葉鯛 | 海水 | 本土 |
| 1392 | Histiopterus typus | 帆鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 1427 | Howella brodiei | 布氏尖棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 1540 | Lateolabrax japonicus | 日本花鱸 | 海水 | 本土 |
| 1680 | Malakichthys elegans | 美軟魚 | 海水 | 本土 |
| 1681 | Malakichthys griseus | 灰軟魚 | 海水 | 本土 |
| 2174 | Pempheris adusta | 暗單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 2175 | Pempheris japonica | 日本單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 2176 | Pempheris oualensis | 黑稍單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 2181 | Pentaceros japonicus | 日本五棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 2861 | Scombrops boops | 牛眼青鯥 | 海水 | 本土 |
| 3133 | Synagrops japonicus | 日本尖牙鱸(光棘尖牙鱸) | 海水 | 本土 |
| 3564 | Acanthaphritis barbata | 須棘吻魚 | 海水 | 本土 |
| 3582 | Acropoma hanedai | 圓鱗發光鯛 | 海水 | 本土 |
| 3681 | Bathysphyraenops simplex | 深海擬野鱸 | 海水 | 本土 |
| 3797 | Champsodon guentheri | 貢氏鱷齒魚 | 海水 | 本土 |
| 4255 | Limnichthys fasciatus | 條紋沼澤魚 | 海水 | 本土 |
| 4286 | Malakichthys wakiyae | 脅谷軟魚 | 海水 | 本土 |
| 4347 | Neobathyclupea gracilis | 細身深海鯡 | 海水 | 本土 |
| 4348 | Neobathyclupea japanotaiwana | 日台深海鯡 | 海水 | 本土 |
| 4406 | Osopsaron formosensis | 台灣小骨鰧 | 海水 | 本土 |
| 4468 | Parapriacanthus ransonneti | 紅海副單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4471 | Parascombrops analis | 多棘擬鯥 | 海水 | 本土 |
| 4472 | Parascombrops glossodon | 舌齒擬鯥 | 海水 | 本土 |
| 4473 | Parascombrops mochizukii | 望月氏擬鯥 | 海水 | 本土 |
| 4474 | Parascombrops nakayamai | 中山氏擬鯥 | 海水 | 本土 |
| 4475 | Parascombrops philippinensis | 小鱗尖牙鱸 | 海水 | 本土 |
| 4476 | Parascombrops serratospinosus | 鋸棘尖牙鱸 | 海水 | 本土 |
| 4477 | Parascombrops yamanouei | 山野上氏擬鯥 | 海水 | 本土 |
| 4490 | Pempheris nyctereutes | 白邊單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4491 | Pempheris schwenkii | 銀腹單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4492 | Pempheris vanicolensis | 黑緣單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4636 | Pteropsaron evolans | 帆鰭鱸鰧 | 海水 | 本土 |
| 4762 | Symphysanodon katayamai | 片山愈牙鮨 | 海水 | 本土 |
| 4833 | Verilus pacificus | 太平洋新鯥 | 海水 | 本土 |
| 4900 | Pempheris molucca | 摩鹿加單鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 北梭魚目 Albuliformes | ||||
| 113 | Albula glossodonta | 圓頜北梭魚 | 海水 | 本土 |
| 114 | Albula vulpes | 北梭魚 | 海水 | 本土 |
| 2496 | Pterothrissus gissu | 長背魚 | 海水 | 本土 |
| 3583 | Albula koreana | 東海北梭魚 | 海水 | 本土 |
| 黑頭魚目 Alepocephaliformes | ||||
| 123 | Alepocephalus longiceps | 長鰭平頭魚 | 海水 | 本土 |
| 124 | Alepocephalus longirostris | 長吻平頭魚 | 海水 | 本土 |
| 125 | Alepocephalus triangularis | 尖吻平頭魚 | 海水 | 本土 |
| 126 | Alepocephalus umbriceps | 暗首平頭魚 | 海水 | 本土 |
| 1582 | Leptoderma retropinna | 連尾細皮平頭魚 | 海水 | 本土 |
| 1800 | Narcetes lloydi | 魯氏黑口魚 | 海水 | 本土 |
| 2647 | Rouleina guentheri | 根室魯氏魚 | 海水 | 本土 |
| 2648 | Rouleina watasei | 渡瀨魯氏魚 | 海水 | 本土 |
| 3187 | Talismania antillarum | 安的列斯塔氏魚 | 海水 | 本土 |
| 3188 | Talismania brachycephala | 短頭塔氏魚 | 海水 | 本土 |
| 3585 | Alepocephalus bicolor | 雙色平頭魚 | 海水 | 本土 |
| 4838 | Xenodermichthys nodulosus | 日本裸平頭魚 | 海水 | 本土 |
| 攀鱸目 Anabantiformes | ||||
| 181 | Anabas testudineus | 攀鱸 | 淡水 | 本土 |
| 548 | Channa argus | 烏鱧 | 淡水 | 本土 |
| 549 | Channa asiatica | 月鱧 | 淡水 | 本土 |
| 550 | Channa gachua | 緣鱧(寬額鱧) | 淡水 | 本土 |
| 551 | Channa lucius | 帶鱧 | 淡水 | 本土 |
| 552 | Channa maculata | 斑鱧 | 淡水 | 本土 |
| 553 | Channa marulius | 巨眼鱧 | 淡水 | 本土 |
| 554 | Channa nox | 黑月鱧 | 淡水 | 本土 |
| 555 | Channa orientalis | 東方鱧 | 淡水 | 本土 |
| 556 | Channa punctata | 翠鱧 | 淡水 | 本土 |
| 557 | Channa shingon | 真言鱧 | 淡水 | 本土 |
| 558 | Channa striata | 線鱧 | 淡水 | 本土 |
| 843 | Dario dayingensis | 紫紅達里奧鱸 | 淡水 | 本土 |
| 1669 | Macropodus ocellatus | 眼斑鬥魚 | 淡水 | 本土 |
| 1670 | Macropodus opercularis | 叉尾鬥魚 | 淡水 | 本土 |
| 2002 | Osphronemus goramy | 點額絲足鱸 | 淡水 | 本土 |
| 3274 | Trichopodus trichopterus | 絲鰭毛足鬥魚 | 淡水 | 本土 |
| 4802 | Trichogaster fasciata | 條紋毛足鱸 | 淡水 | 引入種 |
| 4803 | Trichogaster labiosa | 厚唇毛足鱸 | 淡水 | 引入種 |
| 4804 | Trichogaster lalius | 紅紋毛足鱸(小密鱸) | 淡水 | 引入種 |
| 4806 | Trichopodus leerii | 珍珠毛足鬥魚 | 淡水 | 引入種 |
| 4807 | Trichopodus microlepis | 小鱗毛足鱸 | 淡水 | 引入種 |
| 4888 | Macropodus hongkongensis | 香港鬥魚 | 淡水 | 本土 |
| 鰻鱺目 Anguilliformes | ||||
| 192 | Anguilla japonica | 日本鰻鱺 | 淡水/海水 | 本土 |
| 193 | Anguilla marmorata | 花鰻鱺 | 淡水/海水 | 本土 |
| 227 | Apterichtus hatookai | 橘斑無鰭蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 238 | Ariosoma anago | 穴美體鰻(齊頭鰻) | 海水 | 本土 |
| 239 | Ariosoma anagoides | 擬穴美體鰻(奇鰻) | 海水 | 本土 |
| 240 | Ariosoma majus | 大奇鰻 | 海水 | 本土 |
| 284 | Avocettina infans | 喙吻鰻 | 海水 | 本土 |
| 335 | Bascanichthys longipinnis | 長鰭褐蛇鰻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 345 | Bathyuroconger vicinus | 深海尾鰻 | 海水 | 本土 |
| 395 | Brachysomophis crocodilinus | 鱷形短體蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 396 | Brachysomophis porphyreus | 紫身短體蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 414 | Callechelys maculatus | 斑紋麗蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 641 | Cirrhimuraena chinensis | 中華須鰻 | 海水 | 本土 |
| 642 | Cirrhimuraena yuanding | 元鼎須鰻 | 海水 | 本土 |
| 712 | Conger cinereus | 灰康吉鰻 | 海水 | 本土 |
| 713 | Conger japonicus | 日本康吉鰻 | 海水 | 本土 |
| 714 | Conger myriaster | 星康吉鰻 | 海水 | 本土 |
| 715 | Congresox talabonoides | 似原鶴海鰻 | 海水 | 本土 |
| 946 | Dysomma anguillare | 前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 949 | Echidna delicatula | 棕斑蛇鱔 | 海水 | 本土 |
| 950 | Echidna nebulosa | 雲紋蛇鱔(雲紋海鱔) | 海水 | 本土 |
| 951 | Echidna polyzona | 多帶蛇鱔(多帶海鱔) | 海水 | 本土 |
| 1168 | Gnathophis nystromi | 尼氏頜吻鰻 | 海水 | 本土 |
| 1249 | Gymnomuraena zebra | 條紋裸海鱔 | 海水 | 本土 |
| 1251 | Gymnothorax fimbriatus | 細斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1252 | Gymnothorax flavimarginatus | 黃邊裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1253 | Gymnothorax isingteena | 魔斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1254 | Gymnothorax meleagris | 斑點裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1255 | Gymnothorax minor | 小裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1256 | Gymnothorax pictus | 花斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1257 | Gymnothorax prionodon | 鋸齒裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1258 | Gymnothorax pseudothyrsoideus | 密網裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1259 | Gymnothorax punctatofasciatus | 斑條裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1260 | Gymnothorax reevesii | 勻斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1261 | Gymnothorax reticularis | 網紋裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1262 | Gymnothorax richardsonii | 異紋裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1263 | Gymnothorax rueppelliae | 鞍斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1264 | Gymnothorax thyrsoideus | 密點裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1265 | Gymnothorax undulatus | 波紋裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 1549 | Leiuranus semicinctus | 半環蓋蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1762 | Moringua macrocephalus | 大頭蚓鰻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1763 | Moringua raitaborua | 賴塔蚓鰻 | 淡水 | 本土 |
| 1770 | Muraenesox bagio | 褐海鰻 | 海水 | 本土 |
| 1771 | Muraenesox cinereus | 海鰻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1772 | Muraenesox yamaguchiensis | 山口海鰻 | 海水 | 本土 |
| 1773 | Muraenichthys gymnopterus | 裸鰭蟲鰻 | 海水 | 本土 |
| 1783 | Myrichthys colubrinus | 斑竹花蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1784 | Myrichthys maculosus | 斑紋花蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1820 | Neenchelys parvipectoralis | 微鰭新蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1831 | Nemichthys scolopaceus | 線鰻(線口鰻) | 海水 | 本土 |
| 1879 | Nettastoma parviceps | 小頭絲鰻(小頭鴨嘴鰻) | 海水 | 本土 |
| 1948 | Ophichthus apicalis | 尖吻蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1949 | Ophichthus fasciatus | 橫帶蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1950 | Ophichthus retrodorsalis | 後鰭蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1951 | Ophichthus tchangi | 張氏蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1952 | Ophichthus woosuitingi | 伍氏蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 1956 | Ophisurus macrorhynchos | 大吻沙蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 2034 | Oxyconger leptognathus | 細頜鰻 | 海水 | 本土 |
| 2056 | Parabathymyrus macrophthalmus | 大眼擬海蠕鰻 | 海水 | 本土 |
| 2217 | Pisodonophis boro | 雜食豆齒鰻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2218 | Pisodonophis cancrivorus | 食蟹豆齒鰻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2698 | Saurenchelys fierasfer | 線尾蜥鰻 | 海水 | 本土 |
| 2879 | Scuticaria tigrina | 虎斑鞭尾鱔 | 海水 | 本土 |
| 2936 | Simenchelys parasitica | 寄生鰻 | 海水 | 本土 |
| 3136 | Synaphobranchus affinis | 長鰭合鰓鰻(連鰓鰻) | 海水 | 本土 |
| 3137 | Synaphobranchus brevidorsalis | 短背鰭合鰓鰻 | 海水 | 本土 |
| 3138 | Synaphobranchus kaupii | 高氏合鰓鰻 | 海水 | 本土 |
| 3439 | Uroconger lepturus | 尖尾鰻 | 海水 | 本土 |
| 3442 | Uropterygius concolor | 單色尾鱔 | 海水 | 本土 |
| 3443 | Uropterygius marmoratus | 花斑尾鱔 | 海水 | 本土 |
| 3502 | Xyrias revulsus | 列齒蛇鰻(光唇蛇鰻) | 海水 | 本土 |
| 3608 | Anarchias allardicei | 褐高眉鱔 | 海水 | 本土 |
| 3611 | Anguilla bicolor | 雙色鰻鱺 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3637 | Ariosoma fasciatum | 條紋美體鰻 | 海水 | 本土 |
| 3638 | Ariosoma meeki | 米克氏美體鰻 | 海水 | 本土 |
| 3639 | Ariosoma shiroanago | 白穴美體鰻 | 海水 | 本土 |
| 3666 | Bascanichthys kabeyawan | 龜壁灣褐蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 3669 | Bathycongrus melanostomus | 黑口深海糯鰻 | 海水 | 本土 |
| 3670 | Bathycongrus retrotinctus | 網格深海康吉鰻 | 海水 | 本土 |
| 3678 | Bathymyrus simus | 銼吻淵油鰻(銼吻海康吉鰻) | 海水 | 本土 |
| 3710 | Brachysomophis cirrocheilos | 須唇短體蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 3711 | Brachysomophis longipinnis | 長鰭短體蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 3724 | Callechelys marmorata | 雲紋麗蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 3798 | Channomuraena vittata | 寬帶鱧鱔 | 海水 | 本土 |
| 3816 | Chlopsis nanhaiensis | 南海草鰻 | 海水 | 本土 |
| 3847 | Cirricaecula macdowelli | 麥氏無鰭須蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 3848 | Cirrimaxilla formosa | 台灣頜須鱔(須裸海鱔) | 海水 | 本土 |
| 3871 | Coloconger maculatus | 斑點短糯鰻 | 海水 | 本土 |
| 3873 | Congresox talabon | 原鶴海鰻 | 海水 | 本土 |
| 3932 | Dysomma dolichosomatum | 長身前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3933 | Dysomma goslinei | 高氏前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3934 | Dysomma longirostrum | 長吻前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3935 | Dysomma melanurum | 黑尾前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3936 | Dysomma opisthoproctus | 後臀前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3937 | Dysomma polycatodon | 多齒前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3938 | Dysomma taiwanense | 台灣前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3939 | Dysommina rugosa | 後肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 3940 | Echelus polyspondylus | 多椎鰭蠕鰻 | 海水 | 本土 |
| 3941 | Echidna xanthospilos | 黃點蛇鱔 | 海水 | 本土 |
| 3953 | Enchelycore bayeri | 貝氏勾吻鱔 | 海水 | 本土 |
| 3954 | Enchelycore bikiniensis | 比基尼勾吻鱔 | 海水 | 本土 |
| 3955 | Enchelycore lichenosa | 苔斑勾吻鱔 | 海水 | 本土 |
| 3956 | Enchelycore nigricans | 褐勾吻鱔 | 海水 | 本土 |
| 3957 | Enchelycore pardalis | 豹紋勾吻鱔 | 海水 | 本土 |
| 3958 | Enchelycore schismatorhynchus | 裂紋勾吻鱔 | 海水 | 本土 |
| 4061 | Gavialiceps taiwanensis | 台灣鱷頭鰻 | 海水 | 本土 |
| 4095 | Gorgasia japonica | 日本園鰻 | 海水 | 本土 |
| 4096 | Gorgasia taiwanensis | 台灣園鰻 | 海水 | 本土 |
| 4104 | Gymnothorax albimarginatus | 白緣裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4105 | Gymnothorax berndti | 班第氏裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4106 | Gymnothorax buroensis | 伯恩斯裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4107 | Gymnothorax chilospilus | 雲紋裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4108 | Gymnothorax chlamydatus | 黑環裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4109 | Gymnothorax eurostus | 霉身裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4110 | Gymnothorax favagineus | 豆點裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4111 | Gymnothorax hepaticus | 白邊裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4112 | Gymnothorax herrei | 海氏裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4113 | Gymnothorax javanicus | 爪哇裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4114 | Gymnothorax kidako | 蠕紋裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4115 | Gymnothorax margaritophorus | 斑項裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4116 | Gymnothorax melanosomatus | 黑身裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4117 | Gymnothorax melatremus | 黃體裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4118 | Gymnothorax monostigma | 眼斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4119 | Gymnothorax neglectus | 細花斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4120 | Gymnothorax niphostigmus | 雪花斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4121 | Gymnothorax nudivomer | 裸犁裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4122 | Gymnothorax phasmatodes | 無斑裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4123 | Gymnothorax pindae | 平氏裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4124 | Gymnothorax poikilospilus | 海水 | 本土 | |
| 4125 | Gymnothorax polyuranodon | 豹紋裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4126 | Gymnothorax prolatus | 長身裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4127 | Gymnothorax pseudomelanosomatus | 擬黑身裸胸鯙 | 海水 | 本土 |
| 4128 | Gymnothorax sagmacephalus | 鞍頭裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4129 | Gymnothorax shaoi | 邵氏裸胸鯙 | 海水 | 本土 |
| 4130 | Gymnothorax taiwanensis | 台灣裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4131 | Gymnothorax ypsilon | 褐首裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4132 | Gymnothorax zonipectis | 帶尾裸胸鱔 | 海水 | 本土 |
| 4164 | Heteroconger hassi | 哈氏異康吉鰻 | 海水 | 本土 |
| 4211 | Kaupichthys diodontus | 雙齒眶鼻鰻 | 海水 | 本土 |
| 4212 | Kaupichthys hyoproroides | 高體眶鼻鰻 | 海水 | 本土 |
| 4281 | Macrocephenchelys brevirostris | 短吻大頭糯鰻 | 海水 | 本土 |
| 4292 | Meadia roseni | 羅氏箭齒前肛鰻 | 海水 | 本土 |
| 4316 | Moringua abbreviata | 短線蚓鰻 | 海水 | 本土 |
| 4339 | Neenchelys cheni | 陳氏新蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4340 | Neenchelys diaphora | 異新鰻 | 海水 | 本土 |
| 4341 | Neenchelys mccoskeri | 麥氏新蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4342 | Neenchelys pelagica | 大洋新鰻 | 海水 | 本土 |
| 4343 | Neenchelys similis | 長身新蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4388 | Ophichthus aphotistos | 暗鰭蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4389 | Ophichthus bicolor | 高鰭蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4390 | Ophichthus bonaparti | 鮑氏蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4391 | Ophichthus celebicus | 西里伯斯蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4392 | Ophichthus cephalozona | 項斑蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4393 | Ophichthus erabo | 斑紋蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4394 | Ophichthus lithinus | 石蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4395 | Ophichthus macrochir | 大鰭蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4396 | Ophichthus polyophthalmus | 多斑蛇鰻(眼斑蛇鰻) | 海水 | 本土 |
| 4397 | Ophichthus semilunatus | 半月蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4398 | Ophichthus tsuchidae | 柴田氏蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4399 | Ophichthus urolophus | 裙鰭蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4434 | Parabathymyrus brachyrhynchus | 短吻擬海蠕鰻 | 海水 | 本土 |
| 4604 | Pseudechidna brummeri | 擬蛇鱔 | 海水 | 本土 |
| 4647 | Pylorobranchus hoi | 何氏雙鰭鰻 | 海水 | 本土 |
| 4658 | Rhinomuraena quaesita | 大口管鼻鱔 | 海水 | 本土 |
| 4662 | Rhynchoconger ectenurus | 黑尾吻鰻 | 海水 | 本土 |
| 4673 | Saurenchelys lateromaculata | 海水 | 本土 | |
| 4683 | Scolecenchelys gymnota | 裸身蠕蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4684 | Scolecenchelys iredalei | 愛氏蠕蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4685 | Scolecenchelys macroptera | 大鰭蠕蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4748 | Strophidon dorsalis | 長背長鯙 | 海水 | 本土 |
| 4749 | Strophidon sathete | 長尾彎牙海鱔(長海鱔) | 淡水/海水 | 本土 |
| 4818 | Uropterygius macrocephalus | 大頭尾鱔 | 海水 | 本土 |
| 4819 | Uropterygius micropterus | 小鰭尾鱔 | 海水 | 本土 |
| 4820 | Uropterygius nagoensis | 網紋尾鱔 | 海水 | 本土 |
| 4821 | Uropterygius oligospondylus | 少椎尾鱔 | 海水 | 本土 |
| 4842 | Xyrias chioui | 邱氏列齒蛇鰻 | 海水 | 本土 |
| 4844 | Yirrkala misolensis | 米蘇爾細犁鰻 | 海水 | 本土 |
| 4855 | Ariosoma megalops | 大眼美體鰻 | 海水 | 本土 |
| 水珍魚目 Argentiniformes | ||||
| 228 | Argentina kagoshimae | 鹿兒島水珍魚 | 海水 | 本土 |
| 935 | Dolichopteryx longipes | 長頭胸翼魚 | 海水 | 本土 |
| 1799 | Nansenia ardesiaca | 南氏魚 | 海水 | 本土 |
| 1957 | Opisthoproctus soleatus | 後肛魚 | 海水 | 本土 |
| 4078 | Glossanodon semifasciatus | 半帶舌珍魚 | 海水 | 本土 |
| 辮魚目 Ateleopodiformes | ||||
| 265 | Ateleopus japonicus | 日本辮魚 | 海水 | 本土 |
| 266 | Ateleopus purpureus | 紫辮魚 | 海水 | 本土 |
| 1456 | Ijimaia dofleini | 大眼大辮魚 | 海水 | 本土 |
| 銀漢魚目 Atheriniformes | ||||
| 268 | Atherinomorus lacunosus | 南洋美銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 1436 | Hypoatherina temminckii | 坦氏下銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 1437 | Hypoatherina valenciennei | 凡氏下銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 3659 | Atherinomorus insularum | 島嶼美銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 3660 | Atherinomorus pinguis | 壯體美銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 3661 | Atherion elymus | 糙頭細銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 4181 | Hypoatherina tsurugae | 後肛下銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 4182 | Hypoatherina woodwardi | 吳氏下銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 4197 | Iso flosmaris | 浪花銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 4198 | Iso rhothophilus | 澳洲浪花銀漢魚 | 海水 | 本土 |
| 仙女魚目 Aulopiformes | ||||
| 122 | Alepisaurus ferox | 帆蜥魚 | 海水 | 本土 |
| 343 | Bathypterois atricolor | 小眼深海狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 344 | Bathypterois guentheri | 貢氏深海狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 362 | Benthalbella linguidens | 舌齒深海珠目魚 | 海水 | 本土 |
| 603 | Chlorophthalmus acutifrons | 尖額青眼魚 | 海水 | 本土 |
| 604 | Chlorophthalmus agassizi | 尖吻青眼魚 | 海水 | 本土 |
| 605 | Chlorophthalmus albatrossis | 大眼青眼魚 | 海水 | 本土 |
| 606 | Chlorophthalmus nigromarginatus | 黑緣青眼魚 | 海水 | 本土 |
| 694 | Coccorella atrata | 阿氏谷口魚 | 海水 | 本土 |
| 1055 | Evermannella indica | 印度齒口魚 | 海水 | 本土 |
| 1298 | Harpadon microchir | 短臂龍頭魚 | 海水 | 本土 |
| 1299 | Harpadon nehereus | 龍頭魚 | 海水 | 本土 |
| 1378 | Hime japonica | 日本姬魚 | 海水 | 本土 |
| 1587 | Lestidium prolixum | 長裸蜥魚 | 海水 | 本土 |
| 1588 | Lestrolepis japonica | 日本光鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1907 | Odontostomops normalops | 細眼擬強牙巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 1921 | Omosudis lowii | 錘頜魚 | 海水 | 本土 |
| 2699 | Saurida elongata | 長體蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 2700 | Saurida filamentosa | 長條蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 2701 | Saurida gracilis | 細蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 2702 | Saurida microlepis | 小鱗蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 2703 | Saurida micropectoralis | 短臂蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 2704 | Saurida tumbil | 多齒蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 2705 | Saurida wanieso | 鱷蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 2862 | Scopelarchus analis | 柔珠目魚 | 海水 | 本土 |
| 2863 | Scopelarchus guentheri | 根室珠目魚 | 海水 | 本土 |
| 3145 | Synodus binotatus | 雙斑狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 3146 | Synodus fuscus | 褐狗母魚(背斑狗母魚) | 海水 | 本土 |
| 3147 | Synodus hoshinonis | 肩班狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 3148 | Synodus jaculum | 射狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 3149 | Synodus kaianus | 方斑狗母魚(灰狗母魚) | 海水 | 本土 |
| 3150 | Synodus macrops | 叉斑狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 3151 | Synodus rubromarmoratus | 紅花斑狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 3152 | Synodus ulae | 紅斑狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 3153 | Synodus variegatus | 雜斑狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 3256 | Trachinocephalus trachinus | 擬龍鰧大頭花桿狗母 | 海水 | 本土 |
| 3817 | Chlorophthalmus borealis | 北域青眼魚 | 海水 | 本土 |
| 4169 | Hime formosana | 台灣姬魚 | 海水 | 本土 |
| 4236 | Leptaulopus damasi | 達氏姬魚 | 海水 | 本土 |
| 4241 | Lestidium longilucifer | 長燈裸蜥魚 | 海水 | 本土 |
| 4242 | Lestidium orientale | 東方裸蜥魚 | 海水 | 本土 |
| 4243 | Lestidium rofeni | 盧氏裸蜥魚 | 海水 | 本土 |
| 4244 | Lestrolepis intermedia | 中間光鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4245 | Lestrolepis nigroventralis | 黑腹光鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4674 | Saurida nebulosa | 雲紋蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 4675 | Saurida umeyoshii | 梅芳蛇鯔 | 海水 | 本土 |
| 4689 | Scopelosaurus adleri | 艾氏弱蜥魚 | 海水 | 本土 |
| 4771 | Synodus capricornis | 羊角狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 4772 | Synodus dermatogenys | 革狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 4773 | Synodus doaki | 道氏狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 4774 | Synodus lobeli | 洛氏狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 4775 | Synodus orientalis | 東方狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 4776 | Synodus pacificus | 太平洋狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 4777 | Synodus taiwanensis | 台灣狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 4778 | Synodus tectus | 肩蓋狗母魚 | 海水 | 本土 |
| 蟾魚目 Batrachoidiformes | ||||
| 1292 | Halophryne diemensis | 橫帶小孔蟾魚 | 海水 | 本土 |
| 鶴鱵目 Beloniformes | ||||
| 10 | Ablennes hians | 橫帶扁頜針魚 | 海水 | 本土 |
| 577 | Cheilopogon agoo | 燕鰩須唇飛魚（燕鰩魚） | 海水 | 本土 |
| 578 | Cheilopogon arcticeps | 弓頭唇須飛魚 | 海水 | 本土 |
| 579 | Cheilopogon atrisignis | 紅斑須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 580 | Cheilopogon cyanopterus | 青翼須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 581 | Cheilopogon doederleinii | 多氏須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 582 | Cheilopogon pinnatibarbatus | 翼髭鬚唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 583 | Cheilopogon spilopterus | 點鰭須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 711 | Cololabis saira | 秋刀魚 | 海水 | 本土 |
| 833 | Cypselurus oligolepis | 少鱗燕鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 834 | Cypselurus poecilopterus | 花鰭燕鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 835 | Cypselurus starksi | 斯氏燕鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 1045 | Euleptorhamphus viridis | 長吻鱵 | 海水 | 本土 |
| 1059 | Exocoetus volitans | 大頭飛魚 | 海水 | 本土 |
| 1343 | Hemiramphus convexus | 黑鰭鱵 | 海水 | 本土 |
| 1344 | Hemiramphus far | 斑鱵 | 海水 | 本土 |
| 1389 | Hirundichthys oxycephalus | 尖頭文鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 1390 | Hirundichthys rondeletii | 黑翼文鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 1391 | Hirundichthys speculiger | 尖鰭文鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 1442 | Hyporhamphus dussumieri | 杜氏下鱵魚 | 海水 | 本土 |
| 1443 | Hyporhamphus gernaerti | 簡氏下鱵魚 | 海水 | 本土 |
| 1444 | Hyporhamphus intermedius | 間下鱵 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1445 | Hyporhamphus limbatus | 緣下鱵 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1446 | Hyporhamphus paucirastris | 少耙下鱵魚 | 海水 | 本土 |
| 1447 | Hyporhamphus quoyi | 瓜氏下鱵魚 | 海水 | 本土 |
| 1448 | Hyporhamphus sajori | 沙氏下鱵 | 海水 | 本土 |
| 1998 | Oryzias curvinotus | 弓背青鱂 | 淡水 | 本土 |
| 1999 | Oryzias latipes | 青鱂 | 淡水 | 本土 |
| 2000 | Oryzias minutillus | 小青鱂 | 淡水 | 本土 |
| 2001 | Oryzias sinensis | 中華青鱂 | 淡水 | 本土 |
| 2038 | Oxyporhamphus micropterus | 白鰭飛鱵 | 海水 | 本土 |
| 2156 | Parexocoetus brachypterus | 短鰭擬飛魚 | 海水 | 本土 |
| 2238 | Platybelone platyura | 寬尾頜針魚 | 海水 | 本土 |
| 2639 | Rhynchorhamphus georgii | 喬氏吻鱵 | 海水 | 本土 |
| 3122 | Strongylura anastomella | 尖嘴柱頜針魚 | 海水 | 本土 |
| 3123 | Strongylura leiura | 無斑柱頜針魚 | 海水 | 本土 |
| 3124 | Strongylura strongylura | 尾斑柱頜針魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3418 | Tylosurus crocodilus | 大圓頜針魚 | 海水 | 本土 |
| 3419 | Tylosurus melanotus | 叉尾頜針魚 | 海水 | 本土 |
| 3549 | Zenarchopterus buffonis | 蟾異鱗鱵 | 海水 | 本土 |
| 3807 | Cheilopogon furcatus | 斑翼須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 3808 | Cheilopogon spilonotopterus | 點背須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 3809 | Cheilopogon suttoni | 蘇氏須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 3810 | Cheilopogon unicolor | 白鰭須唇飛魚 | 海水 | 本土 |
| 3897 | Cypselurus angusticeps | 細頭燕鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 3898 | Cypselurus naresii | 納氏燕鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 4042 | Exocoetus monocirrhus | 單須飛魚 | 海水 | 本土 |
| 4161 | Hemiramphus lutkei | 無斑鱵 | 海水 | 本土 |
| 4184 | Hyporhamphus taiwanensis | 台灣下鱵魚 | 淡水 | 本土 |
| 4185 | Hyporhamphus yuri | 尤氏下鱵魚 | 海水 | 本土 |
| 4481 | Parexocoetus mento | 長頜擬飛魚 | 海水 | 本土 |
| 4588 | Prognichthys brevipinnis | 短鰭真燕鰩(短鰭燕飛魚) | 海水 | 本土 |
| 4747 | Strongylura incisa | 琉球柱頜針魚 | 海水 | 本土 |
| 4847 | Zenarchopterus dunckeri | 董氏異鱗鱵 | 海水 | 本土 |
| 4848 | Zenarchopterus ectuntio | 恆河異鱗鱵 | 淡水 | 本土 |
| 4867 | Cypselurus simus | 單峰燕鰩魚 | 海水 | 本土 |
| 4922 | Zenarchopterus striga | 條紋異鱗鱵 | 海水 | 本土 |
| 金眼鯛目 Beryciformes | ||||
| 20 | Acanthochaenus luetkenii | 羅氏棘冠鯛 | 海水 | 本土 |
| 331 | Barbourisia rufa | 紅刺鯨口魚 | 海水 | 本土 |
| 368 | Beryx splendens | 紅金眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 485 | Centroberyx lineatus | 線紋擬棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 515 | Cetichthys indagator | 裂鯨口魚 | 海水 | 本土 |
| 1053 | Eutaeniophorus festivus | 莫桑比克真鰻口魚 | 海水 | 本土 |
| 1700 | Melamphaes simus | 洞孔頭鯛 | 海水 | 本土 |
| 2646 | Rondeletia loricata | 網肩龍氏鯨頭魚 | 海水 | 本土 |
| 2865 | Scopeloberyx opisthopterus | 後鰭燈孔鯛 | 海水 | 本土 |
| 2866 | Scopeloberyx robustus | 壯體燈孔鯛 | 海水 | 本土 |
| 2867 | Scopelogadus bispinosus | 大鱗鰓孔鯛 | 海水 | 本土 |
| 2868 | Scopelogadus mizolepis | 大鱗鱗孔鯛 | 海水 | 本土 |
| 3478 | Vitiaziella cubiceps | 方頭獅鼻魚 | 海水 | 本土 |
| 3688 | Beryx decadactylus | 大目金眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 3760 | Centroberyx rubricaudus | 金眼擬棘鯛 | 海水 | 特有種 |
| 4295 | Melamphaes leprus | 多耙孔頭鯛 | 海水 | 本土 |
| 䲁形目 Blenniiformes | ||||
| 258 | Aspidontus taeniatus | 縱帶盾齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 371 | Blenniella periophthalmus | 圍眼真動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 650 | Cirripectes castaneus | 頰紋穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 651 | Cirripectes quagga | 斑穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 652 | Cirripectes variolosus | 暗褐穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 978 | Enneapterygius etheostoma | 篩口雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 979 | Enneapterygius philippinus | 菲律賓雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 980 | Entomacrodus caudofasciatus | 尾帶犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 981 | Entomacrodus lighti | 賴氏犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 1304 | Helcogramma chica | 奇卡彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 1305 | Helcogramma fuscipectoris | 四紋彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 1472 | Istiblennius dussumieri | 杜氏動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 1473 | Istiblennius edentulus | 暗紋動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 1474 | Istiblennius lineatus | 條紋動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 1697 | Meiacanthus atrodorsalis | 金鰭稀棘䲁 | 海水 | 本土 |
| 1916 | Omobranchus aurosplendidus | 金色肩鰓䲁 | 海水 | 本土 |
| 1917 | Omobranchus elegans | 美肩鰓䲁 | 海水 | 本土 |
| 1918 | Omobranchus elongatus | 長肩鰓䲁 | 海水 | 本土 |
| 1919 | Omobranchus fasciolatoceps | 斑頭肩鰓䲁 | 海水 | 本土 |
| 1920 | Omobranchus germaini | 吉氏肩鰓䲁 | 海水 | 本土 |
| 2225 | Plagiotremus rhinorhynchos | 粗吻短帶䲁 | 海水 | 本土 |
| 2226 | Plagiotremus spilistius | 叉短帶䲁 | 海水 | 本土 |
| 2227 | Plagiotremus tapeinosoma | 窄體短帶䲁 | 海水 | 本土 |
| 2552 | Rhabdoblennius nitidus | 燦爛棒䲁 | 海水 | 本土 |
| 2657 | Salarias fasciatus | 細紋鳳䲁 | 海水 | 本土 |
| 3497 | Xiphasia setifer | 帶䲁 | 海水 | 本土 |
| 3587 | Alticus saliens | 跳彈䲁 | 海水 | 本土 |
| 3609 | Andamia reyi | 雷氏唇盤䲁 | 海水 | 本土 |
| 3610 | Andamia tetradactylus | 四指唇盤䲁 | 海水 | 本土 |
| 3650 | Aspidontus dussumieri | 杜氏盾齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3692 | Blenniella bilitonensis | 對斑真動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3693 | Blenniella caudolineata | 尾紋真動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3694 | Blenniella chrysospilos | 紅點真動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3695 | Blenniella interrupta | 斷紋真動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3775 | Ceratobregma helenae | 海倫額角三鰭䲁 | 海水 | 本土 |
| 3849 | Cirripectes auritus | 項斑穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 3850 | Cirripectes filamentosus | 絲背穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 3851 | Cirripectes fuscoguttatus | 微斑穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 3852 | Cirripectes imitator | 紫黑穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 3853 | Cirripectes perustus | 袋穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 3854 | Cirripectes polyzona | 多斑穗肩䲁 | 海水 | 本土 |
| 3942 | Ecsenius bicolor | 二色異齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3943 | Ecsenius frontalis | 額異齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3944 | Ecsenius lineatus | 線紋異齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3945 | Ecsenius namiyei | 納氏異齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3946 | Ecsenius oculus | 眼斑異齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3947 | Ecsenius yaeyamaensis | 八重山島異齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3959 | Enchelyurus kraussii | 克氏連鰭䲁 | 海水 | 本土 |
| 3968 | Enneapterygius bahasa | 馬來雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3969 | Enneapterygius cheni | 陳氏雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3970 | Enneapterygius elegans | 美麗雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3971 | Enneapterygius fasciatus | 條紋雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3972 | Enneapterygius flavoccipitis | 黃項雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3973 | Enneapterygius fuscoventer | 黑腹雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3974 | Enneapterygius hemimelas | 半黑雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3975 | Enneapterygius hsiojenae | 孝真雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3976 | Enneapterygius leucopunctatus | 白點雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3977 | Enneapterygius minutus | 小雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3978 | Enneapterygius nanus | 矮雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3979 | Enneapterygius niger | 黑色雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3980 | Enneapterygius nigricauda | 黑尾雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3981 | Enneapterygius pallidoserialis | 淡白斑雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3982 | Enneapterygius rhabdotus | 棒狀雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3983 | Enneapterygius rubicauda | 紅尾雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3984 | Enneapterygius shaoi | 卲氏雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3985 | Enneapterygius sheni | 沈氏雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3986 | Enneapterygius tutuilae | 隆背雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3987 | Enneapterygius unimaculatus | 單斑雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 3988 | Entomacrodus decussatus | 斑紋犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3989 | Entomacrodus epalzeocheilos | 觸角犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3990 | Entomacrodus longicirrus | 長鬚犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3991 | Entomacrodus niuafoouensis | 雲紋犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3992 | Entomacrodus striatus | 點斑犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 3993 | Entomacrodus thalassinus | 海犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 4041 | Exallias brevis | 短豹䲁 | 海水 | 本土 |
| 4150 | Helcogramma fuscopinna | 黑鰭彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 4151 | Helcogramma inclinata | 三角彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 4152 | Helcogramma obtusirostris | 鈍吻彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 4153 | Helcogramma striata | 縱帶彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 4154 | Helcogramma trigloides | 斑鰭彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 4155 | Helcogramma williamsi | 威氏彎線䲁 | 海水 | 本土 |
| 4199 | Istiblennius muelleri | 穆氏動齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 4226 | Laiphognathus longispinis | 長棘寬頜䲁 | 海水 | 本土 |
| 4227 | Laiphognathus multimaculatus | 多斑寬頜䲁 | 海水 | 本土 |
| 4293 | Meiacanthus grammistes | 黑帶稀棘䲁 | 海水 | 本土 |
| 4294 | Meiacanthus kamoharai | 淺帶稀棘䲁 | 海水 | 本土 |
| 4305 | Mimoblennius atrocinctus | 黑點仿䲁 | 海水 | 本土 |
| 4353 | Neoclinus nudus | 裸新熱䲁 | 海水 | 本土 |
| 4363 | Norfolkia brachylepis | 短鱗諾福克䲁 | 海水 | 本土 |
| 4378 | Omobranchus ferox | 猛肩鰓䲁 | 淡水 | 本土 |
| 4379 | Omobranchus punctatus | 斑點肩鰓䲁 | 海水 | 本土 |
| 4435 | Parablennius yatabei | 八部副䲁 | 海水 | 本土 |
| 4480 | Parenchelyurus hepburni | 赫氏龜䲁 | 海水 | 本土 |
| 4496 | Petroscirtes breviceps | 短頭跳岩䲁 | 海水 | 本土 |
| 4497 | Petroscirtes mitratus | 高鰭跳岩䲁 | 海水 | 本土 |
| 4498 | Petroscirtes springeri | 史氏跳岩䲁 | 海水 | 本土 |
| 4499 | Petroscirtes variabilis | 變色跳岩䲁 | 海水 | 本土 |
| 4507 | Plagiotremus laudandus | 雲雀短帶䲁 | 海水 | 本土 |
| 4571 | Praealticus striatus | 吻紋矮冠䲁 | 海水 | 本土 |
| 4572 | Praealticus tanegasimae | 種子島矮冠䲁 | 海水 | 本土 |
| 4676 | Scartella cristata | 敏䲁 | 海水 | 本土 |
| 4734 | Springeratus xanthosoma | 黃身跳磯䲁 | 海水 | 本土 |
| 4741 | Stanulus seychellensis | 塞舌爾呆䲁 | 海水 | 本土 |
| 4868 | Enneapterygius vexillarius | 黑鞍斑雙線䲁 | 海水 | 本土 |
| 4869 | Entomacrodus stellifer | 星斑犁齒䲁 | 海水 | 本土 |
| 4894 | Parablennius thysanius | 纓副䲁 | 海水 | 本土 |
| 䲗目 Callionymiformes | ||||
| 337 | Bathycallionymus kaianus | 基島深水䲗 | 海水 | 本土 |
| 415 | Callionymus altipinnis | 大鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 416 | Callionymus beniteguri | 本氏䲗 | 海水 | 本土 |
| 417 | Callionymus curvicornis | 彎角䲗 | 淡水/海水 | 本土 |
| 418 | Callionymus doryssus | 絲背䲗 | 海水 | 本土 |
| 419 | Callionymus enneactis | 斑鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 420 | Callionymus filamentosus | 單絲䲗 | 海水 | 本土 |
| 421 | Callionymus hainanensis | 海南䲗 | 海水 | 本土 |
| 422 | Callionymus hindsii | 海氏䲗 | 海水 | 本土 |
| 423 | Callionymus japonicus | 日本䲗 | 海水 | 本土 |
| 424 | Callionymus koreanus | 朝鮮䲗 | 海水 | 本土 |
| 425 | Callionymus lunatus | 彎月䲗 | 海水 | 本土 |
| 426 | Callionymus ochiaii | 落合氏䲗 | 海水 | 本土 |
| 427 | Callionymus octostigmatus | 斑臀䲗 | 海水 | 本土 |
| 428 | Callionymus sagitta | 箭䲗 | 海水 | 本土 |
| 429 | Callionymus schaapii | 沙氏䲗 | 海水 | 本土 |
| 430 | Callionymus valenciennei | 瓦氏䲗 | 海水 | 本土 |
| 488 | Centrodraco pseudoxenicus | 珠點粗棘蜥䲗 | 海水 | 本土 |
| 840 | Dactylopus dactylopus | 指腳䲗 | 海水 | 本土 |
| 900 | Diplogrammus goramensis | 葛羅姆雙線䲗 | 海水 | 本土 |
| 938 | Draconetta xenica | 蜥䲗 | 海水 | 本土 |
| 939 | Draculo mirabilis | 單鰭喉褶䲗 | 海水 | 本土 |
| 2547 | Repomucenus huguenini | 長崎斜棘䲗 | 海水 | 本土 |
| 2548 | Repomucenus olidus | 香斜棘䲗 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2549 | Repomucenus ornatipinnis | 飾鰭斜棘䲗 | 海水 | 本土 |
| 2550 | Repomucenus virgis | 絲鰭斜棘䲗 | 海水 | 本土 |
| 3139 | Synchiropus altivelis | 紅連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 3140 | Synchiropus lateralis | 側斑連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 3141 | Synchiropus ocellatus | 眼斑連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 3725 | Callionymus formosanus | 台灣䲗 | 海水 | 本土 |
| 3726 | Callionymus martinae | 黑緣䲗 | 海水 | 本土 |
| 3727 | Callionymus meridionalis | 南方䲗 | 海水 | 本土 |
| 3728 | Callionymus planus | 扁身䲗 | 海水 | 本土 |
| 3729 | Callionymus pleurostictus | 白臀䲗 | 海水 | 本土 |
| 3730 | Callionymus scabriceps | 粗首䲗 | 海水 | 本土 |
| 3922 | Diplogrammus xenicus | 暗帶雙線䲗 | 海水 | 本土 |
| 4047 | Foetorepus masudai | 益田氏棘紅䲗 | 海水 | 本土 |
| 4606 | Pseudocalliurichthys variegatus | 曳絲擬美尾䲗 | 海水 | 本土 |
| 4763 | Synchiropus delandi | 戴氏連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 4764 | Synchiropus grinnelli | 格氏連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 4765 | Synchiropus lineolatus | 線紋連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 4766 | Synchiropus morrisoni | 莫氏連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 4767 | Synchiropus picturatus | 繡鰭連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 4768 | Synchiropus splendidus | 花斑連鰭䲗 | 海水 | 本土 |
| 4859 | Callionymus belcheri | 貝氏䲗 | 海水 | 本土 |
| 鰺形系 Carangaria/misc | ||||
| 960 | Eleutheronema rhadinum | 多鱗四指馬鮁 | 海水 | 本土 |
| 1516 | Lactarius lactarius | 乳香魚 | 海水 | 本土 |
| 1541 | Lates calcarifer | 尖吻鱸 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1704 | Mene maculata | 眼鏡魚 | 海水 | 本土 |
| 2283 | Polydactylus plebeius | 五指多指馬鮁 | 海水 | 本土 |
| 2284 | Polydactylus sextarius | 六指多指馬鮁 | 海水 | 本土 |
| 2357 | Psammoperca waigiensis | 紅眼沙鱸 | 海水 | 本土 |
| 3058 | Sphyraena barracuda | 大魣 | 海水 | 本土 |
| 3059 | Sphyraena forsteri | 大眼魣 | 海水 | 本土 |
| 3060 | Sphyraena helleri | 黃帶魣 | 海水 | 本土 |
| 3061 | Sphyraena jello | 斑條魣 | 海水 | 本土 |
| 3062 | Sphyraena obtusata | 鈍魣 | 海水 | 本土 |
| 3063 | Sphyraena pinguis | 油魣 | 海水 | 本土 |
| 3950 | Eleutheronema tetradactylum | 四指馬鮁 | 海水 | 本土 |
| 4549 | Polydactylus microstoma | 小口馬鮁魚 | 海水 | 本土 |
| 4550 | Polydactylus sexfilis | 六絲多指馬鮁 | 海水 | 本土 |
| 4729 | Sphyraena acutipinnis | 尖鰭魣 | 海水 | 本土 |
| 4730 | Sphyraena flavicauda | 黃尾魣 | 海水 | 本土 |
| 4731 | Sphyraena japonica | 日本魣 | 海水 | 本土 |
| 4732 | Sphyraena putnamae | 倒牙魣 | 海水 | 本土 |
| 4911 | Sphyraena novaehollandiae | 箭魣 | 海水 | 本土 |
| 鰺形目 Carangiformes | ||||
| 116 | Alectis ciliaris | 絲鰺 | 海水 | 本土 |
| 117 | Alectis indica | 印度絲鰺 | 海水 | 本土 |
| 119 | Alepes djedaba | 吉打副葉鰺 | 海水 | 本土 |
| 120 | Alepes melanoptera | 黑鰭副葉鰺 | 海水 | 本土 |
| 121 | Alepes vari | 范氏副葉鰺 | 海水 | 本土 |
| 274 | Atropus atropos | 溝鰺 | 海水 | 本土 |
| 275 | Atule mate | 游鰭葉鰺 | 海水 | 本土 |
| 442 | Carangoides armatus | 甲若鰺 | 海水 | 本土 |
| 443 | Carangoides chrysophrys | 長吻若鰺 | 海水 | 本土 |
| 444 | Carangoides coeruleopinnatus | 青羽若鰺 | 海水 | 本土 |
| 445 | Carangoides dinema | 背點若鰺 | 海水 | 本土 |
| 446 | Carangoides equula | 高體若鰺 | 海水 | 本土 |
| 447 | Carangoides ferdau | 平線若鰺 | 海水 | 本土 |
| 448 | Carangoides fulvoguttatus | 黃點若鰺 | 海水 | 本土 |
| 449 | Carangoides gymnostethus | 裸胸若鰺 | 海水 | 本土 |
| 450 | Carangoides hedlandensis | 海蘭德若鰺 | 海水 | 本土 |
| 451 | Carangoides malabaricus | 馬拉巴若鰺 | 海水 | 本土 |
| 452 | Carangoides oblongus | 卵圓若鰺 | 海水 | 本土 |
| 453 | Carangoides plagiotaenia | 橫帶若鰺 | 海水 | 本土 |
| 454 | Carangoides praeustus | 褐背若鰺 | 海水 | 本土 |
| 455 | Carangoides talamparoides | 白舌若鰺 | 海水 | 本土 |
| 456 | Caranx ignobilis | 珍鰺 | 海水 | 本土 |
| 457 | Caranx lugubris | 闊步鰺 | 海水 | 本土 |
| 458 | Caranx melampygus | 黑尻鰺 | 海水 | 本土 |
| 459 | Caranx sexfasciatus | 六帶鰺 | 海水 | 本土 |
| 735 | Coryphaena equiselis | 棘鯕鰍 | 海水 | 本土 |
| 736 | Coryphaena hippurus | 鯕鰍 | 海水 | 本土 |
| 852 | Decapterus kurroides | 無斑圓鰺 | 海水 | 本土 |
| 853 | Decapterus macrosoma | 長身圓鰺 | 海水 | 本土 |
| 854 | Decapterus maruadsi | 紅背圓鰺(藍圓鰺) | 海水 | 本土 |
| 855 | Decapterus russelli | 羅氏圓鰺 | 海水 | 本土 |
| 948 | Echeneis naucrates | 鮣 | 海水 | 本土 |
| 953 | Elagatis bipinnulata | 紡綞鰤 | 海水 | 本土 |
| 1064 | Ferdauia orthogrammus | 直線若鰺 | 海水 | 本土 |
| 1165 | Gnathanodon speciosus | 無齒鰺 | 海水 | 本土 |
| 1477 | Istiompax indica | 印度槍魚 | 海水 | 本土 |
| 1478 | Istiophorus platypterus | 平鰭旗魚 | 海水 | 本土 |
| 1675 | Makaira mazara | 藍槍魚 | 海水 | 本土 |
| 1689 | Megalaspis cordyla | 大甲鰺 | 海水 | 本土 |
| 1816 | Naucrates ductor | 舟鰤 | 海水 | 本土 |
| 2134 | Parastromateus niger | 烏鰺 | 海水 | 本土 |
| 2524 | Rachycentron canadum | 軍曹魚 | 海水 | 本土 |
| 2543 | Remora albescens | 白短鮣 | 海水 | 本土 |
| 2544 | Remora brachyptera | 短臂短鮣 | 海水 | 本土 |
| 2545 | Remora osteochir | 大盤短鮣 | 海水 | 本土 |
| 2546 | Remora remora | 短鮣 | 海水 | 本土 |
| 2854 | Scomberoides lysan | 長頜似鰺 | 海水 | 本土 |
| 2855 | Scomberoides tol | 革似鰺 | 海水 | 本土 |
| 2888 | Selar boops | 牛目凹肩鰺 | 海水 | 本土 |
| 2889 | Selar crumenophthalmus | 脂眼凹肩鰺 | 海水 | 本土 |
| 2890 | Selaroides leptolepis | 金帶細鰺 | 海水 | 本土 |
| 2894 | Seriola dumerili | 杜氏鰤(高體鰤) | 海水 | 本土 |
| 2895 | Seriola lalandi | 黃尾鰤 | 海水 | 本土 |
| 2896 | Seriola quinqueradiata | 五條鰤 | 海水 | 本土 |
| 2897 | Seriola rivoliana | 長鰭鰤 | 海水 | 本土 |
| 2898 | Seriolina nigrofasciata | 黑紋小條鰤 | 海水 | 本土 |
| 3204 | Tetrapturus angustirostris | 小吻四鰭旗魚 | 海水 | 本土 |
| 3257 | Trachinotus baillonii | 斐氏鯧鰺 | 海水 | 本土 |
| 3258 | Trachinotus blochii | 布氏鯧鰺 | 海水 | 本土 |
| 3259 | Trachinotus mookalee | 穆克鯧鰺 | 海水 | 本土 |
| 3263 | Trachurus japonicus | 日本竹筴魚 | 海水 | 本土 |
| 3421 | Ulua mentalis | 短絲羽鰓鰺 | 海水 | 本土 |
| 3437 | Uraspis uraspis | 白口尾甲鰺 | 海水 | 本土 |
| 3498 | Xiphias gladius | 劍魚 | 海水 | 本土 |
| 3584 | Alepes kleinii | 克氏副葉鰺 | 海水 | 本土 |
| 3751 | Carangoides bajad | 橘點若鰺 | 海水 | 本土 |
| 3752 | Carangoides humerosus | 大眼若鰺 | 海水 | 本土 |
| 3753 | Caranx bucculentus | 大口鰺 | 海水 | 本土 |
| 3754 | Caranx papuensis | 巴布亞鰺 | 海水 | 本土 |
| 3755 | Caranx tille | 泰勒鰺 | 海水 | 本土 |
| 3902 | Decapterus akaadsi | 紅尾圓鰺 | 海水 | 本土 |
| 3903 | Decapterus macarellus | 頜圓鰺 | 海水 | 本土 |
| 3904 | Decapterus muroadsi | 穆氏圓鰺 | 海水 | 本土 |
| 3905 | Decapterus tabl | 泰勃圓鰺 | 海水 | 本土 |
| 4208 | Kajikia audax | 紅肉槍魚 | 海水 | 本土 |
| 4607 | Pseudocaranx dentex | 黃帶擬鰺 | 海水 | 本土 |
| 4652 | Remora australis | 澳洲短鮣 | 海水 | 本土 |
| 4688 | Scomberoides commersonnianus | 康氏似鰺 | 海水 | 本土 |
| 4799 | Trachinotus anak | 阿納鯧鰺 | 海水 | 本土 |
| 4800 | Trachinotus falcatus | 鐮鰭鯧鰺 | 海水 | 引入種 |
| 4918 | Trachinotus ovatus | 卵形鯧鰺 | 海水 | 本土 |
| 4920 | Uraspis helvola | 白舌尾甲鰺 | 海水 | 本土 |
| 真鯊目 Carcharhiniformes | ||||
| 217 | Apristurus gibbosus | 駝背光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 218 | Apristurus herklotsi | 霍氏光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 219 | Apristurus internatus | 中間光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 220 | Apristurus japonicus | 日本光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 221 | Apristurus longicephalus | 長頭光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 222 | Apristurus macrorhynchus | 大吻光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 223 | Apristurus macrostomus | 大口光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 224 | Apristurus pinguis | 粗體光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 225 | Apristurus platyrhynchus | 扁吻光尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 226 | Apristurus sinensis | 中華光尾鯊 | 海水 | 特有種 |
| 267 | Atelomycterus marmoratus | 白斑斑鯊 | 海水 | 本土 |
| 406 | Bythaelurus immaculatus | 無斑深海溝鯊 | 海水 | 特有種 |
| 466 | Carcharhinus albimarginatus | 白邊鰭真鯊 | 海水 | 本土 |
| 467 | Carcharhinus altimus | 大鼻真鯊 | 海水 | 本土 |
| 468 | Carcharhinus amblyrhynchoides | 鈍吻真鯊 | 海水 | 本土 |
| 469 | Carcharhinus amblyrhynchos | 黑尾真鯊 | 海水 | 本土 |
| 470 | Carcharhinus borneensis | 婆羅真鯊 | 海水 | 本土 |
| 471 | Carcharhinus brachyurus | 短尾真鯊 | 海水 | 本土 |
| 472 | Carcharhinus falciformis | 鐮狀真鯊 | 海水 | 本土 |
| 473 | Carcharhinus hemiodon | 半齒真鯊 | 海水 | 本土 |
| 474 | Carcharhinus limbatus | 黑邊鰭真鯊 | 海水 | 本土 |
| 475 | Carcharhinus longimanus | 長鰭真鯊 | 海水 | 本土 |
| 476 | Carcharhinus macloti | 麥氏真鯊 | 海水 | 本土 |
| 477 | Carcharhinus melanopterus | 污翅真鯊 | 海水 | 本土 |
| 478 | Carcharhinus obscurus | 灰真鯊(暗體真鯊) | 海水 | 本土 |
| 479 | Carcharhinus plumbeus | 鉛灰真鯊 | 海水 | 本土 |
| 480 | Carcharhinus sealei | 西氏真鯊 | 海水 | 本土 |
| 481 | Carcharhinus sorrah | 色拉真鯊 | 海水 | 本土 |
| 509 | Cephaloscyllium fasciatum | 網紋絨毛鯊 | 海水 | 本土 |
| 510 | Cephaloscyllium umbratile | 陰影絨毛鯊 | 海水 | 本土 |
| 517 | Chaenogaleus macrostoma | 大口尖齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 1024 | Eridacnis radcliffei | 雷氏光唇鯊 | 海水 | 本土 |
| 1050 | Eusphyra blochii | 布氏真雙髻鯊 | 海水 | 本土 |
| 1086 | Galeocerdo cuvier | 鼬鯊 | 海水 | 本土 |
| 1087 | Galeorhinus galeus | 翅鯊 | 海水 | 本土 |
| 1088 | Galeus eastmani | 伊氏鋸尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 1089 | Galeus nipponensis | 日本鋸尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 1132 | Glyphis gangeticus | 恆河露齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 1272 | Halaelurus buergeri | 梅花鯊 | 海水 | 本土 |
| 1330 | Hemigaleus microstoma | 小口半沙條鯊 | 海水 | 本土 |
| 1342 | Hemipristis elongata | 鈍吻鯊(半鋸鯊) | 海水 | 本土 |
| 1349 | Hemitriakis japanica | 日本半皺唇鯊(日本翅鯊) | 海水 | 本土 |
| 1631 | Loxodon macrorhinus | 廣鼻彎齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 1774 | Mustelus griseus | 灰星鯊 | 海水 | 本土 |
| 1775 | Mustelus manazo | 白斑星鯊 | 海水 | 本土 |
| 1821 | Negaprion acutidens | 尖齒檸檬鯊 | 海水 | 本土 |
| 2080 | Paragaleus tengi | 鄧氏副沙條鯊 | 海水 | 本土 |
| 2158 | Parmaturus melanobranchus | 黑鰓盾尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 2329 | Prionace glauca | 大青鯊 | 海水 | 本土 |
| 2346 | Proscyllium habereri | 哈氏原鯊 | 海水 | 本土 |
| 2347 | Proscyllium venustum | 維納斯原鯊 | 海水 | 本土 |
| 2475 | Pseudotriakis microdon | 小齒擬皺唇鯊 | 海水 | 本土 |
| 2618 | Rhizoprionodon acutus | 尖吻斜鋸牙鯊 | 海水 | 本土 |
| 2619 | Rhizoprionodon oligolinx | 短鰭斜鋸牙鯊(短鰭尖吻鯊) | 海水 | 本土 |
| 2841 | Scoliodon laticaudus | 寬尾斜齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 2842 | Scoliodon macrorhynchos | 大吻斜齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 2880 | Scyliorhinus torazame | 虎紋貓鯊 | 海水 | 本土 |
| 3064 | Sphyrna lewini | 路易氏雙髻鯊 | 海水 | 本土 |
| 3065 | Sphyrna mokarran | 無溝雙髻鯊 | 海水 | 本土 |
| 3066 | Sphyrna zygaena | 錘頭雙髻鯊 | 海水 | 本土 |
| 3268 | Triaenodon obesus | 灰三齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 3269 | Triakis scyllium | 皺唇鯊 | 海水 | 本土 |
| 3756 | Carcharhinus brevipinna | 直齒真鯊 | 海水 | 本土 |
| 3757 | Carcharhinus leucas | 低鰭真鯊(公牛真鯊) | 淡水/海水 | 本土 |
| 3758 | Carcharhinus tjutjot | 爪哇真鯊 | 海水 | 本土 |
| 3773 | Cephaloscyllium formosanum | 台灣絨毛鯊 | 海水 | 特有種 |
| 3774 | Cephaloscyllium sarawakense | 沙勞越頭鯊 | 海水 | 本土 |
| 4060 | Galeus sauteri | 沙氏鋸尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 4162 | Hemitriakis complicofasciata | 雜紋半皺唇鯊 | 海水 | 本土 |
| 4183 | Hypogaleus hyugaensis | 下盔鯊(黑鰭翅鯊) | 海水 | 本土 |
| 日鱸目 Centrarchiformes | ||||
| 139 | Amblycirrhitus bimacula | 雙斑鈍䱵 | 海水 | 本土 |
| 140 | Amblycirrhitus unimacula | 單斑鈍䱵 | 海水 | 本土 |
| 644 | Cirrhitichthys aprinus | 斑金䱵 | 海水 | 本土 |
| 645 | Cirrhitichthys aureus | 金䱵 | 海水 | 本土 |
| 646 | Cirrhitichthys falco | 鷹金䱵 | 海水 | 本土 |
| 647 | Cirrhitus pinnulatus | 翼䱵 | 海水 | 本土 |
| 728 | Coreoperca herzi | 朝鮮少鱗鱖 | 淡水 | 本土 |
| 729 | Coreoperca liui | 劉氏少鱗鱖 | 淡水 | 本土 |
| 730 | Coreoperca loona | 灕江少鱗鱖 | 淡水 | 本土 |
| 731 | Coreoperca whiteheadi | 中國少鱗鱖(石鱖) | 淡水 | 本土 |
| 815 | Cyprinocirrhites polyactis | 多棘鯉䱵 | 海水 | 本土 |
| 1125 | Girella punctata | 斑魢 | 海水 | 本土 |
| 1213 | Goniistius quadricornis | 四角隼䱵 | 海水 | 本土 |
| 1500 | Kuhlia mugil | 鯔形湯鯉 | 海水 | 本土 |
| 1503 | Kyphosus cinerascens | 長鰭[魚舵] | 海水 | 本土 |
| 1504 | Kyphosus vaigiensis | 低鰭[魚舵] | 海水 | 本土 |
| 1713 | Microcanthus strigatus | 細刺魚 | 海水 | 本土 |
| 1742 | Micropterus salmoides | 大口黑鱸 | 淡水 | 引入種 |
| 1961 | Oplegnathus fasciatus | 條石鯛 | 海水 | 本土 |
| 1962 | Oplegnathus punctatus | 斑石鯛 | 海水 | 本土 |
| 2077 | Paracirrhites arcatus | 副䱵 | 海水 | 本土 |
| 2169 | Pelates qinglanensis | 清瀾牙鯻 | 海水 | 本土 |
| 2170 | Pelates quadrilineatus | 四帶牙鯻 | 海水 | 本土 |
| 2638 | Rhynchopelates oxyrhynchus | 尖突吻鯻 | 海水 | 本土 |
| 2878 | Scortum barcoo | 高體革鯻 | 淡水 | 引入種 |
| 2953 | Siniperca chuatsi | 鱖 | 淡水 | 本土 |
| 2954 | Siniperca fortis | 麻鱖 | 淡水 | 本土 |
| 2955 | Siniperca knerii | 大眼鱖 | 淡水 | 本土 |
| 2956 | Siniperca liuzhouensis | 柳州鱖 | 淡水 | 本土 |
| 2957 | Siniperca obscura | 暗鱖 | 淡水 | 本土 |
| 2958 | Siniperca roulei | 長身鱖 | 淡水 | 特有種 |
| 2959 | Siniperca scherzeri | 斑鱖 | 淡水 | 本土 |
| 2960 | Siniperca undulata | 波紋鱖 | 淡水 | 本土 |
| 2961 | Siniperca vietnamensis | 越南鱖 | 淡水 | 本土 |
| 3201 | Terapon jarbua | 細鱗鯻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3202 | Terapon theraps | 鯻 | 海水 | 本土 |
| 3689 | Bidyanus bidyanus | 銀鋸眶鯻 | 淡水 | 引入種 |
| 3846 | Cirrhitichthys oxycephalus | 尖頭金䱵 | 海水 | 本土 |
| 4073 | Girella leonina | 小鱗黑魢 | 海水 | 本土 |
| 4074 | Girella mezina | 綠帶魢 | 海水 | 本土 |
| 4093 | Goniistius zebra | 斑馬鷹䱵 | 海水 | 本土 |
| 4094 | Goniistius zonatus | 花尾鷹䱵 | 海水 | 本土 |
| 4156 | Helotes sexlineatus | 六帶叉牙鯻 | 海水 | 本土 |
| 4216 | Kuhlia marginata | 黑邊湯鯉 | 淡水 | 本土 |
| 4217 | Kuhlia rupestris | 大口湯鯉 | 淡水/海水 | 本土 |
| 4220 | Kyphosus bigibbus | 雙峰[魚舵] | 海水 | 本土 |
| 4298 | Mesopristes cancellatus | 格紋中鋸鯻 | 淡水 | 本土 |
| 4430 | Oxycirrhites typus | 尖吻䱵 | 海水 | 本土 |
| 4445 | Paracirrhites forsteri | 福氏副䱵 | 海水 | 本土 |
| 脂鯉目 Characiformes | ||||
| 2215 | Piaractus brachypomus | 短蓋肥脂鯉(淡水白鯧) | 淡水 | 引入種 |
| 2342 | Prochilodus lineatus | 條紋鯪脂鯉 | 淡水 | 引入種 |
| 2521 | Pygocentrus nattereri | 納氏臀點脂鯉 | 淡水 | 引入種 |
| 3872 | Colossoma macropomum | 大鰓蓋巨脂鯉 | 淡水 | 引入種 |
| 銀鮫目 Chimaeriformes | ||||
| 597 | Chimaera phantasma | 黑線銀鮫 | 海水 | 本土 |
| 1300 | Harriotta raleighana | 扁吻銀鮫 | 海水 | 本土 |
| 2561 | Rhinochimaera pacifica | 太平洋長吻銀鮫 | 海水 | 本土 |
| 4656 | Rhinochimaera africana | 非洲長吻銀鮫 | 海水 | 本土 |
| 慈鯛目 Cichliformes | ||||
| 1974 | Oreochromis aureus | 奧利亞口孵非鯽 | 淡水 | 引入種 |
| 1975 | Oreochromis mossambicus | 莫桑比克口孵非鯽 | 淡水 | 引入種 |
| 1976 | Oreochromis niloticus | 尼羅口孵非鯽(尼羅非鯽) | 淡水 | 引入種 |
| 3603 | Amphilophus citrinellus | 橘色雙冠麗魚 | 淡水 | 引入種 |
| 3875 | Coptodon zillii | 吉利慈鯛 | 淡水 | 引入種 |
| 4065 | Geophagus brasiliensis | 巴西珠母麗魚 | 淡水 | 引入種 |
| 4444 | Parachromis managuensis | 花身副麗魚 | 淡水 | 引入種 |
| 4808 | Trichromis salvini | 淡水 | 引入種 | |
| 鯡形目 Clupeiformes | ||||
| 142 | Amblygaster clupeoides | 短頜鈍腹鯡 | 海水 | 本土 |
| 143 | Amblygaster leiogaster | 平胸鈍腹鯡 | 海水 | 本土 |
| 144 | Amblygaster sirm | 斑點鈍腹鯡 | 海水 | 本土 |
| 599 | Chirocentrus dorab | 寶刀魚 | 海水 | 本土 |
| 600 | Chirocentrus nudus | 長頜寶刀魚 | 海水 | 本土 |
| 663 | Clupanodon thrissa | 花鰶 | 淡水/海水 | 本土 |
| 664 | Clupea pallasii | 太平洋鯡 | 海水 | 本土 |
| 705 | Coilia brachygnathus | 短頜鱭 | 淡水 | 本土 |
| 706 | Coilia grayii | 七絲鱭 | 淡水/海水 | 本土 |
| 707 | Coilia mystus | 鳳鱭 | 海水 | 本土 |
| 708 | Coilia nasus | 刀鱭 | 淡水/海水 | 本土 |
| 944 | Dussumieria acuta | 尖吻圓腹鯡 | 海水 | 本土 |
| 945 | Dussumieria elopsoides | 黃帶圓腹鯡 | 淡水/海水 | 本土 |
| 968 | Encrasicholina devisi | 戴氏半棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 969 | Encrasicholina heteroloba | 尖吻半棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 970 | Encrasicholina punctifer | 銀灰半棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 971 | Engraulis japonicus | 日本鯷 | 海水 | 本土 |
| 1038 | Etrumeus micropus | 小鱗脂眼鯡 | 海水 | 本土 |
| 1361 | Herklotsichthys ovalis | 大眼似青鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1362 | Herklotsichthys quadrimaculatus | 四點似青鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1374 | Hilsa kelee | 花點鰣 | 海水 | 本土 |
| 1457 | Ilisha elongata | 鰳 | 海水 | 本土 |
| 1458 | Ilisha megaloptera | 大鰭鰳 | 海水 | 本土 |
| 1459 | Ilisha melastoma | 黑口鰳 | 海水 | 本土 |
| 1499 | Konosirus punctatus | 斑鰶 | 海水 | 本土 |
| 1827 | Nematalosa come | 環球海鰶 | 海水 | 本土 |
| 1828 | Nematalosa japonica | 日本海鰶 | 海水 | 本土 |
| 1829 | Nematalosa nasus | 圓吻海鰶 | 海水 | 本土 |
| 1958 | Opisthopterus valenciennesi | 伐氏後鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 2473 | Pseudosetipinna haizhouensis | 海州擬黃鯽 | 海水 | 本土 |
| 2677 | Sardinella albella | 白腹小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2678 | Sardinella gibbosa | 隆背小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2679 | Sardinella hualiensis | 花蓮小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2680 | Sardinella lemuru | 黃澤小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2681 | Sardinella melanura | 黑尾小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2682 | Sardinella richardsoni | 里氏小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2683 | Sardinella zunasi | 錘氏小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2684 | Sardinops sagax | 擬沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 2900 | Setipinna taty | 太的黃鯽 | 海水 | 本土 |
| 2901 | Setipinna tenuifilis | 黃鯽 | 海水 | 本土 |
| 3072 | Spratelloides delicatulus | 鏽眼小體鯡 | 海水 | 本土 |
| 3073 | Spratelloides gracilis | 銀帶小體鯡 | 海水 | 本土 |
| 3115 | Stolephorus chinensis | 中華側帶小公魚 | 海水 | 本土 |
| 3116 | Stolephorus commersonnii | 康氏側帶小公魚 | 海水 | 本土 |
| 3117 | Stolephorus indicus | 印度側帶小公魚 | 海水 | 本土 |
| 3118 | Stolephorus insularis | 島嶼側帶小公魚 | 海水 | 本土 |
| 3119 | Stolephorus shantungensis | 山東側帶小公魚 | 海水 | 本土 |
| 3199 | Tenualosa reevesii | 鰣 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3219 | Thryssa adelae | 汕頭棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 3220 | Thryssa chefuensis | 芝罘棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 3221 | Thryssa dussumieri | 杜氏棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 3222 | Thryssa hamiltonii | 漢氏棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 3223 | Thryssa kammalensis | 赤鼻棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 3224 | Thryssa mystax | 中頜棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 3225 | Thryssa setirostris | 長頜棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 3931 | Dussumieria modakandai | 海水 | 本土 | |
| 3960 | Encrasicholina oligobranchus | 寡鰓半棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 4489 | Pellona ditchela | 庇隆多齒鰳 | 淡水/海水 | 本土 |
| 4667 | Sardinella jussieu | 裘氏小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 4745 | Stolephorus baganensis | 巴甘側帶小公魚 | 海水 | 本土 |
| 4746 | Stolephorus waitei | 韋氏側帶小公魚 | 海水 | 本土 |
| 4787 | Tenualosa toli | 托氏鰣 | 海水 | 本土 |
| 4794 | Thryssa vitrirostris | 黃吻棱鯷 | 海水 | 本土 |
| 4892 | Opisthopterus tardoore | 後鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4905 | Sardinella aurita | 金色小沙丁魚(圓小沙丁魚) | 海水 | 本土 |
| 4906 | Sardinella brachysoma | 高體小沙丁魚 | 海水 | 本土 |
| 鯉形目 Cypriniformes | ||||
| 5 | Abbottina lalinensis | 拉林棒花魚 | 淡水 | 本土 |
| 6 | Abbottina liaoningensis | 遼寧棒花魚 | 淡水 | 本土 |
| 7 | Abbottina obtusirostris | 鈍吻棒花魚 | 淡水 | 本土 |
| 8 | Abbottina rivularis | 棒花魚 | 淡水 | 本土 |
| 11 | Abramis brama | 歐鯿 | 淡水 | 引入種 |
| 21 | Acanthocobitis botia | 巴基斯坦棘鰍 | 淡水 | 本土 |
| 23 | Acanthogobio guentheri | 刺鮈 | 淡水 | 本土 |
| 34 | Acanthorhodeus chankaensis | 興凱鱊 | 淡水 | 本土 |
| 46 | Acantopsis dialuzona | 蒼帶小刺眼鰍 | 淡水 | 本土 |
| 50 | Acheilognathus asmussii | 黑龍江鱊 | 淡水 | 本土 |
| 51 | Acheilognathus barbatulus | 短鬚鱊 | 淡水 | 本土 |
| 52 | Acheilognathus barbatus | 須鱊 | 淡水 | 本土 |
| 53 | Acheilognathus binidentatus | 雙齒鱊 | 淡水 | 本土 |
| 54 | Acheilognathus brevicaudatus | 短尾鱊 | 淡水 | 本土 |
| 55 | Acheilognathus changtingensis | 長汀鱊 | 淡水 | 本土 |
| 56 | Acheilognathus elongatoides | 擬長身鱊 | 淡水 | 本土 |
| 57 | Acheilognathus elongatus | 長身鱊 | 淡水 | 本土 |
| 58 | Acheilognathus gracilis | 無須鱊 | 淡水 | 本土 |
| 59 | Acheilognathus hypselonotus | 寡鱗鱊 | 淡水 | 本土 |
| 60 | Acheilognathus imberbis | 缺須鱊 | 淡水 | 本土 |
| 61 | Acheilognathus macromandibularis | 大頜舌鱊 | 淡水 | 本土 |
| 62 | Acheilognathus macropterus | 大鰭鱊 | 淡水 | 本土 |
| 63 | Acheilognathus meridianus | 廣西鱊 | 淡水 | 本土 |
| 64 | Acheilognathus microphysa | 雲南鱊 | 淡水 | 本土 |
| 65 | Acheilognathus omeiensis | 峨眉鱊 | 淡水 | 本土 |
| 66 | Acheilognathus peihoensis | 白河鱊 | 淡水 | 本土 |
| 67 | Acheilognathus polylepis | 多鱗鱊 | 淡水 | 本土 |
| 68 | Acheilognathus striatus | 條紋鱊 | 淡水 | 本土 |
| 69 | Acheilognathus taenianalis | 斑條鱊 | 淡水 | 本土 |
| 70 | Acheilognathus tonkinensis | 越南鱊 | 淡水 | 本土 |
| 82 | Acrossocheilus beijiangensis | 北江光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 83 | Acrossocheilus clivosius | 多耙光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 84 | Acrossocheilus fasciatus | 光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 85 | Acrossocheilus hemispinus | 半刺光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 86 | Acrossocheilus ikedai | 池田光唇魚 | 淡水 | 特有種 |
| 87 | Acrossocheilus iridescens | 虹彩光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 88 | Acrossocheilus jishouensis | 吉首光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 89 | Acrossocheilus kreyenbergii | 薄頜光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 90 | Acrossocheilus longipinnis | 長鰭光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 91 | Acrossocheilus malacopterus | 軟鰭光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 92 | Acrossocheilus microstoma | 小口光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 93 | Acrossocheilus monticola | 寬口光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 94 | Acrossocheilus multistriatus | 多帶光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 95 | Acrossocheilus paradoxus | 台灣光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 96 | Acrossocheilus parallens | 側條光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 97 | Acrossocheilus rendahli | 似細身光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 98 | Acrossocheilus spinifer | 小刺光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 99 | Acrossocheilus wenchowensis | 溫州光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 100 | Acrossocheilus wuyiensis | 武夷光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 101 | Acrossocheilus xamensis | 老撾光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 102 | Acrossocheilus yunnanensis | 雲南光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 136 | Ambastaia nigrolineata | 黑線安巴鰍 | 淡水 | 本土 |
| 163 | Anabarilius alburnops | 銀白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 164 | Anabarilius andersoni | 星雲白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 165 | Anabarilius brevianalis | 短臀白魚 | 淡水 | 本土 |
| 166 | Anabarilius duoyiheensis | 多衣河白魚 | 淡水 | 本土 |
| 167 | Anabarilius goldenlineus | 路南金線白魚 | 淡水 | 本土 |
| 168 | Anabarilius grahami | 鱇浪白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 169 | Anabarilius liui | 雅礱江白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 170 | Anabarilius longicaudatus | 長尾白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 171 | Anabarilius macrolepis | 大鱗白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 172 | Anabarilius maculatus | 斑白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 173 | Anabarilius paucirastellus | 少耙白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 174 | Anabarilius polylepis | 多鱗白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 175 | Anabarilius qiluensis | 杞麓白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 176 | Anabarilius qionghaiensis | 邛海白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 177 | Anabarilius songmingensis | 嵩明白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 178 | Anabarilius transmontanus | 山白魚 | 淡水 | 本土 |
| 179 | Anabarilius xundianensis | 尋甸白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 180 | Anabarilius yangzonensis | 陽宗白魚 | 淡水 | 特有種 |
| 187 | Ancherythroculter kurematsui | 高體近紅鮊 | 淡水 | 本土 |
| 188 | Ancherythroculter lini | 大眼近紅鮊 | 淡水 | 本土 |
| 189 | Ancherythroculter nigrocauda | 黑尾近紅鮊 | 淡水 | 本土 |
| 190 | Ancherythroculter wangi | 汪氏近紅鮊 | 淡水 | 本土 |
| 191 | Anchicyclocheilus halfibindus | 半盲近金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 204 | Aphyocypris arcus | 瑤山細鯽 | 淡水 | 特有種 |
| 205 | Aphyocypris chinensis | 中華細鯽 | 淡水 | 本土 |
| 206 | Aphyocypris lini | 林氏細鯽 | 淡水 | 本土 |
| 207 | Aphyocypris normalis | 擬細鯽 | 淡水 | 本土 |
| 208 | Aphyocypris pulchrilineata | 麗紋細鯽 | 淡水 | 本土 |
| 259 | Aspiorhynchus laticeps | 新疆扁吻魚(新彊大頭魚) | 淡水 | 本土 |
| 269 | Atrilinea macrolepis | 大鱗黑線䱗 | 淡水 | 本土 |
| 270 | Atrilinea macrops | 大眼黑線䱗 | 淡水 | 本土 |
| 271 | Atrilinea roulei | 黑線䱗 | 淡水 | 本土 |
| 297 | Balitora brucei | 布魯斯氏爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 298 | Balitora burmanica | 緬甸爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 299 | Balitora elongata | 長體爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 300 | Balitora kwangsiensis | 廣西爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 301 | Balitora lancangjiangensis | 瀾滄江爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 302 | Balitora longibarbata | 長鬚爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 303 | Balitora ludongensis | 祿洞爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 304 | Balitora meridionalis | 南方爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 305 | Balitora nantingensis | 南汀爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 306 | Balitora nujiangensis | 怒江爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 307 | Balitora tchangi | 張氏爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 308 | Bangana brevirostris | 短吻孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 309 | Bangana decora | 桂孟加拉鯪 | 淡水 | 特有種 |
| 310 | Bangana dero | 墨脫孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 311 | Bangana discognathoides | 盆唇孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 312 | Bangana lemassoni | 滇孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 313 | Bangana lippus | 湄公河孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 314 | Bangana rendahli | 倫氏孟加拉鯪 | 淡水 | 特有種 |
| 315 | Bangana tonkinensis | 河口孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 316 | Bangana tungting | 洞庭孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 317 | Bangana wui | 伍氏孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 318 | Bangana xanthogenys | 元江孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 319 | Bangana yunnanensis | 雲南孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 320 | Bangana zhui | 朱氏孟加拉鯪 | 淡水 | 本土 |
| 323 | Barbatula altayensis | 阿爾泰須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 324 | Barbatula barbatula | 條須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 325 | Barbatula nuda | 北方須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 326 | Barbatula potaninorum | 細尾須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 327 | Barbatula toni | 托尼須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 328 | Barbodes polylepis | 多鱗四須䰾 | 淡水 | 本土 |
| 329 | Barbodes semifasciolatus | 五線無須魮 | 淡水 | 本土 |
| 330 | Barbonymus gonionotus | 銀高體䰾 | 淡水 | 引入種 |
| 332 | Barbus barbus | 䰾 | 淡水 | 本土 |
| 333 | Barilius barila | 滇西低線鱲 | 淡水 | 本土 |
| 334 | Barilius caudiocellatus | 斑尾低線鱲 | 淡水 | 本土 |
| 346 | Beaufortia cyclica | 圓體爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 347 | Beaufortia huangguoshuensis | 黃果樹爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 348 | Beaufortia intermedia | 中間爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 349 | Beaufortia kweichowensis | 貴州爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 350 | Beaufortia leveretti | 爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 351 | Beaufortia liui | 側溝爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 352 | Beaufortia niulanensis | 牛欄爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 353 | Beaufortia pingi | 秉氏爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 354 | Beaufortia polylepis | 多鱗爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 355 | Beaufortia szechuanensis | 四川爬岩鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 356 | Beaufortia zebroida | 條斑爬岩鰍 | 淡水 | 本土 |
| 357 | Belligobio nummifer | 似䱻 | 淡水 | 特有種 |
| 358 | Belligobio pengxianensis | 彭縣似䱻 | 淡水 | 本土 |
| 369 | Bibarba bibarba | 雙須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 370 | Bibarba parvoculus | 小眼雙須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 388 | Botia rostrata | 突吻沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 407 | Cabdio morar | 短頜鯝 | 淡水 | 本土 |
| 461 | Carassioides acuminatus | 須鯽 | 淡水 | 本土 |
| 462 | Carassius auratus | 鯽 | 淡水 | 本土 |
| 463 | Carassius carassius | 黑鯽 | 淡水 | 本土 |
| 464 | Carassius cuvieri | 高身鯽 | 淡水 | 引入種 |
| 465 | Carassius gibelio | 銀鯽 | 淡水 | 本土 |
| 559 | Chanodichthys abramoides | 似歐紅鰭鮊 | 淡水 | 本土 |
| 560 | Chanodichthys dabryi | 達氏鮊 | 淡水 | 本土 |
| 561 | Chanodichthys erythropterus | 紅鰭鮊 | 淡水 | 本土 |
| 562 | Chanodichthys mongolicus | 蒙古紅鮊 | 淡水 | 本土 |
| 563 | Chanodichthys oxycephalus | 尖頭鮊 | 淡水 | 本土 |
| 634 | Chuanchia labiosa | 骨唇黃河魚 | 淡水 | 特有種 |
| 643 | Cirrhinus molitorella | 鯪 | 淡水 | 本土 |
| 654 | Claea dabryi | 達氏克拉爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 669 | Cobitis arenae | 沙花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 670 | Cobitis australis | 南方鰍 | 淡水 | 本土 |
| 671 | Cobitis brevipinna | 短鰭花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 672 | Cobitis choii | 朝鮮花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 673 | Cobitis crassicauda | 厚尾華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 674 | Cobitis dolichorhynchus | 長吻鰍 | 淡水 | 本土 |
| 675 | Cobitis fasciola | 橫紋花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 676 | Cobitis fimbriata | 緣花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 677 | Cobitis lebedevi | 萊氏鰍 | 淡水 | 本土 |
| 678 | Cobitis leptosoma | 淡水 | 本土 | |
| 679 | Cobitis lutheri | 黑龍江鰍 | 淡水 | 本土 |
| 680 | Cobitis macrostigma | 大斑花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 681 | Cobitis melanoleuca | 花斑花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 682 | Cobitis microcephala | 小頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 683 | Cobitis multimaculata | 多斑花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 684 | Cobitis nigrolinea | 黑線花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 685 | Cobitis obtusirostra | 鈍吻花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 686 | Cobitis qujiangensis | 衢江花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 687 | Cobitis rara | 稀有花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 688 | Cobitis sibirica | 北方鰍 | 淡水 | 本土 |
| 689 | Cobitis sinensis | 中華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 690 | Cobitis stenocauda | 窄尾華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 691 | Cobitis taenia | 花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 692 | Cobitis wumingensis | 武鳴花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 693 | Cobitis zhejiangensis | 浙江鰍 | 淡水 | 本土 |
| 718 | Cophecheilus bamen | 巴門褶吻鯪 | 淡水 | 本土 |
| 719 | Cophecheilus brevibarbatus | 短鬚吻褶鯪 | 淡水 | 特有種 |
| 724 | Coreius cetopsis | 細銅魚 | 淡水 | 本土 |
| 725 | Coreius guichenoti | 圓口銅魚 | 淡水 | 本土 |
| 726 | Coreius heterodon | 銅魚 | 淡水 | 本土 |
| 727 | Coreius septentrionalis | 北方銅魚 | 淡水 | 本土 |
| 740 | Cosmochilus cardinalis | 紅鰭方口䰾 | 淡水 | 本土 |
| 741 | Cosmochilus nanlaensis | 南臘方口䰾 | 淡水 | 本土 |
| 757 | Crossocheilus burmanicus | 緬甸穗唇䰾 | 淡水 | 本土 |
| 758 | Crossocheilus reticulatus | 網紋穗唇䰾 | 淡水 | 本土 |
| 778 | Ctenopharyngodon idella | 草魚 | 淡水 | 本土 |
| 780 | Culter alburnus | 翹嘴鮊 | 淡水 | 本土 |
| 781 | Culter oxycephaloides | 擬尖頭鮊 | 淡水 | 本土 |
| 782 | Culter recurviceps | 海南鮊 | 淡水 | 本土 |
| 783 | Cultrichthys compressocorpus | 扁體原鮊 | 淡水 | 本土 |
| 784 | Cyclocheilichthys sinensis | 圓唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 816 | Cyprinus acutidorsalis | 尖鰭鯉 | 淡水 | 本土 |
| 817 | Cyprinus barbatus | 洱海鯉 | 淡水 | 本土 |
| 818 | Cyprinus carpio | 鯉 | 淡水 | 本土 |
| 819 | Cyprinus chilia | 杞麓鯉 | 淡水 | 本土 |
| 820 | Cyprinus daliensis | 大理鯉 | 淡水 | 本土 |
| 821 | Cyprinus fuxianensis | 撫仙鯉 | 淡水 | 本土 |
| 822 | Cyprinus ilishaestomus | 翹嘴鯉 | 淡水 | 特有種 |
| 823 | Cyprinus longipectoralis | 春鯉 | 淡水 | 特有種 |
| 824 | Cyprinus longzhouensis | 龍州鯉 | 淡水 | 本土 |
| 825 | Cyprinus megalophthalmus | 大眼鯉 | 淡水 | 特有種 |
| 826 | Cyprinus micristius | 小鯉 | 淡水 | 特有種 |
| 827 | Cyprinus multitaeniatus | 三角鯉 | 淡水 | 本土 |
| 828 | Cyprinus pellegrini | 大頭鯉 | 淡水 | 特有種 |
| 829 | Cyprinus qionghaiensis | 邛海鯉 | 淡水 | 本土 |
| 830 | Cyprinus rubrofuscus | 赤棕鯉 | 淡水 | 本土 |
| 831 | Cyprinus yilongensis | 異龍鯉 | 淡水 | 本土 |
| 832 | Cyprinus yunnanensis | 雲南鯉 | 淡水 | 特有種 |
| 842 | Danio albolineatus | 白線鿕 | 淡水 | 本土 |
| 860 | Devario aequipinnatus | 波條神鿕 | 淡水 | 本土 |
| 861 | Devario apogon | 缺須神鿕 | 淡水 | 本土 |
| 862 | Devario chrysotaeniatus | 金線神鿕 | 淡水 | 本土 |
| 863 | Devario interruptus | 半線神鿕 | 淡水 | 本土 |
| 864 | Devario kakhienensis | 紅蚌神鿕 | 淡水 | 本土 |
| 865 | Devario laoensis | 老撾神鿕 | 淡水 | 本土 |
| 866 | Devario shanensis | 沙姆神鿕 | 淡水 | 本土 |
| 909 | Diptychus maculatus | 斑重唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 910 | Discherodontus parvus | 小盤齒䰾 | 淡水 | 本土 |
| 916 | Discocheilus multilepis | 多鱗盤唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 917 | Discocheilus wui | 伍氏盤唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 918 | Discogobio antethoracalis | 前胸盤鮈 | 淡水 | 本土 |
| 919 | Discogobio bismargaritus | 雙珠盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 920 | Discogobio brachyphysallidos | 短鰾盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 921 | Discogobio elongatus | 長體盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 922 | Discogobio laticeps | 寬頭盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 923 | Discogobio longibarbatus | 長鬚盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 924 | Discogobio macrophysallidos | 長鰾盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 925 | Discogobio multilineatus | 多線盤鮈 | 淡水 | 本土 |
| 926 | Discogobio poneventralis | 後腹盤鮈 | 淡水 | 本土 |
| 927 | Discogobio propeanalis | 近臀盤鮈 | 淡水 | 本土 |
| 928 | Discogobio tetrabarbatus | 四須盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 929 | Discogobio yunnanensis | 雲南盤鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 930 | Discolabeo wuluoheensis | 五洛河盤鯪 | 淡水 | 本土 |
| 931 | Distoechodon macrophthalmus | 大眼圓吻鯝 | 淡水 | 本土 |
| 932 | Distoechodon tumirostris | 圓吻鯝 | 淡水 | 本土 |
| 962 | Elopichthys bambusa | 鱤 | 淡水 | 本土 |
| 1028 | Erromyzon kalotaenia | 美斑原吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1029 | Erromyzon sinensis | 中華游吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1030 | Erromyzon yangi | 楊氏游吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1068 | Folifer brevifilis | 瓣結魚 | 淡水 | 本土 |
| 1069 | Folifer yunnanensis | 雲南瓣結魚 | 淡水 | 特有種 |
| 1072 | Formosania chenyiyui | 陳氏台鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1073 | Formosania davidi | 達氏台鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1074 | Formosania fascicauda | 花尾台鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1075 | Formosania fasciolata | 橫紋台鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1076 | Formosania galericula | 亮斑纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1077 | Formosania paucisquama | 少鱗台鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1078 | Formosania stigmata | 斑紋台鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1079 | Formosania tinkhami | 廷氏台鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1092 | Garra bisangularis | 雙角墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1093 | Garra bispinosa | 雙刺墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1094 | Garra cambodgiensis | 柬埔寨墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1095 | Garra dulongensis | 杜朗墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1096 | Garra findolabium | 裂唇墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1097 | Garra hainanensis | 海南墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1098 | Garra imberba | 無須墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1099 | Garra imberbis | 無髯墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1100 | Garra kempi | 西藏墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1101 | Garra micropulvinus | 小墊墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1102 | Garra mirofrontis | 奇額墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1103 | Garra nasuta | 長鬚墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1104 | Garra nujiangensis | 怒江墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1105 | Garra orientalis | 東方墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1106 | Garra qiaojiensis | 橋街墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1107 | Garra rotundinasus | 圓鼻墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1108 | Garra tengchongensis | 騰衝墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1109 | Garra yiliangensis | 宜良墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1169 | Gnathopogon herzensteini | 嘉陵頜須鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1170 | Gnathopogon imberbis | 短鬚頜須鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1171 | Gnathopogon nicholsi | 隱須頜須鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1172 | Gnathopogon polytaenia | 多紋頜須鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1173 | Gnathopogon strigatus | 條紋頜須鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1174 | Gnathopogon taeniellus | 細紋頜須鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1175 | Gnathopogon tsinanensis | 濟南頜須鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1176 | Gobio acutipinnatus | 尖鰭鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1177 | Gobio coriparoides | 似銅鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1178 | Gobio cynocephalus | 犬首鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1179 | Gobio fushunensis | 撫順鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1180 | Gobio gobio | 鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1181 | Gobio huanghensis | 黃河鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1182 | Gobio lingyuanensis | 凌源鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1183 | Gobio macrocephalus | 大頭鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1184 | Gobio meridionalis | 南方鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1185 | Gobio rivuloides | 棒花鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1186 | Gobio soldatovi | 高體鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1187 | Gobiobotia abbreviata | 短身鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1188 | Gobiobotia brevirostris | 短吻鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1189 | Gobiobotia cheni | 陳氏鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1190 | Gobiobotia filifer | 宜昌鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1191 | Gobiobotia guilingensis | 桂林鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1192 | Gobiobotia homalopteroidea | 平鰭鰍鮀 | 淡水 | 特有種 |
| 1193 | Gobiobotia jiangxiensis | 江西鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1194 | Gobiobotia kolleri | 海南鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1195 | Gobiobotia lii | 李氏鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1196 | Gobiobotia longibarba | 長鬚鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1197 | Gobiobotia meridionalis | 南方鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1198 | Gobiobotia nicholsi | 尼氏鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1199 | Gobiobotia pappenheimi | 潘氏鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1200 | Gobiobotia paucirastella | 少耙鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1201 | Gobiobotia tungi | 董氏鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1202 | Gobiobotia yuanjiangensis | 元江鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 1203 | Gobiocypris rarus | 稀有鮈鯽 | 淡水 | 本土 |
| 1229 | Gymnocypris chilianensis | 祁連裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1230 | Gymnocypris chui | 蘭格湖裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1231 | Gymnocypris dobula | 軟刺裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1232 | Gymnocypris eckloni | 花斑裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1233 | Gymnocypris firmispinatus | 硬刺裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1234 | Gymnocypris namensis | 納木錯裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1235 | Gymnocypris potanini | 松潘裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1236 | Gymnocypris przewalskii | 青海湖裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1237 | Gymnocypris scleracanthus | 拉孜裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1238 | Gymnocypris waddellii | 高原裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1239 | Gymnodanio strigatus | 條紋裸鿕 | 淡水 | 本土 |
| 1240 | Gymnodiptychus dybowskii | 新疆裸重唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 1241 | Gymnodiptychus integrigymnatus | 全裸裸重唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 1242 | Gymnodiptychus pachycheilus | 厚唇裸重唇魚 | 淡水 | 特有種 |
| 1270 | Gyrinocheilus aymonieri | 湄公雙孔魚 | 淡水 | 本土 |
| 1271 | Hainania serrata | 鋸齒海南䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1293 | Hampala macrolepidota | 大鱗裂峽䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1301 | Hedinichthys grummorum | 格拉赫氏爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1302 | Hedinichthys macropterus | 大鰭赫氏爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1303 | Hedinichthys yarkandensis | 葉爾羌赫氏爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1314 | Hemibarbus brevipennus | 短鰭䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1315 | Hemibarbus labeo | 唇䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1316 | Hemibarbus longirostris | 長吻䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1317 | Hemibarbus macracanthus | 大刺䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1318 | Hemibarbus maculatus | 花䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1319 | Hemibarbus medius | 間䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1320 | Hemibarbus qianjiangensis | 錢江䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1321 | Hemibarbus umbrifer | 花棘䱻 | 淡水 | 本土 |
| 1322 | Hemiculter bleekeri | 貝氏䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1323 | Hemiculter leucisculus | 䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1324 | Hemiculter lucidus | 興凱䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1325 | Hemiculter tchangi | 張氏䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1326 | Hemiculter varpachovskii | 瓦氏䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1327 | Hemiculterella macrolepis | 大鱗半䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1328 | Hemiculterella sauvagei | 四川半䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1329 | Hemiculterella wui | 伍氏半䱗 | 淡水 | 本土 |
| 1335 | Hemimyzon macroptera | 大鰭間吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1336 | Hemimyzon megalopseos | 大眼間吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1337 | Hemimyzon pengi | 彭氏間吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1338 | Hemimyzon pumilicorpora | 矮身間吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1339 | Hemimyzon yaotanensis | 窟灘間吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1340 | Heminoemacheilus hyalinus | 透明間條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1341 | Heminoemacheilus zhengbaoshani | 鄭氏間條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1363 | Herzensteinia microcephalus | 小頭高原魚 | 淡水 | 本土 |
| 1396 | Homatula acuticephala | 尖頭荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1397 | Homatula anguillioides | 擬鰻荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1398 | Homatula anteridorsalis | 前背副鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1399 | Homatula berezowskii | 貝氏荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1400 | Homatula change | 美斑荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1401 | Homatula cryptoclathrata | 隱紋荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1402 | Homatula disparizona | 異斑荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1403 | Homatula erhaiensis | 洱海荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1404 | Homatula guanheensis | 灌河荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1405 | Homatula laxiclathra | 寬紋荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1406 | Homatula longidorsalis | 長背荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1407 | Homatula nanpanjiangensis | 南盤江荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1408 | Homatula nigra | 黑荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1409 | Homatula oligolepis | 寡鱗荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1410 | Homatula potanini | 短體荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1411 | Homatula pycnolepis | 多鱗荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1412 | Homatula robusta | 粗壯荷馬條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1413 | Homatula variegata | 紅尾荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1414 | Homatula wenshanensis | 文山荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1415 | Homatula wujiangensis | 烏江荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1416 | Homatula wuliangensis | 無量荷馬條鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1418 | Hongshuia banmo | 板麼紅水野鯪 | 淡水 | 本土 |
| 1419 | Hongshuia microstomata | 小口華纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 1420 | Hongshuia paoli | 袍里紅水野鯪 | 淡水 | 本土 |
| 1439 | Hypophthalmichthys harmandi | 大鱗鰱 | 淡水 | 本土 |
| 1440 | Hypophthalmichthys molitrix | 鰱 | 淡水 | 本土 |
| 1441 | Hypophthalmichthys nobilis | 鱅(花鰱) | 淡水 | 特有種 |
| 1452 | Hypsibarbus pierrei | 高體高須魚 | 淡水 | 本土 |
| 1453 | Hypsibarbus vernayi | 大鱗高須魚 | 淡水 | 本土 |
| 1485 | Jinshaia abbreviata | 短身金沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1486 | Jinshaia niulanjiangensis | 牛欄江金沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1487 | Jinshaia sinensis | 中華金沙鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1505 | Labeo calbasu | 藍野鯪 | 淡水 | 引入種 |
| 1506 | Labeo catla | 卡特拉魮 | 淡水 | 引入種 |
| 1507 | Labeo pierrei | 皮氏野鯪 | 淡水 | 本土 |
| 1508 | Labeo yunnanensis | 雲南野鯪 | 淡水 | 本土 |
| 1509 | Labiobarbus leptocheilus | 細唇長背䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1510 | Labiobarbus lineatus | 線紋長背䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1518 | Ladislavia taczanowskii | 平口鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1542 | Lefua costata | 北鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1552 | Lepidocephalichthys berdmorei | 柏氏似鱗頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1553 | Lepidocephalichthys birmanicus | 尾斑似鱗頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1554 | Lepidocephalichthys hasselti | 赫氏似鱗頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1565 | Leptobotia bellacauda | 麗尾薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1566 | Leptobotia brachycephala | 短頭薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1567 | Leptobotia citrauratea | 橘黃薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1568 | Leptobotia elongata | 長薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1569 | Leptobotia flavolineata | 黃線薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1570 | Leptobotia guilinensis | 桂林薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1571 | Leptobotia hengyangensis | 衡陽薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1572 | Leptobotia micra | 小薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1573 | Leptobotia microphthalma | 小眼薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1574 | Leptobotia orientalis | 東方薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1575 | Leptobotia pellegrini | 佩氏薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1576 | Leptobotia posterodorsalis | 後鰭薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1577 | Leptobotia punctata | 斑點薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1578 | Leptobotia rubrilabris | 紅唇薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1579 | Leptobotia taeniops | 紫薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1580 | Leptobotia tchangi | 寬斑薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1581 | Leptobotia tientainensis | 扁尾薄鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1585 | Lepturichthys dolichopterus | 長鰭犁頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1586 | Lepturichthys fimbriatus | 犁頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1598 | Leuciscus aspius | 赤稍雅羅魚 | 淡水 | 引入種 |
| 1599 | Leuciscus baicalensis | 貝加爾雅羅魚 | 淡水 | 本土 |
| 1600 | Leuciscus chuanchicus | 黃河雅羅魚 | 淡水 | 本土 |
| 1601 | Leuciscus idus | 紅鰭雅羅魚 | 淡水 | 本土 |
| 1602 | Leuciscus merzbacheri | 新疆雅羅魚 | 淡水 | 特有種 |
| 1603 | Leuciscus waleckii | 瓦氏雅羅魚 | 淡水 | 本土 |
| 1607 | Linichthys laticeps | 寬頭林氏䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1608 | Liniparhomaloptera disparis | 擬平鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1609 | Liniparhomaloptera obtusirostris | 鈍吻擬平鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1610 | Liniparhomaloptera qiongzhongensis | 瓊中擬平鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1622 | Lobocheilos melanotaenia | 黑紋舌唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 1624 | Longanalus macrochirous | 大鰭長臀鯪 | 淡水 | 本土 |
| 1632 | Luciobrama macrocephalus | 鯮 | 淡水 | 本土 |
| 1634 | Luciocyprinus langsoni | 單紋擬鱤 | 淡水 | 本土 |
| 1635 | Luciocyprinus striolatus | 細紋擬鱤 | 淡水 | 本土 |
| 1666 | Macrochirichthys macrochirus | 大鰭魚 | 淡水 | 本土 |
| 1690 | Megalobrama amblycephala | 團頭魴 | 淡水 | 本土 |
| 1691 | Megalobrama elongata | 長體魴 | 淡水 | 本土 |
| 1692 | Megalobrama mantschuricus | 東北魴 | 淡水 | 本土 |
| 1693 | Megalobrama pellegrini | 厚頜魴 | 淡水 | 本土 |
| 1694 | Megalobrama terminalis | 三角魴 | 淡水 | 本土 |
| 1698 | Mekongina erythrospila | 湄公魚 | 淡水 | 本土 |
| 1699 | Mekongina lancangensis | 瀾滄湄公魚 | 淡水 | 本土 |
| 1705 | Mesogobio lachneri | 鴨綠江中鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1706 | Mesogobio tumenensis | 圖們江中鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1707 | Metahomaloptera longicauda | 長尾後平鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1708 | Metahomaloptera omeiensis | 峨眉後平鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1709 | Metzia formosae | 台灣梅氏鯿 | 淡水 | 本土 |
| 1710 | Metzia lineata | 線紋梅氏鯿 | 淡水 | 本土 |
| 1711 | Metzia longinasus | 長鼻梅氏鯿 | 淡水 | 本土 |
| 1712 | Metzia parva | Metzia parva | 淡水 | 本土 |
| 1715 | Micronemacheilus zispi | 齊氏小條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1720 | Microphysogobio amurensis | 突吻小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1721 | Microphysogobio chenhsienensis | 胡鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1722 | Microphysogobio chinssuensis | 清徐小鰾鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 1723 | Microphysogobio elongatus | 長體小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1724 | Microphysogobio exilicauda | 細尾小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1725 | Microphysogobio fukiensis | 福建小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1726 | Microphysogobio hsinglungshanensis | 東北小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1727 | Microphysogobio kachekensis | 嘉積小鰾鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 1728 | Microphysogobio kiatingensis | 樂山小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1729 | Microphysogobio labeoides | 似鯪小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1730 | Microphysogobio liaohensis | 遼河突吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1731 | Microphysogobio linghensis | 凌河小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1732 | Microphysogobio luhensis | 陸河小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1733 | Microphysogobio microstomus | 小口小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1734 | Microphysogobio nudiventris | 裸腹小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1735 | Microphysogobio pseudoelongatus | 似長體小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1736 | Microphysogobio tafangensis | 建德小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1737 | Microphysogobio tungtingensis | 洞庭小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1738 | Microphysogobio wulonghensis | 五龍河小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1739 | Microphysogobio xianyouensis | 仙遊小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1740 | Microphysogobio yunnanensis | 雲南小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1741 | Microphysogobio zhangi | 張氏小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 1743 | Microrasbora microphthalma | 小眼小波魚 | 淡水 | 本土 |
| 1749 | Misgurnus anguillicaudatus | 泥鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1750 | Misgurnus mizolepis | 大鱗泥鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1751 | Misgurnus mohoity | 黑龍江泥鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1781 | Mylopharyngodon piceus | 青魚 | 淡水 | 本土 |
| 1793 | Mystacoleucus chilopterus | 月斑長臀䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1794 | Mystacoleucus greenwayi | 格氏長臀䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1795 | Mystacoleucus lepturus | 細尾長臀䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1796 | Mystacoleucus marginatus | 長臀䰾 | 淡水 | 本土 |
| 1798 | Myxocyprinus asiaticus | 胭脂魚 | 淡水 | 特有種 |
| 1822 | Nemacheilus fasciatus | 帶紋條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1823 | Nemacheilus huapingensis | 華坪條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1824 | Nemacheilus shuangjiangensis | 雙江條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1825 | Nemacheilus subfusca | 淺棕條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1826 | Nemacheilus yingjiangensis | 盈江條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1851 | Neolissochilus baoshanensis | 保山新光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 1852 | Neolissochilus benasi | 軟鰭新光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 1853 | Neolissochilus hemispinus | 半刺結魚 | 淡水 | 本土 |
| 1854 | Neolissochilus heterostomus | 異口新光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 1855 | Neolissochilus hexagonolepis | 墨脫新光唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 1856 | Neolissochilus qiaojiensis | 橋街結魚 | 淡水 | 本土 |
| 1860 | Neonoemacheilus labeosus | 厚唇新條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1861 | Neonoemacheilus mengdingensis | 孟定新條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1888 | Nipponocypris temminckii | 特氏東瀛鯉 | 淡水 | 本土 |
| 1889 | Niwaella laterimaculata | 側斑後鰭花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1890 | Niwaella longibarba | 長鬚後鰭花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1891 | Niwaella xinjiangensis | 信江後鰭花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1900 | Ochetobius elongatus | 䲘 | 淡水 | 本土 |
| 1929 | Onychostoma alticorpus | 高身白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1930 | Onychostoma angustistomatum | 四川白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1931 | Onychostoma barbatulum | 台灣白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1932 | Onychostoma barbatum | 粗須白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1933 | Onychostoma breve | 短身白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1934 | Onychostoma daduense | 大渡白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1935 | Onychostoma elongatum | 長身白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1936 | Onychostoma fangi | 范氏白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1937 | Onychostoma fusiforme | 紡錘白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1938 | Onychostoma gerlachi | 葛氏白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1939 | Onychostoma laticeps | 側頭白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1940 | Onychostoma lepturus | 細尾突吻魚 | 淡水 | 本土 |
| 1941 | Onychostoma lini | 小口白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1942 | Onychostoma macrolepis | 多鱗白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1943 | Onychostoma minnanense | 閩南白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1944 | Onychostoma ovale | 卵形白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1945 | Onychostoma rarum | 稀有白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1946 | Onychostoma simum | 准白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1947 | Onychostoma virgulatum | 條紋白甲魚 | 淡水 | 本土 |
| 1965 | Opsariichthys bidens | 馬口魚 | 淡水 | 本土 |
| 1966 | Opsariichthys evolans | 長鰭馬口魚 | 淡水 | 本土 |
| 1967 | Opsariichthys hainanensis | 海南馬口魚 | 淡水 | 本土 |
| 1968 | Opsariichthys minutus | 小馬口魚 | 淡水 | 本土 |
| 1969 | Opsariichthys pachycephalus | 粗首馬口魚 | 淡水 | 本土 |
| 1970 | Opsariichthys uncirostris | 真馬口魚 | 淡水 | 本土 |
| 1971 | Opsarius barnoides | 巴納低線鱲 | 淡水 | 本土 |
| 1972 | Opsarius pulchellus | 美麗真馬口波魚 | 淡水 | 本土 |
| 1983 | Oreonectes acridorsalis | 弓背嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1984 | Oreonectes anophthalmus | 無眼嶺鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1985 | Oreonectes barbatus | 弱須嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1986 | Oreonectes donglanensis | 東蘭嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1987 | Oreonectes duanensis | 都安嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1988 | Oreonectes elongatus | 長身嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1989 | Oreonectes furcocaudalis | 叉尾嶺鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1990 | Oreonectes guananensis | 關安嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1991 | Oreonectes luochengensis | 羅城嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1992 | Oreonectes macrolepis | 大鱗嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1993 | Oreonectes microphthalmus | 小眼嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1994 | Oreonectes platycephalus | 平頭嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1995 | Oreonectes polystigmus | 多斑嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1996 | Oreonectes retrodorsalis | 後鰭嶺鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 1997 | Oreonectes translucens | 透明嶺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2003 | Osteobrama belangeri | 比氏骨鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2004 | Osteobrama feae | 費氏骨鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2005 | Osteochilus salsburyi | 暗花紋唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 2006 | Osteochilus vittatus | 縱帶紋唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 2036 | Oxygymnocypris stewartii | 斯氏尖裸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2059 | Parabotia banarescui | 武昌副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2060 | Parabotia bimaculatus | 雙斑副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2061 | Parabotia brevirostris | 短吻副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2062 | Parabotia fasciatus | 宜昌沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2063 | Parabotia kiangsiensis | 江西副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2064 | Parabotia lijiangensis | 灕江副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2065 | Parabotia maculosus | 頭點副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2066 | Parabotia mantschuricus | 松花江副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2067 | Parabotia parvus | 小副沙鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2068 | Parabramis pekinensis | 鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2071 | Paracanthobrama guichenoti | 似刺鯿鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2078 | Paracobitis maolanensis | 茂蘭盲副鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2079 | Paracobitis posterodorsalus | 後鰭盲副鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2085 | Paralaubuca barroni | 巴氏羅碧魚 | 淡水 | 本土 |
| 2086 | Paralepidocephalus guishanensis | 圭山細頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2087 | Paralepidocephalus yui | 細頭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2088 | Paraleucogobio notacanthus | 似白鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2091 | Paramisgurnus dabryanus | 大鱗副泥鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2094 | Paranemachilus genilepis | 頰鱗異條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2095 | Paranemachilus pingguoensis | 平果異條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2114 | Paraprotomyzon bamaensis | 巴馬副原腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2115 | Paraprotomyzon lungkowensis | 龍口副原腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2116 | Paraprotomyzon multifasciatus | 副原腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2117 | Paraprotomyzon niulanjiangensis | 牛欄江副原腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2118 | Paraprotomyzon yunnanensis | 雲南副原腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2120 | Paraqianlabeo lineatus | 條紋異黔鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2122 | Paraschistura alepidota | 丑副南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2127 | Parasinilabeo assimilis | 異華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2128 | Parasinilabeo longibarbus | 長鬚異華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2129 | Parasinilabeo longicorpus | 長身異華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2130 | Parasinilabeo longiventralis | 長腹異華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2131 | Parasinilabeo maculatus | 班異華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2132 | Parasinilabeo microps | 小眼異華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2133 | Paraspinibarbus macracanthus | 大刺副袋唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 2135 | Paratanakia chii | 齊氏田中鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2136 | Parator zonatus | 葉副結魚 | 淡水 | 本土 |
| 2139 | Parazacco fasciatus | 海南異鱲 | 淡水 | 本土 |
| 2140 | Parazacco spilurus | 異鱲 | 淡水 | 本土 |
| 2189 | Percocypris pingi | 秉氏鱸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2190 | Percocypris regani | 里根鱸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2191 | Percocypris tchangi | 張氏鱸鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2199 | Pethia ticto | 異斑佩西䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2207 | Phoxinus brachyurus | 短尾鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2208 | Phoxinus grumi | 吐魯番鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2209 | Phoxinus phoxinus | 真鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2210 | Phoxinus tchangi | 張氏鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2211 | Phoxinus ujmonensis | 阿勒泰鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2214 | Physoschistura absumbra | 缺影游鰾條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2219 | Placocheilus caudofasciatus | 尾紋扁唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 2220 | Placocheilus cryptonemus | 缺須扁唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 2221 | Placocheilus dulongensis | 獨龍盆唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 2222 | Placocheilus robustus | 壯尾扁唇魚 | 淡水 | 本土 |
| 2223 | Plagiognathops microlepis | 細鱗斜頜鯝 | 淡水 | 本土 |
| 2241 | Platypharodon extremus | 扁咽齒魚 | 淡水 | 本土 |
| 2244 | Platysmacheilus exiguus | 片唇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2245 | Platysmacheilus longibarbatus | 長鬚片唇鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 2246 | Platysmacheilus nudiventris | 裸腹片唇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2247 | Platysmacheilus zhenjiangensis | 鎮江片唇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2269 | Plesiomyzon baotingensis | 保亭近腹吸鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 2280 | Pogobrama barbatula | 須華鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2311 | Poropuntius alloiopleurus | 淡水 | 本土 | |
| 2312 | Poropuntius carinatus | 棱頭孔小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2313 | Poropuntius chonglingchungi | 常氏頭孔小䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2314 | Poropuntius cogginii | 科氏頭孔小䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2315 | Poropuntius daliensis | 洱海頭孔小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2316 | Poropuntius exiguus | 油頭孔小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2317 | Poropuntius fuxianhuensis | 撫仙頭孔小䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2318 | Poropuntius huangchuchieni | 雲南頭孔小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2319 | Poropuntius krempfi | 克氏頭孔小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2320 | Poropuntius margarianus | 太平吻孔䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2321 | Poropuntius opisthopterus | 後鰭頭孔小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2322 | Poropuntius rhomboides | 魴形吻孔䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2323 | Poropuntius susanae | 蘇珊頭孔小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2343 | Procypris mera | 烏原鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2344 | Procypris rabaudi | 岩原鯉 | 淡水 | 特有種 |
| 2348 | Protocobitis anteroventris | 前腹原花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2349 | Protocobitis polylepis | 多鱗原花鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2350 | Protocobitis typhlops | 盲眼原花鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 2351 | Protolabeo protolabeo | 原鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2352 | Protonemacheilus longipectoralis | 長胸鰭原條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2370 | Pseudaspius brandtii | 平三齒雅羅魚 | 淡水 | 本土 |
| 2371 | Pseudaspius hakonensis | 箱根三齒雅羅魚 | 淡水 | 本土 |
| 2372 | Pseudaspius leptocephalus | 擬赤稍魚 | 淡水 | 本土 |
| 2416 | Pseudobrama simoni | 似鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2422 | Pseudocrossocheilus liuchengensis | 柳城擬纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2423 | Pseudocrossocheilus longibullus | 長鰾擬纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2424 | Pseudocrossocheilus nigrovittatus | 黑帶擬纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2425 | Pseudocrossocheilus papillolabrus | 瘤唇擬纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2426 | Pseudocrossocheilus tridentis | 三齒擬纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2427 | Pseudogastromyzon changtingensis | 長汀擬腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2428 | Pseudogastromyzon cheni | 圓斑擬腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2429 | Pseudogastromyzon daon | 越南擬腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2430 | Pseudogastromyzon fangi | 珠江擬腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2431 | Pseudogastromyzon fasciatus | 條紋擬腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2432 | Pseudogastromyzon laticeps | 寬頭擬腹吸鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 2433 | Pseudogastromyzon lianjiangensis | 練江擬腹吸鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 2434 | Pseudogastromyzon meihuashanensis | 梅花山擬腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2435 | Pseudogastromyzon myersi | 邁氏擬腹吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2436 | Pseudogastromyzon peristictus | 密斑擬腹吸鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 2437 | Pseudogobio esocinus | 長吻似鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2438 | Pseudogobio guilinensis | 桂林似鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2439 | Pseudogobio vaillanti | 似鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2443 | Pseudogyrinocheilus longisulcus | 長溝泉水魚 | 淡水 | 本土 |
| 2444 | Pseudogyrinocheilus prochilus | 泉水魚 | 淡水 | 特有種 |
| 2445 | Pseudohemiculter dispar | 南方擬䱗 | 淡水 | 本土 |
| 2446 | Pseudohemiculter hainanensis | 海南擬䱗 | 淡水 | 本土 |
| 2447 | Pseudohemiculter kweichowensis | 貴州擬䱗 | 淡水 | 本土 |
| 2448 | Pseudohomaloptera vulgaris | 普通平鰭鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2449 | Pseudohomaloptera yunnanensis | 雲南原爬鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2453 | Pseudolaubuca engraulis | 寡鱗飄魚 | 淡水 | 本土 |
| 2454 | Pseudolaubuca sinensis | 銀飄魚 | 淡水 | 本土 |
| 2458 | Pseudopungtungia tenuicorpus | 細擬扁吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2459 | Pseudorasbora elongata | 長麥穗魚 | 淡水 | 本土 |
| 2460 | Pseudorasbora interrupta | 斷線麥穗魚 | 淡水 | 本土 |
| 2461 | Pseudorasbora parva | 麥穗魚 | 淡水 | 本土 |
| 2474 | Pseudosinocyclocheilus jinxiensis | 靖西擬金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2476 | Psilorhynchus homaloptera | 平鰭裸吻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2495 | Pteronemacheilus meridionalis | 南方翼條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2501 | Ptychidio jordani | 卷口魚 | 淡水 | 本土 |
| 2502 | Ptychidio longibarbus | 長鬚卷口魚 | 淡水 | 本土 |
| 2503 | Ptychidio macrops | 大眼卷口魚 | 淡水 | 本土 |
| 2504 | Ptychobarbus chungtienensis | 中甸葉須魚(中甸重唇魚) | 淡水 | 特有種 |
| 2505 | Ptychobarbus conirostris | 錐吻葉須魚(錐吻重唇魚) | 淡水 | 本土 |
| 2506 | Ptychobarbus dipogon | 雙須葉須魚(雙須重唇魚) | 淡水 | 特有種 |
| 2507 | Ptychobarbus kaznakovi | 裸腹葉須魚(裸腹重唇魚) | 淡水 | 本土 |
| 2511 | Pungtungia herzi | 扁吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2512 | Puntioplites falcifer | 鐮䰾鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2513 | Puntioplites proctozystron | 䰾鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2514 | Puntioplites waandersi | 爪哇䰾鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2515 | Puntius paucimaculatus | 疏斑小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2516 | Puntius sophore | 斑尾小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2523 | Qianlabeo striatus | 條紋黔野鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2525 | Raiamas guttatus | 長嘴鱲 | 淡水 | 本土 |
| 2527 | Rasbora argyrotaenia | 銀線波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2528 | Rasbora atridorsalis | 黑背波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2529 | Rasbora cephalotaenia | 頭條波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2530 | Rasbora dusonensis | 黃尾波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2531 | Rasbora septentrionalis | 北方波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2532 | Rasbora steineri | 南方波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2533 | Rasbora sumatrana | 蘇門答臘波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2534 | Rasbora volzii | 沃氏波魚 | 淡水 | 本土 |
| 2537 | Rectoris longibarbus | 長鬚直口鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2538 | Rectoris longifinus | 長鰭直口鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2539 | Rectoris luxiensis | 瀘溪直口鯪 | 淡水 | 特有種 |
| 2540 | Rectoris mutabilis | 變形直口鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2541 | Rectoris posehensis | 直口鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2562 | Rhinogobio cylindricus | 圓筒吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2563 | Rhinogobio hunanensis | 湖南吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2564 | Rhinogobio nasutus | 大鼻吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2565 | Rhinogobio typus | 吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2566 | Rhinogobio ventralis | 長鰭吻鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2620 | Rhodeus albomarginatus | 白邊鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2621 | Rhodeus amurensis | 黑龍江鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2622 | Rhodeus fangi | 方氏鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2623 | Rhodeus haradai | 原田鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2624 | Rhodeus lighti | 彩石鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2625 | Rhodeus monguonensis | 蒙國鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2626 | Rhodeus notatus | 濟南鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2627 | Rhodeus ocellatus | 高體鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2628 | Rhodeus sericeus | 絲鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2629 | Rhodeus shitaiensis | 石台鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2630 | Rhodeus sinensis | 中華鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2631 | Rhodeus spinalis | 刺鰭鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 2634 | Rhynchocypris czekanowskii | 花江大吻鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2635 | Rhynchocypris lagowskii | 拉氏大吻鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2636 | Rhynchocypris oxycephala | 尖頭鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2637 | Rhynchocypris percnura | 東北湖鱥 | 淡水 | 本土 |
| 2643 | Romanogobio amplexilabris | 黃河羅馬諾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2644 | Romanogobio johntreadwelli | 山西羅馬諾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2645 | Romanogobio tenuicorpus | 細體羅馬諾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2650 | Rutilus rutilus | 擬鯉 | 淡水 | 本土 |
| 2666 | Sarcocheilichthys czerskii | 克氏鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2667 | Sarcocheilichthys davidi | 川西鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2668 | Sarcocheilichthys hainanensis | 海南鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2669 | Sarcocheilichthys kiangsiensis | 江西鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2670 | Sarcocheilichthys lacustris | 東北鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2671 | Sarcocheilichthys nigripinnis | 黑鰭鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2672 | Sarcocheilichthys parvus | 小鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2673 | Sarcocheilichthys sinensis | 福建華鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2674 | Sarcocheilichthys soldatovi | 索氏鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2675 | Sarcocheilichthys vittatus | 條紋鰁 | 淡水 | 本土 |
| 2706 | Saurogobio dabryi | 蛇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2707 | Saurogobio dumerili | 長蛇鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 2708 | Saurogobio gracilicaudatus | 細尾蛇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2709 | Saurogobio gymnocheilus | 光唇蛇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2710 | Saurogobio immaculatus | 無斑蛇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2711 | Saurogobio lissilabris | 滑唇蛇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2712 | Saurogobio punctatus | 斑點蛇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2713 | Saurogobio xiangjiangensis | 湘江蛇鮈 | 淡水 | 本土 |
| 2716 | Scaphiodonichthys acanthopterus | 少鱗舟齒魚(刺鰭鏟齒魚) | 淡水 | 本土 |
| 2717 | Scaphiodonichthys macracanthus | 長鰭舟齒魚(大刺鏟齒魚) | 淡水 | 本土 |
| 2740 | Schistura albirostris | 白鼻南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2741 | Schistura amplizona | 寬帶南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2742 | Schistura bannaensis | 版納南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2743 | Schistura breviceps | 短頭南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2744 | Schistura bucculenta | 鼓頰南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2745 | Schistura callichroma | 美斑南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2746 | Schistura caudofurca | 叉尾南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2747 | Schistura conirostris | 錐吻南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2748 | Schistura cryptofasciata | 隱斑南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2749 | Schistura disparizona | 異斑南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2750 | Schistura fascimaculata | 條斑南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2751 | Schistura fasciolata | 橫紋南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2752 | Schistura greenei | 格氏南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2753 | Schistura hingi | 亨氏南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2754 | Schistura humilis | 矮南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2755 | Schistura incerta | 無斑南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2756 | Schistura kengtungensis | 湄南南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2757 | Schistura kloetzliae | 克氏南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2758 | Schistura kongphengi | 康氏南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2759 | Schistura latifasciata | 寬紋南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2760 | Schistura lingyunensis | 凌雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2761 | Schistura longa | 長南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2762 | Schistura macrocephalus | 大頭南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2763 | Schistura macrotaenia | 大斑南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2764 | Schistura malaisei | 雲紋南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2765 | Schistura megalodon | 大齒南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2766 | Schistura nandingensis | 南定南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2767 | Schistura nicholsi | 尼氏南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2768 | Schistura niulanjiangensis | 牛欄江南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2769 | Schistura paraxena | 奇異南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2770 | Schistura pertica | 棒狀南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2771 | Schistura poculi | 密帶南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2772 | Schistura polytaenia | 多紋南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2773 | Schistura prolixifasciata | 長帶南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2774 | Schistura pseudofasciolata | 似橫紋南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2775 | Schistura rara | 稀有南鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 2776 | Schistura schultzi | 多鱗南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2777 | Schistura sexnubes | 六斑南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2778 | Schistura sikmaiensis | 錫克曼南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2779 | Schistura vinciguerrae | 密紋南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2780 | Schistura waltoni | 瓦氏南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2781 | Schizopygopsis anteroventris | 前腹裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2782 | Schizopygopsis kessleri | 柴達木裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2783 | Schizopygopsis kialingensis | 嘉陵裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2784 | Schizopygopsis malacanthus | 大渡軟刺裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2785 | Schizopygopsis pylzovi | 黃河裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2786 | Schizopygopsis selincuoensis | 淡水 | 特有種 | |
| 2787 | Schizopygopsis stoliczkai | 高原裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2788 | Schizopygopsis thermalis | 溫泉裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2789 | Schizopygopsis younghusbandi | 拉薩裸裂尻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2790 | Schizothorax argentatus | 銀色裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2791 | Schizothorax beipanensis | 北盤裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2792 | Schizothorax biddulphi | 塔里木裂腹魚 | 淡水 | 特有種 |
| 2793 | Schizothorax chongi | 細鱗裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2794 | Schizothorax cryptolepis | 隱鱗裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2795 | Schizothorax curvifrons | 彎頜裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2796 | Schizothorax curvilabiatus | 弓唇裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2797 | Schizothorax davidi | 重口裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2798 | Schizothorax dolichonema | 長絲裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2799 | Schizothorax dulongensis | 獨龍裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2800 | Schizothorax elongatus | 長身裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2801 | Schizothorax esocinus | 扁嘴裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2802 | Schizothorax eurystomus | 寬口裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2803 | Schizothorax gongshanensis | 貢山裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2804 | Schizothorax grahami | 昆明裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2805 | Schizothorax griseus | 灰裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2806 | Schizothorax heteri | 奇異裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2807 | Schizothorax heterochilus | 異唇裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2808 | Schizothorax heterophysallidos | 異鰾裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2809 | Schizothorax integrilabiatus | 完唇裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2810 | Schizothorax kozlovi | 四川裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2811 | Schizothorax labiatus | 全唇裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2812 | Schizothorax labrosus | 厚唇裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2813 | Schizothorax lantsangensis | 瀾滄裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2814 | Schizothorax lepidothorax | 鱗胸裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2815 | Schizothorax leukus | 白體裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2816 | Schizothorax lissolabiatus | 光唇裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2817 | Schizothorax longibarbus | 長鬚裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2818 | Schizothorax macropogon | 巨須裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2819 | Schizothorax malacanthus | 軟刺裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2820 | Schizothorax meridionalis | 南方裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2821 | Schizothorax microstomus | 小口裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2822 | Schizothorax molesworthi | 墨脫裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2823 | Schizothorax myzostomus | 吸口裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2824 | Schizothorax nasus | 大鼻裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2825 | Schizothorax ninglangensis | 寧蒗裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2826 | Schizothorax nudiventris | 裸腹裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2827 | Schizothorax nukiangensis | 怒江裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2828 | Schizothorax oconnori | 異齒裂腹魚 | 淡水 | 特有種 |
| 2829 | Schizothorax oligolepis | 少鱗裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2830 | Schizothorax parvus | 小裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2831 | Schizothorax plagiostomus | 橫口裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2832 | Schizothorax prenanti | 齊口裂腹魚 | 淡水 | 特有種 |
| 2833 | Schizothorax progastus | 前裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2834 | Schizothorax pseudoaksaiensis | 伊氏裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2835 | Schizothorax richardsonii | 理氏裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2836 | Schizothorax rotundimaxillaris | 圓頜裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2837 | Schizothorax sinensis | 中華裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2838 | Schizothorax waltoni | 拉薩裂腹魚 | 淡水 | 特有種 |
| 2839 | Schizothorax wangchiachii | 短鬚裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2840 | Schizothorax yunnanensis | 威寧裂腹魚 | 淡水 | 本土 |
| 2887 | Sectoria heterognathos | 異頜棱唇條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2892 | Semilabeo notabilis | 唇鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2893 | Semilabeo obscurus | 暗色唇鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2902 | Sewellia lineolata | 線紋思凡鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2916 | Sikukia flavicaudata | 黃尾短吻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2917 | Sikukia gudgeri | 短吻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2918 | Sikukia longibarbata | 長鬚短吻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2919 | Sikukia stejnegeri | 史氏短吻魚 | 淡水 | 本土 |
| 2938 | Sinibotia longiventralis | 長腹華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2939 | Sinibotia pulchra | 美麗華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2940 | Sinibotia reevesae | 寬體華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2941 | Sinibotia robusta | 壯體華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2942 | Sinibotia superciliaris | 華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2943 | Sinibotia zebra | 斑紋華鰍 | 淡水 | 本土 |
| 2944 | Sinibrama longianalis | 長鰭華鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2945 | Sinibrama macrops | 大眼華鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2946 | Sinibrama melrosei | 海南華鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2947 | Sinibrama taeniatus | 四川華鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2948 | Sinibrama wui | 伍氏華鯿 | 淡水 | 本土 |
| 2949 | Sinigarra napoense | 那坡中國墨頭魚 | 淡水 | 本土 |
| 2950 | Sinilabeo cirrhinoides | 似鯪華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2951 | Sinilabeo hummeli | 赫氏華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2952 | Sinilabeo longibarbatus | 長鬚華鯪 | 淡水 | 本土 |
| 2964 | Sinocrossocheilus bamaensis | 巴馬華纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2965 | Sinocrossocheilus guizhouensis | 華纓魚 | 淡水 | 特有種 |
| 2966 | Sinocrossocheilus labiatus | 寬唇華纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2967 | Sinocrossocheilus megalophthalmus | 大眼華纓魚 | 淡水 | 本土 |
| 2968 | Sinocyclocheilus altishoulderus | 高肩金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2969 | Sinocyclocheilus anatirostris | 鴨嘴金線䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2970 | Sinocyclocheilus angularis | 角金線䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2971 | Sinocyclocheilus angustiporus | 狹孔金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2972 | Sinocyclocheilus anophthalmus | 無眼金線䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2973 | Sinocyclocheilus anshuiensis | 安水金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2974 | Sinocyclocheilus aquihornes | 鷹喙角金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2975 | Sinocyclocheilus biangularis | 兩角金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2976 | Sinocyclocheilus bicornutus | 雙角金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2977 | Sinocyclocheilus brevibarbatus | 短鬚金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2978 | Sinocyclocheilus brevifinus | 短尾金線魮 | 淡水 | 本土 |
| 2979 | Sinocyclocheilus brevis | 短身金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2980 | Sinocyclocheilus broadihornes | 寬角金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2981 | Sinocyclocheilus cyphotergous | 駝背金線䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2982 | Sinocyclocheilus donglanensis | 東蘭金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2983 | Sinocyclocheilus dongtangensis | 洞塘金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2984 | Sinocyclocheilus flexuosdorsalis | 曲背金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2985 | Sinocyclocheilus furcodorsalis | 叉背金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2986 | Sinocyclocheilus gracilicaudatus | 細尾金線魮 | 淡水 | 本土 |
| 2987 | Sinocyclocheilus gracilis | 細身金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2988 | Sinocyclocheilus grahami | 滇池金線䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 2989 | Sinocyclocheilus guanduensis | 官渡金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2990 | Sinocyclocheilus guilinensis | 桂林金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2991 | Sinocyclocheilus guishanensis | 圭山金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2992 | Sinocyclocheilus hei | 何氏金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2993 | Sinocyclocheilus huanglongdongensis | 黃龍洞金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2994 | Sinocyclocheilus huangtianensis | 黃田金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2995 | Sinocyclocheilus huaningensis | 華寧金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2996 | Sinocyclocheilus huanjiangensis | 環江金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2997 | Sinocyclocheilus hugeibarbus | 巨須金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 2998 | Sinocyclocheilus huizeensis | 會澤金線魮 | 淡水 | 本土 |
| 2999 | Sinocyclocheilus hyalinus | 透明金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3000 | Sinocyclocheilus jii | 季氏金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3001 | Sinocyclocheilus jiuxuensis | 九圩金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3002 | Sinocyclocheilus lateristriatus | 側條金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3003 | Sinocyclocheilus liboensis | 荔波金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3004 | Sinocyclocheilus lingyunensis | 凌雲金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3005 | Sinocyclocheilus longibarbatus | 長鬚金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3006 | Sinocyclocheilus longifinus | 長鰭金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3007 | Sinocyclocheilus luolouensis | 邏樓金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3008 | Sinocyclocheilus luopingensis | 羅平金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3009 | Sinocyclocheilus macrocephalus | 大頭金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3010 | Sinocyclocheilus macrolepis | 大鱗金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3011 | Sinocyclocheilus macrophthalmus | 大眼金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3012 | Sinocyclocheilus macroscalus | 陸良金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3013 | Sinocyclocheilus maculatus | 麻花金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3014 | Sinocyclocheilus maitianheensis | 麥田河金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3015 | Sinocyclocheilus malacopterus | 軟鰭金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3016 | Sinocyclocheilus mashanensis | 馬山金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3017 | Sinocyclocheilus microphthalmus | 小眼金線䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 3018 | Sinocyclocheilus multipunctatus | 多斑金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3019 | Sinocyclocheilus oxycephalus | 尖頭金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3020 | Sinocyclocheilus purpureus | 紫色金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3021 | Sinocyclocheilus qiubeiensis | 丘北金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3022 | Sinocyclocheilus qujingensis | 曲靖金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3023 | Sinocyclocheilus rhinocerous | 犀角金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3024 | Sinocyclocheilus robustus | 粗壯金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3025 | Sinocyclocheilus tianlinensis | 田林金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3026 | Sinocyclocheilus tileihornes | 瓦狀角金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3027 | Sinocyclocheilus tingi | 撫仙金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3028 | Sinocyclocheilus wui | 伍氏金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3029 | Sinocyclocheilus wumengshanensis | 烏蒙山金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3030 | Sinocyclocheilus xichouensis | 西疇金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3031 | Sinocyclocheilus xunlensis | 馴樂金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3032 | Sinocyclocheilus yangzongensis | 陽宗金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3033 | Sinocyclocheilus yaolanensis | 堯蘭金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3034 | Sinocyclocheilus yimenensis | 易門金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3035 | Sinocyclocheilus yishanensis | 宜山金線䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3036 | Sinogastromyzon daduheensis | 大渡河華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3037 | Sinogastromyzon dezeensis | 德澤華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3038 | Sinogastromyzon hsiashiensis | 下司華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3039 | Sinogastromyzon lixianjiangensis | 李仙江華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3040 | Sinogastromyzon macrostoma | 大口華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3041 | Sinogastromyzon nanpanjiangensis | 南盤江華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3042 | Sinogastromyzon sichangensis | 西昌華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3043 | Sinogastromyzon szechuanensis | 四川華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3044 | Sinogastromyzon tonkinensis | 越南華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3045 | Sinogastromyzon wui | 伍氏華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3046 | Sinorhodeus microlepis | 細鱗中華鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 3056 | Sphaerophysa dianchiensis | 滇池球鰾鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3068 | Spinibarbus caldwelli | 喀氏倒刺䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3069 | Spinibarbus denticulatus | 鋸齒倒刺䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3070 | Spinibarbus hollandi | 光倒刺䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3071 | Spinibarbus sinensis | 中華倒刺䰾 | 淡水 | 本土 |
| 3074 | Squalidus argentatus | 銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3075 | Squalidus atromaculatus | 暗斑銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3076 | Squalidus chankaensis | 興凱銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3077 | Squalidus iijimae | 飯島氏銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3078 | Squalidus intermedius | 中間銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3079 | Squalidus mantschuricus | 東北銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3080 | Squalidus minor | 海南銀鮈(小銀鮈) | 淡水 | 特有種 |
| 3081 | Squalidus nitens | 亮銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3082 | Squalidus wolterstorffi | 點紋銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 3083 | Squaliobarbus curriculus | 赤眼鱒 | 淡水 | 本土 |
| 3101 | Stenorynchoacrum xijiangensis | 西江狹吻魚 | 淡水 | 本土 |
| 3142 | Syncrossus beauforti | 斑鰭纓須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3143 | Syncrossus berdmorei | 緬甸纓須鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3189 | Tanakia lanceolata | 矛形田中鰟鮍 | 淡水 | 本土 |
| 3190 | Tanichthys albiventris | 白腹唐魚 | 淡水 | 本土 |
| 3191 | Tanichthys albonubes | 唐魚 | 淡水 | 本土 |
| 3192 | Tanichthys flavianalis | 黃臀唐魚 | 淡水 | 本土 |
| 3193 | Tariqilabeo bicornis | 角魚 | 淡水 | 本土 |
| 3194 | Tariqilabeo latius | 淡水 | 本土 | |
| 3236 | Tinca tinca | 丁鱥 | 淡水 | 本土 |
| 3237 | Tor douronensis | 爪哇結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3238 | Tor laterivittatus | 側帶結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3239 | Tor polylepis | 多鱗結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3240 | Tor putitora | 黃鰭結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3241 | Tor sinensis | 中國結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3242 | Tor tambra | 野結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3243 | Tor tambroides | 似野結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3244 | Tor yingjiangensis | 盈江結魚 | 淡水 | 本土 |
| 3247 | Toxabramis argentifer | 銀似鱎 | 淡水 | 本土 |
| 3248 | Toxabramis hoffmanni | 小似鱎 | 淡水 | 本土 |
| 3249 | Toxabramis houdemeri | 海南似鱎 | 淡水 | 本土 |
| 3250 | Toxabramis swinhonis | 似鱎 | 淡水 | 特有種 |
| 3251 | Traccatichthys pulcher | 美麗中條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3252 | Traccatichthys taeniatus | 越南中條鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3253 | Traccatichthys tuberculum | 具結沙貓鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3288 | Triplophysa alexandrae | 亞歷山大高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3289 | Triplophysa aliensis | 阿里高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3290 | Triplophysa alticeps | 隆頭高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3291 | Triplophysa altipinnis | 高鰭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3292 | Triplophysa aluensis | 阿廬高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3293 | Triplophysa angeli | 安氏高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3294 | Triplophysa anterodorsalis | 前鰭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3295 | Triplophysa aquaecaeruleae | 水綠高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3296 | Triplophysa bashanensis | 巴山高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3297 | Triplophysa bleekeri | 勃氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3298 | Triplophysa bombifrons | 隆額高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3299 | Triplophysa brachyptera | 短鰭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3300 | Triplophysa brevibarba | 短鬚高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3301 | Triplophysa brevicauda | 短尾高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3302 | Triplophysa cakaensis | 茶卡高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3303 | Triplophysa chondrostoma | 鏟頜高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3304 | Triplophysa crassicauda | 糙尾高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3305 | Triplophysa crassilabris | 粗唇高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3306 | Triplophysa cuneicephala | 尖頭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3307 | Triplophysa dalaica | 達里湖高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3308 | Triplophysa daochengensis | 稻城高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3309 | Triplophysa daqiaoensis | 大橋高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3310 | Triplophysa dongganensis | 峒敢高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3311 | Triplophysa dorsalis | 黑背高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3312 | Triplophysa edsinica | 貪食高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3313 | Triplophysa eugeniae | 尤金氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3314 | Triplophysa fengshanensis | 鳳山高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3315 | Triplophysa flavicorpus | 黃體高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3316 | Triplophysa furva | 暗色高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3317 | Triplophysa fuxianensis | 撫仙高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3318 | Triplophysa gejiuensis | 個舊盲高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3319 | Triplophysa gerzeensis | 改則高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3320 | Triplophysa gracilis | 灰高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3321 | Triplophysa grahami | 昆明高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3322 | Triplophysa griffithii | 格氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3323 | Triplophysa hexiensis | 河西高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3324 | Triplophysa heyangensis | 郃陽高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3325 | Triplophysa hialmari | 希氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3326 | Triplophysa hsutschouensis | 酒泉高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3327 | Triplophysa huanjiangensis | 環江高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3328 | Triplophysa huapingensis | 花坪高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3329 | Triplophysa hutjertjuensis | 忽吉圖高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3330 | Triplophysa incipiens | 蟄棲高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3331 | Triplophysa intermedia | 中間高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3332 | Triplophysa jianchuanensis | 劍川高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3333 | Triplophysa jiarongensis | 佳榮盲高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3334 | Triplophysa kaznakowi | 卡氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3335 | Triplophysa labiata | 穗唇高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3336 | Triplophysa lacustris | 湖高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3337 | Triplophysa ladacensis | 拉達克高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3338 | Triplophysa langpingensis | 浪平高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3339 | Triplophysa laterimaculata | 側斑高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3340 | Triplophysa laticeps | 側頭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3341 | Triplophysa leptosoma | 梭形高原鰍(修長高原鰍) | 淡水 | 本土 |
| 3342 | Triplophysa lihuensis | 里湖高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3343 | Triplophysa lixianensis | 理縣高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3344 | Triplophysa longianguis | 蛇形高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3345 | Triplophysa longibarbata | 長鬚盲高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3346 | Triplophysa longipectoralis | 長鰭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3347 | Triplophysa longliensis | 龍里高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3348 | Triplophysa luochengensis | 羅城高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3349 | Triplophysa macrocephala | 大頭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3350 | Triplophysa macromaculata | 大斑高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3351 | Triplophysa macrophthalma | 大眼高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3352 | Triplophysa markehenensis | 瑪柯河高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3353 | Triplophysa microphthalma | 細眼高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3354 | Triplophysa microphysa | 小鰾高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3355 | Triplophysa microps | 小眼高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3356 | Triplophysa minuta | 小體高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3357 | Triplophysa minxianensis | 岷縣高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3358 | Triplophysa moquensis | 墨曲高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3359 | Triplophysa nandanensis | 南丹高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3360 | Triplophysa nanpanjiangensis | 南盤江高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3361 | Triplophysa nasalis | 大鼻高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3362 | Triplophysa nasobarbatula | 鼻須高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3363 | Triplophysa ninglangensis | 寧蒗高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3364 | Triplophysa nujiangensa | 怒江高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3365 | Triplophysa obscura | 黑體高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3366 | Triplophysa obtusirostra | 鈍吻高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3367 | Triplophysa orientalis | 東方高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3368 | Triplophysa papillosolabiata | 粒唇高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3369 | Triplophysa pappenheimi | 黃河高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3370 | Triplophysa parvus | 小高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3371 | Triplophysa polyfasciata | 多帶高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3372 | Triplophysa pseudoscleroptera | 擬硬刺高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3373 | Triplophysa pseudostenura | 擬細尾高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3374 | Triplophysa qilianensis | 祁連高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3375 | Triplophysa qiubeiensis | 丘北盲高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3376 | Triplophysa robusta | 粗壯高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3377 | Triplophysa rosa | 玫瑰高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3378 | Triplophysa rossoperegrinatorum | 紅異高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3379 | Triplophysa rotundiventris | 圓腹高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3380 | Triplophysa scapanognatha | 挖頜高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3381 | Triplophysa scleroptera | 硬鰭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3382 | Triplophysa sellaefer | 賽麗高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3383 | Triplophysa shaanxiensis | 陝西高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3384 | Triplophysa shilinensis | 石林盲高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3385 | Triplophysa shiyangensis | 石羊河高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3386 | Triplophysa siluroides | 似鯰高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3387 | Triplophysa stenura | 細尾高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3388 | Triplophysa stewarti | 異尾高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3389 | Triplophysa stolickai | 斯氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3390 | Triplophysa strauchii | 新疆高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3391 | Triplophysa tanggulaensis | 唐古拉高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3392 | Triplophysa tenuicauda | 窄尾高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3393 | Triplophysa tenuis | 長身高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3394 | Triplophysa tianeensis | 天峨高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3395 | Triplophysa tianlinensis | 田林高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3396 | Triplophysa tibetana | 西藏高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3397 | Triplophysa turpanensis | 吐魯番高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3398 | Triplophysa venusta | 秀麗高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3399 | Triplophysa waisihani | 歪思可汗高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3400 | Triplophysa wuweiensis | 武威高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3401 | Triplophysa xiangshuingensis | 響水箐高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3402 | Triplophysa xiangxiensis | 湘西盲高原鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3403 | Triplophysa xichangensis | 西昌高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3404 | Triplophysa xingshanensis | 興山高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3405 | Triplophysa xiqiensis | 西溪高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3406 | Triplophysa yaopeizhii | 姚氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3407 | Triplophysa yasinensis | 南亞高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3408 | Triplophysa yunnanensis | 雲南高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3409 | Triplophysa zaidamensis | 柴達木高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3410 | Triplophysa zamegacephala | 巨頭高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3411 | Triplophysa zhaoi | 趙氏高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3412 | Triplophysa zhenfengensis | 貞豐高原鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3420 | Typhlobarbus nudiventris | 裸腹盲䰾 | 淡水 | 特有種 |
| 3452 | Vanmanenia caldwelli | 縱紋原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3453 | Vanmanenia gymnetrus | 裸腹原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3454 | Vanmanenia hainanensis | 海南原纓口鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3455 | Vanmanenia homalocephala | 扁頭原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3456 | Vanmanenia lineata | 線紋原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3457 | Vanmanenia maculata | 大斑原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3458 | Vanmanenia microcephala | 小頭原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3459 | Vanmanenia pingchowensis | 平舟原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3460 | Vanmanenia polylepis | 多鱗原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3461 | Vanmanenia pseudostriata | 擬橫斑原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3462 | Vanmanenia serrilineata | 湄公河原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3463 | Vanmanenia stenosoma | 原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3464 | Vanmanenia striata | 橫斑原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3465 | Vanmanenia tetraloba | 四葉原纓口鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3466 | Vanmanenia xinyiensis | 信宜原纓口鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3486 | Xenocyprioides carinatus | 梭似鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3487 | Xenocyprioides parvulus | 小似鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3488 | Xenocypris davidi | 黃尾鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3489 | Xenocypris fangi | 方氏鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3490 | Xenocypris hupeinensis | 湖北鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3491 | Xenocypris macrolepis | 細鱗鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3492 | Xenocypris medius | 台灣鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3493 | Xenocypris yunnanensis | 雲南鯝 | 淡水 | 本土 |
| 3495 | Xenophysogobio boulengeri | 異鰾鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 3496 | Xenophysogobio nudicorpa | 裸體異鰾鰍鮀 | 淡水 | 本土 |
| 3503 | Yaoshania pachychilus | 厚唇瑤山鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3504 | Yunnanilus altus | 高體雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3505 | Yunnanilus analis | 長臀雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3506 | Yunnanilus bailianensis | 白蓮雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3507 | Yunnanilus bajiangensis | 巴江雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3508 | Yunnanilus beipanjiangensis | 北盤江雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3509 | Yunnanilus caohaiensis | 草海雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3510 | Yunnanilus chui | 褚氏雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3511 | Yunnanilus discoloris | 異色雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3512 | Yunnanilus elakatis | 紡綞雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3513 | Yunnanilus forkicaudalis | 叉尾雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3514 | Yunnanilus ganheensis | 干河雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3515 | Yunnanilus jinxiensis | 靖西雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3516 | Yunnanilus longibarbatus | 長鬚雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3517 | Yunnanilus longibulla | 長鰾雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3518 | Yunnanilus longidorsalis | 長背雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3519 | Yunnanilus macrogaster | 膨腹雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3520 | Yunnanilus macrolepis | 大鱗雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3521 | Yunnanilus macrositanus | 大斑雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3522 | Yunnanilus nanpanjiangensis | 南盤江雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3523 | Yunnanilus niger | 黑體雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3524 | Yunnanilus nigromaculatus | 黑斑雲南鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3525 | Yunnanilus niulanensis | 牛欄江雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3526 | Yunnanilus obtusirostris | 鈍吻雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3527 | Yunnanilus pachycephalus | 寬頭雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3528 | Yunnanilus paludosus | 沼澤雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3529 | Yunnanilus parvus | 小雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3530 | Yunnanilus pleurotaenia | 側紋雲南鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 3531 | Yunnanilus pulcherrimus | 麗紋雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3532 | Yunnanilus sichuanensis | 四川雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3533 | Yunnanilus spanisbripes | 橫斑雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3534 | Yunnanilus tigerivinus | 虎斑雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3535 | Yunnanilus yangzonghaiensis | 陽宗海雲南鰍 | 淡水 | 本土 |
| 3536 | Zacco acutipinnis | 尖棘鱲 | 淡水 | 本土 |
| 3537 | Zacco chengtui | 成都鱲 | 淡水 | 特有種 |
| 3538 | Zacco platypus | 寬鰭鱲 | 淡水 | 本土 |
| 3539 | Zacco taliensis | 大理鱲 | 淡水 | 特有種 |
| 3619 | Aphyocypris amnis | 溪流細鯽 | 淡水 | 本土 |
| 3620 | Aphyocypris kikuchii | 台灣細鯽 | 淡水 | 特有種 |
| 3621 | Aphyocypris moltrechti | 台灣副細鯽 | 淡水 | 特有種 |
| 3664 | Barbonymus schwanefeldii | 施氏魮 | 淡水 | 引入種 |
| 3737 | Candidia barbata | 須鱲 | 淡水 | 特有種 |
| 3738 | Candidia pingtungensis | 屏東須鱲 | 淡水 | 本土 |
| 4048 | Formosania lacustris | 台灣纓口鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 4157 | Hemimyzon formosanus | 台灣間吸鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 4158 | Hemimyzon sheni | 沈氏間吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 4159 | Hemimyzon taitungensis | 台東間吸鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 4160 | Hemimyzon yushanensis | 玉山間吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 4299 | Metzia mesembrinum | 大鱗梅氏鯿 | 淡水 | 本土 |
| 4303 | Microphysogobio alticorpus | 高身小鰾鮈 | 淡水 | 本土 |
| 4304 | Microphysogobio brevirostris | 短吻小鰾鮈 | 淡水 | 特有種 |
| 4405 | Opsariichthys kaopingensis | 高屏馬口魚 | 淡水 | 本土 |
| 4479 | Paratanakia himantegus | 革條田中鰟鮍 | 淡水 | 特有種 |
| 4640 | Puntius snyderi | 斯奈德小䰾 | 淡水 | 本土 |
| 4719 | Sinogastromyzon nantaiensis | 南台中華吸鰍 | 淡水 | 本土 |
| 4720 | Sinogastromyzon puliensis | 埔里華吸鰍 | 淡水 | 特有種 |
| 4735 | Squalidus banarescui | 巴氏銀鮈 | 淡水 | 本土 |
| 鱂形目 Cyprinodontiformes | ||||
| 1090 | Gambusia affinis | 食蚊魚 | 淡水 | 引入種 |
| 4547 | Poecilia reticulata | 虹鱂（孔雀魚） | 淡水 | 引入種 |
| 4548 | Poecilia velifera | 帆鰭花鱂(摩利魚) | 淡水 | 引入種 |
| 4840 | Xiphophorus hellerii | 劍尾魚 | 淡水 | 引入種 |
| 4921 | Xiphophorus variatus | 雜色劍尾魚 | 淡水 | 引入種 |
| 豹魴鮄目 Dactylopteriformes | ||||
| 838 | Dactyloptena orientalis | 東方豹魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 839 | Dactyloptena peterseni | 單棘豹魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 1049 | Eurypegasus draconis | 寬海蛾魚(龍海蛾魚) | 海水 | 本土 |
| 2167 | Pegasus laternarius | 海蛾魚 | 海水 | 本土 |
| 2168 | Pegasus volitans | 飛海蛾魚 | 海水 | 本土 |
| 3899 | Dactyloptena gilberti | 吉氏豹魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 棘鯊目 Dactylopteriformes | ||||
| 952 | Echinorhinus cookei | 笠鱗棘鯊 | 海水 | 本土 |
| 海鰱目 Elopiformes | ||||
| 963 | Elops machnata | 大眼海鰱 | 海水 | 本土 |
| 1696 | Megalops cyprinoides | 大海鰱 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3951 | Elops hawaiensis | 夏威夷海鰱 | 海水 | 本土 |
| 狗魚目 Esociformes | ||||
| 1031 | Esox lucius | 白斑狗魚 | 淡水 | 本土 |
| 1032 | Esox reichertii | 黑斑狗魚 | 淡水 | 本土 |
| 真鱸形系 Eupercaria/misc | ||||
| 17 | Acanthocepola indica | 印度棘赤刀魚 | 海水 | 本土 |
| 18 | Acanthocepola krusensternii | 克氏棘赤刀魚 | 海水 | 本土 |
| 19 | Acanthocepola limbata | 背點棘赤刀魚 | 海水 | 本土 |
| 30 | Acanthopagrus latus | 黃鰭棘鯛 | 淡水/海水 | 本土 |
| 31 | Acanthopagrus pacificus | 太平洋棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 32 | Acanthopagrus schlegelii | 黑棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 183 | Anampses caeruleopunctatus | 熒斑阿南魚 | 海水 | 本土 |
| 184 | Anampses melanurus | 烏尾阿南魚 | 海水 | 本土 |
| 185 | Anampses meleagrides | 黃尾阿南魚 | 海水 | 本土 |
| 186 | Anampses twistii | 星阿南魚 | 海水 | 本土 |
| 202 | Aphareus furca | 叉尾鯛 | 海水 | 本土 |
| 203 | Aphareus rutilans | 紅叉尾鯛 | 海水 | 本土 |
| 216 | Aprion virescens | 藍短鰭笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 233 | Argyrops bleekeri | 四長棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 234 | Argyrosomus amoyensis | 廈門白姑魚 | 海水 | 本土 |
| 235 | Argyrosomus japonicus | 日本白姑魚 | 海水 | 本土 |
| 272 | Atrobucca nibe | 黑姑魚 | 海水 | 本土 |
| 293 | Bahaba taipingensis | 黃唇魚 | 海水 | 本土 |
| 372 | Bodianus axillaris | 腋斑普提魚 | 海水 | 本土 |
| 373 | Bodianus bilunulatus | 雙帶普提魚 | 海水 | 本土 |
| 374 | Bodianus loxozonus | 斜帶普提魚 | 海水 | 本土 |
| 375 | Bodianus mesothorax | 中胸普提魚 | 海水 | 本土 |
| 376 | Bodianus oxycephalus | 尖頭普提魚 | 海水 | 本土 |
| 377 | Bolbometopon muricatum | 駝峰大鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 398 | Branchiostegus albus | 白方頭魚 | 海水 | 本土 |
| 399 | Branchiostegus argentatus | 銀方頭魚 | 海水 | 本土 |
| 400 | Branchiostegus japonicus | 日本方頭魚 | 海水 | 本土 |
| 408 | Caesio caerulaurea | 褐梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 409 | Caesio cuning | 黃尾梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 410 | Caesio lunaris | 新月梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 411 | Caesio teres | 黃藍背梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 412 | Caesio xanthonota | 黃背梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 413 | Callanthias japonicus | 日本麗花鮨 | 海水 | 本土 |
| 433 | Calotomus japonicus | 日本絢鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 434 | Calotomus spinidens | 凹尾絢鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 511 | Cepola schlegelii | 史氏赤刀魚 | 海水 | 本土 |
| 568 | Cheilinus chlorourus | 綠尾唇魚 | 海水 | 本土 |
| 569 | Cheilinus fasciatus | 橫帶唇魚 | 海水 | 本土 |
| 570 | Cheilinus oxycephalus | 尖頭唇魚 | 海水 | 本土 |
| 571 | Cheilinus trilobatus | 三葉唇魚 | 海水 | 本土 |
| 572 | Cheilinus undulatus | 波紋唇魚(蘇眉) | 海水 | 本土 |
| 573 | Cheilio inermis | 管唇魚 | 海水 | 本土 |
| 607 | Chlorurus bleekeri | 白氏綠鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 608 | Chlorurus japanensis | 日本綠鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 609 | Chlorurus spilurus | 海水 | 本土 | |
| 610 | Choerodon azurio | 藍豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 611 | Choerodon melanostigma | 大斑豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 612 | Choerodon schoenleinii | 邵氏豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 633 | Chrysochir aureus | 尖頭黃鰭牙䱛 | 海水 | 本土 |
| 636 | Cirrhilabrus brunneus | 深棕絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 637 | Cirrhilabrus cyanopleura | 藍身絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 638 | Cirrhilabrus exquisitus | 艷麗絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 639 | Cirrhilabrus melanomarginatus | 黑緣絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 640 | Cirrhilabrus solorensis | 緑絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 709 | Collichthys lucidus | 棘頭梅童魚 | 海水 | 本土 |
| 710 | Collichthys niveatus | 黑鰓梅童魚 | 海水 | 本土 |
| 732 | Coris aygula | 鰓斑盔魚 | 海水 | 本土 |
| 733 | Coris dorsomacula | 背斑盔魚 | 海水 | 本土 |
| 734 | Coris gaimard | 露珠盔魚 | 海水 | 本土 |
| 858 | Dendrophysa russelii | 勒氏枝鰾石首魚 | 海水 | 本土 |
| 859 | Dentex hypselosomus | 黃背牙鯛 | 海水 | 本土 |
| 868 | Diagramma pictum | 密點少棘胡椒鯛(胡椒鯛) | 海水 | 本土 |
| 903 | Dipterygonotus balteatus | 雙鰭梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 964 | Emmelichthys struhsakeri | 史氏諧魚 | 海水 | 本土 |
| 984 | Epibulus insidiator | 伸口魚 | 海水 | 本土 |
| 1033 | Etelis carbunculus | 紅鑽魚 | 海水 | 本土 |
| 1034 | Etelis coruscans | 絲尾紅鑽魚 | 海水 | 本土 |
| 1035 | Etelis radiosus | 多耙紅鑽魚 | 海水 | 本土 |
| 1057 | Evynnis cardinalis | 二長棘犁齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 1058 | Evynnis tumifrons | 黃鋤齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 1115 | Gerres decacanthus | 十刺銀鱸 | 淡水 | 本土 |
| 1116 | Gerres erythrourus | 紅尾銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1117 | Gerres filamentosus | 長棘銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1118 | Gerres japonicus | 日本銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1119 | Gerres limbatus | 緣邊銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1120 | Gerres longirostris | 長吻銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1121 | Gerres oblongus | 長圓銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1122 | Gerres oyena | 奧奈銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1123 | Gerres septemfasciatus | 七帶銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 1166 | Gnathodentex aureolineatus | 金帶齒頜鯛 | 海水 | 本土 |
| 1212 | Gomphosus varius | 雜色尖嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 1223 | Gymnocranius elongatus | 長裸頂鯛 | 海水 | 本土 |
| 1224 | Gymnocranius euanus | 真裸頂鯛 | 海水 | 本土 |
| 1225 | Gymnocranius frenatus | 黃吻裸頂鯛 | 海水 | 本土 |
| 1226 | Gymnocranius grandoculis | 藍線裸頂鯛 | 海水 | 本土 |
| 1227 | Gymnocranius griseus | 灰裸頂鯛 | 海水 | 本土 |
| 1228 | Gymnocranius microdon | 小齒裸頂鯛 | 海水 | 本土 |
| 1274 | Halichoeres biocellatus | 雙眼斑海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1275 | Halichoeres chrysus | 金色海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1276 | Halichoeres hartzfeldii | 哈氏海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1277 | Halichoeres hortulanus | 格紋海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1278 | Halichoeres margaritaceus | 斑點海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1279 | Halichoeres marginatus | 緣鰭海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1280 | Halichoeres melanochir | 胸斑海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1281 | Halichoeres melanurus | 黑尾海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1282 | Halichoeres miniatus | 臀點海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1283 | Halichoeres nebulosus | 星雲海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1284 | Halichoeres nigrescens | 雲斑海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1285 | Halichoeres tenuispinis | 細棘海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1286 | Halichoeres trimaculatus | 三斑海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1287 | Halichoeres zeylonicus | 大鱗海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 1333 | Hemigymnus fasciatus | 橫帶厚唇魚 | 海水 | 本土 |
| 1334 | Hemigymnus melapterus | 黑鰭厚唇魚 | 海水 | 本土 |
| 1368 | Heteropriacanthus cruentatus | 灰鰭異大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 1388 | Hipposcarus longiceps | 長頭馬鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 1394 | Hologymnosus annulatus | 環紋細鱗盔魚 | 海水 | 本土 |
| 1395 | Hologymnosus doliatus | 狹帶細鱗盔魚 | 海水 | 本土 |
| 1462 | Iniistius aneitensis | 短項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 1463 | Iniistius dea | 洛神項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 1464 | Iniistius evides | 背點項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 1465 | Iniistius melanopus | 黑斑項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 1466 | Iniistius pavo | 孔雀項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 1488 | Johnius amblycephalus | 團頭叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1489 | Johnius belangerii | 皮氏叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1490 | Johnius borneensis | 婆羅叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1491 | Johnius carouna | 卡氏叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1492 | Johnius distinctus | 鱗鰭叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1493 | Johnius fasciatus | 條紋叫姑魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1494 | Johnius grypotus | 叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1495 | Johnius taiwanensis | 臺灣叫姑魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1496 | Johnius trewavasae | 屈氏叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1512 | Labrichthys unilineatus | 單線突唇魚 | 海水 | 本土 |
| 1513 | Labroides bicolor | 雙色裂唇魚 | 海水 | 本土 |
| 1514 | Labroides dimidiatus | 裂唇魚 | 海水 | 本土 |
| 1515 | Labropsis manabei | 曼氏褶唇魚 | 海水 | 本土 |
| 1538 | Larimichthys crocea | 大黃魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1539 | Larimichthys polyactis | 小黃魚 | 海水 | 本土 |
| 1583 | Leptoscarus vaigiensis | 纖鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 1591 | Lethrinus haematopterus | 紅鰭裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 1592 | Lethrinus lentjan | 扁裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 1593 | Lethrinus nebulosus | 星斑裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 1594 | Lethrinus ornatus | 短吻裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 1595 | Lethrinus rubrioperculatus | 紅裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 1596 | Lethrinus variegatus | 雜色裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 1597 | Lethrinus xanthochilus | 黃唇裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 1621 | Lipocheilus carnolabrum | 葉唇笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1638 | Lutjanus argentimaculatus | 紫紅笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1639 | Lutjanus bengalensis | 孟加拉灣笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1640 | Lutjanus bohar | 白斑笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1641 | Lutjanus boutton | 藍帶笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1642 | Lutjanus carponotatus | 胸斑笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1643 | Lutjanus ehrenbergii | 埃氏笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1644 | Lutjanus erythropterus | 紅鰭笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1645 | Lutjanus fulviflamma | 金焰笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1646 | Lutjanus fulvus | 焦黃笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1647 | Lutjanus fuscescens | 大斑笛鯛 | 淡水 | 本土 |
| 1648 | Lutjanus gibbus | 隆背笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1649 | Lutjanus johnii | 約氏笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1650 | Lutjanus kasmira | 四線笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1651 | Lutjanus lemniscatus | 褶尾笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1652 | Lutjanus lutjanus | 正笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1653 | Lutjanus malabaricus | 馬拉巴笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1654 | Lutjanus monostigma | 單斑笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1655 | Lutjanus ophuysenii | 奧氏笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1656 | Lutjanus quinquelineatus | 五線笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1657 | Lutjanus rivulatus | 藍點笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1658 | Lutjanus russellii | 勒氏笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1659 | Lutjanus sebae | 千年笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1660 | Lutjanus stellatus | 星點笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1661 | Lutjanus vitta | 縱帶笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1662 | Lutjanus xanthopinnis | 前鱗笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1665 | Macolor niger | 黑背羽鰓笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 1668 | Macropharyngodon meleagris | 珠斑大咽齒魚 | 海水 | 本土 |
| 1676 | Malacanthus brevirostris | 短吻弱棘魚 | 海水 | 本土 |
| 1677 | Malacanthus latovittatus | 側條弱棘魚 | 海水 | 本土 |
| 1695 | Megalonibea fusca | 褐毛鱨 | 海水 | 本土 |
| 1745 | Miichthys miiuy | 鮸 | 海水 | 本土 |
| 1758 | Monodactylus argenteus | 銀大眼鯧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1761 | Monotaxis grandoculis | 單列齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 1832 | Nemipterus aurora | 赤黃金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1833 | Nemipterus bathybius | 深水金線魚(黃肚金線魚) | 海水 | 本土 |
| 1834 | Nemipterus furcosus | 橫斑金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1835 | Nemipterus hexodon | 六齒金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1836 | Nemipterus japonicus | 日本金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1837 | Nemipterus marginatus | 緣金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1838 | Nemipterus nematophorus | 長絲金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1839 | Nemipterus nemurus | 紅棘金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1840 | Nemipterus peronii | 裴氏金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1841 | Nemipterus thosaporni | 黃緣金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1842 | Nemipterus virgatus | 金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1843 | Nemipterus zysron | 長體金線魚 | 海水 | 本土 |
| 1883 | Nibea albiflora | 黃姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1884 | Nibea chui | 元鼎黃姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1885 | Nibea coibor | 淺色黃姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1886 | Nibea semifasciata | 半斑黃姑魚 | 海水 | 本土 |
| 1898 | Novaculichthys taeniourus | 帶尾美鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 2026 | Otolithes ruber | 紅牙䱛 | 海水 | 本土 |
| 2027 | Otolithoides biauritus | 長吻擬牙䱛 | 海水 | 本土 |
| 2028 | Owstonia tosaensis | 土佐歐氏鰧 | 海水 | 本土 |
| 2030 | Oxycheilinus bimaculatus | 雙斑尖唇魚 | 海水 | 本土 |
| 2031 | Oxycheilinus celebicus | 西里伯斯唇魚 | 海水 | 本土 |
| 2032 | Oxycheilinus digramma | 雙線尖唇魚 | 海水 | 本土 |
| 2033 | Oxycheilinus orientalis | 東方尖唇魚 | 海水 | 本土 |
| 2045 | Pagrus auratus | 金赤鯛 | 海水 | 本土 |
| 2046 | Pagrus major | 真赤鯛(真鯛) | 海水 | 本土 |
| 2069 | Paracaesio sordida | 沖繩若梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 2070 | Paracaesio xanthura | 黃背若梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 2084 | Parajulis poecilepterus | 花鰭副海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 2113 | Parapristipoma trilineatum | 三線幾鱸 | 海水 | 本土 |
| 2121 | Parargyrops edita | 二長棘鯛 | 淡水 | 本土 |
| 2123 | Parascolopsis inermis | 橫帶副眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2124 | Parascolopsis tosensis | 土佐副眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2177 | Pennahia aneus | 大眼白姑魚 | 海水 | 本土 |
| 2178 | Pennahia argentata | 銀姑魚 | 海水 | 本土 |
| 2179 | Pennahia macrocephalus | 大頭銀姑魚 | 海水 | 本土 |
| 2180 | Pennahia pawak | 斑鰭銀姑魚 | 海水 | 本土 |
| 2182 | Pentapodus caninus | 犬牙錐齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2183 | Pentapodus nagasakiensis | 長崎錐齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2184 | Pentapodus setosus | 線尾錐齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2185 | Pentaprion longimanus | 五棘銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 2216 | Pinjalo pinjalo | 斜鱗笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 2249 | Plectorhinchus chaetodonoides | 斑胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2250 | Plectorhinchus cinctus | 花尾胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2251 | Plectorhinchus diagrammus | 雙帶胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2252 | Plectorhinchus flavomaculatus | 黃點胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2253 | Plectorhinchus gibbosus | 駝背胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2254 | Plectorhinchus lineatus | 條紋胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2255 | Plectorhinchus pictus | 胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2256 | Plectorhinchus picus | 暗點胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2257 | Plectorhinchus schotaf | 邵氏胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2258 | Plectorhinchus vittatus | 條斑胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 2306 | Pomadasys argenteus | 銀石鱸 | 海水 | 本土 |
| 2307 | Pomadasys auritus | 金石鱸 | 海水 | 本土 |
| 2308 | Pomadasys maculatus | 大斑石鱸 | 海水 | 本土 |
| 2309 | Pomadasys unimaculatus | 單斑石鱸 | 海水 | 本土 |
| 2324 | Priacanthus hamrur | 金目大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 2325 | Priacanthus macracanthus | 短尾大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 2326 | Priacanthus tayenus | 長尾大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 2332 | Pristigenys niphonia | 日本鋸大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 2334 | Pristipomoides argyrogrammicus | 藍紋紫魚 | 海水 | 本土 |
| 2335 | Pristipomoides auricilla | 日本紫魚 | 海水 | 本土 |
| 2336 | Pristipomoides filamentosus | 絲鰭紫魚 | 海水 | 本土 |
| 2337 | Pristipomoides flavipinnis | 黃鰭紫魚 | 海水 | 本土 |
| 2338 | Pristipomoides multidens | 多牙紫魚 | 海水 | 本土 |
| 2339 | Pristipomoides sieboldii | 西氏紫魚 | 海水 | 本土 |
| 2340 | Pristipomoides typus | 尖齒紫魚 | 海水 | 本土 |
| 2353 | Protonibea diacanthus | 雙棘原黃姑魚 | 海水 | 本土 |
| 2417 | Pseudocheilinus evanidus | 姬擬唇魚 | 海水 | 本土 |
| 2418 | Pseudocheilinus hexataenia | 六帶擬唇魚 | 海水 | 本土 |
| 2421 | Pseudocoris yamashiroi | 山下氏擬盔魚 | 海水 | 本土 |
| 2450 | Pseudolabrus eoethinus | 紅項擬隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 2451 | Pseudolabrus japonicus | 日本擬隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 2477 | Pteragogus flagellifer | 紅海高體盔魚 | 海水 | 本土 |
| 2480 | Pterocaesio chrysozona | 金帶鱗鰭梅鯛(金帶梅鯛) | 海水 | 本土 |
| 2481 | Pterocaesio digramma | 雙帶鱗鰭梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 2482 | Pterocaesio marri | 馬氏鱗鰭梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 2483 | Pterocaesio pisang | 斑尾鱗鰭梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 2484 | Pterocaesio tile | 黑帶鱗鰭梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 2485 | Pterocaesio trilineata | 三帶鱗鰭梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 2553 | Rhabdosargus sarba | 平鯛 | 海水 | 本土 |
| 2720 | Scarus chinensis | 中華鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2721 | Scarus dimidiatus | 弧帶鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2722 | Scarus ferrugineus | 鏽色鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2723 | Scarus festivus | 雜色鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2724 | Scarus forsteni | 綠唇鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2725 | Scarus frenatus | 網紋鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2726 | Scarus ghobban | 青點鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2727 | Scarus globiceps | 黑斑鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2728 | Scarus gracilis | 細鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2729 | Scarus niger | 黑鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2730 | Scarus oviceps | 黃鞍鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2731 | Scarus ovifrons | 突額鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2732 | Scarus prasiognathos | 綠頜鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2733 | Scarus psittacus | 棕吻鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2734 | Scarus rivulatus | 截尾鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2735 | Scarus rubroviolaceus | 鈍頭鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2736 | Scarus scaber | 橫帶鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2737 | Scarus schlegeli | 許氏鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 2843 | Scolopsis affinis | 烏面眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2844 | Scolopsis bilineata | 雙帶眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2845 | Scolopsis ciliata | 齒頜眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2846 | Scolopsis lineata | 線紋眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2847 | Scolopsis margaritifera | 珠斑眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2848 | Scolopsis monogramma | 單帶眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2849 | Scolopsis taenioptera | 條紋眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2850 | Scolopsis trilineata | 三帶眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2851 | Scolopsis vosmeri | 伏氏眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2920 | Sillago aeolus | 雜色鱚 | 海水 | 本土 |
| 2921 | Sillago asiatica | 亞洲鱚 | 海水 | 本土 |
| 2922 | Sillago boutani | 北部灣鱚 | 海水 | 本土 |
| 2923 | Sillago japonica | 少鱗鱚 | 海水 | 本土 |
| 2924 | Sillago megacephalus | 大頭鱚 | 海水 | 本土 |
| 2925 | Sillago sihama | 多鱗鱚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2926 | Sillago sinica | 華鱚 | 海水 | 本土 |
| 3106 | Stethojulis balteata | 圈紫胸魚 | 海水 | 本土 |
| 3107 | Stethojulis bandanensis | 黑星紫胸魚 | 海水 | 本土 |
| 3108 | Stethojulis strigiventer | 虹紋紫胸魚 | 海水 | 本土 |
| 3109 | Stethojulis terina | 斷紋紫胸魚 | 海水 | 本土 |
| 3125 | Suezichthys gracilis | 細長蘇彝士隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3130 | Symphorichthys spilurus | 帆鰭笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 3131 | Symphorus nematophorus | 絲條長鰭笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 3207 | Thalassoma amblycephalum | 鈍頭錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3208 | Thalassoma cupido | 環帶錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3209 | Thalassoma hardwicke | 鞍斑錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3210 | Thalassoma jansenii | 詹氏錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3211 | Thalassoma lunare | 新月錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3212 | Thalassoma lutescens | 胸斑錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3213 | Thalassoma purpureum | 紫錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3214 | Thalassoma quinquevittatum | 縱紋錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3215 | Thalassoma trilobatum | 三葉錦魚 | 海水 | 本土 |
| 3481 | Wattsia mossambica | 莫桑比克脊頜鯛 | 海水 | 本土 |
| 3566 | Acanthopagrus chinshira | 琉球棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 3567 | Acanthopagrus taiwanensis | 台灣棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 3606 | Anampses geographicus | 蠕紋阿南魚 | 海水 | 本土 |
| 3607 | Anampses neoguinaicus | 新幾內亞阿南魚 | 海水 | 本土 |
| 3696 | Bodianus anthioides | 似花普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3697 | Bodianus bimaculatus | 雙斑普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3698 | Bodianus cylindriatus | 圓身普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3699 | Bodianus dictynna | 網紋普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3700 | Bodianus izuensis | 伊津普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3701 | Bodianus leucosticticus | 點帶普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3702 | Bodianus masudai | 益田普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3703 | Bodianus perditio | 大黃斑普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3704 | Bodianus prognathus | 白斑普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3705 | Bodianus rubrisos | 紅赭普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3706 | Bodianus thoracotaeniatus | 絲鰭普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3707 | Bodianus trilineatus | 三線普提魚 | 海水 | 本土 |
| 3712 | Branchiostegus auratus | 斑鰭方頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3736 | Calotomus carolinus | 星眼絢鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 3776 | Cetoscarus ocellatus | 紫頭鯨鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 3818 | Chlorurus bowersi | 鮑氏綠鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 3819 | Chlorurus frontalis | 高額綠鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 3820 | Chlorurus microrhinos | 小鼻綠鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 3821 | Chlorurus oedema | 瘤綠鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 3822 | Choerodon anchorago | 鞍斑豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 3823 | Choerodon fasciatus | 七帶豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 3824 | Choerodon gymnogenys | 紫紋豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 3825 | Choerodon jordani | 喬氏豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 3826 | Choerodon margaritiferus | 菲律賓豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 3827 | Choerodon robustus | 粗豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 3828 | Choerodon zamboangae | 扎汶豬齒魚 | 海水 | 本土 |
| 3841 | Cirrhilabrus isosceles | 海水 | 本土 | |
| 3842 | Cirrhilabrus lunatus | 新月絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3843 | Cirrhilabrus rubrimarginatus | 紅緣絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3844 | Cirrhilabrus ryukyuensis | 琉球絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3845 | Cirrhilabrus temminckii | 丁氏絲隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3874 | Cookeolus japonicus | 日本牛目鯛 | 海水 | 本土 |
| 3876 | Coris batuensis | 巴都盔魚 | 海水 | 本土 |
| 3877 | Coris musume | 黑帶盔魚 | 海水 | 本土 |
| 3893 | Cymolutes torquatus | 環狀鈍頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3906 | Decodon pacificus | 太平洋裸齒隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 3908 | Dentex abei | 阿部氏牙鯛 | 海水 | 本土 |
| 4014 | Erythrocles scintillans | 火花紅諧魚 | 海水 | 本土 |
| 4040 | Evynnis mononematos | 單長棘犁齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 4067 | Gerres baconensis | 培根銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 4068 | Gerres shima | 志摩銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 4135 | Halichoeres argus | 珠光海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4136 | Halichoeres kneri | 克氏海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4137 | Halichoeres leucurus | 亮海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4138 | Halichoeres orientalis | 東方海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4139 | Halichoeres ornatissimus | 飾妝海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4140 | Halichoeres pelicieri | 派氏海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4141 | Halichoeres prosopeion | 黑額海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4142 | Halichoeres scapularis | 側帶海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4174 | Hologymnosus rhodonotus | 玫瑰細鱗盔魚 | 海水 | 本土 |
| 4189 | Iniistius baldwini | 鮑氏項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4190 | Iniistius bimaculatus | 雙斑項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4191 | Iniistius celebicus | 西里伯斯項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4192 | Iniistius pentadactylus | 五指項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4193 | Iniistius trivittatus | 三帶項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4194 | Iniistius twistii | 彩虹項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4195 | Iniistius verrens | 薔薇項鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4207 | Johnius macrorhynus | 大吻叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 4237 | Leptojulis cyanopleura | 阿曼藍胸魚 | 海水 | 本土 |
| 4238 | Leptojulis lambdastigma | 項斑藍胸魚 | 海水 | 本土 |
| 4239 | Leptojulis urostigma | 尾斑藍胸魚 | 海水 | 本土 |
| 4246 | Lethrinus atkinsoni | 阿氏裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4247 | Lethrinus erythracanthus | 紅棘裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4248 | Lethrinus erythropterus | 赤鰭裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4249 | Lethrinus genivittatus | 長棘裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4250 | Lethrinus harak | 黑點裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4251 | Lethrinus microdon | 小齒裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4252 | Lethrinus olivaceus | 尖吻裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4253 | Lethrinus reticulatus | 網紋裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4254 | Lethrinus semicinctus | 半帶裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4274 | Lutjanus decussatus | 斜帶笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 4275 | Lutjanus dodecacanthoides | 似十二棘笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 4276 | Lutjanus notatus | 顯赫笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 4277 | Lutjanus rufolineatus | 紅紋笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 4280 | Macolor macularis | 斑點羽鰓笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 4282 | Macropharyngodon moyeri | 莫氏大咽齒魚 | 海水 | 本土 |
| 4283 | Macropharyngodon negrosensis | 胸斑大咽齒魚 | 海水 | 本土 |
| 4346 | Nemipterus sugillatus | 藍頰金線魚 | 海水 | 本土 |
| 4362 | Nibea mitsukurii | 箕作氏黃姑魚 | 海水 | 本土 |
| 4366 | Novaculoides macrolepidotus | 大鱗似美鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 4428 | Owstonia grammodon | 粒牙歐氏鰧 | 海水 | 本土 |
| 4429 | Oxycheilinus unifasciatus | 單帶尖唇魚 | 海水 | 本土 |
| 4437 | Paracaesio caerulea | 青若梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 4438 | Paracaesio kusakarii | 條紋若梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 4439 | Paracaesio stonei | 橫帶若梅鯛 | 海水 | 本土 |
| 4441 | Paracheilinus carpenteri | 卡氏副唇魚 | 海水 | 本土 |
| 4442 | Paracheilinus filamentosus | 月尾副唇魚 | 海水 | 本土 |
| 4443 | Paracheilinus lineopunctatus | 線斑副唇魚 | 海水 | 本土 |
| 4469 | Parascolopsis akatamae | 赤玉副眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 4470 | Parascolopsis eriomma | 寬帶副眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 4493 | Pentapodus aureofasciatus | 黃帶錐齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 4506 | Pinjalo lewisi | 李維氏斜鱗笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 4512 | Plectorhinchus albovittatus | 白帶胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 4513 | Plectorhinchus chrysotaenia | 黃紋胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 4514 | Plectorhinchus lessonii | 雷氏胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 4515 | Plectorhinchus multivittatus | 多紋胡椒鯛 | 海水 | 本土 |
| 4567 | Pomadasys kaakan | 點石鱸 | 海水 | 本土 |
| 4568 | Pomadasys quadrilineatus | 四帶石鱸 | 海水 | 本土 |
| 4573 | Priacanthus blochii | 布氏大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 4584 | Pristigenys meyeri | 麥氏鋸大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 4585 | Pristigenys refulgens | 黑緣大鱗大眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 4586 | Pristipomoides zonatus | 斜帶紫魚 | 海水 | 本土 |
| 4610 | Pseudocheilinus octotaenia | 八帶擬唇魚 | 海水 | 本土 |
| 4616 | Pseudocoris heteroptera | 異鰭擬盔魚 | 海水 | 本土 |
| 4617 | Pseudocoris ocellata | 眼斑擬盔魚 | 海水 | 本土 |
| 4618 | Pseudodax moluccanus | 摩鹿加擬鑿牙魚 | 海水 | 本土 |
| 4621 | Pseudojuloides splendens | 擬海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4626 | Pteragogus aurigarius | 長鰭高體盔魚 | 海水 | 本土 |
| 4627 | Pteragogus cryptus | 隱秘高體盔魚 | 海水 | 本土 |
| 4628 | Pteragogus enneacanthus | 九棘高體盔魚 | 海水 | 本土 |
| 4677 | Scarus chameleon | 藍臀鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 4678 | Scarus fuscocaudalis | 灰尾鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 4679 | Scarus hypselopterus | 高鰭鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 4680 | Scarus spinus | 刺鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 4681 | Scarus xanthopleura | 黃肋鸚嘴魚 | 海水 | 本土 |
| 4686 | Scolopsis aurata | 黃帶眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 4687 | Scolopsis xenochrous | 藍帶眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 4714 | Sillaginopodys chondropus | 砂大指鱚 | 海水 | 本土 |
| 4715 | Sillago ingenuua | 海灣鱚 | 海水 | 本土 |
| 4716 | Sillago microps | 小眼鱚 | 海水 | 特有種 |
| 4717 | Sillago parvisquamis | 細鱗鱚 | 海水 | 本土 |
| 4744 | Stethojulis trilineata | 三線紫胸魚 | 海水 | 本土 |
| 4750 | Suezichthys notatus | 頭斑蘇彝士隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 4835 | Wetmorella albofasciata | 白條濕鸚鯛 | 海水 | 本土 |
| 4836 | Wetmorella nigropinnata | 黑鰭濕鸚鯛 | 海水 | 本土 |
| 4839 | Xiphocheilus typus | 劍唇魚 | 海水 | 本土 |
| 4875 | Gerres macracanthus | 大棘銀鱸 | 海水 | 本土 |
| 4876 | Halichoeres bicolor | 雙色海豬魚 | 海水 | 本土 |
| 4882 | Johnius dussumieri | 杜氏叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 4883 | Johnius weberi | 韋氏叫姑魚 | 海水 | 本土 |
| 4886 | Lethrinus obsoletus | 桔帶裸頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 4887 | Lutjanus sanguineus | 紅笛鯛 | 海水 | 本土 |
| 4891 | Nibea soldado | 黑緣黃姑魚 | 海水 | 本土 |
| 4907 | Scolopsis bimaculata | 雙斑眶棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 4909 | Semicossyphus reticulatus | 金黃突額隆頭魚 | 海水 | 本土 |
| 4913 | Stethojulis interrupta | 斷帶紫胸魚 | 海水 | 本土 |
| 鱈形目 Gadiformes | ||||
| 338 | Bathygadus antrodes | 孔頭底尾鱈 | 海水 | 本土 |
| 339 | Bathygadus garretti | 加氏底尾鱈 | 海水 | 本土 |
| 401 | Bregmaceros japonicus | 日本犀鱈 | 海水 | 本土 |
| 635 | Ciliata tchangi | 張氏五須岩鱈 | 海水 | 本土 |
| 696 | Coelorinchus anatirostris | 鴨嘴腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 697 | Coelorinchus asteroides | 擬星腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 698 | Coelorinchus formosanus | 台灣腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 699 | Coelorinchus japonicus | 日本腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 700 | Coelorinchus jordani | 喬丹氏腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 701 | Coelorinchus kamoharai | 蒲原氏腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 702 | Coelorinchus longissimus | 長管腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 703 | Coelorinchus parallelus | 平棘腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 704 | Coelorinchus smithi | 史氏腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 737 | Coryphaenoides marginatus | 暗邊突吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 738 | Coryphaenoides nasutus | 錐鼻突吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 1081 | Gadella jordani | 喬丹氏短稚鱈 | 海水 | 本土 |
| 1082 | Gadomus colletti | 柯氏鼠鱈 | 海水 | 本土 |
| 1083 | Gadus macrocephalus | 大頭鱈 | 海水 | 本土 |
| 1434 | Hymenocephalus lethonemus | 刺吻膜首鱈 | 海水 | 本土 |
| 1435 | Hymenocephalus striatissimus | 紋喉膜頭鱈 | 海水 | 本土 |
| 1629 | Lota lota | 江鱈 | 淡水 | 本土 |
| 1630 | Lotella phycis | 褐潯鱈 | 海水 | 本土 |
| 1678 | Malacocephalus laevis | 滑軟首鱈 | 海水 | 本土 |
| 1882 | Nezumia proxima | 原始奈氏鱈 | 海水 | 本土 |
| 2213 | Physiculus japonicus | 日本小褐鱈 | 海水 | 本土 |
| 3067 | Spicomacrurus kuronumai | 黑沼氏箭鱈 | 海水 | 本土 |
| 3085 | Squalogadus modificatus | 卵首鱈 | 海水 | 本土 |
| 3262 | Trachonurus villosus | 粗尾鱈 | 海水 | 本土 |
| 3469 | Ventrifossa garmani | 加曼氏凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 3470 | Ventrifossa nigrodorsalis | 黑背鰭凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 3471 | Ventrifossa rhipidodorsalis | 扇鰭凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 3671 | Bathygadus nipponicus | 日本底尾鱈 | 海水 | 本土 |
| 3713 | Bregmaceros anchovia | 擬鯷犀鱈 | 海水 | 本土 |
| 3714 | Bregmaceros lanceolatus | 尖鰭犀鱈 | 海水 | 本土 |
| 3715 | Bregmaceros nectabanus | 銀腰犀鱈 | 海水 | 本土 |
| 3716 | Bregmaceros pescadorus | 澎湖犀鱈 | 海水 | 本土 |
| 3859 | Coelorinchus brevirostris | 短吻腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3860 | Coelorinchus cingulatus | 帶斑腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3861 | Coelorinchus fuscigulus | 黑喉腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3862 | Coelorinchus gilberti | 吉氏腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3863 | Coelorinchus hubbsi | 哈氏腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3864 | Coelorinchus kishinouyei | 岸上氏腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3865 | Coelorinchus leptorhinus | 窄吻腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3866 | Coelorinchus matsubarai | 松原腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3867 | Coelorinchus multispinulosus | 多棘腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3868 | Coelorinchus productus | 東海腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3869 | Coelorinchus sheni | 沈氏腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3870 | Coelorinchus tokiensis | 東京腔吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 3878 | Coryphaenoides microps | 細眼突吻鱈 | 海水 | 本土 |
| 4177 | Hymenocephalus longiceps | 長頭膜首鱈 | 海水 | 本土 |
| 4178 | Hymenocephalus torvus | 菲律賓膜首鱈 | 海水 | 本土 |
| 4179 | Hymenogadus gracilis | 細身膜鱈 | 海水 | 本土 |
| 4218 | Kumba japonica | 日本舟尾鱈 | 海水 | 本土 |
| 4219 | Kuronezumia dara | 達氏庫隆長尾鱈 | 海水 | 本土 |
| 4271 | Lucigadus lucifer | 魔燈梭鱈 | 海水 | 本土 |
| 4272 | Lucigadus nigromarginatus | 黑緣梭鱈 | 海水 | 本土 |
| 4361 | Nezumia condylura | 獅鼻奈氏鱈 | 海水 | 本土 |
| 4504 | Physiculus roseus | 紅須小褐鱈 | 海水 | 本土 |
| 4609 | Pseudocetonurus septifer | 擬櫛尾鱈 | 海水 | 本土 |
| 4828 | Ventrifossa atherodon | 箭齒凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 4829 | Ventrifossa divergens | 歧異凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 4830 | Ventrifossa longibarbata | 長鬚凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 4831 | Ventrifossa macroptera | 大鰭凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 4832 | Ventrifossa saikaiensis | 西海凹腹鱈 | 海水 | 本土 |
| 4877 | Hymenocephalus nascens | 無須膜首鱈 | 海水 | 本土 |
| 喉盤魚目 Gobiesociformes | ||||
| 717 | Conidens laticephalus | 黑紋錐齒喉盤魚 | 海水 | 本土 |
| 3648 | Aspasma minima | 日本小姥魚 | 海水 | 本土 |
| 3649 | Aspasmichthys ciconiae | 台灣鶴姥魚 | 海水 | 本土 |
| 3912 | Diademichthys lineatus | 線紋環盤魚 | 海水 | 本土 |
| 3928 | Discotrema crinophilum | 琉球盤孔喉盤魚 | 海水 | 本土 |
| 4500 | Pherallodus indicus | 印度細喉盤魚 | 海水 | 本土 |
| 蝦虎魚目 Gobiiformes | ||||
| 24 | Acanthogobius elongatus | 長體刺蝦虎魚 | 海水 | 本土 |
| 25 | Acanthogobius flavimanus | 黃鰭刺鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 26 | Acanthogobius hasta | 矛尾刺鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 27 | Acanthogobius lactipes | 乳色刺鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 28 | Acanthogobius luridus | 棕刺鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 29 | Acanthogobius ommaturus | 斑尾刺蝦虎魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 47 | Acentrogobius caninus | 犬牙細棘鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 48 | Acentrogobius chlorostigmatoides | 綠斑細棘鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 49 | Acentrogobius viridipunctatus | 青斑細棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 138 | Amblychaeturichthys hexanema | 六絲鈍尾鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 141 | Amblyeleotris cephalotaenia | 頭帶絲鰕虎魚 | 淡水 | 本土 |
| 148 | Amblygobius albimaculatus | 白條鈍鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 149 | Amblygobius nocturnus | 短唇鈍鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 150 | Amblygobius phalaena | 尾斑鈍鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 151 | Amblyotrypauchen arctocephalus | 窄頭鈍孔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 211 | Apocryptodon madurensis | 馬都拉叉牙鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 262 | Asterropteryx semipunctata | 半斑星塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 278 | Aulopareia unicolor | 單色頰溝鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 285 | Awaous grammepomus | 紋鰓阿胡鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 286 | Awaous melanocephalus | 黑頭阿胡鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 287 | Awaous ocellaris | 眼斑阿胡鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 340 | Bathygobius cocosensis | 椰子深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 341 | Bathygobius fuscus | 褐深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 378 | Boleophthalmus boddarti | 薄氏大彈塗魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 379 | Boleophthalmus pectinirostris | 大彈塗魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 383 | Bostrychus sinensis | 中華烏塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 404 | Butis butis | 脊塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 405 | Butis koilomatodon | 鋸脊塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 431 | Callogobius sclateri | 美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 518 | Chaenogobius gulosus | 大口裸頭鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 545 | Chaeturichthys jeoni | 詹氏矛尾鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 546 | Chaeturichthys stigmatias | 矛尾鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 756 | Cristatogobius albius | 白色項冠鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 765 | Ctenogobiops aurocingulus | 斜帶櫛眼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 766 | Ctenogobiops crocineus | 褐斑櫛眼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 767 | Ctenogobiops feroculus | 絲棘櫛眼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 768 | Ctenogobiops pomastictus | 點斑櫛眼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 769 | Ctenogobiops tangaroai | 長棘櫛眼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 770 | Ctenogobius aestivaregia | 夏宮櫛鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 771 | Ctenogobius cervicosquamus | 項鱗櫛蝦虎魚 | 淡水 | 特有種 |
| 772 | Ctenogobius chengtuensis | 成都櫛鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 773 | Ctenogobius chusanensis | 舟山櫛鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 774 | Ctenogobius clarki | 喀氏吻鰕虎魚 | 淡水 | 本土 |
| 775 | Ctenogobius fukushimai | 福島吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 776 | Ctenogobius shennongensis | 神農櫛鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 777 | Ctenogobius szechuanensis | 四川櫛鰕虎魚 | 淡水 | 本土 |
| 779 | Ctenotrypauchen chinensis | 中華櫛孔鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 942 | Drombus ocyurus | 圓頭捷鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 954 | Eleotris acanthopomus | 刺蓋塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 955 | Eleotris balia | 峇里島塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 956 | Eleotris fasciata | 條紋塘鱧 | 淡水 | 本土 |
| 957 | Eleotris fusca | 褐塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 958 | Eleotris melanosoma | 黑體塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 959 | Eleotris oxycephala | 尖頭塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1044 | Eugnathogobius siamensis | 泰國真頜鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1052 | Eutaeniichthys gilli | 帶鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1056 | Eviota prasites | 胸斑幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 1062 | Exyrias puntang | 縱帶鸚鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1063 | Favonigobius gymnauchen | 裸項蜂巢鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1126 | Gladiogobius brevispinis | 短刺蓋棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1129 | Glossogobius aureus | 金黃舌鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1130 | Glossogobius giuris | 舌鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1131 | Glossogobius olivaceus | 斑紋舌鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1167 | Gnatholepis cauerensis | 高倫頜鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1204 | Gobiodon erythrospilus | 紅點葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1205 | Gobiodon multilineatus | 多線葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1206 | Gobiodon oculolineatus | 眼帶葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1207 | Gobiodon okinawae | 黃體葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1208 | Gobiodon quinquestrigatus | 五帶葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1209 | Gobiodon rivulatus | 溝葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1210 | Gobiopsis macrostoma | 大口髯鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1211 | Gobiopterus macrolepis | 大鱗鰭鰕虎 | 海水 | 特有種 |
| 1243 | Gymnogobius heptacanthus | 七棘裸身鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1244 | Gymnogobius mororanus | 網紋裸身鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1245 | Gymnogobius nigrimembranis | 黑皮裸身鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1246 | Gymnogobius petschiliensis | 日本裸身鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1247 | Gymnogobius transversefasciatus | 橫帶裸身鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1248 | Gymnogobius zhoushanensis | 舟山裸身鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1332 | Hemigobius hoevenii | 斜紋半鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1451 | Hypseleotris compressocephalus | 側扁黃黝魚 | 淡水 | 本土 |
| 1475 | Istigobius campbelli | 康培氏銜鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1476 | Istigobius ornatus | 飾妝銜鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1604 | Leucopsarion petersii | 彼氏冰鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1626 | Lophiogobius ocellicauda | 眼尾蝌蚪鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1636 | Luciogobius brevipterus | 短鰭竿鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1637 | Luciogobius guttatus | 斑點竿鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1716 | Micropercops borealis | 北方小黃黝魚 | 淡水 | 本土 |
| 1717 | Micropercops cinctus | 斑小黃黝魚 | 淡水 | 本土 |
| 1718 | Micropercops dabryi | 達氏小黃黝魚 | 淡水 | 本土 |
| 1719 | Micropercops swinhonis | 小黃黝魚 | 淡水 | 本土 |
| 1765 | Mugilogobius abei | 阿部氏鯔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1766 | Mugilogobius myxodermus | 粘皮鯔鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 1767 | Mugilogobius tagala | 泰加拉鯔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1779 | Myersina filifer | 長絲犁突鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1830 | Nemateleotris magnifica | 大口線塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 1846 | Neodontobutis hainanensis | 海南新沙塘鱧 | 淡水 | 特有種 |
| 1901 | Odontamblyopus lacepedii | 拉氏狼牙鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1902 | Odontobutis haifengensis | 海豐沙塘鱧 | 淡水 | 特有種 |
| 1903 | Odontobutis obscurus | 暗色沙塘鱧 | 淡水 | 本土 |
| 1904 | Odontobutis potamophilus | 河川沙塘鱧 | 淡水 | 本土 |
| 1905 | Odontobutis sinensis | 中華沙塘鱧 | 淡水 | 本土 |
| 1906 | Odontobutis yaluensis | 鴨綠沙塘鱧 | 淡水 | 本土 |
| 1914 | Oligolepis acutipennis | 尖鰭寡鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 1915 | Oligolepis formosanus | 台灣溝鰕虎魚 | 海水 | 本土 |
| 1955 | Ophiocara porocephala | 頭孔塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1963 | Oplopomus caninoides | 擬犬牙刺蓋鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2029 | Oxuderces dentatus | 犬齒背眼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2035 | Oxyeleotris marmorata | 雲斑尖塘鱧 | 淡水 | 引入種 |
| 2039 | Oxyurichthys auchenolepis | 項鱗溝鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2040 | Oxyurichthys chinensis | 中華溝鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2041 | Oxyurichthys microlepis | 小鱗溝鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2042 | Oxyurichthys papuensis | 巴布亞溝鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2043 | Oxyurichthys tentacularis | 觸角溝鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2050 | Pandaka bipunctata | 雙斑矮鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2075 | Parachaeturichthys polynema | 多須擬矛尾鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2081 | Paragobiodon echinocephalus | 棘頭副葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2082 | Paragobiodon melanosoma | 黑副葉鰕虎魚 | 海水 | 本土 |
| 2083 | Paragobiodon xanthosoma | 黃身副葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2112 | Parapocryptes serperaster | 蜥形副平牙鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2138 | Paratrypauchen microcephalus | 小頭副孔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2157 | Parioglossus sinensis | 中華舌塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 2188 | Perccottus glenii | 葛氏鱸塘鱧 | 淡水 | 本土 |
| 2192 | Periophthalmus argentilineatus | 銀線彈塗魚 | 海水 | 本土 |
| 2193 | Periophthalmus kalolo | 卡路彈塗魚 | 海水 | 本土 |
| 2194 | Periophthalmus magnuspinnatus | 大鰭彈塗魚 | 海水 | 本土 |
| 2195 | Periophthalmus modestus | 彈塗魚 | 海水 | 本土 |
| 2293 | Polyspondylogobius sinensis | 中華多椎鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2327 | Priolepis cincta | 橫帶鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2328 | Priolepis semidoliata | 半紋鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2356 | Psammogobius biocellatus | 雙眼斑砂鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2369 | Pseudapocryptes elongatus | 長身擬平牙鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2440 | Pseudogobius masago | 小口擬鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2441 | Pseudogobius poicilosoma | 雜色擬鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2442 | Pseudogobius taijiangensis | 台江擬鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2478 | Ptereleotris evides | 黑尾鰭塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 2479 | Ptereleotris microlepis | 細鱗鰭塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 2488 | Pterogobius elapoides | 蛇首高鰭鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 2567 | Rhinogobius aporus | 無孔吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2568 | Rhinogobius brunneus | 褐吻鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2569 | Rhinogobius candidianus | 明潭吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2570 | Rhinogobius changjiangensis | 昌江吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2571 | Rhinogobius changtinensis | 長汀吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2572 | Rhinogobius cliffordpopei | 波氏吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2573 | Rhinogobius davidi | 戴氏吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2574 | Rhinogobius delicatus | 細斑吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2575 | Rhinogobius duospilus | 溪吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2576 | Rhinogobius filamentosus | 絲鰭吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2577 | Rhinogobius formosanus | 台灣吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2578 | Rhinogobius genanematus | 頰紋吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2579 | Rhinogobius gigas | 大吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2580 | Rhinogobius giurinus | 子陵吻鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2581 | Rhinogobius henchuenensis | 恆春吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2582 | Rhinogobius henryi | 亨氏吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2583 | Rhinogobius honghensis | 紅河吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2584 | Rhinogobius immaculatus | 無斑吻蝦虎魚 | 淡水 | 本土 |
| 2585 | Rhinogobius lanyuensis | 蘭嶼吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2586 | Rhinogobius leavelli | 李氏吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2587 | Rhinogobius lentiginis | 雀斑吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2588 | Rhinogobius lianchengensis | 連城吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2589 | Rhinogobius lindbergi | 林氏吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2590 | Rhinogobius lingtongyanensis | 靈通岩吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2591 | Rhinogobius linshuiensis | 陵水吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2592 | Rhinogobius longyanensis | 龍巖吻鰕虎 | 淡水 | 特有種 |
| 2593 | Rhinogobius lungwoensis | 龍窩吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2594 | Rhinogobius maculafasciatus | 斑帶吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2595 | Rhinogobius maculicervix | 項斑吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2596 | Rhinogobius multimaculatus | 密點吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2597 | Rhinogobius nagoyae | 名古屋吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2598 | Rhinogobius nandujiangensis | 南渡江吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2599 | Rhinogobius nantaiensis | 南台吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2600 | Rhinogobius parvus | 小吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2601 | Rhinogobius ponkouensis | 朋口吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2602 | Rhinogobius reticulatus | 網紋吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2603 | Rhinogobius rubrolineatus | 紅線吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2604 | Rhinogobius rubromaculatus | 短吻紅斑吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2605 | Rhinogobius sagittus | 箭吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2606 | Rhinogobius sangenloensis | 三更羅吻鰕虎魚 | 淡水 | 本土 |
| 2607 | Rhinogobius similis | 真吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2608 | Rhinogobius wangchuangensis | 萬泉河吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2609 | Rhinogobius wangi | 韓江吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2610 | Rhinogobius wuyanlingensis | 烏岩嶺吻鰕虎 | 淡水 | 特有種 |
| 2611 | Rhinogobius wuyiensis | 武義吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2612 | Rhinogobius xianshuiensis | 仙水吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2613 | Rhinogobius yaoshanensis | 瑤山吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2614 | Rhinogobius zhoui | 周氏吻鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2632 | Rhyacichthys aspro | 溪鱧 | 淡水 | 本土 |
| 2718 | Scartelaos gigas | 大青彈塗魚 | 海水 | 本土 |
| 2719 | Scartelaos histophorus | 青彈塗魚 | 海水 | 本土 |
| 2739 | Schindleria praematura | 早熟辛氏微體魚 | 海水 | 本土 |
| 2903 | Sicyopterus japonicus | 日本瓢鰭鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 2904 | Sicyopus zosterophorus | 環帶瓢眼鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2937 | Sineleotris chalmersi | 海南華黝魚 | 淡水 | 本土 |
| 3100 | Stenogobius genivittatus | 條紋狹鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3111 | Stiphodon atropurpureus | 黑紫枝牙鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3112 | Stiphodon imperiorientis | 明仁枝牙鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3113 | Stiphodon multisquamus | 多鱗枝牙鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3114 | Stiphodon percnopterygionus | 黑鰭枝牙鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3166 | Taenioides anguillaris | 鰻鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3167 | Taenioides cirratus | 須鰻鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3273 | Trichonotus filamentosus | 絲鰭毛背魚 | 海水 | 本土 |
| 3275 | Tridentiger barbatus | 髭縞鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3276 | Tridentiger bifasciatus | 雙帶縞鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3277 | Tridentiger brevispinis | 短棘縞鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 3278 | Tridentiger microsquamis | 海水 | 本土 | |
| 3279 | Tridentiger nudicervicus | 裸項縞鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3280 | Tridentiger obscurus | 暗縞鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3281 | Tridentiger radiatus | 海水 | 本土 | |
| 3282 | Tridentiger trigonocephalus | 紋縞鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3283 | Trimma annosum | 橘點磨塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3284 | Trimma caesiura | 紅磨塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3285 | Trimma naudei | 絲背磨塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3414 | Trypauchen vagina | 孔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3415 | Tryssogobius porosus | 大孔精美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3444 | Valenciennea immaculata | 無斑凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3445 | Valenciennea longipinnis | 長鰭凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3446 | Valenciennea muralis | 石壁凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3447 | Valenciennea strigata | 絲條凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3448 | Valenciennea wardii | 鞍帶凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3451 | Vanderhorstia puncticeps | 斑頭梵鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3482 | Wuhanlinigobius polylepis | 多鱗漢霖鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3577 | Acentrogobius janthinopterus | 紫鰭細棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3578 | Acentrogobius masoni | 梅氏細棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3579 | Acentrogobius nebulosus | 雲斑裸頰鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3580 | Acentrogobius pflaumii | 普氏細棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3581 | Acentrogobius viganensis | 頭紋細棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3591 | Amblyeleotris bleekeri | 布氏鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3592 | Amblyeleotris fasciata | 條帶鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3593 | Amblyeleotris fontanesii | 福氏鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3594 | Amblyeleotris guttata | 點紋鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3595 | Amblyeleotris japonica | 日本鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3596 | Amblyeleotris ogasawarensis | 小笠原鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3597 | Amblyeleotris periophthalma | 圓眶鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3598 | Amblyeleotris steinitzi | 史氏鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3599 | Amblyeleotris taipinensis | 太平島鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3600 | Amblyeleotris wheeleri | 威氏鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3652 | Asterropteryx spinosa | 棘星塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3662 | Austrolethops wardi | 沃氏軟塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3665 | Barbuligobius boehlkei | 髯毛鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3672 | Bathygobius coalitus | 藍點深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3673 | Bathygobius cotticeps | 闊頭深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3674 | Bathygobius cyclopterus | 圓鰭深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3675 | Bathygobius hongkongensis | 香江深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3676 | Bathygobius laddi | 萊氏深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3677 | Bathygobius meggitti | 梅氏深鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3718 | Bryaninops natans | 漂游珊瑚鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3719 | Bryaninops yongei | 勇氏珊瑚鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3721 | Butis amboinensis | 安汶脊塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3722 | Butis gymnopomus | 裸首脊塘鱧 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3723 | Butis melanostigma | 黑點脊塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 3731 | Callogobius hasseltii | 長鰭美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3732 | Callogobius nigromarginatus | 黑鰭緣美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3733 | Callogobius okinawae | 沖繩美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3734 | Callogobius sheni | 沈氏美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3735 | Callogobius snelliusi | 史氏美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3750 | Caragobius urolepis | 尾鱗頭鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3855 | Clariger taiwanensis | 台灣翼棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3881 | Cristatogobius nonatoae | 淺色項冠鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3884 | Cryptocentrus albidorsus | 白背帶絲鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3885 | Cryptocentrus nigrocellatus | 眼斑絲鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3886 | Cryptocentrus strigilliceps | 紋斑絲鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3887 | Cryptocentrus yatsui | 谷津氏絲鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3889 | Ctenogobiops formosa | 台灣櫛眼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 3927 | Discordipinna griessingeri | 格氏異翼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4025 | Eviota afelei | 條紋幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4026 | Eviota aquila | 暗色磯塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4027 | Eviota bipunctata | 雙斑異塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4028 | Eviota japonica | 日本幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4029 | Eviota melasma | 黑體幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4030 | Eviota piperata | 海水 | 本土 | |
| 4031 | Eviota prasina | 蔥綠幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4032 | Eviota queenslandica | 昆士蘭幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4033 | Eviota saipanensis | 塞班幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4034 | Eviota sebreei | 希氏幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4035 | Eviota smaragdus | 蜘蛛幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4036 | Eviota zebrina | 條尾幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4037 | Eviota zonura | 綠帶幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4043 | Favonigobius reichei | 雷氏蜂巢鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 4053 | Fusigobius duospilus | 裸項紡錘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4054 | Fusigobius humeralis | 臂斑紡錘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4055 | Fusigobius inframaculatus | 下斑紡錘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4056 | Fusigobius longispinus | 長棘紡錘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4057 | Fusigobius maximus | 巨紡錘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4058 | Fusigobius neophytus | 短棘紡錘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4059 | Fusigobius signipinnis | 斑鰭紡錘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4075 | Giuris margaritaceus | 無孔塘鱧 | 淡水 | 本土 |
| 4079 | Glossogobius bicirrhosus | 雙須舌鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4080 | Glossogobius brunnoides | 擬背斑舌鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4081 | Glossogobius celebius | 盤鰭舌鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 4082 | Glossogobius circumspectus | 鈍吻舌鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4083 | Glossogobius obscuripinnis | 暗鰭舌鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4085 | Gnatholepis anjerensis | 頜鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4086 | Gnatholepis ophthalmotaenia | 眼帶頜鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4087 | Gobiodon citrinus | 橙色葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4088 | Gobiodon fulvus | 黃褐葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4089 | Gobiodon micropus | 小鰭葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4090 | Gobiodon unicolor | 灰葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4091 | Gobiopsis arenaria | 砂髯鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4092 | Gobius bontii | 邦氏鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4099 | Gunnellichthys curiosus | 眼帶䲁鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4149 | Hazeus otakii | 大瀧氏粗棘鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4163 | Hetereleotris poecila | 雜色異塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4200 | Istigobius decoratus | 華麗銜鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4201 | Istigobius goldmanni | 戈氏銜鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4202 | Istigobius hoshinonis | 和歌銜鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4213 | Kelloggella cardinalis | 薩摩亞黏鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4215 | Koumansetta hectori | 海氏庫曼鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4229 | Lentipes armatus | 韌鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 4230 | Lentipes bunagaya | 淡水 | 本土 | |
| 4231 | Lentipes kijimuna | 淡水 | 本土 | |
| 4269 | Lotilia klausewitzi | 克氏櫛眼鰕虎魚 | 海水 | 本土 |
| 4270 | Lubricogobius exiguus | 短身裸葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4273 | Luciogobius saikaiensis | 西海竿鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4285 | Mahidolia mystacina | 大口巨頜鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4317 | Mugilogobius cavifrons | 清尾鯔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4318 | Mugilogobius chulae | 諸氏鯔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4319 | Mugilogobius notospilus | 背斑鯔鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4321 | Myersina macrostoma | 大口犁突鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4322 | Myersina papuanus | 巴布亞犁突鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4323 | Myersina yangii | 楊氏犁突鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4377 | Oligolepis stomias | 大口寡鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4404 | Oplopomus oplopomus | 刺蓋鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4432 | Oxyurichthys ophthalmonema | 眼瓣溝鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4446 | Paragobiodon lacunicolus | 黑鰭副葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4447 | Paragobiodon modestus | 疣副葉鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4482 | Parioglossus formosus | 華美舌塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4483 | Parioglossus taeniatus | 帶狀舌塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4543 | Pleurosicya bilobata | 雙葉腹瓢鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4544 | Pleurosicya micheli | 米氏腹瓢鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4545 | Pleurosicya mossambica | 莫桑比克腹瓢鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4574 | Priolepis boreus | 廣裸鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4575 | Priolepis fallacincta | 擬橫帶鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4576 | Priolepis inhaca | 裸頰鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4577 | Priolepis kappa | 卡氏鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4578 | Priolepis latifascima | 側帶鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4579 | Priolepis nuchifasciata | 項紋鋸鱗鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4629 | Ptereleotris hanae | 絲尾鰭塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4630 | Ptereleotris heteroptera | 尾斑鰭塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4631 | Ptereleotris monoptera | 單鰭鰭塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4632 | Ptereleotris zebra | 斑馬鰭塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4651 | Redigobius bikolanus | 拜庫雷鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4657 | Rhinogobius yangminshanensis | 陽明山雷鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 4682 | Schismatogobius ampluvinculus | 寬帶裂身鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 4710 | Sicyopterus micrurus | 短尾瓢鰭鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4743 | Stenogobius ophthalmoporus | 眼帶狹鰕虎 | 淡水 | 本土 |
| 4798 | Tomiyamichthys smithi | 史氏富山鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4805 | Trichonotus setiger | 毛背魚 | 海水 | 本土 |
| 4809 | Trimma caudomaculatum | 海水 | 本土 | |
| 4810 | Trimma grammistes | 縱帶磨塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4811 | Trimma macrophthalmus | 大眼磨塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4812 | Trimma milta | 橘黃磨塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4813 | Trimma okinawae | 沖繩磨塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4814 | Trimmatom macropodus | 大足微鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4822 | Valenciennea helsdingenii | 雙帶凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4823 | Valenciennea puellaris | 大鱗凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4824 | Valenciennea sexguttata | 六斑凡塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4825 | Vanderhorstia ambanoro | 安貝洛羅梵鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4826 | Vanderhorstia mertensi | 默氏梵鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4837 | Xenisthmus nigrolateralis | 海水 | 本土 | |
| 4845 | Yongeichthys criniger | 雲紋裸頰鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4852 | Amblyeleotris gymnocephala | 裸頭鈍塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4853 | Apocryptes bato | 棘平牙鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4857 | Brachyamblyopus brachysoma | 短體盲鰕虎 | 淡水/海水 | 本土 |
| 4858 | Butis humeralis | 印尼脊塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4860 | Callogobius maculipinnis | 斑鰭美鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4862 | Cryptocentrus cinctus | 黑唇絲鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4863 | Cryptocentrus leptocephalus | 小頭絲鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4864 | Cryptocentrus pretiosus | 銀絲鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4874 | Eviota storthynx | 顳斑幾塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4880 | Istigobius diadema | 印度銜鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4893 | Oxymetopon compressus | 側扁窄顱塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4898 | Parioglossus dotui | 尾斑舌塘鱧 | 海水 | 本土 |
| 4904 | Pterogobius virgo | 縱帶高鰭鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 4910 | Sineleotris saccharae | 薩氏華黝魚 | 淡水 | 本土 |
| 4917 | Tomiyamichthys oni | 奧奈氏富山鰕虎 | 海水 | 本土 |
| 鼠鱚目 Gonorynchiformes | ||||
| 564 | Chanos chanos | 遮目魚 | 海水 | 本土 |
| 1214 | Gonorynchus abbreviatus | 鼠鱚 | 海水 | 本土 |
| 虎鯊目 Heterodontiformes | ||||
| 1364 | Heterodontus japonicus | 寬紋虎鯊 | 海水 | 本土 |
| 1365 | Heterodontus zebra | 狹紋虎鯊 | 海水 | 本土 |
| 六鰓鯊目 Hexanchiformes | ||||
| 1360 | Heptranchias perlo | 尖頭七鰓鯊 | 海水 | 本土 |
| 1371 | Hexanchus griseus | 灰六鰓鯊 | 海水 | 本土 |
| 1372 | Hexanchus nakamurai | 中村氏六鰓鯊 | 海水 | 本土 |
| 1896 | Notorynchus cepedianus | 扁頭哈那鯊 | 海水 | 本土 |
| 3815 | Chlamydoselachus anguineus | 皺鰓鯊 | 海水 | 本土 |
| 鰃目 Hexanchiformes | ||||
| 1785 | Myripristis adusta | 焦黑鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1786 | Myripristis botche | 柏氏鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1787 | Myripristis chryseres | 黃鰭鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1788 | Myripristis kuntee | 康德鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1789 | Myripristis murdjan | 白邊鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1790 | Myripristis pralinia | 紅鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1791 | Myripristis violacea | 紫紅鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1792 | Myripristis vittata | 無斑鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 1857 | Neoniphon argenteus | 銀色新東洋鰃 | 海水 | 本土 |
| 1858 | Neoniphon opercularis | 黑鰭新東洋鰃 | 海水 | 本土 |
| 1859 | Neoniphon sammara | 莎姆新東洋鰃 | 海水 | 本土 |
| 2011 | Ostichthys japonicus | 日本骨鰃 | 海水 | 本土 |
| 2012 | Ostichthys kaianus | 深海骨鰃 | 海水 | 本土 |
| 2685 | Sargocentron caudimaculatum | 尾斑棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2686 | Sargocentron cornutum | 角棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2687 | Sargocentron diadema | 黑鰭棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2688 | Sargocentron ensifer | 劍棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2689 | Sargocentron melanospilos | 黑點棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2690 | Sargocentron microstoma | 小口棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2691 | Sargocentron punctatissimum | 斑紋棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2692 | Sargocentron rubrum | 點帶棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2693 | Sargocentron spiniferum | 尖吻棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2694 | Sargocentron spinosissimum | 大刺棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 2695 | Sargocentron violaceum | 白邊棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4324 | Myripristis berndti | 凸頜鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4325 | Myripristis formosa | 台灣鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4326 | Myripristis hexagona | 六角鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4327 | Myripristis randalli | 倫氏鋸鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4358 | Neoniphon aurolineatus | 黃帶新東洋鰃 | 海水 | 本土 |
| 4408 | Ostichthys sheni | 沈氏骨鰃 | 海水 | 本土 |
| 4539 | Plectrypops lima | 灘涂琉球鰃 | 海水 | 本土 |
| 4668 | Sargocentron ittodai | 銀帶棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4669 | Sargocentron praslin | 普拉斯林棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 4670 | Sargocentron tiere | 赤鰭棘鱗魚 | 海水 | 本土 |
| 鈎頭魚目 Kurtiformes | ||||
| 212 | Apogonichthyoides niger | 黑似天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 213 | Apogonichthyoides pseudotaeniatus | 擬雙帶似天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 214 | Apogonichthyoides sialis | 帶似天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 574 | Cheilodipterus macrodon | 巨牙天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 575 | Cheilodipterus quinquelineatus | 五帶巨牙天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 576 | Cheilodipterus singapurensis | 新加坡巨牙天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 1065 | Fibramia amboinensis | 弓線天竺鯛 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1080 | Fowleria aurita | 金色乳突天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 1480 | Jaydia carinatus | 斑鰭銀口天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 1481 | Jaydia ellioti | 黑邊天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 1482 | Jaydia lineata | 細條天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 1483 | Jaydia smithi | 史密斯氏天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 1484 | Jaydia tchefouensis | 煙臺銀口天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 1502 | Kurtus indicus | 印度鈎魚 | 淡水 | 本土 |
| 1819 | Nectamia bandanensis | 頰紋聖天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2013 | Ostorhinchus cookii | 庫氏鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2014 | Ostorhinchus doederleini | 稻氏鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2015 | Ostorhinchus fasciatus | 寬條鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2016 | Ostorhinchus fleurieu | 斑柄鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2017 | Ostorhinchus kiensis | 中線鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2018 | Ostorhinchus nigrofasciatus | 黑帶鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2019 | Ostorhinchus novemfasciatus | 九線鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2020 | Ostorhinchus pleuron | 側帶鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2021 | Ostorhinchus schlegeli | 施氏鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2022 | Ostorhinchus semilineatus | 半線鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 2331 | Pristicon trimaculatus | 三斑鋸竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3055 | Sphaeramia orbicularis | 環紋圓天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3602 | Amioides polyacanthus | 多刺天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3622 | Apogon coccineus | 透明紅天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3623 | Apogon crassiceps | 堅頭天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3624 | Apogon doryssa | 長棘天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3625 | Apogon nitidus | 褐條天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3626 | Apogon quadrisquamatus | 鋸頰天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3627 | Apogon semiornatus | 半飾天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3628 | Apogon unicolor | 單色天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3629 | Apogonichthyoides cathetogramma | 垂帶似天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3630 | Apogonichthyoides melas | 黑身似天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 3631 | Apogonichthyoides nigripinnis | 黑鰭似天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 3632 | Apogonichthyoides timorensis | 帝汶似天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 3633 | Apogonichthys ocellatus | 眼斑天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 3634 | Apogonichthys perdix | 鳩斑天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 3636 | Archamia bleekeri | 布氏長鰭天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3805 | Cheilodipterus artus | 縱帶巨牙天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 3806 | Cheilodipterus subulatus | 圓蓋巨牙天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4044 | Fibramia lateralis | 駝背線天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4045 | Fibramia thermalis | 條腹線天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4046 | Foa fo | 菲律賓齶竺魚 | 海水 | 本土 |
| 4049 | Fowleria isostigma | 犬形乳突天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4050 | Fowleria marmorata | 顯斑乳突天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4051 | Fowleria vaiulae | 維拉乳突天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4052 | Fowleria variegata | 雜斑乳突天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4100 | Gymnapogon annona | 無斑裸天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4101 | Gymnapogon japonicus | 日本裸天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4102 | Gymnapogon philippinus | 菲律賓裸天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4103 | Gymnapogon urospilotus | 尾斑裸天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4205 | Jaydia striata | 條紋銀口天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4336 | Neamia octospina | 八棘扁天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4337 | Nectamia fusca | 褐色聖天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4338 | Nectamia savayensis | 薩摩亞聖天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4409 | Ostorhinchus angustatus | 縱帶鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4410 | Ostorhinchus apogonoides | 短齒鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4411 | Ostorhinchus aureus | 環尾鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4412 | Ostorhinchus cheni | 陳氏鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4413 | Ostorhinchus chrysotaenia | 黃體鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4414 | Ostorhinchus compressus | 裂帶鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4415 | Ostorhinchus cyanosoma | 金帶鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4416 | Ostorhinchus dispar | 箭矢鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4417 | Ostorhinchus endekataenia | 細線鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4418 | Ostorhinchus hoevenii | 霍氏鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4419 | Ostorhinchus holotaenia | 全紋鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4420 | Ostorhinchus moluccensis | 摩鹿加鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4421 | Ostorhinchus multilineatus | 多帶鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4422 | Ostorhinchus notatus | 黑點鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4423 | Ostorhinchus parvulus | 小鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4424 | Ostorhinchus rubrimacula | 棕斑鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4425 | Ostorhinchus taeniophorus | 褐帶鸚天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4580 | Pristiapogon exostigma | 單線棘眼天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4581 | Pristiapogon fraenatus | 棘眼天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4582 | Pristiapogon kallopterus | 麗鰭棘眼天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4583 | Pristiapogon taeniopterus | 條鰭棘眼天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4593 | Pseudamia amblyuroptera | 鈍尾擬天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4594 | Pseudamia gelatinosa | 犬牙擬天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4595 | Pseudamia hayashii | 林氏擬天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4596 | Pseudamiops gracilicauda | 准天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4653 | Rhabdamia gracilis | 箭天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4721 | Siphamia fuscolineata | 棕線管天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4722 | Siphamia majimai | 馬島氏管天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4723 | Siphamia tubifer | 湯加管天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4728 | Sphaeramia nematoptera | 絲鰭圓天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4779 | Taeniamia biguttata | 雙斑帶天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4780 | Taeniamia buruensis | 橫帶天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4781 | Taeniamia fucata | 褐斑帶天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4782 | Taeniamia kagoshimanus | 鹿兒帶天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4783 | Taeniamia macroptera | 真帶天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4834 | Verulux cypselurus | 燕尾矛天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4843 | Yarica hyalosoma | 扁頭亞氏天竺鯛 | 淡水 | 本土 |
| 4850 | Zoramia gilberti | 齊氏狸天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 4854 | Apogonichthyoides taeniatus | 雙帶似天竺魚 | 海水 | 本土 |
| 4881 | Jaydia striatodes | 印度洋銀口天竺鯛 | 海水 | 本土 |
| 鼠鯊目 Lamniformes | ||||
| 129 | Alopias pelagicus | 淺海長尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 130 | Alopias vulpinus | 弧形長尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 482 | Carcharias taurus | 錐齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 483 | Carcharodon carcharias | 噬人鯊 | 海水 | 本土 |
| 516 | Cetorhinus maximus | 姥鯊 | 海水 | 本土 |
| 1479 | Isurus oxyrinchus | 尖吻鯖鯊 | 海水 | 本土 |
| 3586 | Alopias superciliosus | 大眼長尾鯊 | 海水 | 本土 |
| 4203 | Isurus paucus | 長臂鯖鯊 | 海水 | 本土 |
| 4608 | Pseudocarcharias kamoharai | 蒲原氏擬錐齒鯊 | 海水 | 本土 |
| 月魚目 Lampriformes | ||||
| 1046 | Eumecichthys fiski | 菲氏真冠帶魚 | 海水 | 本土 |
| 1536 | Lampris guttatus | 斑點月魚 | 海水 | 本土 |
| 2542 | Regalecus russellii | 勒氏皇帶魚 | 海水 | 本土 |
| 3260 | Trachipterus ishikawae | 石川粗鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 3261 | Trachipterus trachypterus | 粗鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 3468 | Velifer hypselopterus | 旗月魚 | 海水 | 本土 |
| 3558 | Zu cristatus | 冠絲鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 3909 | Desmodema polystictum | 多斑扇尾魚 | 海水 | 本土 |
| 4649 | Radiicephalus kessinger | 異尾帶魚 | 海水 | 本土 |
| 鮟鱇目 Lophiiformes | ||||
| 2 | Abantennarius coccineus | 細斑躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3 | Abantennarius dorehensis | 新幾內亞躄魚 | 海水 | 本土 |
| 4 | Abantennarius nummifer | 日本躄魚 | 海水 | 本土 |
| 196 | Antennarius hispidus | 毛躄魚 | 海水 | 本土 |
| 197 | Antennarius striatus | 帶紋躄魚 | 海水 | 本土 |
| 403 | Bufoceratias thele | 後棘蟾鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 512 | Ceratias holboelli | 霍氏角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 567 | Chaunax fimbriatus | 單棘躄魚 | 海水 | 本土 |
| 762 | Cryptopsaras couesii | 密棘角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 1124 | Gigantactis vanhoeffeni | 梵氏巨棘鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 1288 | Halicmetus reticulatus | 網紋牙棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 1289 | Halieutaea fumosa | 雲紋棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 1290 | Halieutaea indica | 印度棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 1291 | Halieutaea stellata | 棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 1375 | Himantolophus groenlandicus | 多指鞭冠鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 1393 | Histrio histrio | 裸躄魚 | 海水 | 本土 |
| 1625 | Lophiodes triradiatus | 褐擬鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 1627 | Lophiomus setigerus | 黑鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 1628 | Lophius litulon | 黃鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 1682 | Malthopsis annulifera | 環紋海蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 1701 | Melanocetus johnsonii | 約氏黑犀魚 | 海水 | 本土 |
| 3613 | Antennarius biocellatus | 雙斑躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3614 | Antennarius commerson | 康氏躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3615 | Antennarius maculatus | 大斑躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3616 | Antennarius pictus | 白斑躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3617 | Antennarius randalli | 藍道氏躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3618 | Antennatus tuberosus | 網紋手躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3720 | Bufoceratias shaoi | 邵氏蟾鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 3759 | Caulophryne pelagica | 大洋莖角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 3764 | Centrophryne spinulosa | 刺鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 3799 | Chaunax abei | 阿部單棘躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3800 | Chaunax apus | 粉紅單棘躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3801 | Chaunax erythraeus | 紅單棘躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3802 | Chaunax obscurus | 黑口單棘躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3803 | Chaunax penicillatus | 雲紋單棘躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3804 | Chaunax viridiretis | 綠網紋單棘躄魚 | 海水 | 本土 |
| 3857 | Coelophrys brevicaudata | 短尾腔蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 3858 | Coelophrys micropus | 小足腔蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 3918 | Dibranchus japonicus | 日本長鰭蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 3919 | Diceratias bispinosus | 細瓣雙角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 3929 | Dolopichthys pullatus | 黑狡鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4069 | Gigantactis cheni | 陳氏巨棘鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4070 | Gigantactis elsmani | 艾氏大角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4071 | Gigantactis gargantua | 深口大角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4143 | Halicmetus niger | 黑牙棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 4144 | Halieutaea fitzsimonsi | 費氏棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 4145 | Halieutopsis ingerorum | 英格擬棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 4146 | Halieutopsis margaretae | 馬格瑞擬棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 4147 | Halieutopsis simula | 準擬棘茄魚 | 海水 | 本土 |
| 4167 | Himantolophus melanolophus | 黑鞭冠鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4172 | Histiophryne cryptacanthus | 隱刺薄躄魚 | 海水 | 本土 |
| 4256 | Linophryne indica | 印度樹須魚 | 海水 | 本土 |
| 4266 | Lophiodes endoi | 遠藤擬鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4267 | Lophiodes mutilus | 大眼擬鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4268 | Lophodolos indicus | 印度冠鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4287 | Malthopsis formosa | 台灣海蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 4288 | Malthopsis gigas | 巨海蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 4289 | Malthopsis kobayashii | 科氏海蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 4290 | Malthopsis mitrigera | 鈎棘海蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 4291 | Malthopsis tiarella | 斑點海蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 4296 | Melanocetus murrayi | 短柄黑犀魚 | 海水 | 本土 |
| 4352 | Neoceratias spinifer | 新角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4381 | Oneirodes carlsbergi | 卡氏夢鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4382 | Oneirodes formosanus | 台灣夢鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4383 | Oneirodes pietschi | 皮氏夢鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4384 | Oneirodes sabex | 砂夢鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4659 | Rhynchactis leptonema | 細絲吻長角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4660 | Rhynchactis macrothrix | 長絲吻長角鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4726 | Solocisquama stellulata | 星點梭羅蝠魚 | 海水 | 本土 |
| 4733 | Spiniphryne gladisfenae | 劍狀棘蟾鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4793 | Thaumatichthys pagidostomus | 印度洋奇鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 4816 | Tyrannophryne pugnax | 暴龍蜍鮟鱇 | 海水 | 本土 |
| 鯔形目 Mugiliformes | ||||
| 749 | Crenimugil crenilabis | 粒唇鯔 | 海水 | 本土 |
| 750 | Crenimugil seheli | 圓吻凡鯔 | 海水 | 本土 |
| 961 | Ellochelon vaigiensis | 黃鯔 | 海水 | 本土 |
| 1764 | Mugil cephalus | 鯔 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2007 | Osteomugil cunnesius | 科氏鯔 | 海水 | 本土 |
| 2008 | Osteomugil engeli | 英氏凡鯔 | 海水 | 本土 |
| 2009 | Osteomugil formosae | 台灣凡鯔 | 海水 | 本土 |
| 2010 | Osteomugil speigleri | 斯氏凡鯔 | 海水 | 本土 |
| 2228 | Planiliza affinis | 前鱗鮻 | 海水 | 本土 |
| 2229 | Planiliza carinata | 棱鮻 | 海水 | 本土 |
| 2230 | Planiliza haematocheilus | 鮻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2231 | Planiliza macrolepis | 大鱗鮻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2232 | Planiliza melinoptera | 塞蘭鮻 | 海水 | 本土 |
| 2233 | Planiliza planiceps | 尖頭鮻 | 海水 | 本土 |
| 2275 | Plicomugil labiosus | 角瘤唇鯔 | 海水 | 本土 |
| 4407 | Osteomugil perusii | 佩氏莫鯔 | 海水 | 本土 |
| 4508 | Planiliza alata | 竹筒鮻 | 海水 | 本土 |
| 4509 | Planiliza subviridis | 白鮻 | 淡水/海水 | 本土 |
| 4896 | Paramugil parmatus | 盾副鯔 | 海水 | 本土 |
| 羊魚目 Mulliformes | ||||
| 1768 | Mulloidichthys flavolineatus | 黃帶擬羊魚 | 海水 | 本土 |
| 1769 | Mulloidichthys vanicolensis | 無斑擬羊魚 | 海水 | 本土 |
| 2159 | Parupeneus barberinus | 條斑副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 2160 | Parupeneus biaculeatus | 雙帶副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 2161 | Parupeneus ciliatus | 短鬚副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 2162 | Parupeneus cyclostomus | 圓口副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 2163 | Parupeneus heptacanthus | 七棘副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 2164 | Parupeneus indicus | 印度副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 2165 | Parupeneus multifasciatus | 多帶副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 2166 | Parupeneus pleurostigma | 黑斑副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3422 | Upeneus heterospinus | 異奇棘緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3423 | Upeneus japonicus | 日本緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3424 | Upeneus moluccensis | 馬六甲緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3425 | Upeneus quadrilineatus | 四帶緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3426 | Upeneus subvittatus | 縱帶緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3427 | Upeneus sulphureus | 黃帶緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3428 | Upeneus taeniopterus | 紋鰭緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3429 | Upeneus tragula | 黑斑緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 3430 | Upeneus vittatus | 多帶緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 4320 | Mulloidichthys pfluegeri | 紅背擬羊魚 | 海水 | 本土 |
| 4484 | Parupeneus barberinoides | 似條斑副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 4485 | Parupeneus chrysopleuron | 黃帶副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 4486 | Parupeneus crassilabris | 粗唇副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 4487 | Parupeneus rubescens | 玫瑰副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 4488 | Parupeneus spilurus | 點紋副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 4899 | Parupeneus trifasciatus | 三帶副緋鯉 | 海水 | 本土 |
| 燈籠魚目 Myctophiformes | ||||
| 364 | Benthosema fibulatum | 帶底燈魚 | 海水 | 本土 |
| 365 | Benthosema pterotum | 七星底燈魚 | 海水 | 本土 |
| 366 | Benthosema suborbitale | 耀眼底燈魚 | 海水 | 本土 |
| 380 | Bolinichthys longipes | 長鰭虹燈魚 | 海水 | 本土 |
| 381 | Bolinichthys pyrsobolus | 眶暗虹燈魚 | 海水 | 本土 |
| 486 | Centrobranchus andreae | 牡錦燈魚 | 海水 | 本土 |
| 487 | Centrobranchus choerocephalus | 橢錦燈魚 | 海水 | 本土 |
| 513 | Ceratoscopelus townsendi | 湯氏角燈魚 | 海水 | 本土 |
| 514 | Ceratoscopelus warmingii | 瓦明氏角燈魚 | 海水 | 本土 |
| 847 | Dasyscopelus asper | 暗色燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 848 | Dasyscopelus obtusirostris | 鈍吻燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 849 | Dasyscopelus selenops | 粗短燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 850 | Dasyscopelus spinosus | 櫛刺燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 871 | Diaphus aliciae | 長距眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 872 | Diaphus brachycephalus | 短頭眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 873 | Diaphus chrysorhynchus | 金鼻眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 874 | Diaphus coeruleus | 藍光眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 875 | Diaphus diademophilus | 冠冕眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 876 | Diaphus fragilis | 符氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 877 | Diaphus fulgens | 燦爛眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 878 | Diaphus garmani | 喀氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 879 | Diaphus jenseni | 顏氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 880 | Diaphus lucidus | 耀眼眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 881 | Diaphus luetkeni | 呂氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 882 | Diaphus malayanus | 馬來亞眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 883 | Diaphus mollis | 短距眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 884 | Diaphus parri | 帕爾眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 885 | Diaphus perspicillatus | 華麗眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 886 | Diaphus phillipsi | 菲氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 887 | Diaphus regani | 翹光眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 888 | Diaphus richardsoni | 李氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 889 | Diaphus sagamiensis | 相模灣眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 890 | Diaphus signatus | 後光眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 891 | Diaphus suborbitalis | 光腺眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 892 | Diaphus watasei | 渡瀨眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 899 | Diogenichthys atlanticus | 大西洋明燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1432 | Hygophum proximum | 近壯燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1433 | Hygophum reinhardtii | 萊氏壯燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1527 | Lampadena luminosa | 發光炬燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1528 | Lampadena speculigera | 暗柄炬燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1529 | Lampanyctus alatus | 翼珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1530 | Lampanyctus festivus | 雜色珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1531 | Lampanyctus hubbsi | 赫氏珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1532 | Lampanyctus macropterus | 大鰭珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1533 | Lampanyctus niger | 黑體珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1534 | Lampanyctus nobilis | 諾貝珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1535 | Lampanyctus tenuiformis | 天紐珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1776 | Myctophum aurolaternatum | 金焰燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 1777 | Myctophum lychnobium | 雙燈燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 1778 | Myctophum nitidulum | 閃光燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 1874 | Neoscopelus macrolepidotus | 大鱗新燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1875 | Neoscopelus microchir | 小鰭新燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1876 | Neoscopelus porosus | 多孔新燈魚 | 海水 | 本土 |
| 1897 | Notoscopelus resplendens | 閃光背燈魚 | 海水 | 本土 |
| 2864 | Scopelengys tristis | 擬燈籠魚 | 海水 | 本土 |
| 3129 | Symbolophorus evermanni | 埃氏標燈魚 | 海水 | 本土 |
| 3154 | Taaningichthys bathyphilus | 前臀月燈魚 | 海水 | 本土 |
| 3287 | Triphoturus nigrescens | 淺黑尾燈魚 | 海水 | 本土 |
| 3913 | Diaphus knappi | 奈氏眼眶魚 | 海水 | 本土 |
| 3914 | Diaphus pacificus | 太平洋眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 3915 | Diaphus schmidti | 史氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 3916 | Diaphus splendidus | 亮眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 3917 | Diaphus taaningi | 譚氏眶燈魚 | 海水 | 本土 |
| 3949 | Electrona risso | 高體電燈魚 | 海水 | 本土 |
| 4228 | Lampanyctus turneri | 圖氏珍燈魚 | 海水 | 本土 |
| 4265 | Lobianchia gemellarii | 吉氏葉燈魚 | 海水 | 本土 |
| 4364 | Notolychnus valdiviae | 瓦氏尖吻背燈魚 | 海水 | 本土 |
| 4365 | Notoscopelus caudispinosus | 尾棘背燈魚 | 海水 | 本土 |
| 鱝目 Myliobatiformes | ||||
| 106 | Aetobatus narutobiei | 海水 | 本土 | |
| 107 | Aetobatus ocellatus | 眼斑鷂鱝 | 海水 | 本土 |
| 108 | Aetomylaeus maculatus | 花點無刺鱝 | 海水 | 本土 |
| 109 | Aetomylaeus milvus | 鷹狀無刺鱝 | 海水 | 本土 |
| 110 | Aetomylaeus nichofii | 聶氏無刺鱝 | 海水 | 本土 |
| 111 | Aetomylaeus vespertilio | 蝠狀無刺鱝 | 海水 | 本土 |
| 1266 | Gymnura bimaculata | 雙斑燕魟 | 海水 | 本土 |
| 1267 | Gymnura crooki | 克氏燕魟 | 海水 | 本土 |
| 1268 | Gymnura japonica | 日本燕魟 | 海水 | 本土 |
| 1269 | Gymnura poecilura | 花尾燕魟 | 海水 | 本土 |
| 1350 | Hemitrygon akajei | 赤魟 | 海水 | 本土 |
| 1351 | Hemitrygon bennettii | 白玉鯆 | 海水 | 本土 |
| 1352 | Hemitrygon laevigata | 光魟 | 海水 | 本土 |
| 1353 | Hemitrygon navarrae | 黑土魟 | 海水 | 本土 |
| 1354 | Hemitrygon sinensis | 中國魟 | 海水 | 本土 |
| 1376 | Himantura microphthalma | 小眼窄尾魟 | 海水 | 本土 |
| 1377 | Himantura uarnak | 花點窄尾魟 | 海水 | 本土 |
| 1674 | Maculabatis gerrardi | 齊氏土魟 | 海水 | 本土 |
| 1752 | Mobula birostris | 雙吻前口蝠鱝 | 海水 | 本土 |
| 1753 | Mobula japanica | 日本蝠鱝 | 海水 | 本土 |
| 1780 | Myliobatis tobijei | 鳶鱝 | 海水 | 本土 |
| 2268 | Plesiobatis daviesi | 達氏深水尾魟 | 海水 | 本土 |
| 2616 | Rhinoptera javanica | 爪哇牛鼻鱝 | 海水 | 本土 |
| 2617 | Rhinoptera jayakari | 傑氏牛鼻鱝 | 海水 | 本土 |
| 3168 | Taeniurops meyeni | 邁氏條尾魟 | 海水 | 本土 |
| 3197 | Telatrygon zugei | 尖嘴土魟 | 海水 | 本土 |
| 3440 | Urogymnus asperrimus | 糙沙粒魟 | 海水 | 本土 |
| 3441 | Urolophus aurantiacus | 褐黃扁魟 | 海水 | 本土 |
| 3682 | Bathytoshia lata | 鬼土魟 | 海水 | 本土 |
| 4166 | Hexatrygon bickelli | 比氏六鰓魟 | 海水 | 本土 |
| 4168 | Himantura undulata | 波緣窄尾魟 | 海水 | 本土 |
| 4284 | Maculabatis macrura | 海水 | 本土 | |
| 4312 | Mobula tarapacana | 褐背蝠鱝 | 海水 | 本土 |
| 4360 | Neotrygon varidens | 雜色新魟 | 海水 | 本土 |
| 4817 | Urogymnus granulatus | 海水 | 本土 | |
| 盲鰻目 Myxiniformes | ||||
| 1020 | Eptatretus burgeri | 蒲氏黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 1021 | Eptatretus chinensis | 中華黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4002 | Eptatretus cheni | 陳氏黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4003 | Eptatretus fernholmi | 費氏黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4004 | Eptatretus nelsoni | 紐氏黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4005 | Eptatretus okinoseanus | 紫黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4006 | Eptatretus sheni | 沈氏黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4007 | Eptatretus taiwanae | 台灣黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4008 | Eptatretus wisneri | 懷氏黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4009 | Eptatretus yangi | 楊氏黏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4328 | Myxine formosana | 台灣盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4329 | Myxine kuoi | 郭氏盲鰻 | 海水 | 本土 |
| 4664 | Rubicundus rubicundus | 紅尾盲鰻 | 海水 | 特有種 |
| 背棘魚目 Notacanthiformes | ||||
| 115 | Aldrovandia affinis | 異鱗海蜴魚 | 海水 | 本土 |
| 1893 | Notacanthus abbotti | 長吻背棘魚 | 海水 | 本土 |
| 鼬䲁目 Ophidiiformes | ||||
| 127 | Alionematichthys piger | 大眼海鼬魚 | 海水 | 本土 |
| 128 | Alionematichthys riukiuensis | 琉球海鼬魚 | 海水 | 本土 |
| 322 | Barathronus diaphanus | 盲鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 336 | Bassozetus robustus | 壯體索深鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 402 | Brotula multibarbata | 多須鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 460 | Carapus mourlani | 蒙氏潛魚 | 海水 | 本土 |
| 869 | Diancistrus fuscus | 暗色獵神深䲁 | 海水 | 本土 |
| 870 | Diancistrus vietnamensis | 越南獵神深䲁 | 海水 | 本土 |
| 893 | Dicrolene quinquarius | 五指絲指鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 894 | Dicrolene tristis | 短絲指鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 965 | Encheliophis boraborensis | 博拉細潛魚 | 海水 | 本土 |
| 966 | Encheliophis homei | 長胸細潛魚 | 海水 | 本土 |
| 967 | Encheliophis sagamianus | 佐上細潛魚 | 海水 | 本土 |
| 1220 | Grammonus robustus | 粗寡須䲁 | 海水 | 本土 |
| 1417 | Homostolus acer | 長趾鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1423 | Hoplobrotula armata | 棘鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1537 | Lamprogrammus brunswigi | 布氏軟鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1633 | Luciobrotula bartschi | 巴奇氏矛鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1759 | Monomitopus kumae | 熊吉單趾鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1844 | Neobythites sivicola | 黑潮新鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1845 | Neobythites unimaculatus | 單斑新鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1928 | Onuxodon parvibrachium | 短臂鈎潛魚 | 海水 | 本土 |
| 1953 | Ophidion asiro | 蓆鱗鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 1954 | Ophidion muraenolepis | 黑邊鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 2520 | Pycnocraspedum microlepis | 細鱗姬鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 3047 | Sirembo imberbis | 仙鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 3565 | Acanthonus armatus | 大棘鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 3667 | Bassozetus compressus | 扁索深鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 3668 | Bassozetus glutinosus | 黏身索深鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 3679 | Bathyonus caudalis | 大尾深水鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 3717 | Brotulinella taiwanensis | 台灣小線深䲁 | 海水 | 本土 |
| 3920 | Dinematichthys iluocoeteoides | 雙線鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 3952 | Encheliophis gracilis | 鰻形細潛魚 | 海水 | 本土 |
| 4021 | Eurypleuron owasianum | 日本突吻潛魚 | 海水 | 本土 |
| 4084 | Glyptophidium lucidum | 光曲鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 4173 | Holcomycteronus aequatoris | 深海鈍吻鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 4315 | Monomitopus pallidus | 重齒單趾鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 4349 | Neobythites fasciatus | 橫帶新鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 4350 | Neobythites stigmosus | 多斑新鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 4386 | Onuxodon albometeori | 流星鈎隱魚 | 海水 | 本土 |
| 4387 | Onuxodon fowleri | 福氏鈎潛魚 | 海水 | 本土 |
| 4570 | Porogadus miles | 頭棘孔鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 4622 | Pseudonus squamiceps | 鱗頭擬鼠䲁 | 海水 | 本土 |
| 4648 | Pyramodon ventralis | 纖尾錐齒潛魚 | 海水 | 本土 |
| 4841 | Xyelacyba myersi | 梅氏棘鰓鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 4889 | Monomitopus longiceps | 長頭單趾鼬䲁 | 海水 | 本土 |
| 鬚鯊目 Orectolobiformes | ||||
| 593 | Chiloscyllium griseum | 灰斑竹鯊 | 海水 | 本土 |
| 594 | Chiloscyllium indicum | 印度斑竹鯊 | 海水 | 本土 |
| 595 | Chiloscyllium plagiosum | 條紋斑竹鯊 | 海水 | 本土 |
| 596 | Chiloscyllium punctatum | 點紋斑竹鯊 | 海水 | 本土 |
| 648 | Cirrhoscyllium expolitum | 橙黃鯊 | 海水 | 本土 |
| 649 | Cirrhoscyllium formosanum | 台灣橙黃鯊 | 海水 | 本土 |
| 1818 | Nebrius ferrugineus | 長尾光鱗鯊 | 海水 | 本土 |
| 1973 | Orectolobus japonicus | 日本鬚鯊 | 海水 | 本土 |
| 2555 | Rhincodon typus | 鯨鯊 | 海水 | 本土 |
| 3098 | Stegostoma tigrinum | 大尾虎鮫 | 海水 | 本土 |
| 胡瓜魚目 Osmeriformes | ||||
| 1345 | Hemisalanx brachyrostralis | 短吻間銀魚 | 淡水 | 特有種 |
| 1438 | Hypomesus olidus | 池沼公魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1605 | Leucosoma reevesii | 里氏白肌銀魚 | 淡水 | 本土 |
| 1865 | Neosalanx anderssoni | 安氏新銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1866 | Neosalanx argentea | 銀色新銀魚 | 淡水 | 本土 |
| 1867 | Neosalanx brevirostris | 短吻新銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1868 | Neosalanx hubbsi | 赫氏新銀魚 | 淡水 | 本土 |
| 1869 | Neosalanx jordani | 喬氏新銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1870 | Neosalanx oligodontis | 寡齒新銀魚 | 淡水 | 本土 |
| 1871 | Neosalanx pseudotaihuensis | 近太湖新銀魚 | 淡水 | 本土 |
| 1872 | Neosalanx taihuensis | 太湖新銀魚 | 淡水 | 特有種 |
| 1873 | Neosalanx tangkahkeii | 陳氏新銀魚 | 淡水 | 特有種 |
| 2248 | Plecoglossus altivelis | 香魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2354 | Protosalanx chinensis | 中國大銀魚 | 淡水 | 本土 |
| 2355 | Protosalanx hyalocranius | 大銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2653 | Salanx ariakensis | 有明銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2654 | Salanx chinensis | 中國銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2655 | Salanx cuvieri | 居氏銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2656 | Salanx prognathus | 前頜銀魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 骨舌魚目 Osteoglossiformes | ||||
| 1894 | Notopterus notopterus | 弓背魚(駝背魚) | 淡水 | 本土 |
| 卵附系 Ovalentaria/misc | ||||
| 12 | Abudefduf bengalensis | 孟加拉豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 13 | Abudefduf septemfasciatus | 七帶豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 14 | Abudefduf sexfasciatus | 六帶豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 15 | Abudefduf sordidus | 豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 16 | Abudefduf vaigiensis | 五帶豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 33 | Acanthoplesiops hiatti | 海氏若棘鮗 | 海水 | 本土 |
| 134 | Ambassis dussumieri | 杜氏雙邊魚 | 海水 | 本土 |
| 135 | Ambassis gymnocephalus | 裸頭雙邊魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 145 | Amblyglyphidodon aureus | 金凹牙豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 146 | Amblyglyphidodon curacao | 庫拉索凹牙豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 147 | Amblyglyphidodon leucogaster | 白腹凹牙豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 155 | Amphiprion akallopisos | 背紋雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 156 | Amphiprion bicinctus | 二帶雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 157 | Amphiprion clarkii | 克氏雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 158 | Amphiprion ephippium | 大眼雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 159 | Amphiprion frenatus | 白條雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 160 | Amphiprion percula | 海葵雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 161 | Amphiprion perideraion | 項環雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 162 | Amphiprion polymnus | 鞍斑雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 260 | Assessor randalli | 藍氏燕尾鮗 | 海水 | 本土 |
| 288 | Azurina lepidolepis | 細鱗光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 432 | Calloplesiops altivelis | 珍珠麗鮗 | 海水 | 本土 |
| 619 | Chromis analis | 長臀光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 620 | Chromis chrysura | 長棘光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 621 | Chromis mirationis | 東海光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 622 | Chromis notata | 尾斑光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 623 | Chromis ternatensis | 條尾光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 624 | Chromis viridis | 藍綠光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 625 | Chromis xanthura | 黃尾光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 626 | Chrysiptera biocellata | 雙斑金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 627 | Chrysiptera brownriggii | 勃氏金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 628 | Chrysiptera cyanea | 圓尾金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 629 | Chrysiptera glauca | 青金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 630 | Chrysiptera starcki | 史氏金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 631 | Chrysiptera talboti | 塔氏金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 632 | Chrysiptera unimaculata | 無斑金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 716 | Congrogadus subducens | 鰻鯛 | 海水 | 本土 |
| 844 | Dascyllus aruanus | 宅泥魚 | 海水 | 本土 |
| 845 | Dascyllus marginatus | 灰邊宅泥魚 | 海水 | 本土 |
| 846 | Dascyllus trimaculatus | 三斑宅泥魚 | 海水 | 本土 |
| 911 | Dischistodus chrysopoecilus | 白點盤雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 912 | Dischistodus melanotus | 黑斑盤雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 913 | Dischistodus perspicillatus | 顯盤雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 914 | Dischistodus prosopotaenia | 黑背盤雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 915 | Dischistodus pseudochrysopoecilus | 暗褐盤雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 933 | Ditrema temminckii | 海鮒 | 海水 | 本土 |
| 1331 | Hemiglyphidodon plagiometopon | 密鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 1511 | Labracinus cyclophthalmus | 圓眼戴氏魚 | 海水 | 本土 |
| 1848 | Neoglyphidodon melas | 黑新箭齒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 1849 | Neoglyphidodon thoracotaeniatus | 紋胸新箭齒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 1862 | Neopomacentrus azysron | 黃尾新雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 1863 | Neopomacentrus taeniurus | 條尾新雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 1864 | Neopomacentrus violascens | 紫身新雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 1959 | Opistognathus evermanni | 艾氏後頜鰧 | 海水 | 本土 |
| 1960 | Opistognathus scops | 梟後頜鰧 | 淡水 | 本土 |
| 2261 | Plectroglyphidodon dickii | 狄氏椒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2262 | Plectroglyphidodon fasciolatus | 珊瑚海近雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2263 | Plectroglyphidodon leucozonus | 白帶椒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2270 | Plesiops coeruleolineatus | 藍線鮗 | 海水 | 本土 |
| 2298 | Pomacentrus bankanensis | 班卡雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2299 | Pomacentrus brachialis | 臂雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2300 | Pomacentrus moluccensis | 摩鹿加雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2301 | Pomacentrus pavo | 孔雀雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2302 | Pomacentrus philippinus | 菲律賓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2303 | Pomacentrus tripunctatus | 三斑雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2304 | Pomacentrus vaiuli | 王子雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2305 | Pomachromis richardsoni | 李氏波光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 2419 | Pseudochromis fuscus | 褐擬雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2420 | Pseudochromis perspicillatus | 壯擬雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2517 | Pycnochromis caudalis | 大尾光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 2518 | Pycnochromis margaritifer | 兩色光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 2519 | Pycnochromis ovatiformis | 卵形光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 3094 | Stalix immaculata | 無斑叉棘鰧 | 海水 | 本土 |
| 3095 | Stegastes albifasciatus | 白帶眶鋸雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 3096 | Stegastes lacrymatus | 珠點固曲齒鯛 | 海水 | 本土 |
| 3097 | Stegastes nigricans | 黑眶鋸雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 3196 | Teixeirichthys jordani | 喬氏蜥雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 3561 | Abudefduf lorenzi | 勞倫氏豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 3562 | Abudefduf nigrimargo | 黑邊豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 3563 | Abudefduf notatus | 黃尾豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 3568 | Acanthoplesiops psilogaster | 滑腹若棘鮗 | 海水 | 本土 |
| 3588 | Ambassis interrupta | 斷線雙邊魚 | 海水 | 本土 |
| 3589 | Ambassis miops | 小眼雙邊魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3590 | Ambassis urotaenia | 尾紋雙邊魚 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3601 | Amblyglyphidodon ternatensis | 平頜凹牙豆娘魚 | 海水 | 本土 |
| 3604 | Amphiprion ocellaris | 眼斑雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 3605 | Amphiprion sandaracinos | 白背雙鋸魚 | 海水 | 本土 |
| 3651 | Assessor macneilli | 麥氏燕尾鮗 | 海水 | 本土 |
| 3663 | Azurina elerae | 海水 | 本土 | |
| 3683 | Beliops batanensis | 菲律賓針鰭鮗 | 海水 | 本土 |
| 3684 | Belonepterygion fasciolatum | 橫帶針翅鮗 | 海水 | 本土 |
| 3811 | Cheiloprion labiatus | 鋸唇魚 | 海水 | 本土 |
| 3829 | Chromis albomaculata | 白斑光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3830 | Chromis atripectoralis | 綠光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3831 | Chromis cinerascens | 灰光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3832 | Chromis flavomaculata | 黃斑光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3833 | Chromis fumea | 煙色光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3834 | Chromis onumai | 大沼氏光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3835 | Chromis opercularis | 蓋光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3836 | Chromis weberi | 韋氏光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3837 | Chromis xanthochira | 黃腋光鰓魚 | 海水 | 本土 |
| 3838 | Chrysiptera rex | 橙黃金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 3839 | Chrysiptera tricincta | 三帶金翅雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 3896 | Cypho zaps | 扎帕駝雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 3900 | Dascyllus melanurus | 黑尾宅泥魚 | 海水 | 本土 |
| 3901 | Dascyllus reticulatus | 網紋宅泥魚 | 海水 | 本土 |
| 4354 | Neoglyphidodon nigroris | 黑褐新箭齒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4359 | Neopomacentrus cyanomos | 藍黑新雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4400 | Opistognathus castelnaui | 卡氏後頜鰧 | 海水 | 本土 |
| 4401 | Opistognathus hongkongiensis | 香港後頜鰧 | 海水 | 本土 |
| 4402 | Opistognathus solorensis | 蘇祿後頜鰧 | 海水 | 本土 |
| 4403 | Opistognathus variabilis | 多彩後頜鰧 | 海水 | 本土 |
| 4505 | Pictichromis porphyrea | 紫繡雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4530 | Plectroglyphidodon altus | 羽高身雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4531 | Plectroglyphidodon apicalis | 尖高身雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4532 | Plectroglyphidodon aureus | 黃高身雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4533 | Plectroglyphidodon imparipennis | 羽狀椒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4534 | Plectroglyphidodon insularis | 島嶼高身雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4535 | Plectroglyphidodon johnstonianus | 尾斑椒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4536 | Plectroglyphidodon obreptus | 斑棘椒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4537 | Plectroglyphidodon phoenixensis | 鳳凰椒雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4540 | Plesiops corallicola | 珊瑚鮗 | 海水 | 本土 |
| 4541 | Plesiops nakaharae | 仲原氏鮗 | 海水 | 本土 |
| 4542 | Plesiops verecundus | 羞鮗 | 海水 | 本土 |
| 4557 | Pomacentrus alexanderae | 胸斑雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4558 | Pomacentrus amboinensis | 安汶雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4559 | Pomacentrus chrysurus | 金尾雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4560 | Pomacentrus coelestis | 霓虹雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4561 | Pomacentrus grammorhynchus | 藍點雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4562 | Pomacentrus lepidogenys | 頰鱗雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4563 | Pomacentrus nagasakiensis | 長崎雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4564 | Pomacentrus nigromarginatus | 黑緣雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4565 | Pomacentrus stigma | 斑點雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4566 | Pomacentrus taeniometopon | 弓紋雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4587 | Pristotis obtusirostris | 鈍吻鋸雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4611 | Pseudochromis cyanotaenia | 藍帶擬雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4612 | Pseudochromis luteus | 灰黃擬雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4613 | Pseudochromis marshallensis | 馬歇爾島擬雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4614 | Pseudochromis striatus | 條紋擬雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4615 | Pseudochromis tapeinosoma | 紫青擬雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4623 | Pseudoplesiops rosae | 玫瑰擬鮗 | 海水 | 本土 |
| 4641 | Pycnochromis acares | 侏儒光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4642 | Pycnochromis alleni | 亞倫氏光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4643 | Pycnochromis atripes | 黑鰭光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4644 | Pycnochromis delta | 海水 | 本土 | |
| 4645 | Pycnochromis retrofasciatus | 黑帶光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4646 | Pycnochromis vanderbilti | 凡氏光鰓雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4740 | Stalix sheni | 沈氏叉棘鰧 | 海水 | 本土 |
| 4742 | Stegastes punctatus | 大斑眶鋸雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4851 | Ambassis buruensis | 布魯雙邊魚 | 海水 | 本土 |
| 4890 | Neopomacentrus bankieri | 斑氏新雀鯛 | 海水 | 本土 |
| 4912 | Stalix histrio | 紅海叉棘鰧 | 海水 | 本土 |
| 鱸形目鯒狀魚亞目 Perciformes/Bembropoidei | ||||
| 360 | Bembrops caudimacula | 尾斑鯒狀魚 | 海水 | 本土 |
| 361 | Bembrops curvatura | 曲線鯒狀魚 | 海水 | 本土 |
| 616 | Chrionema chlorotaenia | 綠尾低線魚 | 海水 | 本土 |
| 617 | Chrionema chryseres | 黃斑低線魚 | 海水 | 本土 |
| 3686 | Bembrops filiferus | 絲棘鯒狀魚 | 海水 | 本土 |
| 鱸形目杜父魚亞目 Perciformes/Cottoidei | ||||
| 743 | Cottus dzungaricus | 黏滑杜父魚 | 淡水 | 本土 |
| 744 | Cottus hangiongensis | 圖們江杜父魚 | 淡水 | 本土 |
| 1369 | Hexagrammos agrammus | 斑頭六線魚 | 海水 | 本土 |
| 1370 | Hexagrammos otakii | 大瀧六線魚 | 海水 | 本土 |
| 1550 | Lepidobero sinensis | 中華鱗舌杜父魚 | 淡水 | 本土 |
| 1618 | Liparis chefuensis | 網紋獅子魚(煙臺獅子魚) | 海水 | 本土 |
| 1619 | Liparis petschiliensis | 河北獅子魚 | 海水 | 本土 |
| 1620 | Liparis tanakae | 田中獅子魚 | 海水 | 本土 |
| 1782 | Myoxocephalus sinensis | 中華床杜父魚 | 淡水 | 本土 |
| 2271 | Pleurogrammus azonus | 遠東多線魚 | 海水 | 本土 |
| 2415 | Pseudoblennius cottoides | 銀帶䲁杜父魚 | 海水 | 本土 |
| 3255 | Trachidermus fasciatus | 松江鱸 | 淡水 | 本土 |
| 鱸形目刺魚亞目 Perciformes/Gasterosteoidei | ||||
| 277 | Aulichthys japonicus | 日本管刺魚(管魚) | 海水 | 本土 |
| 2508 | Pungitius pungitius | 八棘多刺魚 | 淡水 | 本土 |
| 2509 | Pungitius sinensis | 中華多刺魚 | 淡水 | 本土 |
| 2510 | Pungitius stenurus | 黑龍江多刺魚 | 淡水 | 本土 |
| 鱸形目鱸亞目 Perciformes/Percoidei | ||||
| 1222 | Gymnocephalus cernua | 密歇根梅花鱸 | 淡水 | 本土 |
| 1887 | Niphon spinosus | 東洋鱸 | 海水 | 本土 |
| 2186 | Perca fluviatilis | 河鱸 | 淡水 | 引入種 |
| 2187 | Perca schrenkii | 伊犁鱸 | 淡水 | 本土 |
| 2665 | Sander lucioperca | 白梭吻鱸 | 淡水 | 引入種 |
| 鱸形目鮋亞目 Perciformes/Scorpaenoidei | ||||
| 9 | Ablabys macracanthus | 大棘帆鰭鮋 | 海水 | 本土 |
| 35 | Acanthosphex leurynnis | 印度單棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 209 | Apistus carinatus | 棱須蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 210 | Aploactis aspera | 相模灣疣鮋 | 海水 | 本土 |
| 359 | Bembras japonica | 日本紅鯒 | 海水 | 本土 |
| 394 | Brachypterois serrulata | 鋸棱短棘蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 584 | Chelidonichthys kumu | 綠鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 585 | Chelidonichthys spinosus | 棘綠鰭魚 | 海水 | 本土 |
| 615 | Choridactylus multibarbus | 多須多指鮋 | 海水 | 本土 |
| 695 | Cociella crocodilus | 鱷鯒 | 海水 | 本土 |
| 742 | Cottapistus cottoides | 細鱗項鰭鮋 | 海水 | 本土 |
| 856 | Dendrochirus bellus | 美麗短鰭蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 857 | Dendrochirus zebra | 花斑短鰭蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 947 | Ebosia bleekeri | 布氏盔蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 1025 | Erisphex pottii | 虻鮋(蜂鮋) | 海水 | 本土 |
| 1027 | Erosa erosa | 獅頭毒鮋 | 海水 | 本土 |
| 1091 | Gargariscus prionocephalus | 輪頭魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 1221 | Grammoplites knappi | 克氏棘線鯒 | 海水 | 本土 |
| 1306 | Helicolenus hilgendorfii | 赫氏無鰾鮋 | 海水 | 本土 |
| 1421 | Hoplichthys gilberti | 吉氏棘鯒 | 海水 | 本土 |
| 1422 | Hoplichthys langsdorfii | 藍氏棘鯒 | 海水 | 本土 |
| 1424 | Hoplosebastes armatus | 棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 1460 | Inegocia japonica | 日本瞳鯒 | 海水 | 本土 |
| 1461 | Inegocia ochiaii | 落合氏瞳鯒 | 海水 | 本土 |
| 1467 | Inimicus cuvieri | 居氏鬼鮋 | 海水 | 本土 |
| 1468 | Inimicus didactylus | 雙指鬼鮋 | 海水 | 本土 |
| 1469 | Inimicus japonicus | 日本鬼鮋 | 海水 | 本土 |
| 1470 | Inimicus sinensis | 中華鬼鮋 | 海水 | 本土 |
| 1471 | Iracundus signifer | 南非紀鮋 | 海水 | 本土 |
| 1501 | Kumococius rodericensis | 凹鰭鯒 | 海水 | 本土 |
| 1556 | Lepidotrigla abyssalis | 深海紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1557 | Lepidotrigla guentheri | 貢氏紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1558 | Lepidotrigla hime | 姬紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1559 | Lepidotrigla japonica | 日本紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1560 | Lepidotrigla kishinouyi | 岸上紅娘魚(尖棘紅娘魚) | 海水 | 本土 |
| 1561 | Lepidotrigla longifaciata | 長頭紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1562 | Lepidotrigla longimana | 長指紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1563 | Lepidotrigla microptera | 小鰭紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1564 | Lepidotrigla spiloptera | 圓吻紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 1664 | Lythrichthys longimanus | 長臂囊頭鮋 | 海水 | 本土 |
| 1746 | Minous monodactylus | 單指虎鮋 | 海水 | 本土 |
| 1877 | Neosebastes entaxis | 長鰭新平鮋 | 海水 | 本土 |
| 1927 | Onigocia macrolepis | 大鱗鱗鯒 | 海水 | 本土 |
| 2057 | Parabembras curta | 短鯒 | 海水 | 本土 |
| 2073 | Paracentropogon longispinis | 長棘擬鱗鮋 | 海水 | 本土 |
| 2119 | Parapterois heterura | 異尾擬蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 2125 | Parascorpaena aurita | 金圓鱗鮋 | 海水 | 本土 |
| 2126 | Parascorpaena mcadamsi | 斑鰭圓鱗鮋 | 海水 | 本土 |
| 2196 | Peristedion orientale | 東方黃魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2201 | Phenacoscorpius megalops | 菲律賓偽大眼鮋 | 海水 | 本土 |
| 2239 | Platycephalus cultellatus | 刀鯒 | 海水 | 本土 |
| 2240 | Platycephalus indicus | 鯒(印度鯒) | 海水 | 本土 |
| 2260 | Plectrogenium nanum | 太平洋平頭鮋 | 海水 | 本土 |
| 2310 | Pontinus tentacularis | 觸手冠海鮋 | 海水 | 本土 |
| 2489 | Pteroidichthys amboinensis | 安汶狹蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 2490 | Pteroidichthys noronhai | 諾氏狹蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 2491 | Pterois antennata | 觸角蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 2492 | Pterois radiata | 輻紋蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 2493 | Pterois russelii | 勒氏蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 2494 | Pterois volitans | 魔鬼蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 2497 | Pterygotrigla hemisticta | 尖棘角魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2498 | Pterygotrigla macrorhynchus | 長吻角魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2499 | Pterygotrigla multiocellata | 多斑角魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2500 | Pterygotrigla ryukyuensis | 琉球角魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2536 | Ratabulus megacephalus | 犬牙鯒 | 海水 | 本土 |
| 2615 | Rhinopias frondosa | 前鰭吻鮋 | 海水 | 本土 |
| 2640 | Richardsonichthys leucogaster | 理查森胎䲁 | 海水 | 本土 |
| 2642 | Rogadius asper | 倒棘鯒 | 海水 | 本土 |
| 2696 | Satyrichthys rieffeli | 瑞氏紅魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2697 | Satyrichthys welchi | 魏氏紅魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2714 | Scalicus amiscus | 須叉吻魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2715 | Scalicus orientalis | 東方叉吻魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 2869 | Scorpaena hatizyoensis | 冠棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 2870 | Scorpaena izensis | 伊豆鮋 | 海水 | 本土 |
| 2871 | Scorpaena neglecta | 斑鰭鮋 | 海水 | 本土 |
| 2872 | Scorpaenodes guamensis | 關島小鮋 | 海水 | 本土 |
| 2873 | Scorpaenodes scaber | 長棘小鮋 | 海水 | 本土 |
| 2874 | Scorpaenodes smithi | 史氏小鮋 | 海水 | 本土 |
| 2875 | Scorpaenopsis cirrosa | 須擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 2876 | Scorpaenopsis neglecta | 魔擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 2877 | Scorpaenopsis ramaraoi | 拉氏擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 2881 | Sebastapistes cyanostigma | 黃斑鱗頭鮋 | 海水 | 本土 |
| 2882 | Sebastapistes nuchalis | 花腋鱗頭鮋 | 海水 | 本土 |
| 2883 | Sebastes pachycephalus | 厚頭平鮋 | 海水 | 本土 |
| 2884 | Sebastes schlegelii | 許氏平鮋 | 海水 | 本土 |
| 2885 | Sebastiscus marmoratus | 褐菖鮋 | 海水 | 本土 |
| 2886 | Sebastiscus tertius | 三色菖鮋 | 海水 | 本土 |
| 2899 | Setarches guentheri | 根室氏囊頭鮋 | 海水 | 本土 |
| 3048 | Snyderina yamanokami | 大眼斯氏前鰭鮋 | 海水 | 本土 |
| 3053 | Sorsogona tuberculata | 瘤眶棘鯒 | 海水 | 本土 |
| 3110 | Sthenopus mollis | 發鮋 | 海水 | 本土 |
| 3128 | Suggrundus meerdervoortii | 大眼鯒 | 海水 | 本土 |
| 3134 | Synanceia horrida | 毒鮋 | 海水 | 本土 |
| 3135 | Synanceia verrucosa | 玫瑰毒鮋 | 海水 | 本土 |
| 3165 | Taenianotus triacanthus | 三棘帶鮋 | 海水 | 本土 |
| 3235 | Thysanichthys crossotus | 皮須繸鮋 | 海水 | 本土 |
| 3254 | Trachicephalus uranoscopus | 瞻星粗頭鮋 | 海水 | 本土 |
| 3474 | Vespicula trachinoides | 粗高鰭鮋 | 海水 | 本土 |
| 3559 | Ablabys gymnothorax | 裸胸帆鰭鮋 | 海水 | 本土 |
| 3560 | Ablabys taenianotus | 背帶帆鰭鮋 | 海水 | 本土 |
| 3748 | Caracanthus maculatus | 斑點頭棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 3749 | Caracanthus unipinna | 橢圓頭棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 3856 | Cociella punctata | 點斑鱷鯒 | 海水 | 本土 |
| 3892 | Cymbacephalus beauforti | 博氏孔鯒 | 海水 | 本土 |
| 3907 | Dendrochirus biocellatus | 雙眼斑短鰭蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 3948 | Ectreposebastes imus | 無鰾黑鮋 | 海水 | 本土 |
| 4013 | Erisphex simplex | 平滑虻鮋 | 海水 | 本土 |
| 4098 | Grammoplites scaber | 橫帶棘線鯒 | 海水 | 本土 |
| 4175 | Hoplichthys fasciatus | 黃帶棘鯒 | 海水 | 本土 |
| 4176 | Hoplichthys regani | 長指棘鯒(雷氏棘鯒) | 海水 | 本土 |
| 4232 | Lepidotrigla alata | 翼紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 4233 | Lepidotrigla lepidojugulata | 鱗胸紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 4234 | Lepidotrigla oglina | 大眼紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 4235 | Lepidotrigla punctipectoralis | 斑鰭紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 4278 | Lythrichthys cypho | 海水 | 本土 | |
| 4279 | Lythrichthys eulabes | 海水 | 本土 | |
| 4306 | Minous coccineus | 獨指虎鮋 | 海水 | 本土 |
| 4307 | Minous inermis | 無備虎鮋 | 海水 | 本土 |
| 4308 | Minous pusillus | 絲棘虎鮋 | 海水 | 本土 |
| 4309 | Minous quincarinatus | 五脊虎鮋 | 海水 | 本土 |
| 4310 | Minous radiatus | 輻趾虎鮋 | 海水 | 本土 |
| 4311 | Minous trachycephalus | 粗首虎鮋 | 海水 | 本土 |
| 4351 | Neocentropogon japonicus | 日本新鱗鮋 | 海水 | 本土 |
| 4355 | Neomerinthe erostris | 鈍吻新棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 4356 | Neomerinthe megalepis | 大鱗新棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 4357 | Neomerinthe procurva | 曲背新棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 4369 | Ocosia fasciata | 條紋線鮋 | 海水 | 本土 |
| 4370 | Ocosia spinosa | 棘線鮋 | 海水 | 本土 |
| 4371 | Ocosia vespa | 裸線鮋 | 海水 | 本土 |
| 4385 | Onigocia spinosa | 鋸齒鱗鯒 | 海水 | 本土 |
| 4467 | Paraploactis kagoshimensis | 鹿兒島絨棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 4478 | Parascorpaena mossambica | 莫桑比克圓鱗鮋 | 海水 | 本土 |
| 4494 | Peristedion nierstraszi | 黑帶黃魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 4569 | Pontinus macrocephalus | 大頭海鮋 | 海水 | 本土 |
| 4633 | Pterois lunulata | 環紋蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 4634 | Pterois mombasae | 黑頰蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 4635 | Pterois paucispinula | 少棘蓑鮋 | 海水 | 本土 |
| 4663 | Rogadius patriciae | 派氏倒棘鯒 | 海水 | 本土 |
| 4671 | Satyrichthys laticeps | 闊頭紅魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 4672 | Satyrichthys milleri | 米勒氏魴鮄 | 海水 | 本土 |
| 4690 | Scorpaena miostoma | 小口鮋 | 海水 | 本土 |
| 4691 | Scorpaena onaria | 後頜鮋 | 海水 | 本土 |
| 4692 | Scorpaena pepo | 南瓜鮋 | 海水 | 本土 |
| 4693 | Scorpaenodes albaiensis | 長鰭小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4694 | Scorpaenodes evides | 日本小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4695 | Scorpaenodes hirsutus | 少鱗小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4696 | Scorpaenodes kelloggi | 克氏小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4697 | Scorpaenodes minor | 正小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4698 | Scorpaenodes parvipinnis | 短翅小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4699 | Scorpaenodes quadrispinosus | 四棘小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4700 | Scorpaenodes varipinnis | 花翅小鮋 | 海水 | 本土 |
| 4701 | Scorpaenopsis diabolus | 毒擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 4702 | Scorpaenopsis obtusa | 鈍吻擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 4703 | Scorpaenopsis oxycephalus | 尖頭石狗公 | 海水 | 本土 |
| 4704 | Scorpaenopsis venosa | 枕脊擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 4705 | Scorpaenopsis vittapinna | 紋鰭擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 4706 | Sebastapistes strongia | 眉須鱗頭鮋 | 海水 | 本土 |
| 4707 | Sebastes joyneri | 焦氏平鮋 | 海水 | 本土 |
| 4708 | Sebastiscus albofasciatus | 白斑菖鮋 | 海水 | 本土 |
| 4752 | Suggrundus macracanthus | 大棘大眼鯒 | 海水 | 本土 |
| 4753 | Sunagocia arenicola | 沙棲蘇納鯒 | 海水 | 本土 |
| 4754 | Sunagocia otaitensis | 粒唇蘇納鯒 | 海水 | 本土 |
| 4795 | Thysanophrys celebica | 西里伯斯繸鯒 | 海水 | 本土 |
| 4796 | Thysanophrys chiltonae | 窄眶繸鯒 | 海水 | 本土 |
| 4797 | Thysanophrys longirostris | 長吻繸鯒 | 海水 | 本土 |
| 4879 | Inimicus brachyrhynchus | 短吻鬼鮋 | 海水 | 本土 |
| 4885 | Lepidotrigla kanagashira | 尖鰭紅娘魚 | 海水 | 本土 |
| 4895 | Paracentropogon rubripinnis | 紅鰭擬鱗鮋 | 海水 | 本土 |
| 4897 | Paraploactis hongkongiensis | 香港絨棘鮋 | 海水 | 本土 |
| 4908 | Scorpaenopsis macrochir | 大手擬鮋 | 海水 | 本土 |
| 鱸形目鮨亞目 Perciformes/Serranoidei | ||||
| 105 | Aethaloperca rogaa | 紅嘴煙鱸 | 海水 | 本土 |
| 201 | Anyperodon leucogrammicus | 白線光齶鱸 | 海水 | 本土 |
| 276 | Aulacocephalus temminckii | 特氏紫鱸 | 海水 | 本土 |
| 501 | Cephalopholis argus | 斑點九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 502 | Cephalopholis aurantia | 橙點九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 503 | Cephalopholis boenak | 橫紋九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 504 | Cephalopholis formosa | 藍線九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 505 | Cephalopholis leopardus | 豹紋九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 506 | Cephalopholis miniata | 青星九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 507 | Cephalopholis sonnerati | 索氏九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 508 | Cephalopholis urodeta | 尾紋九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 586 | Chelidoperca hirundinacea | 燕赤鮨 | 海水 | 本土 |
| 587 | Chelidoperca margaritifera | 珠赤鮨 | 海水 | 本土 |
| 588 | Chelidoperca pleurospilus | 側斑赤鮨 | 海水 | 本土 |
| 589 | Chelidoperca stella | 海水 | 本土 | |
| 618 | Chromileptes altivelis | 駝背鱸 | 海水 | 本土 |
| 902 | Diploprion bifasciatum | 雙帶黃鱸 | 海水 | 本土 |
| 985 | Epinephelus akaara | 赤點石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 986 | Epinephelus amblycephalus | 鑲點石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 987 | Epinephelus areolatus | 寶石石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 988 | Epinephelus awoara | 青石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 989 | Epinephelus bleekeri | 布氏石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 990 | Epinephelus bruneus | 褐帶石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 991 | Epinephelus coioides | 點帶石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 992 | Epinephelus corallicola | 珊瑚石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 993 | Epinephelus craigi | 海水 | 本土 | |
| 994 | Epinephelus cyanopodus | 藍鰭石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 995 | Epinephelus epistictus | 小紋石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 996 | Epinephelus fasciatomaculosus | 帶點石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 997 | Epinephelus fasciatus | 橫條石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 998 | Epinephelus fuscoguttatus | 棕點石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 999 | Epinephelus heniochus | 頰條石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1000 | Epinephelus hexagonatus | 六角石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1001 | Epinephelus lanceolatus | 鞍帶石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1002 | Epinephelus latifasciatus | 寬帶石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1003 | Epinephelus longispinis | 長棘石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1004 | Epinephelus macrospilos | 大斑石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1005 | Epinephelus maculatus | 花點石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1006 | Epinephelus malabaricus | 瑪拉巴石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1007 | Epinephelus merra | 蜂巢石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1008 | Epinephelus morrhua | 弧紋石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1009 | Epinephelus poecilonotus | 琉璃石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1010 | Epinephelus polyphekadion | 清水石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1011 | Epinephelus quoyanus | 玳瑁石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1012 | Epinephelus retouti | 雷拖氏石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1013 | Epinephelus rivulatus | 霜點石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1014 | Epinephelus spilotoceps | 吻斑石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1015 | Epinephelus stictus | 南海石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1016 | Epinephelus summana | 白星石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1017 | Epinephelus tauvina | 巨石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1018 | Epinephelus trimaculatus | 三斑石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1019 | Epinephelus undulosus | 波紋石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 1216 | Gracila albomarginata | 白邊纖齒鱸 | 海水 | 本土 |
| 1219 | Grammistes sexlineatus | 六帶線紋魚 | 海水 | 本土 |
| 1449 | Hyporthodus octofasciatus | 八帶下美鮨 | 海水 | 本土 |
| 1450 | Hyporthodus septemfasciatus | 七帶下美鮨 | 海水 | 本土 |
| 1747 | Mirolabrichthys pascalus | 紫紅擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 1748 | Mirolabrichthys tuka | 靜擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 2259 | Plectranthias japonicus | 日本棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 2264 | Plectropomus areolatus | 藍點鰓棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2265 | Plectropomus laevis | 黑鞍鰓棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2266 | Plectropomus leopardus | 豹紋鰓棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2267 | Plectropomus oligacanthus | 點線鰓棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 2281 | Pogonoperca ocellata | 眼斑須鮨 | 海水 | 本土 |
| 2282 | Pogonoperca punctata | 斑點須鮨 | 海水 | 本土 |
| 2367 | Pseudanthias cichlops | 麗擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 2368 | Pseudanthias squamipinnis | 絲鰭擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 2652 | Sacura margaritacea | 珠櫻鮨 | 海水 | 本土 |
| 2658 | Saloptia powelli | 鮑氏澤鮨 | 海水 | 本土 |
| 2891 | Selenanthias analis | 臀斑月花鮨 | 海水 | 本土 |
| 3246 | Tosana niwae | 姬鮨 | 海水 | 本土 |
| 3413 | Triso dermopterus | 鳶鮨(細鱗三棱鱸) | 海水 | 本土 |
| 3467 | Variola louti | 側牙鱸 | 海水 | 本土 |
| 3635 | Aporops bilinearis | 雙線少孔紋鯛 | 海水 | 本土 |
| 3685 | Belonoperca chabanaudi | 查氏鱵鱸 | 海水 | 本土 |
| 3747 | Caprodon schlegelii | 許氏菱牙鮨 | 海水 | 本土 |
| 3770 | Cephalopholis igarashiensis | 七帶九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 3771 | Cephalopholis sexmaculata | 六斑九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 3772 | Cephalopholis spiloparaea | 黑緣尾九棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 3812 | Chelidoperca formosa | 台灣赤鮨 | 海水 | 特有種 |
| 3813 | Chelidoperca santosi | 桑氏赤鮨 | 海水 | 本土 |
| 3994 | Epinephelus bontoides | 點列石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 3995 | Epinephelus coeruleopunctatus | 螢點石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 3996 | Epinephelus kupangensis | 海水 | 本土 | |
| 3997 | Epinephelus melanostigma | 黑斑石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 3998 | Epinephelus ongus | 紋波石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 3999 | Epinephelus radiatus | 雲紋石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 4000 | Epinephelus tukula | 藍身大石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 4072 | Giganthias immaculatus | 桃紅巨花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4206 | Jeboehlkia gladifer | 加勒比傑氏線紋魚 | 海水 | 本土 |
| 4258 | Liopropoma aragai | 荒賀氏長鱸 | 海水 | 本土 |
| 4259 | Liopropoma dorsoluteum | 黃背長鱸 | 海水 | 本土 |
| 4260 | Liopropoma erythraeum | 黑緣長鱸 | 海水 | 本土 |
| 4261 | Liopropoma japonicum | 日本長鱸 | 海水 | 本土 |
| 4262 | Liopropoma latifasciatum | 寬帶長鱸 | 海水 | 本土 |
| 4263 | Liopropoma lunulatum | 新月長鱸 | 海水 | 本土 |
| 4264 | Liopropoma susumi | 孫氏長鱸 | 海水 | 本土 |
| 4344 | Nemanthias bicolor | 海水 | 本土 | |
| 4345 | Nemanthias dispar | 海水 | 本土 | |
| 4372 | Odontanthias borbonius | 黃斑牙花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4373 | Odontanthias katayamai | 片山氏牙花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4374 | Odontanthias rhodopeplus | 紅衣牙花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4375 | Odontanthias unimaculatus | 單斑牙花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4516 | Plectranthias anthioides | 擬棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4517 | Plectranthias elongatus | 長身棘花鱸 | 海水 | 本土 |
| 4518 | Plectranthias helenae | 海氏棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4519 | Plectranthias kamii | 黃吻棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4520 | Plectranthias kelloggi | 凱氏棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4521 | Plectranthias longimanus | 銀點棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4522 | Plectranthias nanus | 短棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4523 | Plectranthias purpuralepis | 紫鱗棘花鱸 | 海水 | 特有種 |
| 4524 | Plectranthias randalli | 倫氏棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4525 | Plectranthias sheni | 沈氏棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4526 | Plectranthias wheeleri | 威氏棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4527 | Plectranthias whiteheadi | 懷特棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4528 | Plectranthias xanthomaculatus | 黃斑棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4529 | Plectranthias yamakawai | 山川氏棘花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4538 | Plectropomus maculatus | 斑鰓棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 4597 | Pseudanthias cooperi | 鋸鰓擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4598 | Pseudanthias elongatus | 長擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4599 | Pseudanthias fasciatus | 條紋擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4600 | Pseudanthias hypselosoma | 高體擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4601 | Pseudanthias luzonensis | 呂宋擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4602 | Pseudanthias pleurotaenia | 側帶擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4603 | Pseudanthias rubrizonatus | 紅帶擬花鮨 | 海水 | 本土 |
| 4619 | Pseudogramma brederi | 海水 | 本土 | |
| 4620 | Pseudogramma polyacantha | 多棘擬線鱸 | 海水 | 本土 |
| 4709 | Serranocirrhitus latus | 伊豆鮨 | 海水 | 本土 |
| 4827 | Variola albimarginata | 白邊側牙鱸 | 海水 | 本土 |
| 4870 | Epinephelus diacanthus | 雙棘石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 4871 | Epinephelus howlandi | 荷氏石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 4872 | Epinephelus polylepis | 多鱗石斑魚 | 海水 | 本土 |
| 4901 | Plectropomus pessuliferus | 蠕線鰓棘鱸 | 海水 | 本土 |
| 鱸形目鰧亞目 Perciformes/Uranoscopoidei | ||||
| 154 | Ammodytes personatus | 太平洋玉筋魚 | 海水 | 本土 |
| 2096 | Parapercis aurantiaca | 黃擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2097 | Parapercis clathrata | 四斑擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2098 | Parapercis cylindrica | 圓擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2099 | Parapercis filamentosa | 長鰭擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2100 | Parapercis hexophtalma | 六睛擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2101 | Parapercis kentingensis | 墾丁擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2102 | Parapercis millepunctata | 雪點擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2103 | Parapercis ommatura | 眼斑擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2104 | Parapercis pacifica | 太平洋擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2105 | Parapercis sexfasciata | 六帶擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2106 | Parapercis snyderi | 史氏擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2107 | Parapercis striolata | 斑棘擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 2108 | Parapercis xanthozona | 黃紋擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 3431 | Uranoscopus affinis | 紫鰧 | 海水 | 本土 |
| 3432 | Uranoscopus bicinctus | 雙斑鰧 | 海水 | 本土 |
| 3433 | Uranoscopus chinensis | 中華鰧 | 海水 | 本土 |
| 3434 | Uranoscopus japonicus | 日本鰧 | 海水 | 本土 |
| 3435 | Uranoscopus oligolepis | 少鱗鰧 | 海水 | 本土 |
| 3436 | Uranoscopus tosae | 土佐鰧 | 海水 | 本土 |
| 3485 | Xenocephalus elongatus | 青奇頭鰧 | 海水 | 本土 |
| 3690 | Bleekeria mitsukurii | 箕作布氏筋魚 | 海水 | 本土 |
| 3691 | Bleekeria viridianguilla | 綠鰻布氏筋魚 | 海水 | 本土 |
| 4187 | Ichthyscopus pollicaris | 東方披肩鰧 | 海水 | 本土 |
| 4214 | Kochichthys flavofasciatus | 黃帶高知鱸 | 海水 | 本土 |
| 4451 | Parapercis decemfasciata | 十橫斑擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4452 | Parapercis dongshaensis | 東沙擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4453 | Parapercis kamoharai | 蒲原氏擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4454 | Parapercis lutevittata | 黃斑擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4455 | Parapercis macrophthalma | 大眼擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4456 | Parapercis moki | 莫氏擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4457 | Parapercis multifasciata | 多帶擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4458 | Parapercis muronis | 鞍帶擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4459 | Parapercis okamurai | 岡村氏擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4460 | Parapercis pulchella | 美擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4461 | Parapercis randalli | 蘭道氏擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4462 | Parapercis rubromaculata | 紅點擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4463 | Parapercis schauinslandii | 玫瑰擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4464 | Parapercis shaoi | 邵氏擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4465 | Parapercis tetracantha | 斑紋擬鱸 | 海水 | 本土 |
| 4589 | Protammodytes brachistos | 短身原玉筋魚 | 海水 | 本土 |
| 4878 | Ichthyscopus sannio | 丑披肩鰧 | 海水 | 本土 |
| 4919 | Uranoscopus kishimotoi | 岸本鰧 | 海水 | 本土 |
| 鱸形目綿䲁亞目 Perciformes/Zoarcoidei | ||||
| 118 | Alectrias benjamini | 綠雞冠䲁 | 海水 | 本土 |
| 601 | Chirolophis japonicus | 日本笠䲁 | 海水 | 本土 |
| 602 | Chirolophis wui | 伍氏笠䲁 | 海水 | 本土 |
| 895 | Dictyosoma burgeri | 伯氏網䲁 | 海水 | 本土 |
| 1026 | Ernogrammus hexagrammus | 六線䲁 | 海水 | 本土 |
| 2202 | Pholis crassispina | 粗棘錦䲁 | 海水 | 本土 |
| 2203 | Pholis fangi | 方氏錦䲁 | 海水 | 本土 |
| 3554 | Zoarces elongatus | 長綿䲁 | 海水 | 本土 |
| 3555 | Zoarces gillii | 吉氏綿䲁 | 海水 | 本土 |
| 3556 | Zoarchias microstomus | 短頜小綿䲁 | 海水 | 本土 |
| 3557 | Zoarchias uchidai | 內田小綿䲁 | 海水 | 本土 |
| 七鰓鰻目 Petromyzontiformes | ||||
| 1043 | Eudontomyzon morii | 東北雙齒七鰓鰻 | 淡水 | 本土 |
| 1589 | Lethenteron camtschaticum | 東亞叉牙七鰓鰻 | 淡水 | 本土 |
| 1590 | Lethenteron reissneri | 雷氏叉牙七鰓鰻 | 淡水 | 本土 |
| 鰈形目 Pleuronectiformes | ||||
| 104 | Aesopia cornuta | 角鰨 | 海水 | 本土 |
| 243 | Arnoglossus japonicus | 日本羊舌鮃 | 海水 | 本土 |
| 244 | Arnoglossus macrolophus | 長冠羊舌鮃 | 海水 | 本土 |
| 245 | Arnoglossus polyspilus | 多斑羊舌鮃 | 海水 | 本土 |
| 246 | Arnoglossus scapha | 大羊舌鮃 | 海水 | 本土 |
| 247 | Arnoglossus tapeinosoma | 長鰭羊舌鮃 | 海水 | 本土 |
| 248 | Arnoglossus tenuis | 細羊舌鮃 | 海水 | 本土 |
| 255 | Aseraggodes dubius | 杜比櫛鱗鰨 | 海水 | 本土 |
| 256 | Aseraggodes kaianus | 日本櫛鱗鰨 | 海水 | 本土 |
| 257 | Aseraggodes kobensis | 褐斑櫛鱗鰨 | 海水 | 本土 |
| 261 | Asterorhombus intermedius | 中間角鮃 | 海水 | 本土 |
| 384 | Bothus assimilis | 圓鱗鮃 | 海水 | 本土 |
| 385 | Bothus mancus | 凹吻鮃 | 海水 | 本土 |
| 386 | Bothus myriaster | 繁星鮃 | 海水 | 本土 |
| 387 | Bothus pantherinus | 豹紋鮃 | 海水 | 本土 |
| 389 | Brachirus orientalis | 東方寬箬鰨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 390 | Brachirus pan | 恆河寬箬鰨 | 海水 | 本土 |
| 393 | Brachypleura novaezeelandiae | 新西蘭短鰈 | 海水 | 本土 |
| 565 | Chascanopsetta lugubris | 大口長頜鮃 | 海水 | 本土 |
| 653 | Citharoides macrolepidotus | 菲律賓擬棘鮃 | 海水 | 本土 |
| 661 | Cleisthenes pinetorum | 松木高眼鰈 | 海水 | 本土 |
| 662 | Clidoderma asperrimum | 粒鰈 | 海水 | 本土 |
| 759 | Crossorhombus azureus | 青纓鮃 | 海水 | 本土 |
| 760 | Crossorhombus kobensis | 高本纓鮃 | 海水 | 本土 |
| 761 | Crossorhombus valderostratus | 寬額青纓鮃 | 海水 | 本土 |
| 791 | Cynoglossus abbreviatus | 短舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 792 | Cynoglossus arel | 印度舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 793 | Cynoglossus bilineatus | 雙線舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 794 | Cynoglossus gracilis | 窄體舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 795 | Cynoglossus interruptus | 斷線舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 796 | Cynoglossus itinus | 單孔舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 797 | Cynoglossus joyneri | 焦氏舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 798 | Cynoglossus kopsii | 格氏舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 799 | Cynoglossus lighti | 長吻舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 800 | Cynoglossus lineolatus | 線紋舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 801 | Cynoglossus macrolepidotus | 巨鱗舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 802 | Cynoglossus melampetalus | 黑尾舌鰨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 803 | Cynoglossus nanhaiensis | 南海舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 804 | Cynoglossus nigropinnatus | 黑鰭舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 805 | Cynoglossus oligolepis | 寡鱗舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 806 | Cynoglossus puncticeps | 斑頭舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 807 | Cynoglossus purpureomaculatus | 紫斑舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 808 | Cynoglossus robustus | 寬體舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 809 | Cynoglossus roulei | 黑鰓舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 810 | Cynoglossus semilaevis | 半滑舌鰨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 811 | Cynoglossus sibogae | 西寶舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 812 | Cynoglossus sinicus | 中華舌鰨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 813 | Cynoglossus trigrammus | 三線舌鰨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 814 | Cynoglossus trulla | 盤狀舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 972 | Engyprosopon filipennis | 長鰭短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 973 | Engyprosopon grandisquama | 偉鱗短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 974 | Engyprosopon latifrons | 寬額短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 975 | Engyprosopon longipelvis | 長腹鰭短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 976 | Engyprosopon mogkii | 黑斑短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 977 | Engyprosopon multisquama | 多鱗短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 982 | Eopsetta grigorjewi | 格氏蟲鰈 | 海水 | 本土 |
| 1133 | Glyptocephalus kitaharae | 長鰈 | 海水 | 本土 |
| 1217 | Grammatobothus polyophthalmus | 多眼雙線鮃 | 海水 | 本土 |
| 1366 | Heteromycteris japonicus | 日本鈎嘴鰨 | 海水 | 本土 |
| 1367 | Heteromycteris matsubarai | 松原氏鈎嘴鰨 | 海水 | 本土 |
| 1387 | Hippoglossoides dubius | 犬形擬庸鰈 | 海水 | 本土 |
| 1519 | Laeops kitaharae | 北原氏左鮃 | 海水 | 本土 |
| 1520 | Laeops lanceolata | 矛狀左鮃 | 海水 | 本土 |
| 1521 | Laeops parviceps | 小頭左鮃 | 海水 | 本土 |
| 1551 | Lepidoblepharon ophthalmolepis | 鱗眼鮃 | 海水 | 本土 |
| 1606 | Liachirus melanospilos | 黑斑圓鱗鰨 | 海水 | 本土 |
| 1744 | Microstomus achne | 亞洲油鰈 | 海水 | 本土 |
| 1757 | Monochirus trichodactylus | 毛鰭單臂鰨 | 海水 | 本土 |
| 1850 | Neolaeops microphthalmus | 小眼新左鮃 | 海水 | 本土 |
| 2058 | Parabothus coarctatus | 短腹擬鮃 | 海水 | 本土 |
| 2089 | Paralichthys olivaceus | 牙鮃 | 海水 | 本土 |
| 2109 | Paraplagusia bilineata | 雙線須鰨 | 海水 | 本土 |
| 2110 | Paraplagusia guttata | 櫛鱗須鰨 | 海水 | 本土 |
| 2111 | Paraplagusia japonica | 日本須鰨 | 海水 | 本土 |
| 2142 | Pardachirus pavoninus | 眼斑豹鰨 | 海水 | 本土 |
| 2224 | Plagiopsetta glossa | 舌形斜頜鰈 | 海水 | 本土 |
| 2236 | Platichthys bicoloratus | 石鰈 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2237 | Platichthys stellatus | 星斑川鰈 | 海水 | 本土 |
| 2272 | Pleuronichthys cornutus | 木葉鰈 | 海水 | 本土 |
| 2273 | Pleuronichthys lighti | 海水 | 本土 | |
| 2277 | Poecilopsetta colorata | 黑斑瓦鰈 | 海水 | 本土 |
| 2278 | Poecilopsetta plinthus | 雙斑瓦鰈 | 海水 | 本土 |
| 2279 | Poecilopsetta praelonga | 長體瓦鰈 | 海水 | 本土 |
| 2363 | Psettina filimana | 絲指鰜鮃 | 海水 | 本土 |
| 2364 | Psettina hainanensis | 海南鰜鮃 | 海水 | 本土 |
| 2365 | Psettina iijimae | 飯島氏鰜鮃 | 海水 | 本土 |
| 2366 | Psettodes erumei | 大口鰜 | 海水 | 本土 |
| 2455 | Pseudopleuronectes herzensteini | 赫氏鰈(尖吻黃蓋鰈) | 海水 | 本土 |
| 2456 | Pseudopleuronectes obscurus | 暗色擬鰈 | 海水 | 本土 |
| 2457 | Pseudopleuronectes yokohamae | 鈍吻擬鰈 | 海水 | 本土 |
| 2462 | Pseudorhombus arsius | 大齒斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2463 | Pseudorhombus cinnamoneus | 桂皮斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2464 | Pseudorhombus dupliciocellatus | 雙瞳斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2465 | Pseudorhombus elevatus | 高體斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2466 | Pseudorhombus javanicus | 爪哇斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2467 | Pseudorhombus levisquamis | 圓鱗斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2468 | Pseudorhombus malayanus | 馬來斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2469 | Pseudorhombus neglectus | 南海斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2470 | Pseudorhombus oligodon | 少牙斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2471 | Pseudorhombus pentophthalmus | 五眼斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2472 | Pseudorhombus quinquocellatus | 五目斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 2661 | Samaris cristatus | 冠鰈 | 海水 | 本土 |
| 2662 | Samariscus filipectoralis | 絲鰭沙鰈 | 海水 | 本土 |
| 2663 | Samariscus huysmani | 胡氏沙鰈 | 海水 | 本土 |
| 2664 | Samariscus latus | 滿月沙鰈 | 海水 | 本土 |
| 3049 | Solea ovata | 卵鰨 | 海水 | 本土 |
| 3132 | Symphurus orientalis | 東方無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 3195 | Tarphops oligolepis | 高體大鱗鮃 | 海水 | 本土 |
| 3200 | Tephrinectes sinensis | 花鮃 | 海水 | 本土 |
| 3472 | Verasper moseri | 條斑星鰈 | 海水 | 本土 |
| 3473 | Verasper variegatus | 圓斑星鰈 | 海水 | 本土 |
| 3545 | Zebrias crossolepis | 纓鱗條鰨 | 海水 | 本土 |
| 3546 | Zebrias japonica | 日本條鰨 | 海水 | 本土 |
| 3547 | Zebrias quagga | 峨嵋條鰨 | 海水 | 本土 |
| 3548 | Zebrias zebra | 條鰨 | 海水 | 本土 |
| 3641 | Arnoglossus aspilos | 無斑羊舌鮃 | 海水 | 本土 |
| 3645 | Aseraggodes cheni | 陳氏櫛鱗鰨 | 海水 | 本土 |
| 3646 | Aseraggodes orientalis | 東方櫛鱗鰨 | 海水 | 本土 |
| 3647 | Aseraggodes xenicus | 外來櫛鱗鰨 | 海水 | 本土 |
| 3708 | Brachirus annularis | 雲斑寬箬鰨 | 海水 | 本土 |
| 3709 | Brachirus aspilos | 盾寬箬鰨 | 海水 | 本土 |
| 3882 | Crossorhombus howensis | 霍文纓鮃 | 海水 | 本土 |
| 3883 | Crossorhombus kanekonis | 雙帶纓鮃 | 海水 | 本土 |
| 3894 | Cynoglossus lida | 南洋舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 3895 | Cynoglossus suyeni | 書顏舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 3961 | Engyprosopon brevifrontale | 窄額短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 3962 | Engyprosopon keliaoense | 蚵寮短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 3963 | Engyprosopon macrolepis | 大鱗短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 3964 | Engyprosopon maldivense | 馬爾代夫短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 3965 | Engyprosopon mozambiquense | 莫桑比克短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 3966 | Engyprosopon parvipectorale | 海水 | 本土 | |
| 3967 | Engyprosopon xystrias | 光短額鮃 | 海水 | 本土 |
| 4097 | Grammatobothus krempfi | 克氏雙線鮃 | 海水 | 本土 |
| 4204 | Japonolaeops dentatus | 多齒日本左鮃 | 海水 | 本土 |
| 4209 | Kamoharaia megastoma | 大嘴鱷口鮃 | 海水 | 本土 |
| 4223 | Laeops clarus | 光耀左鮃 | 海水 | 本土 |
| 4436 | Parabothus taiwanensis | 台灣擬鮃 | 海水 | 本土 |
| 4466 | Paraplagusia blochii | 布氏須鰨 | 海水 | 本土 |
| 4591 | Psettina gigantea | 長鰜鮃 | 海水 | 本土 |
| 4592 | Psettina tosana | 土佐鰜鮃 | 海水 | 本土 |
| 4624 | Pseudorhombus ctenosquamis | 櫛鱗斑鮃 | 海水 | 本土 |
| 4665 | Samariscus longimanus | 長臂沙鰈 | 海水 | 本土 |
| 4666 | Samariscus triocellatus | 三斑沙鰈 | 海水 | 本土 |
| 4724 | Soleichthys heterorhinos | 異吻長鼻鰨 | 海水 | 本土 |
| 4755 | Symphurus hongae | 洪氏無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 4756 | Symphurus leucochilus | 白邊無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 4757 | Symphurus megasomus | 巨體無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 4758 | Symphurus multimaculatus | 多斑無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 4759 | Symphurus novemfasciatus | 九帶無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 4760 | Symphurus oxyrhynchus | 尖吻無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 4761 | Symphurus strictus | 多線無線鰨 | 海水 | 本土 |
| 4846 | Zebrias fasciatus | 線紋條鰨 | 海水 | 本土 |
| 4856 | Brachirus swinhonis | 斯氏寬箬鰨 | 海水 | 本土 |
| 4866 | Cynoglossus monopus | 高眼舌鰨 | 海水 | 本土 |
| 4902 | Psettina brevirictis | 小口鰜鮃 | 海水 | 本土 |
| 4903 | Psettina variegata | 雜色鰜鮃 | 海水 | 本土 |
| 4915 | Taeniopsetta ocellata | 眼斑線鰭鮃 | 海水 | 本土 |
| 須鰃目 Polymixiiformes | ||||
| 2290 | Polymixia berndti | 短鬚須鰃 | 海水 | 本土 |
| 2291 | Polymixia japonica | 日本須鰃 | 海水 | 本土 |
| 2292 | Polymixia longispina | 長棘須鰃 | 海水 | 本土 |
| 鋸鯊目 Pristiophoriformes | ||||
| 2333 | Pristiophorus japonicus | 日本鋸鯊 | 海水 | 本土 |
| 鰩目 Rajiformes | ||||
| 182 | Anacanthobatis nanhaiensis | 南海無鰭鰩 | 海水 | 本土 |
| 367 | Beringraja pulchra | 美鰩 | 海水 | 本土 |
| 904 | Dipturus chinensis | 華鰩 | 海水 | 本土 |
| 905 | Dipturus gigas | 巨長吻鰩 | 海水 | 本土 |
| 906 | Dipturus macrocauda | 大尾長吻鰩 | 海水 | 本土 |
| 907 | Dipturus tengu | 天狗長吻鰩 | 海水 | 本土 |
| 908 | Dipturus wuhanlingi | 漢霖長吻鰩 | 海水 | 本土 |
| 1895 | Notoraja tobitukai | 日本隆背鰩(短鰩) | 海水 | 本土 |
| 1909 | Okamejei boesemani | 鮑氏瓮鰩 | 海水 | 本土 |
| 1910 | Okamejei hollandi | 何氏瓮鰩 | 海水 | 本土 |
| 1911 | Okamejei kenojei | 斑瓮鰩 | 海水 | 本土 |
| 1912 | Okamejei meerdervoortii | 麥氏瓮鰩 | 海水 | 本土 |
| 1913 | Okamejei mengae | 孟氏瓮鰩 | 海水 | 本土 |
| 2962 | Sinobatis borneensis | 婆羅洲海灣無鰭鰩 | 海水 | 本土 |
| 3680 | Bathyraja lindbergi | 林氏深海鰩 | 海水 | 本土 |
| 3925 | Dipturus kwangtungensis | 廣東長吻鰩 | 海水 | 本土 |
| 4376 | Okamejei acutispina | 尖棘瓮鰩 | 海水 | 本土 |
| 4718 | Sinobatis melanosoma | 黑體海灣無鰭鰩 | 海水 | 本土 |
| 犁頭鰩目 Rhinopristiformes | ||||
| 195 | Anoxypristis cuspidata | 鈍鋸鰩(尖齒鋸鰩) | 海水 | 本土 |
| 2341 | Pristis zijsron | 後鰭鋸鰩 | 海水 | 本土 |
| 2554 | Rhina ancylostomus | 波口鱟頭鱝 | 海水 | 本土 |
| 2558 | Rhinobatos formosensis | 台灣犁頭鰩 | 海水 | 本土 |
| 2559 | Rhinobatos hynnicephalus | 斑紋犁頭鰩 | 海水 | 本土 |
| 2560 | Rhinobatos schlegelii | 許氏犁頭鰩 | 海水 | 本土 |
| 2633 | Rhynchobatus laevis | 光滑尖犁頭鰩 | 海水 | 本土 |
| 4076 | Glaucostegus granulatus | 顆粒藍吻犁頭鰩 | 海水 | 本土 |
| 4077 | Glaucostegus microphthalmus | 小眼琵琶鱝 | 海水 | 本土 |
| 4661 | Rhynchobatus immaculatus | 無斑龍紋鱝 | 海水 | 本土 |
| 鮭形目 Salmoniformes | ||||
| 391 | Brachymystax lenok | 細鱗鮭 | 淡水 | 本土 |
| 392 | Brachymystax savinovi | 薩氏細鱗魚 | 淡水 | 本土 |
| 722 | Coregonus chadary | 卡達白鮭 | 淡水 | 本土 |
| 723 | Coregonus ussuriensis | 烏蘇里白鮭 | 淡水 | 本土 |
| 1428 | Hucho bleekeri | 川陝哲羅鮭 | 淡水 | 特有種 |
| 1429 | Hucho ishikawae | 石川哲羅鮭 | 淡水 | 本土 |
| 1430 | Hucho taimen | 哲羅鮭 | 淡水 | 本土 |
| 1923 | Oncorhynchus gorbuscha | 細鱗大麻哈魚 | 淡水 | 本土 |
| 1924 | Oncorhynchus keta | 大麻哈魚 | 淡水 | 本土 |
| 1925 | Oncorhynchus masou | 台灣馬蘇大麻哈魚 | 淡水 | 本土 |
| 1926 | Oncorhynchus mykiss | 虹鱒 | 淡水 | 引入種 |
| 2659 | Salvelinus leucomaenis | 白斑紅點鮭 | 淡水/海水 | 本土 |
| 2660 | Salvelinus malma | 花羔紅點鮭 | 淡水 | 本土 |
| 3099 | Stenodus leucichthys | 白北鮭 | 淡水 | 本土 |
| 3231 | Thymallus arcticus | 北極茴魚 | 淡水 | 本土 |
| 3232 | Thymallus grubii | 黑龍江茴魚 | 淡水 | 本土 |
| 4380 | Oncorhynchus formosanus | 台灣櫻花鈎吻鮭 | 淡水 | 特有種 |
| 鯖形目 Scombriformes | ||||
| 22 | Acanthocybium solandri | 沙氏刺鮁 | 海水 | 本土 |
| 236 | Ariomma indica | 印度無齒鯧 | 海水 | 本土 |
| 237 | Ariomma lurida | 大眼無齒鯧 | 海水 | 本土 |
| 282 | Auxis rochei | 雙鰭舵鰹 | 海水 | 本土 |
| 283 | Auxis thazard | 扁舵鰹 | 海水 | 本土 |
| 363 | Benthodesmus tenuis | 叉尾深海帶魚 | 海水 | 本土 |
| 397 | Brama japonica | 日本烏魴 | 海水 | 本土 |
| 1047 | Eumegistus illustris | 真烏魴 | 海水 | 本土 |
| 1048 | Eupleurogrammus muticus | 小帶魚 | 海水 | 本土 |
| 1054 | Euthynnus affinis | 鮪 | 海水 | 本土 |
| 1111 | Gempylus serpens | 蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 1218 | Grammatorcynus bicarinatus | 澳洲雙線鯖 | 海水 | 本土 |
| 1250 | Gymnosarda unicolor | 裸狐鰹 | 海水 | 本土 |
| 1497 | Katsuwonus pelamis | 鰹 | 海水 | 本土 |
| 1555 | Lepidocybium flavobrunneum | 異鱗蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 1584 | Lepturacanthus savala | 沙帶魚 | 海水 | 本土 |
| 1817 | Nealotus tripes | 三棘若蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 1847 | Neoepinnula orientalis | 東方新蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 1878 | Nesiarchus nasutus | 無耙蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 1892 | Nomeus gronovii | 水母雙鰭鯧 | 海水 | 本土 |
| 2047 | Pampus argenteus | 銀鯧 | 海水 | 本土 |
| 2048 | Pampus cinereus | 灰鯧 | 海水 | 本土 |
| 2049 | Pampus minor | 鏡鯧 | 海水 | 本土 |
| 2345 | Promethichthys prometheus | 紡錘蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 2358 | Psenes arafurensis | 水母玉鯧 | 海水 | 本土 |
| 2359 | Psenes cyanophrys | 玻璃玉鯧 | 海水 | 本土 |
| 2360 | Psenes pellucidus | 花瓣玉鯧 | 海水 | 本土 |
| 2361 | Psenopsis anomala | 刺鯧 | 海水 | 本土 |
| 2535 | Rastrelliger kanagurta | 羽鰓鮐 | 海水 | 本土 |
| 2551 | Rexea prometheoides | 短蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 2651 | Ruvettus pretiosus | 棘鱗蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 2676 | Sarda orientalis | 東方狐鰹 | 海水 | 本土 |
| 2852 | Scomber australasicus | 澳洲鯖 | 海水 | 本土 |
| 2853 | Scomber japonicus | 日本鯖 | 海水 | 本土 |
| 2856 | Scomberomorus commerson | 康氏馬鮫 | 海水 | 本土 |
| 2857 | Scomberomorus guttatus | 斑點馬鮫 | 海水 | 本土 |
| 2858 | Scomberomorus koreanus | 朝鮮馬鮫 | 海水 | 本土 |
| 2859 | Scomberomorus niphonius | 藍點馬鮫 | 海水 | 本土 |
| 2860 | Scomberomorus sinensis | 中華馬鮫 | 海水 | 本土 |
| 3198 | Tentoriceps cristatus | 狹顱帶魚 | 海水 | 本土 |
| 3203 | Tetragonurus cuvieri | 居氏方尾鯧 | 海水 | 本土 |
| 3226 | Thunnus alalunga | 長鰭金槍魚 | 海水 | 本土 |
| 3227 | Thunnus albacares | 黃鰭金槍魚 | 海水 | 本土 |
| 3228 | Thunnus obesus | 大眼金槍魚 | 海水 | 本土 |
| 3229 | Thunnus orientalis | 東方金槍魚 | 海水 | 本土 |
| 3230 | Thunnus tonggol | 青干金槍魚 | 海水 | 本土 |
| 3233 | Thyrsitoides marleyi | 黑鰭蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 3270 | Trichiurus brevis | 短帶魚 | 海水 | 本土 |
| 3271 | Trichiurus japonicus | 日本帶魚 | 海水 | 本土 |
| 3272 | Trichiurus lepturus | 高鰭帶魚 | 海水 | 本土 |
| 3814 | Chiasmodon niger | 黑叉齒龍鰧 | 海水 | 本土 |
| 3890 | Cubiceps whiteleggii | 懷氏方頭鯧 | 海水 | 本土 |
| 4001 | Epinnula pacifica | 太平洋短鰭蛇鯖 | 海水 | 本土 |
| 4038 | Evoxymetopon poeyi | 波氏窄顱帶魚 | 海水 | 本土 |
| 4039 | Evoxymetopon taeniatus | 條狀窄顱帶魚 | 海水 | 本土 |
| 4180 | Hyperoglyphe japonica | 日本櫛鯧 | 海水 | 本土 |
| 4433 | Pampus chinensis | 中國鯧 | 海水 | 本土 |
| 4637 | Pterycombus petersii | 彼氏高鰭魴 | 海水 | 本土 |
| 4650 | Rastrelliger faughni | 福氏羽鰓鮐 | 海水 | 本土 |
| 4785 | Taractes rubescens | 紅棱魴 | 海水 | 本土 |
| 4786 | Taractichthys steindachneri | 斯氏長鰭烏魴 | 海水 | 本土 |
| 4801 | Trichiurus nanhaiensis | 南海帶魚 | 海水 | 本土 |
| 鯰形目 Siluriformes | ||||
| 112 | Akysis brachybarbatus | 短鬚粒鯰 | 淡水 | 本土 |
| 137 | Amblyceps yunnanense | 雲南鈍頭鮠 | 淡水 | 本土 |
| 153 | Ameiurus nebulosus | 雲斑鮰 | 淡水 | 引入種 |
| 241 | Arius arenarius | 砂海鯰 | 海水 | 本土 |
| 242 | Arius maculatus | 斑海鯰 | 海水 | 本土 |
| 289 | Bagarius lica | 巨魾 | 淡水 | 本土 |
| 290 | Bagarius rutilus | 紅魾 | 淡水 | 本土 |
| 291 | Bagrichthys macropterus | 大鰭唇齒鱨 | 淡水 | 本土 |
| 292 | Bagroides hirsutus | 粗仿鱨 | 淡水 | 本土 |
| 598 | Chimarrichthys longus | 長石爬鮡 | 淡水 | 本土 |
| 655 | Clarias abbreviatus | 短胡鯰 | 淡水 | 本土 |
| 656 | Clarias batrachus | 蟾胡鯰 | 淡水 | 引入種 |
| 657 | Clarias fuscus | 鬍子鯰 | 淡水 | 本土 |
| 658 | Clarias gariepinus | 尖齒胡鯰 | 淡水 | 引入種 |
| 659 | Clarias macrocephalus | 大頭胡鯰 | 淡水 | 引入種 |
| 660 | Clarias meladerma | 黑皮胡鯰 | 淡水 | 本土 |
| 665 | Clupisoma longianale | 長臀刀鯰 | 淡水 | 本土 |
| 666 | Clupisoma nujiangense | 怒江鯡鯰 | 淡水 | 本土 |
| 667 | Clupisoma sinense | 中華鯡鯰 | 淡水 | 本土 |
| 668 | Clupisoma yunnanense | 雲南鯡鯰 | 淡水 | 本土 |
| 745 | Cranoglanis bouderius | 長臀鮠 | 淡水 | 本土 |
| 746 | Cranoglanis henrici | 亨氏長臀鮠 | 淡水 | 本土 |
| 747 | Cranoglanis multiradiata | 海南長臀鮠 | 淡水 | 本土 |
| 751 | Creteuchiloglanis brachypterus | 短鰭異鮡 | 淡水 | 本土 |
| 752 | Creteuchiloglanis gongshanensis | 貢山異鮡 | 淡水 | 本土 |
| 753 | Creteuchiloglanis kamengensis | 扁頭離鮡 | 淡水 | 本土 |
| 754 | Creteuchiloglanis longipectoralis | 長胸異鮡 | 淡水 | 本土 |
| 755 | Creteuchiloglanis macropterus | 大鰭異鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1041 | Euchiloglanis kishinouyei | 黃石爬鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1042 | Euchiloglanis longibarbatus | 長鬚石爬鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1060 | Exostoma gaoligongense | 高黎貢鰋 | 淡水 | 本土 |
| 1061 | Exostoma labiatum | 藏鰋 | 淡水 | 本土 |
| 1084 | Gagata cenia | 尾斑黑鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1085 | Gagata dolichonema | 長絲黑鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1127 | Glaridoglanis andersonii | 鑿齒鮡 | 淡水 | 特有種 |
| 1134 | Glyptosternon maculatum | 黑斑原鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1135 | Glyptosternon reticulatum | 網紋原鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1136 | Glyptothorax annandalei | 墨脫紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1137 | Glyptothorax burmanicus | 緬甸紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1138 | Glyptothorax cavia | 穴形紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1139 | Glyptothorax conirostris | 錐吻紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1140 | Glyptothorax deqinensis | 德欽紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1141 | Glyptothorax dorsalis | 亮背紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1142 | Glyptothorax fokiensis | 福建紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1143 | Glyptothorax fucatus | 異色紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1144 | Glyptothorax fuscus | 棕色紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1145 | Glyptothorax gracilis | 細體紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1146 | Glyptothorax granosus | 粒線紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1147 | Glyptothorax hainanensis | 海南紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1148 | Glyptothorax honghensis | 紅河紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1149 | Glyptothorax interspinalum | 間棘紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1150 | Glyptothorax lampris | 麗紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1151 | Glyptothorax lanceatus | 矛形紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1152 | Glyptothorax laosensis | 老撾紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1153 | Glyptothorax longicauda | 長尾紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1154 | Glyptothorax longjiangensis | 龍江紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1155 | Glyptothorax macromaculatus | 大斑紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1156 | Glyptothorax minimaculatus | 細斑紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1157 | Glyptothorax obliquimaculatus | 斜斑紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1158 | Glyptothorax obscurus | 暗色紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1159 | Glyptothorax pallozonus | 白線紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1160 | Glyptothorax quadriocellatus | 四斑紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1161 | Glyptothorax sinensis | 中華紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1162 | Glyptothorax trilineatus | 三線紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1163 | Glyptothorax zanaensis | 扎那紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1164 | Glyptothorax zhujiangensis | 珠江紋胸鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1297 | Hara hara | 真兔鮡 | 淡水 | 本土 |
| 1307 | Hemibagrus amemiyai | 阿氏半鱨 | 淡水 | 本土 |
| 1308 | Hemibagrus guttatus | 斑鱯 | 淡水 | 本土 |
| 1309 | Hemibagrus hainanensis | 海南半鱨 | 淡水 | 本土 |
| 1310 | Hemibagrus macropterus | 大鰭鱯 | 淡水 | 本土 |
| 1311 | Hemibagrus nemurus | 線尾半鱨 | 淡水 | 本土 |
| 1312 | Hemibagrus pluriradiatus | 多輻半鱨 | 淡水 | 本土 |
| 1313 | Hemibagrus wyckioides | 似威氏半鱨 | 淡水 | 本土 |
| 1346 | Hemisilurus heterorhynchus | 異吻半鯰 | 淡水 | 本土 |
| 1347 | Hemisilurus mekongensis | 湄公河半鯰 | 淡水 | 本土 |
| 1373 | Hexanematichthys sagor | 細尾六絲鯰 | 海水 | 本土 |
| 1543 | Leiocassis crassirostris | 粗吻鮠 | 淡水 | 本土 |
| 1544 | Leiocassis longibarbus | 長鬚鮠 | 淡水 | 本土 |
| 1611 | Liobagrus aequilabris | 大唇䱀 | 淡水 | 本土 |
| 1612 | Liobagrus anguillicauda | 鰻尾䱀 | 淡水 | 本土 |
| 1613 | Liobagrus kingi | 金氏䱀 | 淡水 | 特有種 |
| 1614 | Liobagrus marginatoides | 擬緣䱀 | 淡水 | 本土 |
| 1615 | Liobagrus marginatus | 白緣䱀 | 淡水 | 本土 |
| 1616 | Liobagrus nigricauda | 黑尾䱀 | 淡水 | 特有種 |
| 1617 | Liobagrus styani | 司氏䱀 | 淡水 | 本土 |
| 1714 | Micronema moorei | 湄南細絲鯰 | 淡水 | 本土 |
| 1797 | Mystus chinensis | 中國鱯 | 淡水 | 本土 |
| 1880 | Netuma bilineata | 雙線多齒海鯰 | 海水 | 本土 |
| 1881 | Netuma thalassina | 大頭多齒海鯰 | 海水 | 本土 |
| 1922 | Ompok siluroides | 似絢鯰 | 淡水 | 本土 |
| 1977 | Oreoglanis delacouri | 細尾異齒鰋 | 淡水 | 本土 |
| 1978 | Oreoglanis immaculata | 無斑異齒鰋 | 淡水 | 本土 |
| 1979 | Oreoglanis insignis | 伊洛瓦底江異齒鰋 | 淡水 | 本土 |
| 1980 | Oreoglanis jingdongensis | 景東異齒鰋 | 淡水 | 本土 |
| 1981 | Oreoglanis macroptera | 大鰭異齒鰋 | 淡水 | 本土 |
| 1982 | Oreoglanis setigera | 老撾異齒鰋 | 淡水 | 本土 |
| 2051 | Pangasianodon gigas | 巨無齒𩷶 | 淡水 | 本土 |
| 2052 | Pangasius krempfi | 克氏𩷶 | 淡水 | 本土 |
| 2053 | Pangasius nasutus | 細尾𩷶 | 淡水 | 本土 |
| 2054 | Pangasius sanitwongsei | 長絲𩷶 | 淡水 | 本土 |
| 2076 | Parachiloglanis hodgarti | 霍氏平唇鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2143 | Pareuchiloglanis abbreviata | 短體鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2144 | Pareuchiloglanis anteanalis | 前臀鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2145 | Pareuchiloglanis feae | 短鰭鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2146 | Pareuchiloglanis gracilicaudata | 細尾鮡 | 淡水 | 特有種 |
| 2147 | Pareuchiloglanis longicauda | 長尾鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2148 | Pareuchiloglanis macrotrema | 大孔鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2149 | Pareuchiloglanis myzostoma | 蘭坪鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2150 | Pareuchiloglanis poilanei | 越南鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2151 | Pareuchiloglanis prolixdorsalis | 長背鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2152 | Pareuchiloglanis robustus | 壯體鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2153 | Pareuchiloglanis sichuanensis | 四川鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2154 | Pareuchiloglanis sinensis | 中華鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2155 | Pareuchiloglanis tianquanensis | 蒂氏鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2171 | Pelteobagrus eupogon | 長鬚黃顙魚 | 淡水 | 本土 |
| 2172 | Pelteobagrus intermedius | 中間黃顙魚 | 淡水 | 本土 |
| 2173 | Pelteobagrus ussuriensis | 烏蘇里黃顙魚 | 淡水 | 本土 |
| 2200 | Phalacronotus apogon | 湄公河亮背鯰 | 淡水 | 本土 |
| 2274 | Plicofollis nella | 內爾褶囊海鯰 | 海水 | 本土 |
| 2276 | Plotosus lineatus | 線紋鰻鯰 | 海水 | 本土 |
| 2373 | Pseudecheneis brachyura | 粗尾褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2374 | Pseudecheneis gracilis | 纖體褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2375 | Pseudecheneis immaculata | 無斑褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2376 | Pseudecheneis longipectoralis | 長鰭褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2377 | Pseudecheneis paucipunctata | 少斑褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2378 | Pseudecheneis paviei | 平吻褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2379 | Pseudecheneis stenura | 窄尾褶鮡 | 淡水 | 特有種 |
| 2380 | Pseudecheneis sulcata | 黃斑褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2381 | Pseudecheneis sulcatoides | 似黃斑褶鮡 | 淡水 | 特有種 |
| 2382 | Pseudecheneis tchangi | 扁體褶鮡 | 淡水 | 本土 |
| 2383 | Pseudexostoma brachysoma | 短體擬鰋 | 淡水 | 本土 |
| 2384 | Pseudexostoma longipterus | 長鰭擬鰋 | 淡水 | 本土 |
| 2385 | Pseudexostoma yunnanense | 雲南擬鰋 | 淡水 | 本土 |
| 2386 | Pseudobagarius sinensis | 中華擬魾 | 淡水 | 本土 |
| 2387 | Pseudobagrus albomarginatus | 白邊擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2388 | Pseudobagrus analis | 長臀擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2389 | Pseudobagrus brachyrhabdion | 短鬚擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2390 | Pseudobagrus brevianalis | 短臀擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2391 | Pseudobagrus brevicaudatus | 短尾擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2392 | Pseudobagrus crassilabris | 粗唇擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2393 | Pseudobagrus eupogoides | 似真須擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2394 | Pseudobagrus fui | 傅氏擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2395 | Pseudobagrus gracilis | 細身擬鱨 | 淡水 | 特有種 |
| 2396 | Pseudobagrus hwanghoensis | 黃河擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2397 | Pseudobagrus kaifenensis | 開封擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2398 | Pseudobagrus kyphus | 側斑擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2399 | Pseudobagrus medianalis | 中臀擬鱨 | 淡水 | 特有種 |
| 2400 | Pseudobagrus microps | 小眼擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2401 | Pseudobagrus omeihensis | 峨嵋擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2402 | Pseudobagrus ondon | 盎堂擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2403 | Pseudobagrus pratti | 細體擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2404 | Pseudobagrus rendahli | 倫氏擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2405 | Pseudobagrus sinyanensis | 信陽擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2406 | Pseudobagrus taeniatus | 條紋擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2407 | Pseudobagrus taiwanensis | 台灣擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2408 | Pseudobagrus tenuifurcatus | 叉尾擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2409 | Pseudobagrus tenuis | 圓尾擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2410 | Pseudobagrus trilineatus | 三線擬鱨 | 淡水 | 特有種 |
| 2411 | Pseudobagrus truncatus | 切尾擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2412 | Pseudobagrus vachellii | 瓦氏擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2413 | Pseudobagrus wangi | 王氏擬鱨 | 淡水 | 本土 |
| 2452 | Pseudolais micronemus | 短鬚擬𩷶 | 淡水 | 本土 |
| 2486 | Pterocryptis anomala | 糙隱鰭鯰 | 淡水 | 本土 |
| 2487 | Pterocryptis cochinchinensis | 越南隱鰭鯰 | 淡水 | 本土 |
| 2927 | Silurus asotus | 鯰 | 淡水 | 本土 |
| 2928 | Silurus duanensis | 都安鯰 | 淡水 | 本土 |
| 2929 | Silurus glanis | 歐鯰 | 淡水 | 引入種 |
| 2930 | Silurus grahami | 撫仙鯰 | 淡水 | 特有種 |
| 2931 | Silurus lanzhouensis | 蘭州鯰 | 淡水 | 特有種 |
| 2932 | Silurus mento | 昆明鯰 | 淡水 | 特有種 |
| 2933 | Silurus meridionalis | 大口鯰(南方鯰) | 淡水 | 特有種 |
| 2934 | Silurus microdorsalis | 小背鰭鯰 | 淡水 | 本土 |
| 2935 | Silurus soldatovi | 懷頭鯰 | 淡水 | 本土 |
| 3054 | Sperata seenghala | 月尾諾鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3155 | Tachysurus adiposalis | 長脂瘋鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3156 | Tachysurus argentivittatus | 縱帶瘋鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3157 | Tachysurus brashnikowi | 布氏瘋鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3158 | Tachysurus dumerili | 長吻鮠 | 淡水 | 本土 |
| 3159 | Tachysurus fulvidraco | 瘋鱨(黃顙魚) | 淡水 | 本土 |
| 3160 | Tachysurus herzensteini | 黑龍江瘋鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3161 | Tachysurus hoi | 霍氏瘋鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3162 | Tachysurus nitidus | 光澤瘋鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3163 | Tachysurus sinensis | 中華瘋鱨 | 海水 | 本土 |
| 3164 | Tachysurus virgatus | 縱紋瘋鱨 | 淡水 | 本土 |
| 3479 | Wallago attu | 叉尾鯰 | 淡水 | 本土 |
| 3480 | Wallago hexanema | 六絲叉尾鯰 | 淡水 | 本土 |
| 3499 | Xiurenbagrus dorsalis | 後背修仁䱀 | 淡水 | 本土 |
| 3500 | Xiurenbagrus gigas | 巨修仁䱀 | 淡水 | 本土 |
| 3501 | Xiurenbagrus xiurenensis | 修仁䱀 | 淡水 | 特有種 |
| 3640 | Arius dispar | 異海鯰 | 淡水 | 本土 |
| 4186 | Hypostomus plecostomus | 絞口下口鯰 | 淡水 | 引入種 |
| 4188 | Ictalurus punctatus | 斑真鮰(斑點叉尾鮰) | 淡水 | 引入種 |
| 4257 | Liobagrus formosanus | 台灣䱀 | 淡水 | 特有種 |
| 4546 | Plotosus nkunga | 長鬚鰻鯰 | 海水 | 本土 |
| 4638 | Pterygoplichthys disjunctivus | 野翼甲鯰 | 淡水 | 引入種 |
| 4639 | Pterygoplichthys multiradiatus | 多輻翼甲鯰 | 淡水 | 引入種 |
| 角鯊目 Squaliformes | ||||
| 489 | Centrophorus granulosus | 顆粒刺鯊(大西洋刺鯊) | 海水 | 本土 |
| 490 | Centrophorus isodon | 等齒刺鯊 | 海水 | 本土 |
| 491 | Centrophorus lusitanicus | 低鰭刺鯊 | 海水 | 本土 |
| 492 | Centrophorus squamosus | 葉鱗刺鯊 | 海水 | 本土 |
| 493 | Centrophorus tessellatus | 鋸齒刺鯊 | 海水 | 本土 |
| 499 | Centroscyllium kamoharai | 蒲原氏霞鯊 | 海水 | 本土 |
| 500 | Centroscymnus owstonii | 歐氏荊鯊 | 海水 | 本土 |
| 841 | Dalatias licha | 鎧鯊 | 海水 | 本土 |
| 851 | Deania calceus | 喙吻田氏鯊 | 海水 | 本土 |
| 1036 | Etmopterus decacuspidatus | 南海烏鯊 | 海水 | 特有種 |
| 1037 | Etmopterus lucifer | 亮烏鯊 | 海水 | 本土 |
| 3084 | Squaliolus laticaudus | 寬尾擬角鯊 | 海水 | 本土 |
| 3086 | Squalus acanthias | 白斑角鯊 | 海水 | 本土 |
| 3087 | Squalus brevirostris | 短吻角鯊 | 海水 | 本土 |
| 3088 | Squalus japonicus | 日本角鯊 | 海水 | 本土 |
| 3089 | Squalus megalops | 大眼角鯊 | 海水 | 本土 |
| 3090 | Squalus mitsukurii | 長吻角鯊 | 海水 | 本土 |
| 3540 | Zameus squamulosus | 鱗睡鯊 | 海水 | 本土 |
| 3761 | Centrophorus atromarginatus | 黑緣刺鯊 | 海水 | 本土 |
| 3762 | Centrophorus longipinnis | 長鰭刺鯊 | 海水 | 本土 |
| 3763 | Centrophorus moluccensis | 皺皮刺鯊 | 海水 | 本土 |
| 3840 | Cirrhigaleus barbifer | 長鬚卷盔鯊 | 海水 | 本土 |
| 4015 | Etmopterus bigelowi | 比氏烏鯊 | 海水 | 本土 |
| 4016 | Etmopterus brachyurus | 短尾烏鯊 | 海水 | 本土 |
| 4017 | Etmopterus burgessi | 伯氏烏鯊 | 海水 | 本土 |
| 4018 | Etmopterus joungi | 莊氏烏鯊 | 海水 | 本土 |
| 4019 | Etmopterus pusillus | 小烏鯊 | 海水 | 本土 |
| 4020 | Etmopterus splendidus | 斯普蘭汀烏鯊 | 海水 | 本土 |
| 4196 | Isistius brasiliensis | 巴西達摩鯊 | 海水 | 本土 |
| 4431 | Oxynotus japonicus | 日本尖背角鯊 | 海水 | 本土 |
| 4727 | Somniosus cheni | 陳氏睡鯊 | 海水 | 本土 |
| 4736 | Squaliolus aliae | 阿里擬角鯊 | 海水 | 本土 |
| 4737 | Squalus blainville | 高鰭角鯊 | 海水 | 本土 |
| 4738 | Squalus formosus | 台灣角鯊 | 海水 | 本土 |
| 扁鯊目 Squatiniformes | ||||
| 3091 | Squatina japonica | 日本扁鯊 | 海水 | 本土 |
| 3092 | Squatina nebulosa | 星雲扁鯊 | 海水 | 本土 |
| 3093 | Squatina tergocellatoides | 擬背斑扁鯊 | 海水 | 本土 |
| 4739 | Squatina formosa | 台灣扁鯊 | 海水 | 本土 |
| 巨口魚目 Stomiiformes | ||||
| 229 | Argyropelecus aculeatus | 棘銀斧魚 | 海水 | 本土 |
| 230 | Argyropelecus affinis | 長銀斧魚 | 海水 | 本土 |
| 231 | Argyropelecus hemigymnus | 半裸銀斧魚 | 海水 | 本土 |
| 232 | Argyropelecus sladeni | 斯氏銀斧魚 | 海水 | 本土 |
| 263 | Astronesthes indicus | 印度星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 264 | Astronesthes lucifer | 熒光星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 382 | Borostomias elucens | 掠食巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 566 | Chauliodus sloani | 斯氏蝰魚 | 海水 | 本土 |
| 785 | Cyclothone acclinidens | 斜齒圓罩魚 | 海水 | 本土 |
| 786 | Cyclothone alba | 白圓罩魚 | 海水 | 本土 |
| 787 | Cyclothone atraria | 黑圓罩魚 | 海水 | 本土 |
| 788 | Cyclothone obscura | 暗圓罩魚 | 海水 | 本土 |
| 789 | Cyclothone pallida | 蒼圓罩魚 | 海水 | 本土 |
| 790 | Cyclothone pseudopallida | 近蒼圓罩魚 | 海水 | 本土 |
| 901 | Diplophos taenia | 帶紋雙光魚 | 海水 | 本土 |
| 1051 | Eustomias perplexus | 近視真巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 1215 | Gonostoma atlanticum | 大西洋鑽光魚 | 海水 | 本土 |
| 1454 | Ichthyococcus ovatus | 卵圓頜光魚 | 海水 | 本土 |
| 1455 | Idiacanthus fasciola | 奇棘魚 | 海水 | 本土 |
| 1679 | Malacosteus niger | 黑柔骨魚 | 海水 | 本土 |
| 1688 | Maurolicus muelleri | 穆氏暗光魚 | 海水 | 本土 |
| 1964 | Opostomias mitsuii | 脂巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 2044 | Pachystomias microdon | 小牙厚巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 2204 | Photonectes albipennis | 白鰭袋巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 2206 | Photostomias tantillux | 大牙光巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 2285 | Polyipnus aquavitus | 光帶燭光魚 | 海水 | 本土 |
| 2286 | Polyipnus laternatus | 寬柄燭光魚 | 海水 | 本土 |
| 2287 | Polyipnus tridentifer | 三齒燭光魚 | 海水 | 本土 |
| 2288 | Polymetme corythaeola | 腹燈刀光魚 | 海水 | 本土 |
| 2289 | Polymetme elongata | 長刀光魚 | 海水 | 本土 |
| 2914 | Sigmops elongatus | 長纖鑽光魚 | 海水 | 本土 |
| 2915 | Sigmops gracilis | 柔身纖鑽光魚 | 海水 | 本土 |
| 3103 | Sternoptyx diaphana | 褶胸魚 | 海水 | 本土 |
| 3104 | Sternoptyx obscura | 暗色褶胸魚 | 海水 | 本土 |
| 3105 | Sternoptyx pseudobscura | 擬暗色褶胸魚 | 海水 | 本土 |
| 3120 | Stomias affinis | 巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 3121 | Stomias nebulosus | 星雲巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 3234 | Thysanactis dentex | 纓光魚 | 海水 | 本土 |
| 3449 | Valenciennellus carlsbergi | 卡氏叢光魚 | 海水 | 本土 |
| 3450 | Valenciennellus tripunctulatus | 三斑叢光魚 | 海水 | 本土 |
| 3475 | Vinciguerria attenuata | 狹串光魚 | 海水 | 本土 |
| 3476 | Vinciguerria nimbaria | 智利串光魚 | 海水 | 本土 |
| 3477 | Vinciguerria poweriae | 強串光魚 | 海水 | 本土 |
| 3653 | Astronesthes chrysophekadion | 金星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 3654 | Astronesthes fedorovi | 費氏星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 3655 | Astronesthes formosanus | 台灣星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 3656 | Astronesthes indopacificus | 印太星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 3657 | Astronesthes splendidus | 絲球星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 3658 | Astronesthes trifibulatus | 三絲星衫魚 | 海水 | 本土 |
| 3923 | Diplophos pacificus | 太平洋雙光魚 | 海水 | 本土 |
| 3924 | Diplophos vicinia | 西太雙燈魚 | 海水 | 本土 |
| 4022 | Eustomias dendrobium | 花瓣真巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 4023 | Eustomias stamen | 花心真巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 4024 | Eustomias tritentaculatus | 三絲真巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 4165 | Heterophotus ophistoma | 蛇口異星杉魚 | 海水 | 本土 |
| 4240 | Leptostomias robustus | 強壯纖巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 4297 | Melanostomias melanopogon | 烏須黑巨口魚 | 海水 | 本土 |
| 4501 | Photonectes banshee | 海水 | 本土 | |
| 4551 | Polyipnus stereope | 閃電燭光魚 | 海水 | 本土 |
| 4552 | Polyipnus triphanos | 三燭光魚 | 海水 | 本土 |
| 4553 | Polyipnus unispinus | 單棘燭光魚 | 海水 | 本土 |
| 4654 | Rhadinesthes decimus | 細杉魚 | 海水 | 本土 |
| 合鰓目 Synbranchiformes | ||||
| 1667 | Macrognathus aculeatus | 長吻棘鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1683 | Mastacembelus armatus | 大刺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1684 | Mastacembelus strigiventus | 腹紋刺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1685 | Mastacembelus triolobus | 三葉刺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1686 | Mastacembelus undulatus | 波鰭刺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 1760 | Monopterus albus | 黃鱔 | 淡水 | 本土 |
| 2963 | Sinobdella sinensis | 中華刺鰍 | 淡水 | 本土 |
| 海龍魚目 Syngnathiformes | ||||
| 103 | Aeoliscus strigatus | 條紋蝦魚 | 海水 | 本土 |
| 279 | Aulostomus chinensis | 中華管口魚 | 海水 | 本土 |
| 484 | Centriscus scutatus | 玻甲魚 | 海水 | 本土 |
| 613 | Choeroichthys sculptus | 彫紋豬海龍 | 海水 | 本土 |
| 739 | Corythoichthys flavofasciatus | 黃帶冠海龍 | 海水 | 本土 |
| 936 | Doryichthys boaja | 寶珈槍吻海龍 | 淡水 | 本土 |
| 937 | Doryrhamphus excisus | 藍帶矛吻海龍 | 海水 | 本土 |
| 943 | Dunckerocampus dactyliophorus | 帶紋斑節海龍 | 海水 | 本土 |
| 1066 | Fistularia commersonii | 無鱗煙管魚 | 海水 | 本土 |
| 1067 | Fistularia petimba | 鱗煙管魚 | 海水 | 本土 |
| 1273 | Halicampus grayi | 葛氏海蠋魚 | 海水 | 本土 |
| 1379 | Hippichthys cyanospilos | 藍點多環海龍 | 海水 | 本土 |
| 1380 | Hippichthys heptagonus | 前鰭多環海龍 | 淡水 | 本土 |
| 1381 | Hippichthys penicillus | 筆狀多環海龍 | 淡水/海水 | 本土 |
| 1382 | Hippocampus casscsio | 海水 | 本土 | |
| 1383 | Hippocampus histrix | 刺海馬 | 海水 | 本土 |
| 1384 | Hippocampus kelloggi | 大海馬(克氏海馬) | 海水 | 本土 |
| 1385 | Hippocampus kuda | 庫達海馬 | 海水 | 本土 |
| 1386 | Hippocampus trimaculatus | 三斑海馬 | 海水 | 本土 |
| 1671 | Macroramphosus gracilis | 細長吻魚 | 海水 | 本土 |
| 1672 | Macroramphosus scolopax | 長吻魚(鷺管魚) | 海水 | 本土 |
| 2212 | Phoxocampus belcheri | 黑錐海龍 | 海水 | 本土 |
| 3050 | Solegnathus hardwickii | 哈氏刀海龍 | 海水 | 本土 |
| 3051 | Solenostomus paegnius | 鋸吻剃刀魚 | 海水 | 本土 |
| 3052 | Solenostomus paradoxus | 細吻剃刀魚 | 海水 | 本土 |
| 3144 | Syngnathus acus | 尖海龍 | 海水 | 本土 |
| 3264 | Trachyrhamphus bicoarctatus | 短尾粗吻海龍 | 海水 | 本土 |
| 3265 | Trachyrhamphus serratus | 鋸粗吻海龍 | 海水 | 本土 |
| 3438 | Urocampus nanus | 帶紋須海龍 | 海水 | 本土 |
| 3879 | Corythoichthys haematopterus | 紅鰭冠海龍 | 海水 | 本土 |
| 3880 | Cosmocampus banneri | 斑氏環宇海龍 | 海水 | 本土 |
| 3930 | Doryrhamphus japonicus | 日本矛吻海龍 | 海水 | 本土 |
| 4133 | Halicampus macrorhynchus | 大吻海蠋魚 | 海水 | 本土 |
| 4134 | Halicampus mataafae | 馬塔法海蠋魚 | 海水 | 本土 |
| 4170 | Hippichthys spicifer | 帶紋多環海龍 | 海水 | 本土 |
| 4171 | Hippocampus spinosissimus | 棘海馬 | 海水 | 本土 |
| 4300 | Microphis brachyurus | 短尾海龍 | 淡水 | 本土 |
| 4301 | Microphis leiaspis | 無棘腹囊海龍 | 淡水/海水 | 本土 |
| 4302 | Microphis manadensis | 印尼腹囊海龍 | 淡水 | 本土 |
| 4503 | Phoxocampus diacanthus | 雙棘錐海龍 | 海水 | 本土 |
| 4725 | Solenostomus cyanopterus | 藍鰭剃刀魚 | 海水 | 本土 |
| 4769 | Syngnathoides biaculeatus | 雙棘擬海龍 | 海水 | 本土 |
| 4770 | Syngnathus schlegeli | 薛氏海龍 | 海水 | 本土 |
| 4914 | Syngnathus pelagicus | 漂海龍 | 海水 | 本土 |
| 魨形目 Tetraodontiformes | ||||
| 1 | Abalistes stellatus | 寬尾鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 80 | Acreichthys tomentosus | 白線鬃尾魨 | 海水 | 本土 |
| 131 | Aluterus monoceros | 單角革魨 | 海水 | 本土 |
| 132 | Aluterus scriptus | 擬態革魨 | 海水 | 本土 |
| 133 | Amanses scopas | 美尾棘魨 | 海水 | 本土 |
| 152 | Amblyrhynchote honckenii | 白點寬吻魨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 249 | Arothron firmamentum | 瓣叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 250 | Arothron hispidus | 紋腹叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 251 | Arothron immaculatus | 無斑叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 252 | Arothron meleagris | 白點叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 253 | Arothron nigropunctatus | 黑斑叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 254 | Arothron stellatus | 星斑叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 273 | Atrophacanthus japonicus | 日本下棘魨 | 海水 | 本土 |
| 294 | Balistapus undulatus | 波紋鈎鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 295 | Balistoides conspicillum | 花斑擬鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 296 | Balistoides viridescens | 褐擬鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 342 | Bathyphylax bombifrons | 長棘衛淵魨 | 海水 | 本土 |
| 435 | Cantherhines dumerilii | 棘尾前孔魨 | 海水 | 本土 |
| 436 | Cantherhines pardalis | 細斑前孔魨 | 海水 | 本土 |
| 437 | Canthidermis maculata | 疣鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 438 | Canthidermis rotundatus | 卵圓疣鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 439 | Canthigaster bennetti | 點線扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 440 | Canthigaster rivulata | 水紋扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 441 | Canthigaster valentini | 橫帶扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 519 | Chaetodermis penicilligerus | 單棘棘皮魨 | 海水 | 本土 |
| 591 | Chelonodontops patoca | 凹鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 592 | Chilomycterus reticulatus | 網紋短刺魨 | 海水 | 本土 |
| 614 | Chonerhinos naritus | 婆羅洲仰鼻魨 | 淡水 | 本土 |
| 896 | Diodon holocanthus | 六斑刺魨 | 海水 | 本土 |
| 897 | Diodon hystrix | 密斑刺魨 | 海水 | 本土 |
| 898 | Diodon liturosus | 大斑刺魨 | 海水 | 本土 |
| 1498 | Kentrocapros aculeatus | 棘箱魨 | 海水 | 本土 |
| 1517 | Lactoria cornuta | 角箱魨 | 海水 | 本土 |
| 1522 | Lagocephalus inermis | 黑鰓兔頭魨 | 海水 | 本土 |
| 1523 | Lagocephalus lagocephalus | 兔頭魨 | 海水 | 本土 |
| 1524 | Lagocephalus lunaris | 月尾兔頭魨 | 海水 | 本土 |
| 1525 | Lagocephalus sceleratus | 圓斑兔頭魨 | 海水 | 本土 |
| 1526 | Lagocephalus spadiceus | 棕斑兔頭魨 | 海水 | 本土 |
| 1673 | Macrorhamphosodes uradoi | 尤氏擬管吻魨 | 海水 | 本土 |
| 1687 | Masturus lanceolatus | 矛尾翻車魨 | 海水 | 本土 |
| 1702 | Melichthys niger | 角鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 1703 | Melichthys vidua | 黑邊角鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 1754 | Mola mola | 翻車魨 | 海水 | 本土 |
| 1755 | Monacanthus chinensis | 中華單角魨 | 海水 | 本土 |
| 1908 | Odonus niger | 紅牙鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 2023 | Ostracion cubicum | 點斑箱魨 | 海水 | 本土 |
| 2024 | Ostracion meleagris | 白點箱魨 | 海水 | 本土 |
| 2025 | Ostracion rhinorhynchos | 突吻箱魨 | 海水 | 本土 |
| 2037 | Oxymonacanthus longirostris | 尖吻魨 | 海水 | 本土 |
| 2055 | Pao leiurus | 斑腰單孔魨 | 淡水 | 本土 |
| 2090 | Paraluteres prionurus | 鋸尾副革魨 | 海水 | 本土 |
| 2092 | Paramonacanthus nipponensis | 長吻副單角魨 | 海水 | 本土 |
| 2093 | Paramonacanthus pusillus | 布殊勒副單角魨 | 海水 | 本土 |
| 2137 | Paratriacanthodes retrospinis | 倒棘副三棘魨 | 海水 | 本土 |
| 2197 | Pervagor janthinosoma | 紅尾前角魨 | 海水 | 本土 |
| 2198 | Pervagor melanocephalus | 黑頭前角魨 | 海水 | 本土 |
| 2414 | Pseudobalistes fuscus | 黑副鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 2526 | Ranzania laevis | 斑點長翻車魨 | 海水 | 本土 |
| 2556 | Rhinecanthus aculeatus | 叉斑銼鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 2557 | Rhinecanthus rectangulus | 黑帶銼鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 2649 | Rudarius ercodes | 粗皮魨 | 海水 | 本土 |
| 3057 | Sphoeroides pachygaster | 密溝圓魨 | 海水 | 本土 |
| 3102 | Stephanolepis cirrhifer | 絲背細鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 3126 | Sufflamen chrysopterum | 黃鰭多棘鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 3127 | Sufflamen fraenatum | 韁紋多棘鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 3169 | Takifugu alboplumbeus | 鉛點多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3170 | Takifugu bimaculatus | 雙斑多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3171 | Takifugu coronoidus | 暈環多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3172 | Takifugu flavidus | 菊黃多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3173 | Takifugu flavipterus | 海水 | 本土 | |
| 3174 | Takifugu niphobles | 黑點多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3175 | Takifugu obscurus | 暗色多紀魨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3176 | Takifugu ocellatus | 弓斑多紀魨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3177 | Takifugu orbimaculatus | 圓斑多紀魨 | 淡水 | 本土 |
| 3178 | Takifugu pardalis | 豹紋多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3179 | Takifugu plagiocellatus | 斜斑多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3180 | Takifugu poecilonotus | 斑點多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3181 | Takifugu pseudommus | 假眼多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3182 | Takifugu reticularis | 網紋多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3183 | Takifugu rubripes | 紅鰭多紀魨 | 淡水/海水 | 本土 |
| 3184 | Takifugu variomaculatus | 花斑多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3185 | Takifugu vermicularis | 蟲紋多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3186 | Takifugu xanthopterus | 黃鰭多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 3206 | Tetrosomus gibbosus | 駝背真三棱箱魨 | 海水 | 本土 |
| 3216 | Thamnaconus modestus | 馬面魨 | 海水 | 本土 |
| 3217 | Thamnaconus septentrionalis | 綠鰭馬面魨 | 海水 | 本土 |
| 3218 | Thamnaconus tessellatus | 密斑馬面魨 | 海水 | 本土 |
| 3245 | Torquigener hypselogeneion | 頭紋窄額魨 | 海水 | 本土 |
| 3266 | Triacanthodes anomalus | 擬三刺魨 | 海水 | 本土 |
| 3267 | Triacanthus biaculeatus | 雙棘三刺魨 | 海水 | 本土 |
| 3286 | Triodon macropterus | 三齒魨 | 海水 | 本土 |
| 3416 | Tydemania navigatoris | 尖尾倒刺魨 | 海水 | 本土 |
| 3417 | Tylerius spinosissimus | 長刺泰氏魨 | 海水 | 本土 |
| 3483 | Xanthichthys auromarginatus | 金邊黃鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 3484 | Xanthichthys lineopunctatus | 線斑黃鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 3642 | Arothron manilensis | 菲律賓叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 3643 | Arothron mappa | 輻紋叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 3644 | Arothron reticularis | 網紋叉鼻魨 | 海水 | 本土 |
| 3739 | Cantherhines fronticinctus | 縱帶前孔魨 | 海水 | 本土 |
| 3740 | Canthigaster amboinensis | 安汶扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 3741 | Canthigaster axiologus | 軸扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 3742 | Canthigaster compressa | 細紋扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 3743 | Canthigaster epilampra | 亮麗扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 3744 | Canthigaster jactator | 圓點扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 3745 | Canthigaster janthinoptera | 圓斑扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 3746 | Canthigaster solandri | 細斑扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 3891 | Cyclichthys orbicularis | 圓點圓刺魨 | 海水 | 本土 |
| 3921 | Diodon eydouxii | 艾氏刺魨 | 海水 | 本土 |
| 4148 | Halimochirurgus alcocki | 阿氏管吻魨 | 海水 | 本土 |
| 4221 | Lactoria diaphana | 棘背角箱魨 | 海水 | 本土 |
| 4222 | Lactoria fornasini | 福氏角箱魨 | 海水 | 本土 |
| 4224 | Lagocephalus gloveri | 克氏兔頭魨 | 海水 | 本土 |
| 4225 | Lagocephalus wheeleri | 懷氏兔頭魨 | 海水 | 本土 |
| 4313 | Mola alexandrini | 拉氏翻車魨 | 海水 | 本土 |
| 4426 | Ostracion immaculatum | 無斑箱魨 | 海水 | 本土 |
| 4427 | Ostracion solorense | 藍帶箱魨 | 海水 | 本土 |
| 4448 | Paramonacanthus japonicus | 日本副單角魨 | 海水 | 本土 |
| 4449 | Paramonacanthus oblongus | 長方副單角魨 | 海水 | 本土 |
| 4450 | Paramonacanthus sulcatus | 絨紋副單角魨 | 海水 | 本土 |
| 4495 | Pervagor aspricaudus | 粗尾前角魨 | 海水 | 本土 |
| 4605 | Pseudobalistes flavimarginatus | 黃緣副鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 4625 | Pseudotriacanthus strigilifer | 長吻假三刺魨 | 海水 | 本土 |
| 4655 | Rhinecanthus verrucosus | 毒銼鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 4751 | Sufflamen bursa | 項帶多棘鱗魨 | 海水 | 本土 |
| 4784 | Takifugu oblongus | 橫紋多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 4789 | Tetrosomus concatenatus | 雙峰真三棱箱魨 | 海水 | 本土 |
| 4790 | Thamnaconus hypargyreus | 黃鰭馬面魨 | 海水 | 本土 |
| 4791 | Thamnaconus modestoides | 擬綠鰭馬面魨 | 海水 | 本土 |
| 4792 | Thamnaconus multilineatus | 多紋刺鼻單角魨 | 海水 | 本土 |
| 4815 | Tripodichthys blochii | 布氏三足刺魨 | 海水 | 本土 |
| 4861 | Canthigaster papua | 巴布亞扁背魨 | 海水 | 本土 |
| 4865 | Cyclichthys spilostylus | 黃斑圓刺魨 | 海水 | 本土 |
| 4916 | Takifugu porphyreus | 紫色多紀魨 | 海水 | 本土 |
| 電鰩目 Torpediniformes | ||||
| 748 | Crassinarke dormitor | 堅皮單鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 1801 | Narcine brevilabiata | 短唇雙鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 1802 | Narcine lingula | 舌形雙鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 1803 | Narcine maculata | 黑斑雙鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 1804 | Narcine prodorsalis | 前背雙鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 1805 | Narcine timlei | 丁氏雙鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 1806 | Narke dipterygia | 雙翅單鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 1807 | Narke japonica | 日本單鰭電鰩 | 海水 | 本土 |
| 2242 | Platyrhina sinensis | 中國團扇鰩 | 海水 | 本土 |
| 2243 | Platyrhina tangi | 湯氏團扇鰩 | 海水 | 本土 |
| 3205 | Tetronarce tokionis | 東京電鱝 | 海水 | 本土 |
| 3687 | Benthobatis yangi | 楊氏深海電鰩 | 海水 | 本土 |
| 4788 | Tetronarce formosa | 台灣電鰩 | 海水 | 本土 |
| 燧鯛目 Trachichthyiformes | ||||
| 194 | Anoplogaster cornuta | 角高體金眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 280 | Aulotrachichthys prosthemius | 前肛管燧鯛 | 海水 | 本土 |
| 1114 | Gephyroberyx japonicus | 日本橋棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 1425 | Hoplostethus crassispinus | 重胸棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 1426 | Hoplostethus mediterraneus | 地中海胸棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 1756 | Monocentris japonica | 日本松球魚 | 海水 | 本土 |
| 3612 | Anomalops katoptron | 菲律賓燈頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 3926 | Diretmus argenteus | 銀眼鯛 | 海水 | 本土 |
| 4066 | Gephyroberyx darwinii | 達氏橋棘鯛 | 海水 | 本土 |
| 4314 | Monocentris chrysadamas | 金鑽鳳梨魚 | 海水 | 本土 |
| 4590 | Protoblepharon mccoskeri | 麥氏原燈頰鯛 | 海水 | 本土 |
| 海魴目 Zeiformes | ||||
| 836 | Cyttomimus affinis | 青菱海魴 | 海水 | 本土 |
| 837 | Cyttopsis rosea | 紅腹棘海魴 | 海水 | 本土 |
| 2141 | Parazen pacificus | 太平洋副海魴 | 海水 | 本土 |
| 3494 | Xenolepidichthys dalgleishi | 幾內亞灣異菱的鯛 | 海水 | 本土 |
| 3550 | Zenion hololepis | 小海魴 | 海水 | 本土 |
| 3551 | Zenion japonicum | 日本小海魴 | 海水 | 本土 |
| 3552 | Zenopsis nebulosa | 雲紋亞海魴 | 海水 | 本土 |
| 3553 | Zeus faber | 遠東海魴 | 海水 | 本土 |
| 4849 | Zenopsis stabilispinosa | 多棘亞海魴 | 海水 | 本土 |
參考文獻
- ^ Yong-Rui Lu; Cheng-Chi Fang; Shun-Ping He. cnfishbase: A cyber Chinese fish database. Zoological Research. 2023, 44 (5): 950–953 [2023-10-22]. doi:10.24272/j.issn.2095-8137.2023.087. （原始內容存檔於2023-10-23）.