16BO133病毒

16BO133病毒嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,在韓國馬鐵菊頭蝠中發現,於2019年發表,其基因組被完整定序,是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株,在SARSr-CoV中屬於SARS-CoV相關病毒,與其基因組序列相似度為82.8%。

16BO133病毒
病毒分類 編輯
(未分級) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
門: 小核糖病毒門 Pisuviricota
綱: 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠狀病毒科 Coronaviridae
屬: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亞屬: SARS乙型冠狀病毒亞屬 Sarbecovirus
種:
毒株
16BO133病毒 16BO133

發現

16BO133病毒於2016年在韓國馬鐵菊頭蝠的口腔樣本中被發現,此病毒株的基因組長29075nt。在SARSr-CoV中,16BO133和2016年發表、自中國吉林馬鐵菊頭蝠中發現的JTMC15病毒最為接近,基因組核酸序列相似度為98.3%,與其他SARSr-CoV相較之下,這兩個病毒株因爲ORF7b末端的框移突變而喪失了ORF8[1][2]。16BO133病毒和SARS-CoV的基因組核酸序列相似度則為82.8%[3]

過去雖有其他SARSr-CoV病毒株在韓國被發現(B15-21病毒等),但皆無完整序列定序[4],16BO133病毒是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株[1]

演化樹

截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹

16BO133 與SARS-COV相似度82.8 % · 馬鐵菊頭蝠 · 韓國全羅北道 (2016年採集、2019年發表)[1]

Rf1 87.8 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國湖北宜昌 (2004年採集、2005年發表)[5]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中華菊頭蝠 · 香港、中國廣東 (2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株)[6]

LYRa11 90.9 % · 中菊頭蝠 · 中國雲南保山 (2011年採集、2014年發表)[7]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊頭蝠 · 中國廣西南寧 (2004年採集、2005年發表)[5]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國雲南祿豐 (2013年採集、2015年發表)[8]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國雲南祿豐 (2013年採集、2015年發表)[8]

SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 (2011年採集、2013年發表)[9]

WIV1 95.6 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 (2012年採集、2013年發表)[9]

WIV16 96.0 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 (2013年採集、2016年發表)[10]

果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東[6]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人類病毒


參考文獻

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea. Virus Genes. 2019-08, 55 (4). ISSN 0920-8569. PMC 7089380 . PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w (英語). 
  2. ^ Xu L, Zhang F, Yang W, Jiang T, Lu G, He B; et al. Detection and characterization of diverse alpha- and betacoronaviruses from bats in China.. Virol Sin. 2016, 31 (1): 69–77. PMC 7090707 . PMID 26847648. doi:10.1007/s12250-016-3727-3. 
  3. ^ Na EJ, Lee SY, Kim HJ, Oem JK. Comparative genetic analyses of Korean bat coronaviruses with SARS-CoV and the newly emerged SARS-CoV-2.. J Vet Sci. 2021, 22 (1): e12. PMC 7850784 . PMID 33522164. doi:10.4142/jvs.2021.22.e12. 
  4. ^ Kim HK, Yoon SW, Kim DJ, Koo BS, Noh JY, Kim JH; et al. Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome-Like, Middle East Respiratory Syndrome-Like Bat Coronaviruses and Group H Rotavirus in Faeces of Korean Bats.. Transbound Emerg Dis. 2016, 63 (4): 365–72. PMC 7169817 . PMID 27213718. doi:10.1111/tbed.12515. 
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  10. ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa. Perlman, S. , 編. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016-03-15, 90 (6). ISSN 0022-538X. PMC 4810638 . PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15 (英語).