Plazi
Plazi是一家以支持和促進數字生物分類學文獻的長期、公開訪問為目的的國際非營利性組織,總部位於瑞士。Plazi是生物多樣性文獻庫(Biodiversity Literature Repository)的共同創立者。該組織使用TreatmentBank服務,將分類學出版物的數據轉化為XML格式的FAIR數據,並在Zenodo上建立並維護可供公開訪問的生物多樣性文獻庫(Biodiversity Literature Repository)。[1][2]Plazi致力於宣傳科學討論和科學數據的開放獲取的重要意義,它是生物多樣性信息學領域中快速發展的在線分類學的貢獻者。[3]
該方式最初由美國國家科學基金會、德國科學基金會、美國自然史博物館和卡爾斯魯厄理工學院的共同合作開發的。該方式試圖創建使用XML格式對生物系統文獻的內容進行建模分類。舊的學術出版物則使用GoldenGATE的半自動編輯器創建的TaxonX格式。[4]
當下,Plazi依然在使用GoldenGATE作為一個複雜的標記工具,從而允許學術界參與並提高文檔質量。[5][6]
Plazi開發了多種方法,可通過全球生物多樣性信息設施(GBIF)收集的TAPIR服務訪問當前已發布的分類學文獻中的數據記錄。[7]同時可通過物種頁面模型(SPM)傳輸模式,從而獲取第三方機構,如生命百科全書(EOL)的分類數據(物種和更高分類群的科學描述)。目前,達爾文核心檔案(DwC-A)傳輸到全球生物多樣性信息設施(GBIF)的數據為33,623個數量集,占GBIF中所有數據集的比重超過50%。[8]並且在可行的前提下,Plazi通過與外部資料庫(如GenBank、膜翅目名稱伺服器或ZooBank(動物學名稱註冊處))的網絡連結來提高文檔質量。
Plazi聲稱其支持版權法規,辯解稱生物學分類並不屬於文學或藝術作品的範圍。因此Plazi認為這部分作品屬於公共領域,在科學實踐需要的前提下可以自由使用和傳播。[9][10]
參見
參考資料
- ^ TreatmentBank. plazi.org. [2020-02-09]. (原始內容存檔於2021-05-29).
- ^ Catapano, Terry. Taxpub. Plazi. [2009-10-27]. (原始內容存檔於2022-05-06).
- ^ Zauner, H. Evolving e-taxonomy. BMC Evolutionary Biology. 2009, 9: 141. PMC 2714837 . PMID 19555493. doi:10.1186/1471-2148-9-141.
- ^ Sautter, Guido. GoldenGATE Editor. Plazi, Technische Hochschule Karlsruhe. [2009-10-27]. (原始內容存檔於2022-01-19).
- ^ Agosti, Donat; Guidoti, Marcus; Sautter, Guido. Liberating the Richness of Facts implicit in taxonomic Publication: ThePlaziWorkflow. Biodiversity Information Science and Standards. 2020, 4 (e59179). doi:10.3897/biss.4.59179 (英語).
- ^ Agosti, Donat; Egloff, Willi. Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2008, 2 (53). doi:10.1186/1756-0500-2-53 (英語).
- ^ Plazidata in GBIF. Plazi. [2009-10-27]. (原始內容存檔於2016-03-03).
- ^ Plazi.org taxonomic treatments database. gbif.org. [2021-04-25]. (原始內容存檔於2022-03-12).
- ^ Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2009, 2: 53. PMC 2673227 . PMID 19331688. doi:10.1186/1756-0500-2-53.
- ^ Costello M J. Motivating Online Publication of Data. BioScience. 2009, 59:5 (5): 418 [2009-10-27]. doi:10.1525/bio.2009.59.5.9. (原始內容存檔於2011-08-07).