约翰·威廉（德语：Johann Wilhelm，1675年3月28日—1690年11月4日），萨克森-耶拿（英语：Saxe-Jena）公爵，1678年至1690年在位。
当他的的父亲博恩哈德于1678年去世，年仅三岁的约翰·威廉继位并由伯父约翰·恩斯特二世摄政。约翰·威廉于1690年早逝，萨克森-耶拿被萨克森-威玛和萨克森-艾森纳赫瓜分。
