小樽市综合博物馆（日语：おたるしそうごうはくぶつかん）是位于北海道小樽市手宫1丁目的展示有关北海道的历史、自然、铁路等各类和交通、科学有关主题的博物馆。
小樽市综合博物馆是由小樽市博物馆、小樽市青少年科学技术馆、小樽交通记念馆三家博物馆统合之后设立。前身的小樽市博物馆设立于1956年。博物馆收藏展示有众多珍贵的铁路车辆和汽车藏品。
