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黑腹果蝇是被人类研究得最彻底的生物之一。其名字有来于它喜好腐烂的水果以及发酵的果汁。黑腹果蝇第一次被用作试验研究对象在1901年，动物学家和遗传学家通过对果蝇的种系研究，设法了解多代近亲繁殖的结果和取自其中某一代进行杂交所出现的现象。之后，很多遗传学家就开始用果蝇作研究，并且取得了很多遗传学方面的知识，包括这种蝇类基因组里的基因在染色体上的分布。