LIM结构域

LIM结构域(英語:LIM domain)是一种蛋白质结构域,由两个疏水氨基酸残基连接两个锌指结构组成[1],其命名来自于最早发现这一结构域的三种蛋白(Lin11, Isl-1 & Mec-3)的首字母[2]。LIM结构域介导蛋白質交互作用,参与细胞骨架组建,在器官发育和肿瘤发生中有重要作用。

LIM domain
Pinch蛋白的第四个LIM结构域,锌原子为灰色
鑑定
標誌LIM
PfamPF00412旧版
InterPro英语InterProIPR001781
PROSITE英语PROSITEPDOC50178
SCOP英语Structural Classification of Proteins1ctl / SUPFAM
CDD英语Conserved Domain Databasecd08368

除了关键氨基酸如结合半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外,LIM结构域的氨基酸序列高度可变,其通式如下:

[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C]

LIM结构域的图示

参考文献

  1. ^ Kadrmas JL, Beckerle MC. The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5 (11): 920–31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499. 
  2. ^ Bach I. The LIM domain: regulation by association. Mech. Dev. 2000, 91 (1–2): 5–17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7.